MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 456

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020130	ATCT	2	8	1072	1079	25 %	50 %	0 %	25 %	442556536
2	NC_020130	TAGA	2	8	3912	3919	50 %	25 %	25 %	0 %	442556538
3	NC_020130	ATTC	2	8	4046	4053	25 %	50 %	0 %	25 %	442556538
4	NC_020130	AATT	2	8	4260	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	442556538
5	NC_020130	CTTA	2	8	4280	4287	25 %	50 %	0 %	25 %	442556538
6	NC_020130	TCTT	2	8	4891	4898	0 %	75 %	0 %	25 %	442556538
7	NC_020130	ATTG	2	8	5602	5609	25 %	50 %	25 %	0 %	442556539
8	NC_020130	TTCC	2	8	6159	6166	0 %	50 %	0 %	50 %	442556540
9	NC_020130	CTAT	2	8	6336	6343	25 %	50 %	0 %	25 %	442556540
10	NC_020130	TCTT	2	8	6491	6498	0 %	75 %	0 %	25 %	442556540
11	NC_020130	TTTA	2	8	7325	7332	25 %	75 %	0 %	0 %	442556541
12	NC_020130	CATC	2	8	7518	7525	25 %	25 %	0 %	50 %	442556541
13	NC_020130	TCTA	2	8	7576	7583	25 %	50 %	0 %	25 %	442556541
14	NC_020130	ATTT	2	8	7694	7701	25 %	75 %	0 %	0 %	442556541
15	NC_020130	TGTC	2	8	8139	8146	0 %	50 %	25 %	25 %	442556542
16	NC_020130	TGTA	2	8	8598	8605	25 %	50 %	25 %	0 %	442556542
17	NC_020130	TGGG	2	8	8856	8863	0 %	25 %	75 %	0 %	442556542
18	NC_020130	TATT	2	8	8990	8997	25 %	75 %	0 %	0 %	442556542
19	NC_020130	GAAT	2	8	9006	9013	50 %	25 %	25 %	0 %	442556542
20	NC_020130	CAAA	2	8	9038	9045	75 %	0 %	0 %	25 %	442556542
21	NC_020130	TATG	2	8	10491	10498	25 %	50 %	25 %	0 %	442556543
22	NC_020130	AACA	2	8	10734	10741	75 %	0 %	0 %	25 %	442556543
23	NC_020130	AAAC	2	8	12009	12016	75 %	0 %	0 %	25 %	442556544
24	NC_020130	TAAG	2	8	12570	12577	50 %	25 %	25 %	0 %	442556544
25	NC_020130	ATGT	2	8	12784	12791	25 %	50 %	25 %	0 %	442556544
26	NC_020130	GTAA	2	8	12807	12814	50 %	25 %	25 %	0 %	442556544
27	NC_020130	TCCT	2	8	12979	12986	0 %	50 %	0 %	50 %	442556544
28	NC_020130	GGAC	2	8	13389	13396	25 %	0 %	50 %	25 %	442556544
29	NC_020130	AGAT	2	8	13924	13931	50 %	25 %	25 %	0 %	442556544
30	NC_020130	TAGA	2	8	14033	14040	50 %	25 %	25 %	0 %	442556544
31	NC_020130	AGAT	2	8	14152	14159	50 %	25 %	25 %	0 %	442556544
32	NC_020130	GGAT	2	8	14198	14205	25 %	25 %	50 %	0 %	442556544
33	NC_020130	TAAA	2	8	14605	14612	75 %	25 %	0 %	0 %	442556545
34	NC_020130	CCAT	2	8	15067	15074	25 %	25 %	0 %	50 %	442556545
35	NC_020130	ATTT	2	8	15098	15105	25 %	75 %	0 %	0 %	442556545
36	NC_020130	TTCA	2	8	15548	15555	25 %	50 %	0 %	25 %	442556546
37	NC_020130	TATC	2	8	15637	15644	25 %	50 %	0 %	25 %	442556546
38	NC_020130	GGCA	2	8	15892	15899	25 %	0 %	50 %	25 %	442556546
39	NC_020130	TTTG	2	8	16938	16945	0 %	75 %	25 %	0 %	442556547
40	NC_020130	GTAC	2	8	17954	17961	25 %	25 %	25 %	25 %	442556548
41	NC_020130	TGCT	2	8	17973	17980	0 %	50 %	25 %	25 %	442556548
42	NC_020130	TTCC	2	8	18456	18463	0 %	50 %	0 %	50 %	442556548
43	NC_020130	TAAC	2	8	18679	18686	50 %	25 %	0 %	25 %	442556549
44	NC_020130	TACA	2	8	18748	18755	50 %	25 %	0 %	25 %	442556549
45	NC_020130	AGTA	2	8	19052	19059	50 %	25 %	25 %	0 %	442556549
46	NC_020130	TTGT	2	8	19372	19379	0 %	75 %	25 %	0 %	442556549
47	NC_020130	CTTG	2	8	19732	19739	0 %	50 %	25 %	25 %	442556549
48	NC_020130	TTGT	2	8	20049	20056	0 %	75 %	25 %	0 %	442556550
49	NC_020130	ACAA	2	8	20112	20119	75 %	0 %	0 %	25 %	442556550
50	NC_020130	ATAA	2	8	20347	20354	75 %	25 %	0 %	0 %	442556550
51	NC_020130	GTAA	2	8	20521	20528	50 %	25 %	25 %	0 %	442556550
52	NC_020130	TTGT	2	8	20760	20767	0 %	75 %	25 %	0 %	442556550
53	NC_020130	TAAA	2	8	20768	20775	75 %	25 %	0 %	0 %	442556550
54	NC_020130	ATAA	2	8	20901	20908	75 %	25 %	0 %	0 %	442556550
55	NC_020130	TAGA	2	8	20966	20973	50 %	25 %	25 %	0 %	442556550
56	NC_020130	GATA	2	8	21114	21121	50 %	25 %	25 %	0 %	442556551
57	NC_020130	TCCA	2	8	21640	21647	25 %	25 %	0 %	50 %	442556551
58	NC_020130	TTTC	2	8	22013	22020	0 %	75 %	0 %	25 %	442556552
59	NC_020130	AAGT	2	8	22410	22417	50 %	25 %	25 %	0 %	442556553
60	NC_020130	CCAT	2	8	22695	22702	25 %	25 %	0 %	50 %	442556553
61	NC_020130	GATA	2	8	23374	23381	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
62	NC_020130	TGGT	2	8	23748	23755	0 %	50 %	50 %	0 %	442556554
63	NC_020130	TAAT	2	8	23914	23921	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
64	NC_020130	TAAA	2	8	24106	24113	75 %	25 %	0 %	0 %	442556554
65	NC_020130	TTTC	2	8	24350	24357	0 %	75 %	0 %	25 %	442556554
66	NC_020130	TAAG	3	12	24493	24504	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
67	NC_020130	AATA	2	8	24519	24526	75 %	25 %	0 %	0 %	442556554
68	NC_020130	AATG	2	8	24588	24595	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
69	NC_020130	TAAG	2	8	24606	24613	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
70	NC_020130	AAAG	2	8	24899	24906	75 %	0 %	25 %	0 %	442556554
71	NC_020130	CCAG	2	8	25161	25168	25 %	0 %	25 %	50 %	442556554
72	NC_020130	ATTG	2	8	25630	25637	25 %	50 %	25 %	0 %	442556554
73	NC_020130	ATCC	2	8	25768	25775	25 %	25 %	0 %	50 %	442556554
74	NC_020130	AGAA	2	8	25780	25787	75 %	0 %	25 %	0 %	442556554
75	NC_020130	ATAA	2	8	30311	30318	75 %	25 %	0 %	0 %	442556555
76	NC_020130	ATCC	2	8	30393	30400	25 %	25 %	0 %	50 %	442556555
77	NC_020130	GGTA	2	8	30758	30765	25 %	25 %	50 %	0 %	442556555
78	NC_020130	GATG	2	8	30885	30892	25 %	25 %	50 %	0 %	442556555
79	NC_020130	ATGT	2	8	31036	31043	25 %	50 %	25 %	0 %	442556555
80	NC_020130	GTAA	2	8	31457	31464	50 %	25 %	25 %	0 %	442556556
81	NC_020130	AGAA	2	8	32498	32505	75 %	0 %	25 %	0 %	442556557
82	NC_020130	GATA	2	8	33496	33503	50 %	25 %	25 %	0 %	442556558
83	NC_020130	TTTA	2	8	34459	34466	25 %	75 %	0 %	0 %	442556559
84	NC_020130	GTAT	2	8	34630	34637	25 %	50 %	25 %	0 %	442556559
85	NC_020130	ACAA	2	8	34753	34760	75 %	0 %	0 %	25 %	442556559
86	NC_020130	TCAA	2	8	35054	35061	50 %	25 %	0 %	25 %	442556559
87	NC_020130	AGAA	2	8	35351	35358	75 %	0 %	25 %	0 %	442556559
88	NC_020130	ATTT	2	8	35415	35422	25 %	75 %	0 %	0 %	442556559
89	NC_020130	CATA	2	8	35545	35552	50 %	25 %	0 %	25 %	442556559
90	NC_020130	CTAT	2	8	38551	38558	25 %	50 %	0 %	25 %	442556560
91	NC_020130	ATTT	2	8	38719	38726	25 %	75 %	0 %	0 %	442556560
92	NC_020130	GTTT	2	8	38895	38902	0 %	75 %	25 %	0 %	442556560
93	NC_020130	TAAA	2	8	39404	39411	75 %	25 %	0 %	0 %	442556560
94	NC_020130	ACAT	2	8	39570	39577	50 %	25 %	0 %	25 %	442556560
95	NC_020130	GTTT	2	8	39614	39621	0 %	75 %	25 %	0 %	442556561
96	NC_020130	AATT	2	8	39959	39966	50 %	50 %	0 %	0 %	442556561
97	NC_020130	GGAT	2	8	40734	40741	25 %	25 %	50 %	0 %	442556561
98	NC_020130	ATTT	2	8	41048	41055	25 %	75 %	0 %	0 %	442556561
99	NC_020130	TTTA	2	8	41333	41340	25 %	75 %	0 %	0 %	442556562
100	NC_020130	AAAG	2	8	41498	41505	75 %	0 %	25 %	0 %	442556562
101	NC_020130	GCTA	2	8	41656	41663	25 %	25 %	25 %	25 %	442556562
102	NC_020130	GCTT	2	8	43901	43908	0 %	50 %	25 %	25 %	442556563
103	NC_020130	TGCT	2	8	44764	44771	0 %	50 %	25 %	25 %	442556564
104	NC_020130	GTAG	2	8	44931	44938	25 %	25 %	50 %	0 %	442556564
105	NC_020130	TATT	2	8	45193	45200	25 %	75 %	0 %	0 %	442556564
106	NC_020130	AACA	2	8	47298	47305	75 %	0 %	0 %	25 %	442556566
107	NC_020130	AACC	2	8	47945	47952	50 %	0 %	0 %	50 %	442556566
108	NC_020130	ATGA	2	8	48188	48195	50 %	25 %	25 %	0 %	442556566
109	NC_020130	CAAA	2	8	48215	48222	75 %	0 %	0 %	25 %	442556566
110	NC_020130	AGAA	2	8	48979	48986	75 %	0 %	25 %	0 %	442556566
111	NC_020130	CATC	2	8	49454	49461	25 %	25 %	0 %	50 %	442556566
112	NC_020130	TCTA	2	8	50614	50621	25 %	50 %	0 %	25 %	442556566
113	NC_020130	AGCA	2	8	50821	50828	50 %	0 %	25 %	25 %	442556566
114	NC_020130	ACAA	2	8	51004	51011	75 %	0 %	0 %	25 %	442556566
115	NC_020130	ATTT	2	8	52227	52234	25 %	75 %	0 %	0 %	442556567
116	NC_020130	CAAT	2	8	52609	52616	50 %	25 %	0 %	25 %	442556567
117	NC_020130	TTCA	2	8	52885	52892	25 %	50 %	0 %	25 %	442556567
118	NC_020130	AAAT	2	8	53195	53202	75 %	25 %	0 %	0 %	442556567
119	NC_020130	GAAA	2	8	53557	53564	75 %	0 %	25 %	0 %	442556568
120	NC_020130	GTAA	2	8	53952	53959	50 %	25 %	25 %	0 %	442556568
121	NC_020130	TGTT	2	8	54237	54244	0 %	75 %	25 %	0 %	442556568
122	NC_020130	TACA	2	8	55491	55498	50 %	25 %	0 %	25 %	442556568
123	NC_020130	TATG	2	8	55552	55559	25 %	50 %	25 %	0 %	442556568
124	NC_020130	TCTG	2	8	56086	56093	0 %	50 %	25 %	25 %	442556569
125	NC_020130	TTTC	2	8	56121	56128	0 %	75 %	0 %	25 %	442556569
126	NC_020130	TGTA	2	8	56262	56269	25 %	50 %	25 %	0 %	442556569
127	NC_020130	AGTA	2	8	56407	56414	50 %	25 %	25 %	0 %	442556569
128	NC_020130	AATT	2	8	57430	57437	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
129	NC_020130	TGTA	2	8	57452	57459	25 %	50 %	25 %	0 %	442556569
130	NC_020130	AAAT	2	8	57609	57616	75 %	25 %	0 %	0 %	442556569
131	NC_020130	AATA	2	8	60343	60350	75 %	25 %	0 %	0 %	442556570
132	NC_020130	CATT	2	8	60443	60450	25 %	50 %	0 %	25 %	442556570
133	NC_020130	AACT	2	8	60758	60765	50 %	25 %	0 %	25 %	442556570
134	NC_020130	CTTT	2	8	61225	61232	0 %	75 %	0 %	25 %	442556570
135	NC_020130	CTTT	2	8	61261	61268	0 %	75 %	0 %	25 %	442556570
136	NC_020130	GATG	2	8	61648	61655	25 %	25 %	50 %	0 %	442556570
137	NC_020130	ATAC	2	8	61901	61908	50 %	25 %	0 %	25 %	442556570
138	NC_020130	TCTT	2	8	62241	62248	0 %	75 %	0 %	25 %	442556570
139	NC_020130	GAAA	2	8	62362	62369	75 %	0 %	25 %	0 %	442556570
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