MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 2

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020129	CT	3	6	2321	2326	0 %	50 %	0 %	50 %	442556511
2	NC_020129	TA	3	6	3621	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	442556512
3	NC_020129	GT	3	6	5090	5095	0 %	50 %	50 %	0 %	442556513
4	NC_020129	AT	3	6	5157	5162	50 %	50 %	0 %	0 %	442556513
5	NC_020129	AT	3	6	5193	5198	50 %	50 %	0 %	0 %	442556513
6	NC_020129	AT	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	442556513
7	NC_020129	GA	3	6	6117	6122	50 %	0 %	50 %	0 %	442556513
8	NC_020129	GT	3	6	6960	6965	0 %	50 %	50 %	0 %	442556513
9	NC_020129	AT	3	6	9239	9244	50 %	50 %	0 %	0 %	442556514
10	NC_020129	AT	4	8	10470	10477	50 %	50 %	0 %	0 %	442556515
11	NC_020129	TA	4	8	12467	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	442556515
12	NC_020129	TC	3	6	12524	12529	0 %	50 %	0 %	50 %	442556515
13	NC_020129	TG	3	6	13252	13257	0 %	50 %	50 %	0 %	442556516
14	NC_020129	AT	3	6	13375	13380	50 %	50 %	0 %	0 %	442556516
15	NC_020129	AT	3	6	13839	13844	50 %	50 %	0 %	0 %	442556516
16	NC_020129	AT	3	6	14089	14094	50 %	50 %	0 %	0 %	442556516
17	NC_020129	TA	3	6	14310	14315	50 %	50 %	0 %	0 %	442556516
18	NC_020129	TA	3	6	14470	14475	50 %	50 %	0 %	0 %	442556516
19	NC_020129	CA	3	6	14686	14691	50 %	0 %	0 %	50 %	442556516
20	NC_020129	AT	3	6	14943	14948	50 %	50 %	0 %	0 %	442556517
21	NC_020129	AT	3	6	15232	15237	50 %	50 %	0 %	0 %	442556517
22	NC_020129	AT	7	14	16240	16253	50 %	50 %	0 %	0 %	442556518
23	NC_020129	AT	3	6	16341	16346	50 %	50 %	0 %	0 %	442556518
24	NC_020129	AT	3	6	17343	17348	50 %	50 %	0 %	0 %	442556519
25	NC_020129	TA	3	6	17512	17517	50 %	50 %	0 %	0 %	442556519
26	NC_020129	TG	3	6	17543	17548	0 %	50 %	50 %	0 %	442556519
27	NC_020129	TA	3	6	17614	17619	50 %	50 %	0 %	0 %	442556519
28	NC_020129	TA	3	6	18784	18789	50 %	50 %	0 %	0 %	442556521
29	NC_020129	AT	3	6	19614	19619	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
30	NC_020129	AT	3	6	19676	19681	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
31	NC_020129	CA	3	6	20150	20155	50 %	0 %	0 %	50 %	442556522
32	NC_020129	AT	3	6	20170	20175	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
33	NC_020129	TA	3	6	20599	20604	50 %	50 %	0 %	0 %	442556522
34	NC_020129	CA	3	6	20813	20818	50 %	0 %	0 %	50 %	442556523
35	NC_020129	CT	3	6	21195	21200	0 %	50 %	0 %	50 %	442556523
36	NC_020129	AT	4	8	21218	21225	50 %	50 %	0 %	0 %	442556523
37	NC_020129	TA	3	6	22523	22528	50 %	50 %	0 %	0 %	442556524
38	NC_020129	TC	3	6	22632	22637	0 %	50 %	0 %	50 %	442556525
39	NC_020129	TC	3	6	23828	23833	0 %	50 %	0 %	50 %	442556526
40	NC_020129	TA	7	14	24909	24922	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
41	NC_020129	TA	3	6	24980	24985	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
42	NC_020129	TA	3	6	25152	25157	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
43	NC_020129	AT	3	6	25350	25355	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
44	NC_020129	AT	3	6	25488	25493	50 %	50 %	0 %	0 %	442556527
45	NC_020129	TC	3	6	25572	25577	0 %	50 %	0 %	50 %	442556527
46	NC_020129	AT	7	14	26527	26540	50 %	50 %	0 %	0 %	442556528
47	NC_020129	TA	3	6	27841	27846	50 %	50 %	0 %	0 %	442556529
48	NC_020129	TA	4	8	28282	28289	50 %	50 %	0 %	0 %	442556529
49	NC_020129	TA	3	6	28467	28472	50 %	50 %	0 %	0 %	442556529
50	NC_020129	AC	3	6	28522	28527	50 %	0 %	0 %	50 %	442556529
51	NC_020129	TA	4	8	28672	28679	50 %	50 %	0 %	0 %	442556529
52	NC_020129	AT	6	12	33762	33773	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
53	NC_020129	GA	3	6	34513	34518	50 %	0 %	50 %	0 %	442556531
54	NC_020129	TC	4	8	35779	35786	0 %	50 %	0 %	50 %	442556531
55	NC_020129	TC	3	6	35886	35891	0 %	50 %	0 %	50 %	442556531
56	NC_020129	AT	3	6	35934	35939	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
57	NC_020129	AT	3	6	36034	36039	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
58	NC_020129	CT	3	6	36042	36047	0 %	50 %	0 %	50 %	442556531
59	NC_020129	AT	3	6	36099	36104	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
60	NC_020129	AT	3	6	36284	36289	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
61	NC_020129	TA	3	6	37468	37473	50 %	50 %	0 %	0 %	442556532
62	NC_020129	AT	3	6	39383	39388	50 %	50 %	0 %	0 %	442556533
63	NC_020129	AT	3	6	39794	39799	50 %	50 %	0 %	0 %	442556534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.