MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 2

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020129	ACAAA	2	10	1099	1108	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020129	TAAAA	2	10	2570	2579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020129	TATTG	2	10	8154	8163	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020129	CAATT	2	10	10250	10259	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020129	TACAT	2	10	19342	19351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020129	ATAAA	2	10	19384	19393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020129	GTTAT	2	10	20664	20673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020129	ATTAA	2	10	27371	27380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020129	ATTAA	2	10	27399	27408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020129	ATTAT	2	10	27428	27437	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020129	AATTA	2	10	29276	29285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020129	ATCAA	2	10	29574	29583	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_020129	TATAA	2	10	29686	29695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020129	TTCCC	2	10	29941	29950	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_020129	TATAT	2	10	30898	30907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020129	AATAG	2	10	31755	31764	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020129	AACAA	2	10	32868	32877	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020129	TAATA	2	10	33325	33334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020129	AGCTA	2	10	33470	33479	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020129	TAAAT	2	10	33511	33520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020129	TATTT	2	10	36742	36751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020129	GGATA	2	10	36871	36880	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020129	ATATA	2	10	38531	38540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.