MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 31091

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020134	AGT	3	9	331	339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803497
2	NC_020134	ATT	3	9	390	398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803497
3	NC_020134	CGG	2	6	526	531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803497
4	NC_020134	TTA	2	6	642	647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803497
5	NC_020134	GAT	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803497
6	NC_020134	GAA	2	6	671	676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803497
7	NC_020134	CTT	2	6	707	712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803497
8	NC_020134	GAA	2	6	755	760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803497
9	NC_020134	ATT	2	6	806	811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803497
10	NC_020134	GGA	2	6	847	852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803497
11	NC_020134	TGA	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803497
12	NC_020134	GTT	2	6	1040	1045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803497
13	NC_020134	AGC	2	6	1104	1109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803497
14	NC_020134	ATA	2	6	1151	1156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803497
15	NC_020134	GGA	2	6	1304	1309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803497
16	NC_020134	AAG	2	6	1378	1383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803497
17	NC_020134	GAA	2	6	1399	1404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803497
18	NC_020134	CAA	2	6	1623	1628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803498
19	NC_020134	TTA	2	6	1641	1646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803498
20	NC_020134	TAA	2	6	1721	1726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803499
21	NC_020134	TAC	2	6	1748	1753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803499
22	NC_020134	TAC	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803499
23	NC_020134	CAT	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803499
24	NC_020134	TGT	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803499
25	NC_020134	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803499
26	NC_020134	CAG	2	6	2091	2096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803499
27	NC_020134	ATG	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803499
28	NC_020134	GTT	2	6	2259	2264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803499
29	NC_020134	TGA	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803499
30	NC_020134	AAT	2	6	2390	2395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803499
31	NC_020134	GAA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803499
32	NC_020134	ATT	2	6	2550	2555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803499
33	NC_020134	ATA	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803500
34	NC_020134	ATA	2	6	3049	3054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803500
35	NC_020134	ATT	2	6	3055	3060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803500
36	NC_020134	ATG	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803500
37	NC_020134	GTT	2	6	3153	3158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803500
38	NC_020134	AGA	2	6	3216	3221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803500
39	NC_020134	TAT	2	6	3310	3315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803500
40	NC_020134	AAG	2	6	3395	3400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803500
41	NC_020134	GAA	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803500
42	NC_020134	CAG	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803500
43	NC_020134	GGA	2	6	3695	3700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803500
44	NC_020134	TGA	2	6	3740	3745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803500
45	NC_020134	ATT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803500
46	NC_020134	TAA	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803500
47	NC_020134	GAT	2	6	3852	3857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803500
48	NC_020134	AAT	2	6	3998	4003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803501
49	NC_020134	GGA	2	6	4058	4063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803501
50	NC_020134	TAA	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803501
51	NC_020134	TAA	2	6	4136	4141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803501
52	NC_020134	CAA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803501
53	NC_020134	TAA	2	6	4200	4205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803501
54	NC_020134	ATG	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803502
55	NC_020134	TCA	2	6	4352	4357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803502
56	NC_020134	TGA	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803502
57	NC_020134	ATT	2	6	4428	4433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803502
58	NC_020134	GTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803502
59	NC_020134	TGC	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803502
60	NC_020134	TAC	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803502
61	NC_020134	ACG	2	6	4957	4962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803502
62	NC_020134	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803502
63	NC_020134	GGC	2	6	5079	5084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803502
64	NC_020134	GGC	2	6	5105	5110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803502
65	NC_020134	TTG	2	6	5290	5295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803502
66	NC_020134	GGA	2	6	5330	5335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803502
67	NC_020134	AAT	2	6	5354	5359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803502
68	NC_020134	ATT	2	6	5504	5509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803502
69	NC_020134	CGG	2	6	5531	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803502
70	NC_020134	AGA	2	6	5559	5564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803502
71	NC_020134	TTC	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803502
72	NC_020134	ATA	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803502
73	NC_020134	TAA	2	6	5725	5730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803502
74	NC_020134	TCA	2	6	5753	5758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803502
75	NC_020134	GCT	2	6	5768	5773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803502
76	NC_020134	CCT	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803502
77	NC_020134	AGA	2	6	5867	5872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803502
78	NC_020134	ACA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803502
79	NC_020134	AAT	2	6	6048	6053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803502
80	NC_020134	TAA	2	6	6143	6148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803502
81	NC_020134	GAA	2	6	6160	6165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803502
82	NC_020134	TTC	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803503
83	NC_020134	TTG	2	6	7189	7194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803503
84	NC_020134	TTC	2	6	7210	7215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803503
85	NC_020134	TAA	2	6	7257	7262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803503
86	NC_020134	CTA	2	6	7358	7363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803503
87	NC_020134	CTT	2	6	7599	7604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803503
88	NC_020134	TAG	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803503
89	NC_020134	CAA	2	6	7797	7802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803503
90	NC_020134	GTA	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803503
91	NC_020134	TCT	2	6	7838	7843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803503
92	NC_020134	TTG	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803503
93	NC_020134	TTA	2	6	8030	8035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803503
94	NC_020134	CTT	2	6	8058	8063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803503
95	NC_020134	TAC	2	6	9257	9262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803504
96	NC_020134	TTA	2	6	9313	9318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803504
97	NC_020134	AGA	2	6	9473	9478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803504
98	NC_020134	TAT	2	6	9488	9493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803504
99	NC_020134	TTA	2	6	9520	9525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803504
100	NC_020134	TGA	2	6	9607	9612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803504
101	NC_020134	TGA	2	6	9716	9721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803504
102	NC_020134	ATA	2	6	9942	9947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803505
103	NC_020134	TAT	2	6	9948	9953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803505
104	NC_020134	AGC	2	6	10008	10013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803505
105	NC_020134	TAT	2	6	10087	10092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803505
106	NC_020134	ATT	2	6	10121	10126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803505
107	NC_020134	AGA	2	6	10136	10141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803505
108	NC_020134	GGA	2	6	10246	10251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803505
109	NC_020134	GAA	2	6	10265	10270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803505
110	NC_020134	AGG	2	6	10314	10319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803505
111	NC_020134	TAT	2	6	10374	10379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803505
112	NC_020134	ATT	2	6	10493	10498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803505
113	NC_020134	GAA	2	6	10604	10609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803505
114	NC_020134	ATT	2	6	10683	10688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803505
115	NC_020134	ATG	2	6	10692	10697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803505
116	NC_020134	TGG	2	6	10943	10948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803506
117	NC_020134	GTC	2	6	10980	10985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803506
118	NC_020134	GTT	2	6	10993	10998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803506
119	NC_020134	TGA	2	6	11090	11095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803506
120	NC_020134	ACG	2	6	11141	11146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803506
121	NC_020134	CAA	2	6	11238	11243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803506
122	NC_020134	TGA	2	6	11268	11273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803506
123	NC_020134	TCT	2	6	11371	11376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803506
124	NC_020134	GAA	2	6	11377	11382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803506
125	NC_020134	TAA	2	6	11394	11399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803506
126	NC_020134	AAT	2	6	11467	11472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803507
127	NC_020134	GAA	2	6	11476	11481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803507
128	NC_020134	AAG	2	6	11484	11489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803507
129	NC_020134	AAG	2	6	11550	11555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803507
130	NC_020134	GAT	2	6	11767	11772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803507
131	NC_020134	TGG	2	6	11882	11887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803507
132	NC_020134	GCG	2	6	11897	11902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803507
133	NC_020134	GGC	2	6	11911	11916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803507
134	NC_020134	GAA	2	6	11983	11988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803507
135	NC_020134	TGC	2	6	12014	12019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803507
136	NC_020134	CGC	2	6	12020	12025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803507
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138	NC_020134	TTG	2	6	12074	12079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803507
139	NC_020134	CCG	2	6	12140	12145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803507
140	NC_020134	GAA	2	6	12187	12192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803507
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142	NC_020134	ACA	2	6	12316	12321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803507
143	NC_020134	GGA	2	6	12345	12350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803507
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149	NC_020134	AAT	2	6	14011	14016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803508
150	NC_020134	CGC	2	6	14025	14030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803508
151	NC_020134	ATT	2	6	14049	14054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803508
152	NC_020134	GCG	2	6	14388	14393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803508
153	NC_020134	GCT	2	6	14531	14536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803508
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155	NC_020134	AAG	2	6	14589	14594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803508
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158	NC_020134	GGA	2	6	14935	14940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803508
159	NC_020134	AGA	2	6	14971	14976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803508
160	NC_020134	TCC	2	6	14986	14991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803508
161	NC_020134	TGA	2	6	15010	15015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803508
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163	NC_020134	TGA	2	6	15205	15210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803508
164	NC_020134	GGT	2	6	15235	15240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803508
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220	NC_020134	GTT	2	6	22017	22022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803515
221	NC_020134	AAC	2	6	22113	22118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803515
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241	NC_020134	AGA	2	6	24100	24105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803516
242	NC_020134	GAT	2	6	24128	24133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803516
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248	NC_020134	CAC	2	6	24484	24489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442803516
249	NC_020134	ATG	2	6	24644	24649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803516
250	NC_020134	CAA	2	6	24673	24678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803516
251	NC_020134	CCA	2	6	24732	24737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442803516
252	NC_020134	TGC	2	6	24822	24827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803516
253	NC_020134	TGG	2	6	24834	24839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803516
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255	NC_020134	TAA	2	6	24954	24959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803517
256	NC_020134	ATA	2	6	24962	24967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803517
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270	NC_020134	TTG	2	6	26995	27000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803519
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280	NC_020134	GCT	2	6	28064	28069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803520
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292	NC_020134	CTG	2	6	29532	29537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803522
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371	NC_020134	GAG	2	6	37159	37164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803531
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