MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 2

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020129	TTTG	2	8	47	54	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020129	AATT	2	8	92	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020129	AACT	2	8	165	172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020129	TAGT	2	8	304	311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020129	TAAA	2	8	1052	1059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020129	CAAT	2	8	1285	1292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020129	ATTA	2	8	1477	1484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020129	TAAT	2	8	1502	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020129	CAAT	2	8	1851	1858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020129	TAAT	2	8	2170	2177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020129	ATTT	2	8	2671	2678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020129	TAGA	2	8	3966	3973	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020129	ATAA	2	8	4210	4217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020129	AATT	2	8	4218	4225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020129	ATGT	2	8	4688	4695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020129	TAAA	2	8	4699	4706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020129	TTAC	2	8	8059	8066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020129	TTAG	2	8	8087	8094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020129	TAAA	2	8	8096	8103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020129	TAAA	2	8	8259	8266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020129	ATAA	2	8	8307	8314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020129	AGAT	2	8	9724	9731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020129	TTTA	2	8	9954	9961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020129	ATCT	2	8	10161	10168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020129	ACAT	2	8	10318	10325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020129	CATA	2	8	10402	10409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020129	AATC	2	8	16511	16518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020129	CATA	2	8	27547	27554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020129	TCTT	2	8	28926	28933	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020129	TAAT	2	8	29423	29430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020129	CTAA	2	8	29472	29479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020129	CTAA	2	8	29660	29667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020129	TAGA	2	8	29885	29892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020129	TCAT	2	8	29972	29979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020129	AATA	2	8	30113	30120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020129	TATT	2	8	30146	30153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020129	GATA	2	8	30294	30301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020129	TTAT	2	8	30319	30326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020129	CTTT	2	8	30799	30806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020129	TACT	2	8	31144	31151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020129	TTGA	2	8	32011	32018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020129	AATA	2	8	32260	32267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020129	CTGT	2	8	32349	32356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020129	TTCT	2	8	32362	32369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020129	AAAG	2	8	32733	32740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020129	AGCA	2	8	32804	32811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020129	ATAA	2	8	32878	32885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020129	AATA	2	8	33182	33189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020129	AGAA	2	8	33566	33573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020129	TATT	2	8	33597	33604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020129	ACTA	2	8	33611	33618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020129	TAAT	2	8	33619	33626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020129	ATTA	2	8	38151	38158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020129	TAAT	2	8	38273	38280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020129	ATTT	2	8	38379	38386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020129	CTAA	2	8	38415	38422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020129	GTAC	2	8	38608	38615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.