MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020128	TGTTA	2	10	546	555	20 %	60 %	20 %	0 %	442556481
2	NC_020128	TTATA	2	10	1813	1822	40 %	60 %	0 %	0 %	442556482
3	NC_020128	TAAAA	2	10	4101	4110	80 %	20 %	0 %	0 %	442556484
4	NC_020128	ATAAC	2	10	4177	4186	60 %	20 %	0 %	20 %	442556484
5	NC_020128	AAAGA	2	10	5317	5326	80 %	0 %	20 %	0 %	442556484
6	NC_020128	AAAAG	2	10	6074	6083	80 %	0 %	20 %	0 %	442556485
7	NC_020128	GTAAA	2	10	7093	7102	60 %	20 %	20 %	0 %	442556486
8	NC_020128	AGAAA	2	10	11461	11470	80 %	0 %	20 %	0 %	442556491
9	NC_020128	ATTTT	2	10	11587	11596	20 %	80 %	0 %	0 %	442556491
10	NC_020128	AGGAA	2	10	13437	13446	60 %	0 %	40 %	0 %	442556493
11	NC_020128	TCCTT	2	10	14484	14493	0 %	60 %	0 %	40 %	442556494
12	NC_020128	TTTGA	2	10	15018	15027	20 %	60 %	20 %	0 %	442556494
13	NC_020128	AAATT	2	10	15102	15111	60 %	40 %	0 %	0 %	442556494
14	NC_020128	AACAA	2	10	17252	17261	80 %	0 %	0 %	20 %	442556495
15	NC_020128	AGTAA	2	10	17361	17370	60 %	20 %	20 %	0 %	442556495
16	NC_020128	TCTTT	2	10	18572	18581	0 %	80 %	0 %	20 %	442556498
17	NC_020128	GTTTT	2	10	20652	20661	0 %	80 %	20 %	0 %	442556501
18	NC_020128	GATAA	2	10	21342	21351	60 %	20 %	20 %	0 %	442556502
19	NC_020128	AGAAA	2	10	21482	21491	80 %	0 %	20 %	0 %	442556502
20	NC_020128	ATTCC	2	10	24059	24068	20 %	40 %	0 %	40 %	442556505
21	NC_020128	GCATT	2	10	25211	25220	20 %	40 %	20 %	20 %	442556506
22	NC_020128	ATGTT	2	10	25303	25312	20 %	60 %	20 %	0 %	442556506
23	NC_020128	CTTTT	2	10	25510	25519	0 %	80 %	0 %	20 %	442556506
24	NC_020128	ATTTT	2	10	26347	26356	20 %	80 %	0 %	0 %	442556507

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.