MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 2

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020129	TCAACC	2	12	11381	11392	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	442556515
2	NC_020129	TATTAA	2	12	11650	11661	50 %	50 %	0 %	0 %	442556515
3	NC_020129	AGCAAA	2	12	11996	12007	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	442556515
4	NC_020129	TACCAG	2	12	13576	13587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	442556516
5	NC_020129	ATTGCA	2	12	15447	15458	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442556517
6	NC_020129	CATAAA	2	12	15906	15917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	442556518
7	NC_020129	TTTTGT	2	12	19031	19042	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	442556521
8	NC_020129	TTTTTG	2	12	19757	19768	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	442556522
9	NC_020129	TAGATA	2	12	22898	22909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442556525
10	NC_020129	ATATTT	2	12	24233	24244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556526
11	NC_020129	TGAAGA	2	12	24432	24443	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	442556526
12	NC_020129	AAATTT	2	12	25994	26005	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
13	NC_020129	GAAAAA	2	12	34944	34955	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442556531
14	NC_020129	TAGTAA	2	12	35193	35204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442556531
15	NC_020129	GATAAA	2	12	35803	35814	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442556531
16	NC_020129	GAAAAA	2	12	37155	37166	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442556532
17	NC_020129	TTAACA	2	12	37338	37349	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	442556532
18	NC_020129	AGCATT	2	12	38761	38772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442556533
19	NC_020129	GACTAT	2	12	39041	39052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442556533
20	NC_020129	TAAAAG	2	12	39216	39227	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442556533

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.