MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 2

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020129	GTTAT	2	10	936	945	20 %	60 %	20 %	0 %	442556510
2	NC_020129	TTTAT	2	10	974	983	20 %	80 %	0 %	0 %	442556510
3	NC_020129	AAAAG	2	10	3437	3446	80 %	0 %	20 %	0 %	442556512
4	NC_020129	TTTGC	2	10	5825	5834	0 %	60 %	20 %	20 %	442556513
5	NC_020129	TAAGG	2	10	6685	6694	40 %	20 %	40 %	0 %	442556513
6	NC_020129	ATTAT	2	10	7901	7910	40 %	60 %	0 %	0 %	442556513
7	NC_020129	TGTAT	2	10	9056	9065	20 %	60 %	20 %	0 %	442556514
8	NC_020129	CTATG	2	10	9207	9216	20 %	40 %	20 %	20 %	442556514
9	NC_020129	AAGTA	2	10	9418	9427	60 %	20 %	20 %	0 %	442556514
10	NC_020129	CTTTT	2	10	10623	10632	0 %	80 %	0 %	20 %	442556515
11	NC_020129	AAAGT	2	10	11860	11869	60 %	20 %	20 %	0 %	442556515
12	NC_020129	GGCTT	2	10	11922	11931	0 %	40 %	40 %	20 %	442556515
13	NC_020129	TGTCC	2	10	13647	13656	0 %	40 %	20 %	40 %	442556516
14	NC_020129	ATGGA	2	10	13803	13812	40 %	20 %	40 %	0 %	442556516
15	NC_020129	AGTAT	2	10	14243	14252	40 %	40 %	20 %	0 %	442556516
16	NC_020129	TTGCA	2	10	15643	15652	20 %	40 %	20 %	20 %	442556518
17	NC_020129	TTTTA	2	10	15715	15724	20 %	80 %	0 %	0 %	442556518
18	NC_020129	TAATT	2	10	16139	16148	40 %	60 %	0 %	0 %	442556518
19	NC_020129	TTTTA	2	10	16657	16666	20 %	80 %	0 %	0 %	442556519
20	NC_020129	AAAAT	2	10	20018	20027	80 %	20 %	0 %	0 %	442556522
21	NC_020129	TGATA	2	10	20073	20082	40 %	40 %	20 %	0 %	442556522
22	NC_020129	AGAAA	2	10	20529	20538	80 %	0 %	20 %	0 %	442556522
23	NC_020129	GTCTT	2	10	21488	21497	0 %	60 %	20 %	20 %	442556523
24	NC_020129	ATGAA	2	10	22049	22058	60 %	20 %	20 %	0 %	442556524
25	NC_020129	TACAT	2	10	22125	22134	40 %	40 %	0 %	20 %	442556524
26	NC_020129	TACAC	2	10	22372	22381	40 %	20 %	0 %	40 %	442556524
27	NC_020129	AAATG	2	10	23001	23010	60 %	20 %	20 %	0 %	442556525
28	NC_020129	AGAAA	2	10	24923	24932	80 %	0 %	20 %	0 %	442556527
29	NC_020129	TGTAA	2	10	25283	25292	40 %	40 %	20 %	0 %	442556527
30	NC_020129	AAATA	2	10	27694	27703	80 %	20 %	0 %	0 %	442556529
31	NC_020129	ATAAA	2	10	27821	27830	80 %	20 %	0 %	0 %	442556529
32	NC_020129	ATTTT	2	10	37771	37780	20 %	80 %	0 %	0 %	442556532
33	NC_020129	AACTT	2	10	38867	38876	40 %	40 %	0 %	20 %	442556533

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.