MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1

Total Repeats: 14

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020128	TATTTT	2	12	4920	4931	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442556484
2	NC_020128	TATTAG	2	12	5353	5364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020128	ATATTA	2	12	5528	5539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020128	ATATTA	2	12	8516	8527	50 %	50 %	0 %	0 %	442556488
5	NC_020128	TCCCCC	2	12	11707	11718	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	442556491
6	NC_020128	AAAACT	2	12	12949	12960	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020128	TTTTAA	2	12	17573	17584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020128	AACTCC	2	12	17637	17648	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	442556496
9	NC_020128	TATATT	2	12	17934	17945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556496
10	NC_020128	AATTAT	2	12	20799	20810	50 %	50 %	0 %	0 %	442556501
11	NC_020128	ACCATC	2	12	21628	21639	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	442556502
12	NC_020128	TATATG	2	12	23726	23737	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442556505
13	NC_020128	TTTTTC	2	12	24476	24487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	442556506
14	NC_020128	TCTAAA	2	12	27018	27029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.