MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020128	TTTA	2	8	258	265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020128	ATAA	2	8	2184	2191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020128	ATCA	2	8	2302	2309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020128	GAAA	2	8	2456	2463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020128	CTTT	2	8	2526	2533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020128	GTAA	2	8	2562	2569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020128	TAAA	2	8	3301	3308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020128	GGTA	2	8	3331	3338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020128	TAAA	2	8	5440	5447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020128	CTAA	2	8	5513	5520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020128	AATA	2	8	5565	5572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020128	AAAG	2	8	5726	5733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020128	GAAG	2	8	6569	6576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020128	TTTA	2	8	10682	10689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020128	TAAA	2	8	10874	10881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020128	TAAC	2	8	12935	12942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020128	ATTA	2	8	12963	12970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020128	ATAA	2	8	13027	13034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020128	TAAA	2	8	13070	13077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020128	AACT	2	8	13965	13972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020128	ATAG	2	8	15242	15249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020128	CTAT	2	8	15284	15291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020128	AGAA	2	8	15435	15442	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020128	TAAT	2	8	15844	15851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020128	CTAT	2	8	20045	20052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020128	TAAT	2	8	21992	21999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020128	AATA	2	8	22744	22751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020128	TAAA	2	8	26786	26793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020128	TAAA	3	12	26831	26842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020128	TAAA	2	8	26880	26887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020128	TAAA	2	8	26921	26928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.