MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 2

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020129	A	6	6	2536	2541	100 %	0 %	0 %	0 %	442556511
2	NC_020129	T	6	6	2542	2547	0 %	100 %	0 %	0 %	442556511
3	NC_020129	A	7	7	3452	3458	100 %	0 %	0 %	0 %	442556512
4	NC_020129	T	6	6	3670	3675	0 %	100 %	0 %	0 %	442556512
5	NC_020129	A	8	8	3718	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	442556512
6	NC_020129	T	6	6	5687	5692	0 %	100 %	0 %	0 %	442556513
7	NC_020129	T	7	7	7240	7246	0 %	100 %	0 %	0 %	442556513
8	NC_020129	A	7	7	7747	7753	100 %	0 %	0 %	0 %	442556513
9	NC_020129	A	6	6	7801	7806	100 %	0 %	0 %	0 %	442556513
10	NC_020129	T	6	6	7824	7829	0 %	100 %	0 %	0 %	442556513
11	NC_020129	A	6	6	7846	7851	100 %	0 %	0 %	0 %	442556513
12	NC_020129	T	6	6	8420	8425	0 %	100 %	0 %	0 %	442556514
13	NC_020129	T	6	6	8806	8811	0 %	100 %	0 %	0 %	442556514
14	NC_020129	T	6	6	8883	8888	0 %	100 %	0 %	0 %	442556514
15	NC_020129	A	6	6	9120	9125	100 %	0 %	0 %	0 %	442556514
16	NC_020129	T	8	8	9312	9319	0 %	100 %	0 %	0 %	442556514
17	NC_020129	C	6	6	9345	9350	0 %	0 %	0 %	100 %	442556514
18	NC_020129	A	7	7	9443	9449	100 %	0 %	0 %	0 %	442556514
19	NC_020129	T	7	7	9483	9489	0 %	100 %	0 %	0 %	442556514
20	NC_020129	A	8	8	9492	9499	100 %	0 %	0 %	0 %	442556514
21	NC_020129	T	6	6	10857	10862	0 %	100 %	0 %	0 %	442556515
22	NC_020129	A	6	6	10961	10966	100 %	0 %	0 %	0 %	442556515
23	NC_020129	A	6	6	10998	11003	100 %	0 %	0 %	0 %	442556515
24	NC_020129	T	6	6	11248	11253	0 %	100 %	0 %	0 %	442556515
25	NC_020129	T	6	6	11902	11907	0 %	100 %	0 %	0 %	442556515
26	NC_020129	T	7	7	12626	12632	0 %	100 %	0 %	0 %	442556515
27	NC_020129	T	6	6	12808	12813	0 %	100 %	0 %	0 %	442556516
28	NC_020129	T	7	7	13105	13111	0 %	100 %	0 %	0 %	442556516
29	NC_020129	G	7	7	14753	14759	0 %	0 %	100 %	0 %	442556517
30	NC_020129	A	6	6	15102	15107	100 %	0 %	0 %	0 %	442556517
31	NC_020129	A	6	6	15244	15249	100 %	0 %	0 %	0 %	442556517
32	NC_020129	T	7	7	15260	15266	0 %	100 %	0 %	0 %	442556517
33	NC_020129	T	8	8	15328	15335	0 %	100 %	0 %	0 %	442556517
34	NC_020129	A	7	7	15359	15365	100 %	0 %	0 %	0 %	442556517
35	NC_020129	A	7	7	15699	15705	100 %	0 %	0 %	0 %	442556518
36	NC_020129	T	7	7	15897	15903	0 %	100 %	0 %	0 %	442556518
37	NC_020129	A	6	6	15915	15920	100 %	0 %	0 %	0 %	442556518
38	NC_020129	T	8	8	16284	16291	0 %	100 %	0 %	0 %	442556518
39	NC_020129	T	8	8	16417	16424	0 %	100 %	0 %	0 %	442556518
40	NC_020129	T	6	6	16451	16456	0 %	100 %	0 %	0 %	442556518
41	NC_020129	A	6	6	16457	16462	100 %	0 %	0 %	0 %	442556518
42	NC_020129	T	8	8	16472	16479	0 %	100 %	0 %	0 %	442556518
43	NC_020129	T	6	6	16997	17002	0 %	100 %	0 %	0 %	442556519
44	NC_020129	T	6	6	17096	17101	0 %	100 %	0 %	0 %	442556519
45	NC_020129	T	7	7	17215	17221	0 %	100 %	0 %	0 %	442556519
46	NC_020129	T	8	8	17594	17601	0 %	100 %	0 %	0 %	442556519
47	NC_020129	A	6	6	18235	18240	100 %	0 %	0 %	0 %	442556520
48	NC_020129	T	6	6	19049	19054	0 %	100 %	0 %	0 %	442556521
49	NC_020129	A	6	6	19075	19080	100 %	0 %	0 %	0 %	442556521
50	NC_020129	A	7	7	19747	19753	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
51	NC_020129	A	7	7	19992	19998	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
52	NC_020129	A	6	6	20062	20067	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
53	NC_020129	T	7	7	20090	20096	0 %	100 %	0 %	0 %	442556522
54	NC_020129	A	6	6	20390	20395	100 %	0 %	0 %	0 %	442556522
55	NC_020129	T	6	6	20505	20510	0 %	100 %	0 %	0 %	442556522
56	NC_020129	T	6	6	20630	20635	0 %	100 %	0 %	0 %	442556522
57	NC_020129	T	6	6	21228	21233	0 %	100 %	0 %	0 %	442556523
58	NC_020129	G	13	13	21249	21261	0 %	0 %	100 %	0 %	442556523
59	NC_020129	A	6	6	22510	22515	100 %	0 %	0 %	0 %	442556524
60	NC_020129	G	10	10	22810	22819	0 %	0 %	100 %	0 %	442556525
61	NC_020129	A	8	8	22956	22963	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
62	NC_020129	A	6	6	23180	23185	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
63	NC_020129	A	6	6	23394	23399	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
64	NC_020129	A	6	6	23462	23467	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
65	NC_020129	A	6	6	23505	23510	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
66	NC_020129	A	6	6	23621	23626	100 %	0 %	0 %	0 %	442556525
67	NC_020129	A	6	6	24930	24935	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
68	NC_020129	A	6	6	24997	25002	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
69	NC_020129	A	6	6	25160	25165	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
70	NC_020129	A	6	6	25230	25235	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
71	NC_020129	A	6	6	25670	25675	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
72	NC_020129	A	7	7	25841	25847	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
73	NC_020129	A	6	6	26057	26062	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
74	NC_020129	A	6	6	26158	26163	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
75	NC_020129	A	7	7	26197	26203	100 %	0 %	0 %	0 %	442556527
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79	NC_020129	A	6	6	27828	27833	100 %	0 %	0 %	0 %	442556529
80	NC_020129	A	6	6	28164	28169	100 %	0 %	0 %	0 %	442556529
81	NC_020129	A	6	6	28252	28257	100 %	0 %	0 %	0 %	442556529
82	NC_020129	A	6	6	28508	28513	100 %	0 %	0 %	0 %	442556529
83	NC_020129	A	6	6	31346	31351	100 %	0 %	0 %	0 %	442556530
84	NC_020129	A	6	6	31653	31658	100 %	0 %	0 %	0 %	442556530
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87	NC_020129	A	7	7	33971	33977	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
88	NC_020129	A	8	8	34032	34039	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
89	NC_020129	A	8	8	34046	34053	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
90	NC_020129	A	8	8	34077	34084	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
91	NC_020129	A	6	6	34219	34224	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
92	NC_020129	A	8	8	34250	34257	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
93	NC_020129	A	6	6	34272	34277	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
94	NC_020129	A	6	6	34366	34371	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
95	NC_020129	A	6	6	34415	34420	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
96	NC_020129	A	6	6	34473	34478	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
97	NC_020129	A	7	7	34518	34524	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
98	NC_020129	A	6	6	34626	34631	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
99	NC_020129	A	7	7	34659	34665	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
100	NC_020129	A	6	6	34671	34676	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
101	NC_020129	A	7	7	34751	34757	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
102	NC_020129	A	7	7	34807	34813	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
103	NC_020129	A	7	7	34937	34943	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
104	NC_020129	A	7	7	34968	34974	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
105	NC_020129	T	6	6	35058	35063	0 %	100 %	0 %	0 %	442556531
106	NC_020129	A	6	6	35458	35463	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
107	NC_020129	T	6	6	35498	35503	0 %	100 %	0 %	0 %	442556531
108	NC_020129	T	7	7	35685	35691	0 %	100 %	0 %	0 %	442556531
109	NC_020129	A	6	6	35995	36000	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
110	NC_020129	T	8	8	36330	36337	0 %	100 %	0 %	0 %	442556531
111	NC_020129	A	6	6	36354	36359	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
112	NC_020129	A	6	6	36361	36366	100 %	0 %	0 %	0 %	442556531
113	NC_020129	A	8	8	37030	37037	100 %	0 %	0 %	0 %	442556532
114	NC_020129	A	6	6	37141	37146	100 %	0 %	0 %	0 %	442556532
115	NC_020129	A	7	7	37148	37154	100 %	0 %	0 %	0 %	442556532
116	NC_020129	A	8	8	37228	37235	100 %	0 %	0 %	0 %	442556532
117	NC_020129	A	7	7	37331	37337	100 %	0 %	0 %	0 %	442556532
118	NC_020129	A	6	6	37498	37503	100 %	0 %	0 %	0 %	442556532
119	NC_020129	A	6	6	37529	37534	100 %	0 %	0 %	0 %	442556532
120	NC_020129	A	7	7	37691	37697	100 %	0 %	0 %	0 %	442556532
121	NC_020129	A	7	7	38012	38018	100 %	0 %	0 %	0 %	442556532
122	NC_020129	A	7	7	38929	38935	100 %	0 %	0 %	0 %	442556533
123	NC_020129	A	6	6	39476	39481	100 %	0 %	0 %	0 %	442556534
124	NC_020129	A	6	6	39680	39685	100 %	0 %	0 %	0 %	442556534
125	NC_020129	A	7	7	39821	39827	100 %	0 %	0 %	0 %	442556534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.