MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020128	AT	3	6	297	302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020128	AT	3	6	320	325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020128	AT	3	6	733	738	50 %	50 %	0 %	0 %	442556481
4	NC_020128	AT	3	6	1657	1662	50 %	50 %	0 %	0 %	442556482
5	NC_020128	AT	3	6	2028	2033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020128	AT	3	6	2151	2156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020128	TA	3	6	2215	2220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020128	AT	3	6	2539	2544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020128	AT	3	6	3049	3054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020128	TC	3	6	3774	3779	0 %	50 %	0 %	50 %	442556484
11	NC_020128	AT	3	6	3886	3891	50 %	50 %	0 %	0 %	442556484
12	NC_020128	TC	3	6	3961	3966	0 %	50 %	0 %	50 %	442556484
13	NC_020128	AT	3	6	4084	4089	50 %	50 %	0 %	0 %	442556484
14	NC_020128	GA	3	6	4655	4660	50 %	0 %	50 %	0 %	442556484
15	NC_020128	TA	3	6	5041	5046	50 %	50 %	0 %	0 %	442556484
16	NC_020128	TA	3	6	5367	5372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020128	AT	3	6	5399	5404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020128	TA	3	6	5419	5424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020128	AT	4	8	5656	5663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020128	TA	3	6	6354	6359	50 %	50 %	0 %	0 %	442556485
21	NC_020128	AT	3	6	6458	6463	50 %	50 %	0 %	0 %	442556485
22	NC_020128	AT	3	6	6674	6679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020128	TA	7	14	6787	6800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020128	AG	3	6	6848	6853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020128	AT	4	8	7251	7258	50 %	50 %	0 %	0 %	442556486
26	NC_020128	AT	3	6	7958	7963	50 %	50 %	0 %	0 %	442556487
27	NC_020128	AT	3	6	8687	8692	50 %	50 %	0 %	0 %	442556488
28	NC_020128	AT	3	6	8987	8992	50 %	50 %	0 %	0 %	442556488
29	NC_020128	AT	3	6	9041	9046	50 %	50 %	0 %	0 %	442556488
30	NC_020128	AT	3	6	9051	9056	50 %	50 %	0 %	0 %	442556488
31	NC_020128	AT	3	6	9116	9121	50 %	50 %	0 %	0 %	442556488
32	NC_020128	GT	3	6	9274	9279	0 %	50 %	50 %	0 %	442556488
33	NC_020128	AG	3	6	9543	9548	50 %	0 %	50 %	0 %	442556488
34	NC_020128	TA	4	8	9690	9697	50 %	50 %	0 %	0 %	442556489
35	NC_020128	AT	3	6	9723	9728	50 %	50 %	0 %	0 %	442556489
36	NC_020128	AT	3	6	10212	10217	50 %	50 %	0 %	0 %	442556489
37	NC_020128	AT	3	6	11071	11076	50 %	50 %	0 %	0 %	442556490
38	NC_020128	TA	3	6	11290	11295	50 %	50 %	0 %	0 %	442556490
39	NC_020128	AT	3	6	11357	11362	50 %	50 %	0 %	0 %	442556490
40	NC_020128	AT	4	8	11493	11500	50 %	50 %	0 %	0 %	442556491
41	NC_020128	TA	3	6	11744	11749	50 %	50 %	0 %	0 %	442556491
42	NC_020128	AT	3	6	11802	11807	50 %	50 %	0 %	0 %	442556491
43	NC_020128	AT	3	6	12022	12027	50 %	50 %	0 %	0 %	442556491
44	NC_020128	AT	3	6	12056	12061	50 %	50 %	0 %	0 %	442556491
45	NC_020128	TG	3	6	12734	12739	0 %	50 %	50 %	0 %	442556492
46	NC_020128	AT	7	14	12773	12786	50 %	50 %	0 %	0 %	442556492
47	NC_020128	TA	3	6	13078	13083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020128	TA	3	6	13085	13090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020128	TA	7	14	13727	13740	50 %	50 %	0 %	0 %	442556493
50	NC_020128	GT	3	6	13758	13763	0 %	50 %	50 %	0 %	442556493
51	NC_020128	AT	3	6	13816	13821	50 %	50 %	0 %	0 %	442556493
52	NC_020128	AT	3	6	13851	13856	50 %	50 %	0 %	0 %	442556493
53	NC_020128	TA	3	6	14025	14030	50 %	50 %	0 %	0 %	442556494
54	NC_020128	CA	3	6	14350	14355	50 %	0 %	0 %	50 %	442556494
55	NC_020128	TA	7	14	14625	14638	50 %	50 %	0 %	0 %	442556494
56	NC_020128	AT	3	6	14975	14980	50 %	50 %	0 %	0 %	442556494
57	NC_020128	AT	3	6	15566	15571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020128	AT	3	6	15656	15661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020128	TA	3	6	16064	16069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020128	TC	3	6	16110	16115	0 %	50 %	0 %	50 %	442556495
61	NC_020128	AT	3	6	16218	16223	50 %	50 %	0 %	0 %	442556495
62	NC_020128	AT	3	6	16288	16293	50 %	50 %	0 %	0 %	442556495
63	NC_020128	AT	3	6	16827	16832	50 %	50 %	0 %	0 %	442556495
64	NC_020128	TA	3	6	17069	17074	50 %	50 %	0 %	0 %	442556495
65	NC_020128	TA	3	6	17832	17837	50 %	50 %	0 %	0 %	442556496
66	NC_020128	TA	3	6	18958	18963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020128	TA	3	6	18989	18994	50 %	50 %	0 %	0 %	442556499
68	NC_020128	TA	3	6	19409	19414	50 %	50 %	0 %	0 %	442556500
69	NC_020128	TA	7	14	19917	19930	50 %	50 %	0 %	0 %	442556500
70	NC_020128	AG	3	6	19933	19938	50 %	0 %	50 %	0 %	442556500
71	NC_020128	TA	3	6	20066	20071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020128	AT	3	6	20096	20101	50 %	50 %	0 %	0 %	442556501
73	NC_020128	CT	3	6	20179	20184	0 %	50 %	0 %	50 %	442556501
74	NC_020128	AT	4	8	20459	20466	50 %	50 %	0 %	0 %	442556501
75	NC_020128	TA	3	6	21125	21130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020128	AT	7	14	21145	21158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020128	TA	3	6	21251	21256	50 %	50 %	0 %	0 %	442556502
78	NC_020128	AT	4	8	21904	21911	50 %	50 %	0 %	0 %	442556502
79	NC_020128	GA	3	6	21917	21922	50 %	0 %	50 %	0 %	442556502
80	NC_020128	CT	3	6	22155	22160	0 %	50 %	0 %	50 %	442556503
81	NC_020128	TA	3	6	22597	22602	50 %	50 %	0 %	0 %	442556504
82	NC_020128	AT	3	6	23158	23163	50 %	50 %	0 %	0 %	442556505
83	NC_020128	CT	3	6	23310	23315	0 %	50 %	0 %	50 %	442556505
84	NC_020128	TA	3	6	23393	23398	50 %	50 %	0 %	0 %	442556505
85	NC_020128	AT	3	6	23554	23559	50 %	50 %	0 %	0 %	442556505
86	NC_020128	AT	3	6	24263	24268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020128	TA	3	6	24284	24289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020128	TA	4	8	24302	24309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020128	AT	3	6	24888	24893	50 %	50 %	0 %	0 %	442556506
90	NC_020128	TA	3	6	25180	25185	50 %	50 %	0 %	0 %	442556506
91	NC_020128	AT	3	6	25320	25325	50 %	50 %	0 %	0 %	442556506
92	NC_020128	AT	3	6	25485	25490	50 %	50 %	0 %	0 %	442556506
93	NC_020128	GA	3	6	25583	25588	50 %	0 %	50 %	0 %	442556506

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.