MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020130	TAAC	2	8	26	33	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020130	AGTA	2	8	511	518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020130	ATCT	2	8	1072	1079	25 %	50 %	0 %	25 %	442556536
4	NC_020130	TTAA	2	8	1857	1864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020130	GTAA	2	8	1989	1996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020130	CCAA	2	8	2470	2477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020130	ATCT	2	8	2595	2602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020130	TCTT	2	8	2651	2658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020130	AATA	2	8	3712	3719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020130	TAGA	2	8	3912	3919	50 %	25 %	25 %	0 %	442556538
11	NC_020130	ATTC	2	8	4046	4053	25 %	50 %	0 %	25 %	442556538
12	NC_020130	AATT	2	8	4260	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	442556538
13	NC_020130	CTTA	2	8	4280	4287	25 %	50 %	0 %	25 %	442556538
14	NC_020130	TCTT	2	8	4891	4898	0 %	75 %	0 %	25 %	442556538
15	NC_020130	ATTG	2	8	5602	5609	25 %	50 %	25 %	0 %	442556539
16	NC_020130	GAAT	2	8	5706	5713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020130	TTCC	2	8	6159	6166	0 %	50 %	0 %	50 %	442556540
18	NC_020130	CTAT	2	8	6336	6343	25 %	50 %	0 %	25 %	442556540
19	NC_020130	TCTT	2	8	6491	6498	0 %	75 %	0 %	25 %	442556540
20	NC_020130	ATTT	2	8	6691	6698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020130	TTTA	2	8	7325	7332	25 %	75 %	0 %	0 %	442556541
22	NC_020130	CATC	2	8	7518	7525	25 %	25 %	0 %	50 %	442556541
23	NC_020130	TCTA	2	8	7576	7583	25 %	50 %	0 %	25 %	442556541
24	NC_020130	ATTT	2	8	7694	7701	25 %	75 %	0 %	0 %	442556541
25	NC_020130	TGTC	2	8	8139	8146	0 %	50 %	25 %	25 %	442556542
26	NC_020130	TGTA	2	8	8598	8605	25 %	50 %	25 %	0 %	442556542
27	NC_020130	TGGG	2	8	8856	8863	0 %	25 %	75 %	0 %	442556542
28	NC_020130	TATT	2	8	8990	8997	25 %	75 %	0 %	0 %	442556542
29	NC_020130	GAAT	2	8	9006	9013	50 %	25 %	25 %	0 %	442556542
30	NC_020130	CAAA	2	8	9038	9045	75 %	0 %	0 %	25 %	442556542
31	NC_020130	ATTT	2	8	10278	10285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020130	TTAA	2	8	10323	10330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020130	TAGA	2	8	10427	10434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020130	TATG	2	8	10491	10498	25 %	50 %	25 %	0 %	442556543
35	NC_020130	AACA	2	8	10734	10741	75 %	0 %	0 %	25 %	442556543
36	NC_020130	TATT	2	8	11235	11242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020130	AAAC	2	8	12009	12016	75 %	0 %	0 %	25 %	442556544
38	NC_020130	TAAG	2	8	12570	12577	50 %	25 %	25 %	0 %	442556544
39	NC_020130	ATGT	2	8	12784	12791	25 %	50 %	25 %	0 %	442556544
40	NC_020130	GTAA	2	8	12807	12814	50 %	25 %	25 %	0 %	442556544
41	NC_020130	TCCT	2	8	12979	12986	0 %	50 %	0 %	50 %	442556544
42	NC_020130	GGAC	2	8	13389	13396	25 %	0 %	50 %	25 %	442556544
43	NC_020130	AGAT	2	8	13924	13931	50 %	25 %	25 %	0 %	442556544
44	NC_020130	TAGA	2	8	14033	14040	50 %	25 %	25 %	0 %	442556544
45	NC_020130	AGAT	2	8	14152	14159	50 %	25 %	25 %	0 %	442556544
46	NC_020130	GGAT	2	8	14198	14205	25 %	25 %	50 %	0 %	442556544
47	NC_020130	TAAA	2	8	14605	14612	75 %	25 %	0 %	0 %	442556545
48	NC_020130	CCAT	2	8	15067	15074	25 %	25 %	0 %	50 %	442556545
49	NC_020130	ATTT	2	8	15098	15105	25 %	75 %	0 %	0 %	442556545
50	NC_020130	TTCA	2	8	15548	15555	25 %	50 %	0 %	25 %	442556546
51	NC_020130	TATC	2	8	15637	15644	25 %	50 %	0 %	25 %	442556546
52	NC_020130	GGCA	2	8	15892	15899	25 %	0 %	50 %	25 %	442556546
53	NC_020130	TTTG	2	8	16938	16945	0 %	75 %	25 %	0 %	442556547
54	NC_020130	GTAC	2	8	17954	17961	25 %	25 %	25 %	25 %	442556548
55	NC_020130	TGCT	2	8	17973	17980	0 %	50 %	25 %	25 %	442556548
56	NC_020130	TTCC	2	8	18456	18463	0 %	50 %	0 %	50 %	442556548
57	NC_020130	TGTA	2	8	18521	18528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020130	TAAC	2	8	18679	18686	50 %	25 %	0 %	25 %	442556549
59	NC_020130	TACA	2	8	18748	18755	50 %	25 %	0 %	25 %	442556549
60	NC_020130	AGTA	2	8	19052	19059	50 %	25 %	25 %	0 %	442556549
61	NC_020130	TTGT	2	8	19372	19379	0 %	75 %	25 %	0 %	442556549
62	NC_020130	CTTG	2	8	19732	19739	0 %	50 %	25 %	25 %	442556549
63	NC_020130	TTGT	2	8	20049	20056	0 %	75 %	25 %	0 %	442556550
64	NC_020130	ACAA	2	8	20112	20119	75 %	0 %	0 %	25 %	442556550
65	NC_020130	ATAA	2	8	20347	20354	75 %	25 %	0 %	0 %	442556550
66	NC_020130	GTAA	2	8	20521	20528	50 %	25 %	25 %	0 %	442556550
67	NC_020130	TTGT	2	8	20760	20767	0 %	75 %	25 %	0 %	442556550
68	NC_020130	TAAA	2	8	20768	20775	75 %	25 %	0 %	0 %	442556550
69	NC_020130	ATAA	2	8	20901	20908	75 %	25 %	0 %	0 %	442556550
70	NC_020130	TAGA	2	8	20966	20973	50 %	25 %	25 %	0 %	442556550
71	NC_020130	GATA	2	8	21114	21121	50 %	25 %	25 %	0 %	442556551
72	NC_020130	TCCA	2	8	21640	21647	25 %	25 %	0 %	50 %	442556551
73	NC_020130	ATTT	2	8	21741	21748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020130	TTTC	2	8	22013	22020	0 %	75 %	0 %	25 %	442556552
75	NC_020130	AAGT	2	8	22410	22417	50 %	25 %	25 %	0 %	442556553
76	NC_020130	CCAT	2	8	22695	22702	25 %	25 %	0 %	50 %	442556553
77	NC_020130	TAGT	2	8	23036	23043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020130	TAGC	2	8	23046	23053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020130	GATA	2	8	23374	23381	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
80	NC_020130	TGGT	2	8	23748	23755	0 %	50 %	50 %	0 %	442556554
81	NC_020130	TAAT	2	8	23914	23921	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
82	NC_020130	TAAA	2	8	24106	24113	75 %	25 %	0 %	0 %	442556554
83	NC_020130	TTTC	2	8	24350	24357	0 %	75 %	0 %	25 %	442556554
84	NC_020130	TAAG	3	12	24493	24504	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
85	NC_020130	AATA	2	8	24519	24526	75 %	25 %	0 %	0 %	442556554
86	NC_020130	AATG	2	8	24588	24595	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
87	NC_020130	TAAG	2	8	24606	24613	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
88	NC_020130	AAAG	2	8	24899	24906	75 %	0 %	25 %	0 %	442556554
89	NC_020130	CCAG	2	8	25161	25168	25 %	0 %	25 %	50 %	442556554
90	NC_020130	ATTG	2	8	25630	25637	25 %	50 %	25 %	0 %	442556554
91	NC_020130	ATCC	2	8	25768	25775	25 %	25 %	0 %	50 %	442556554
92	NC_020130	AGAA	2	8	25780	25787	75 %	0 %	25 %	0 %	442556554
93	NC_020130	ATAG	2	8	26492	26499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020130	TAGA	2	8	26719	26726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020130	GATG	2	8	27038	27045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020130	CTTT	2	8	27656	27663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020130	AAAG	2	8	28559	28566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020130	AATG	2	8	28596	28603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020130	AGTT	2	8	29127	29134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020130	ATCC	2	8	29447	29454	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020130	AGAA	2	8	29561	29568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020130	TTTA	2	8	29713	29720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020130	ATAA	2	8	30311	30318	75 %	25 %	0 %	0 %	442556555
104	NC_020130	ATCC	2	8	30393	30400	25 %	25 %	0 %	50 %	442556555
105	NC_020130	GGTA	2	8	30758	30765	25 %	25 %	50 %	0 %	442556555
106	NC_020130	GATG	2	8	30885	30892	25 %	25 %	50 %	0 %	442556555
107	NC_020130	ATGT	2	8	31036	31043	25 %	50 %	25 %	0 %	442556555
108	NC_020130	AATA	2	8	31191	31198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020130	GTAA	2	8	31457	31464	50 %	25 %	25 %	0 %	442556556
110	NC_020130	AAAG	2	8	31951	31958	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020130	AGAA	2	8	32498	32505	75 %	0 %	25 %	0 %	442556557
112	NC_020130	GATA	2	8	33496	33503	50 %	25 %	25 %	0 %	442556558
113	NC_020130	AGGT	2	8	34040	34047	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020130	TTTA	2	8	34459	34466	25 %	75 %	0 %	0 %	442556559
115	NC_020130	GTAT	2	8	34630	34637	25 %	50 %	25 %	0 %	442556559
116	NC_020130	ACAA	2	8	34753	34760	75 %	0 %	0 %	25 %	442556559
117	NC_020130	TCAA	2	8	35054	35061	50 %	25 %	0 %	25 %	442556559
118	NC_020130	AGAA	2	8	35351	35358	75 %	0 %	25 %	0 %	442556559
119	NC_020130	ATTT	2	8	35415	35422	25 %	75 %	0 %	0 %	442556559
120	NC_020130	CATA	2	8	35545	35552	50 %	25 %	0 %	25 %	442556559
121	NC_020130	TAGT	2	8	35918	35925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020130	TCAA	2	8	36213	36220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020130	CTTT	2	8	37235	37242	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020130	CATA	2	8	37485	37492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020130	CTAT	2	8	38551	38558	25 %	50 %	0 %	25 %	442556560
126	NC_020130	ATTT	2	8	38719	38726	25 %	75 %	0 %	0 %	442556560
127	NC_020130	GTTT	2	8	38895	38902	0 %	75 %	25 %	0 %	442556560
128	NC_020130	TAAA	2	8	39404	39411	75 %	25 %	0 %	0 %	442556560
129	NC_020130	ACAT	2	8	39570	39577	50 %	25 %	0 %	25 %	442556560
130	NC_020130	GTTT	2	8	39614	39621	0 %	75 %	25 %	0 %	442556561
131	NC_020130	AATT	2	8	39959	39966	50 %	50 %	0 %	0 %	442556561
132	NC_020130	GGAT	2	8	40734	40741	25 %	25 %	50 %	0 %	442556561
133	NC_020130	ATTT	2	8	41048	41055	25 %	75 %	0 %	0 %	442556561
134	NC_020130	TTAT	2	8	41143	41150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020130	TTTA	2	8	41333	41340	25 %	75 %	0 %	0 %	442556562
136	NC_020130	AAAG	2	8	41498	41505	75 %	0 %	25 %	0 %	442556562
137	NC_020130	GCTA	2	8	41656	41663	25 %	25 %	25 %	25 %	442556562
138	NC_020130	CATA	2	8	41736	41743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020130	CATA	2	8	41899	41906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020130	GATA	2	8	41954	41961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020130	ACTT	2	8	42584	42591	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020130	AGAA	2	8	42659	42666	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020130	AAGT	2	8	43082	43089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020130	TAAG	2	8	43142	43149	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020130	GCTT	2	8	43901	43908	0 %	50 %	25 %	25 %	442556563
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163	NC_020130	TGTA	2	8	51988	51995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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