MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Uzinura diaspidicola str. ASNER

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020135	ATTCT	2	10	89	98	20 %	60 %	0 %	20 %	442743029
2	NC_020135	GTAAT	2	10	1389	1398	40 %	40 %	20 %	0 %	442743030
3	NC_020135	GTAAA	2	10	2202	2211	60 %	20 %	20 %	0 %	442743030
4	NC_020135	CTGCA	2	10	4035	4044	20 %	20 %	20 %	40 %	442743031
5	NC_020135	AGAAA	2	10	4260	4269	80 %	0 %	20 %	0 %	442743032
6	NC_020135	ATTTT	2	10	5231	5240	20 %	80 %	0 %	0 %	442743033
7	NC_020135	GAAAT	2	10	7488	7497	60 %	20 %	20 %	0 %	442743034
8	NC_020135	AAAAT	2	10	10603	10612	80 %	20 %	0 %	0 %	442743038
9	NC_020135	CTAAA	2	10	10872	10881	60 %	20 %	0 %	20 %	442743038
10	NC_020135	CAAAA	2	10	15443	15452	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020135	TTTTC	2	10	16420	16429	0 %	80 %	0 %	20 %	442743044
12	NC_020135	AAAAT	2	10	16553	16562	80 %	20 %	0 %	0 %	442743044
13	NC_020135	TTTAA	2	10	16579	16588	40 %	60 %	0 %	0 %	442743044
14	NC_020135	TTGAT	2	10	18081	18090	20 %	60 %	20 %	0 %	442743047
15	NC_020135	TAAAA	2	10	18276	18285	80 %	20 %	0 %	0 %	442743047
16	NC_020135	ATTTG	2	10	18957	18966	20 %	60 %	20 %	0 %	442743048
17	NC_020135	TTGAT	2	10	19649	19658	20 %	60 %	20 %	0 %	442743048
18	NC_020135	GTAGA	2	10	19970	19979	40 %	20 %	40 %	0 %	442743048
19	NC_020135	TCAAA	2	10	20152	20161	60 %	20 %	0 %	20 %	442743048
20	NC_020135	AGATA	2	10	20370	20379	60 %	20 %	20 %	0 %	442743048
21	NC_020135	ACAGA	2	10	20393	20402	60 %	0 %	20 %	20 %	442743048
22	NC_020135	TAAGA	2	10	21309	21318	60 %	20 %	20 %	0 %	442743048
23	NC_020135	ATTAG	2	10	22426	22435	40 %	40 %	20 %	0 %	442743049
24	NC_020135	TAAAG	2	10	23745	23754	60 %	20 %	20 %	0 %	442743049
25	NC_020135	AATGC	2	10	24241	24250	40 %	20 %	20 %	20 %	442743049
26	NC_020135	AGGTA	2	10	25488	25497	40 %	20 %	40 %	0 %	442743049
27	NC_020135	ATTTT	2	10	26652	26661	20 %	80 %	0 %	0 %	442743050
28	NC_020135	TTTTA	2	10	27765	27774	20 %	80 %	0 %	0 %	442743051
29	NC_020135	TAGAT	2	10	30217	30226	40 %	40 %	20 %	0 %	442743055
30	NC_020135	TTAGT	2	10	31367	31376	20 %	60 %	20 %	0 %	442743055
31	NC_020135	AAAGA	2	10	32022	32031	80 %	0 %	20 %	0 %	442743056
32	NC_020135	TTCCT	2	10	32317	32326	0 %	60 %	0 %	40 %	442743056
33	NC_020135	AGTAA	2	10	32548	32557	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020135	AGACA	2	10	32706	32715	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020135	ACCAT	2	10	32740	32749	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_020135	AAGAA	2	10	33285	33294	80 %	0 %	20 %	0 %	442743057
37	NC_020135	GATTT	2	10	33393	33402	20 %	60 %	20 %	0 %	442743057
38	NC_020135	AAATT	2	10	33823	33832	60 %	40 %	0 %	0 %	442743057
39	NC_020135	TTTTA	2	10	34121	34130	20 %	80 %	0 %	0 %	442743057
40	NC_020135	GAACA	2	10	34805	34814	60 %	0 %	20 %	20 %	442743058
41	NC_020135	TAATT	2	10	36073	36082	40 %	60 %	0 %	0 %	442743059
42	NC_020135	AAAAT	2	10	37585	37594	80 %	20 %	0 %	0 %	442743061
43	NC_020135	ATAGC	2	10	39039	39048	40 %	20 %	20 %	20 %	442743063
44	NC_020135	TTTTA	2	10	39497	39506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020135	CCTAT	2	10	43052	43061	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_020135	ACTAG	2	10	44043	44052	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_020135	AGAGA	2	10	47049	47058	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020135	TAAAA	2	10	47396	47405	80 %	20 %	0 %	0 %	442743066
49	NC_020135	ATGCT	2	10	48210	48219	20 %	40 %	20 %	20 %	442743066
50	NC_020135	GAAAT	2	10	48307	48316	60 %	20 %	20 %	0 %	442743066
51	NC_020135	AAAAT	2	10	48537	48546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020135	AAGAT	2	10	49279	49288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020135	TACTT	2	10	49450	49459	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_020135	ATATA	2	10	49475	49484	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020135	AAAAT	2	10	49763	49772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020135	ACTTT	2	10	49997	50006	20 %	60 %	0 %	20 %	442743067
57	NC_020135	TTCCC	2	10	50074	50083	0 %	40 %	0 %	60 %	442743067
58	NC_020135	AATAT	2	10	50389	50398	60 %	40 %	0 %	0 %	442743068
59	NC_020135	GTTTT	2	10	50616	50625	0 %	80 %	20 %	0 %	442743068
60	NC_020135	AGAAA	2	10	50974	50983	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020135	TTCGA	2	10	51076	51085	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020135	AATTG	2	10	51126	51135	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020135	ATGAA	2	10	51407	51416	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020135	TATTC	2	10	53132	53141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020135	AAGAA	2	10	54263	54272	80 %	0 %	20 %	0 %	442743069
66	NC_020135	ATTTT	2	10	55797	55806	20 %	80 %	0 %	0 %	442743070
67	NC_020135	GCTGC	2	10	57866	57875	0 %	20 %	40 %	40 %	442743071
68	NC_020135	TTATT	2	10	57944	57953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020135	TAAAA	2	10	58863	58872	80 %	20 %	0 %	0 %	442743072
70	NC_020135	TATAT	2	10	58905	58914	40 %	60 %	0 %	0 %	442743072
71	NC_020135	ATTTT	2	10	59394	59403	20 %	80 %	0 %	0 %	442743074
72	NC_020135	TGATC	2	10	60438	60447	20 %	40 %	20 %	20 %	442743075
73	NC_020135	GAAAA	2	10	60788	60797	80 %	0 %	20 %	0 %	442743075
74	NC_020135	TGCAT	2	10	61065	61074	20 %	40 %	20 %	20 %	442743075
75	NC_020135	TTTCT	2	10	63369	63378	0 %	80 %	0 %	20 %	442743076
76	NC_020135	TAAAT	2	10	63805	63814	60 %	40 %	0 %	0 %	442743076
77	NC_020135	AAGAA	2	10	64540	64549	80 %	0 %	20 %	0 %	442743076
78	NC_020135	GAATT	2	10	65061	65070	40 %	40 %	20 %	0 %	442743076
79	NC_020135	TCTTT	2	10	65889	65898	0 %	80 %	0 %	20 %	442743076
80	NC_020135	AAAAT	2	10	68672	68681	80 %	20 %	0 %	0 %	442743080
81	NC_020135	GTTTA	2	10	68844	68853	20 %	60 %	20 %	0 %	442743080
82	NC_020135	AAATA	2	10	69180	69189	80 %	20 %	0 %	0 %	442743080
83	NC_020135	CTTTT	2	10	69982	69991	0 %	80 %	0 %	20 %	442743081
84	NC_020135	AGAAA	2	10	70639	70648	80 %	0 %	20 %	0 %	442743082
85	NC_020135	TAAAA	2	10	71190	71199	80 %	20 %	0 %	0 %	442743082
86	NC_020135	AAATA	2	10	73649	73658	80 %	20 %	0 %	0 %	442743085
87	NC_020135	ATAAA	2	10	75901	75910	80 %	20 %	0 %	0 %	442743086
88	NC_020135	TTTAA	2	10	77696	77705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020135	AATGG	2	10	78585	78594	40 %	20 %	40 %	0 %	442743087
90	NC_020135	ATTTC	2	10	79184	79193	20 %	60 %	0 %	20 %	442743088
91	NC_020135	CTAAA	2	10	80552	80561	60 %	20 %	0 %	20 %	442743089
92	NC_020135	AGAGA	2	10	81181	81190	60 %	0 %	40 %	0 %	442743089
93	NC_020135	TTACC	2	10	82311	82320	20 %	40 %	0 %	40 %	442743090
94	NC_020135	TTTTA	2	10	82321	82330	20 %	80 %	0 %	0 %	442743090
95	NC_020135	AAAGA	2	10	84127	84136	80 %	0 %	20 %	0 %	442743091
96	NC_020135	AAATA	2	10	84470	84479	80 %	20 %	0 %	0 %	442743091
97	NC_020135	AAGAT	2	10	85878	85887	60 %	20 %	20 %	0 %	442743093
98	NC_020135	CTTTT	2	10	87011	87020	0 %	80 %	0 %	20 %	442743094
99	NC_020135	GAAAA	2	10	87043	87052	80 %	0 %	20 %	0 %	442743094
100	NC_020135	TAAAT	2	10	87900	87909	60 %	40 %	0 %	0 %	442743094
101	NC_020135	TATTT	2	10	88790	88799	20 %	80 %	0 %	0 %	442743094
102	NC_020135	TAAAG	2	10	91420	91429	60 %	20 %	20 %	0 %	442743096
103	NC_020135	CTTAC	2	10	92205	92214	20 %	40 %	0 %	40 %	442743098
104	NC_020135	ATAAA	2	10	92217	92226	80 %	20 %	0 %	0 %	442743098
105	NC_020135	TGTAT	2	10	93552	93561	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020135	AAAAT	2	10	99958	99967	80 %	20 %	0 %	0 %	442743103
107	NC_020135	ATACA	2	10	100670	100679	60 %	20 %	0 %	20 %	442743105
108	NC_020135	TGTAT	2	10	101407	101416	20 %	60 %	20 %	0 %	442743106
109	NC_020135	TAAAA	2	10	101799	101808	80 %	20 %	0 %	0 %	442743106
110	NC_020135	CCCAA	2	10	102257	102266	40 %	0 %	0 %	60 %	442743107
111	NC_020135	TTAAA	2	10	103005	103014	60 %	40 %	0 %	0 %	442743107
112	NC_020135	ACTAT	2	10	104189	104198	40 %	40 %	0 %	20 %	442743108
113	NC_020135	ACAAA	2	10	105475	105484	80 %	0 %	0 %	20 %	442743109
114	NC_020135	ATTTT	2	10	108813	108822	20 %	80 %	0 %	0 %	442743112
115	NC_020135	GAGAT	2	10	109879	109888	40 %	20 %	40 %	0 %	442743113
116	NC_020135	ATTTT	2	10	110868	110877	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020135	GAACC	2	10	111132	111141	40 %	0 %	20 %	40 %	442743114
118	NC_020135	TAATT	2	10	111224	111233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020135	ACATC	2	10	111574	111583	40 %	20 %	0 %	40 %	442743115
120	NC_020135	AAATA	2	10	112194	112203	80 %	20 %	0 %	0 %	442743115
121	NC_020135	TATTT	2	10	113739	113748	20 %	80 %	0 %	0 %	442743118
122	NC_020135	ACATT	2	10	114830	114839	40 %	40 %	0 %	20 %	442743118
123	NC_020135	AGTAA	2	10	115510	115519	60 %	20 %	20 %	0 %	442743119
124	NC_020135	ACATA	2	10	116027	116036	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020135	GTTTA	2	10	116557	116566	20 %	60 %	20 %	0 %	442743120
126	NC_020135	ATTCT	2	10	117348	117357	20 %	60 %	0 %	20 %	442743120
127	NC_020135	TCCAC	2	10	117536	117545	20 %	20 %	0 %	60 %	442743120
128	NC_020135	AGGGA	2	10	119191	119200	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020135	GAGTT	2	10	119866	119875	20 %	40 %	40 %	0 %	442743123
130	NC_020135	TAAAA	2	10	120422	120431	80 %	20 %	0 %	0 %	442743123
131	NC_020135	TACTT	2	10	121259	121268	20 %	60 %	0 %	20 %	442743124
132	NC_020135	TGATT	2	10	121586	121595	20 %	60 %	20 %	0 %	442743124
133	NC_020135	ATATA	2	10	121622	121631	60 %	40 %	0 %	0 %	442743124
134	NC_020135	TATAT	2	10	121819	121828	40 %	60 %	0 %	0 %	442743125
135	NC_020135	TATAG	2	10	122588	122597	40 %	40 %	20 %	0 %	442743126
136	NC_020135	TATTT	2	10	124444	124453	20 %	80 %	0 %	0 %	442743127
137	NC_020135	CAAAA	2	10	125072	125081	80 %	0 %	0 %	20 %	442743128
138	NC_020135	TAAAT	2	10	126829	126838	60 %	40 %	0 %	0 %	442743129
139	NC_020135	AAATT	2	10	127879	127888	60 %	40 %	0 %	0 %	442743129
140	NC_020135	ATAAA	2	10	129281	129290	80 %	20 %	0 %	0 %	442743129
141	NC_020135	CTGTG	2	10	131440	131449	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_020135	TCTTT	2	10	133586	133595	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_020135	ATAGT	2	10	142166	142175	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020135	AAAAG	2	10	143037	143046	80 %	0 %	20 %	0 %	442743144
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257	NC_020135	TATCT	2	10	258401	258410	20 %	60 %	0 %	20 %	442743251
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260	NC_020135	TAAGA	2	10	260776	260785	60 %	20 %	20 %	0 %	442743253
261	NC_020135	AATAG	2	10	262901	262910	60 %	20 %	20 %	0 %	442743255
262	NC_020135	CTAAG	2	10	263288	263297	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.