MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020128	A	7	7	6	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020128	T	6	6	491	496	0 %	100 %	0 %	0 %	442556481
3	NC_020128	A	6	6	566	571	100 %	0 %	0 %	0 %	442556481
4	NC_020128	T	7	7	664	670	0 %	100 %	0 %	0 %	442556481
5	NC_020128	A	8	8	1022	1029	100 %	0 %	0 %	0 %	442556481
6	NC_020128	T	8	8	1078	1085	0 %	100 %	0 %	0 %	442556481
7	NC_020128	A	6	6	1186	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	442556481
8	NC_020128	T	6	6	1855	1860	0 %	100 %	0 %	0 %	442556482
9	NC_020128	T	7	7	2251	2257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020128	T	9	9	2468	2476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020128	T	6	6	2864	2869	0 %	100 %	0 %	0 %	442556483
12	NC_020128	A	6	6	2875	2880	100 %	0 %	0 %	0 %	442556483
13	NC_020128	A	6	6	3141	3146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020128	T	6	6	3290	3295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020128	T	6	6	3367	3372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020128	T	6	6	3472	3477	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
17	NC_020128	A	7	7	3825	3831	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
18	NC_020128	A	6	6	4030	4035	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
19	NC_020128	T	6	6	4065	4070	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
20	NC_020128	T	6	6	4078	4083	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
21	NC_020128	T	6	6	4189	4194	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
22	NC_020128	A	6	6	4215	4220	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
23	NC_020128	A	6	6	4552	4557	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
24	NC_020128	A	6	6	4879	4884	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
25	NC_020128	T	7	7	4951	4957	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
26	NC_020128	T	6	6	4965	4970	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
27	NC_020128	A	7	7	4990	4996	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
28	NC_020128	A	6	6	5189	5194	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
29	NC_020128	A	7	7	5248	5254	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
30	NC_020128	A	7	7	5271	5277	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
31	NC_020128	T	6	6	5750	5755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020128	A	7	7	5929	5935	100 %	0 %	0 %	0 %	442556485
33	NC_020128	A	6	6	5991	5996	100 %	0 %	0 %	0 %	442556485
34	NC_020128	A	6	6	6025	6030	100 %	0 %	0 %	0 %	442556485
35	NC_020128	T	6	6	6059	6064	0 %	100 %	0 %	0 %	442556485
36	NC_020128	T	6	6	6146	6151	0 %	100 %	0 %	0 %	442556485
37	NC_020128	T	6	6	6326	6331	0 %	100 %	0 %	0 %	442556485
38	NC_020128	A	9	9	6610	6618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020128	A	7	7	6716	6722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020128	T	7	7	6819	6825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020128	A	6	6	6841	6846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020128	T	8	8	6955	6962	0 %	100 %	0 %	0 %	442556486
43	NC_020128	A	7	7	7239	7245	100 %	0 %	0 %	0 %	442556486
44	NC_020128	T	7	7	7268	7274	0 %	100 %	0 %	0 %	442556486
45	NC_020128	T	6	6	7516	7521	0 %	100 %	0 %	0 %	442556487
46	NC_020128	T	6	6	7536	7541	0 %	100 %	0 %	0 %	442556487
47	NC_020128	A	6	6	7755	7760	100 %	0 %	0 %	0 %	442556487
48	NC_020128	T	7	7	7769	7775	0 %	100 %	0 %	0 %	442556487
49	NC_020128	A	6	6	8545	8550	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
50	NC_020128	A	7	7	8722	8728	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
51	NC_020128	A	7	7	8882	8888	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
52	NC_020128	A	6	6	9149	9154	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
53	NC_020128	T	6	6	9155	9160	0 %	100 %	0 %	0 %	442556488
54	NC_020128	A	6	6	9333	9338	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
55	NC_020128	A	6	6	9356	9361	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
56	NC_020128	A	6	6	9493	9498	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
57	NC_020128	T	7	7	9499	9505	0 %	100 %	0 %	0 %	442556488
58	NC_020128	A	8	8	9523	9530	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
59	NC_020128	T	8	8	9640	9647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020128	T	8	8	9771	9778	0 %	100 %	0 %	0 %	442556489
61	NC_020128	T	7	7	9970	9976	0 %	100 %	0 %	0 %	442556489
62	NC_020128	T	8	8	10008	10015	0 %	100 %	0 %	0 %	442556489
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64	NC_020128	T	8	8	11203	11210	0 %	100 %	0 %	0 %	442556490
65	NC_020128	A	6	6	11252	11257	100 %	0 %	0 %	0 %	442556490
66	NC_020128	T	8	8	11330	11337	0 %	100 %	0 %	0 %	442556490
67	NC_020128	T	6	6	11368	11373	0 %	100 %	0 %	0 %	442556490
68	NC_020128	T	7	7	11433	11439	0 %	100 %	0 %	0 %	442556491
69	NC_020128	T	6	6	11581	11586	0 %	100 %	0 %	0 %	442556491
70	NC_020128	C	7	7	11714	11720	0 %	0 %	0 %	100 %	442556491
71	NC_020128	A	7	7	11831	11837	100 %	0 %	0 %	0 %	442556491
72	NC_020128	T	8	8	11934	11941	0 %	100 %	0 %	0 %	442556491
73	NC_020128	A	6	6	11983	11988	100 %	0 %	0 %	0 %	442556491
74	NC_020128	T	6	6	12079	12084	0 %	100 %	0 %	0 %	442556491
75	NC_020128	T	6	6	12151	12156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020128	T	7	7	12215	12221	0 %	100 %	0 %	0 %	442556492
77	NC_020128	A	7	7	12239	12245	100 %	0 %	0 %	0 %	442556492
78	NC_020128	T	7	7	12288	12294	0 %	100 %	0 %	0 %	442556492
79	NC_020128	A	6	6	12405	12410	100 %	0 %	0 %	0 %	442556492
80	NC_020128	T	6	6	12422	12427	0 %	100 %	0 %	0 %	442556492
81	NC_020128	T	8	8	12636	12643	0 %	100 %	0 %	0 %	442556492
82	NC_020128	A	7	7	12713	12719	100 %	0 %	0 %	0 %	442556492
83	NC_020128	T	9	9	12994	13002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020128	A	6	6	13039	13044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020128	T	7	7	13170	13176	0 %	100 %	0 %	0 %	442556493
86	NC_020128	A	7	7	13304	13310	100 %	0 %	0 %	0 %	442556493
87	NC_020128	T	6	6	13409	13414	0 %	100 %	0 %	0 %	442556493
88	NC_020128	T	7	7	13808	13814	0 %	100 %	0 %	0 %	442556493
89	NC_020128	T	6	6	13989	13994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020128	T	7	7	14006	14012	0 %	100 %	0 %	0 %	442556494
91	NC_020128	T	6	6	14166	14171	0 %	100 %	0 %	0 %	442556494
92	NC_020128	T	6	6	14269	14274	0 %	100 %	0 %	0 %	442556494
93	NC_020128	T	6	6	14795	14800	0 %	100 %	0 %	0 %	442556494
94	NC_020128	T	7	7	15277	15283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020128	T	6	6	15342	15347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020128	A	6	6	15349	15354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020128	T	8	8	15375	15382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020128	A	8	8	15399	15406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020128	T	6	6	15446	15451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020128	T	6	6	15586	15591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020128	C	11	11	15813	15823	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_020128	T	7	7	15987	15993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020128	T	6	6	16070	16075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020128	T	6	6	16137	16142	0 %	100 %	0 %	0 %	442556495
105	NC_020128	A	7	7	16973	16979	100 %	0 %	0 %	0 %	442556495
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108	NC_020128	A	8	8	17674	17681	100 %	0 %	0 %	0 %	442556496
109	NC_020128	A	6	6	17769	17774	100 %	0 %	0 %	0 %	442556496
110	NC_020128	T	6	6	17863	17868	0 %	100 %	0 %	0 %	442556496
111	NC_020128	A	6	6	18109	18114	100 %	0 %	0 %	0 %	442556497
112	NC_020128	A	6	6	18235	18240	100 %	0 %	0 %	0 %	442556497
113	NC_020128	A	6	6	18377	18382	100 %	0 %	0 %	0 %	442556497
114	NC_020128	T	6	6	18415	18420	0 %	100 %	0 %	0 %	442556497
115	NC_020128	A	6	6	18617	18622	100 %	0 %	0 %	0 %	442556498
116	NC_020128	A	7	7	18704	18710	100 %	0 %	0 %	0 %	442556498
117	NC_020128	A	6	6	18798	18803	100 %	0 %	0 %	0 %	442556498
118	NC_020128	A	6	6	19100	19105	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
119	NC_020128	A	6	6	19117	19122	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
120	NC_020128	A	6	6	19198	19203	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
121	NC_020128	T	6	6	19256	19261	0 %	100 %	0 %	0 %	442556499
122	NC_020128	A	6	6	19288	19293	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
123	NC_020128	T	6	6	19372	19377	0 %	100 %	0 %	0 %	442556500
124	NC_020128	T	7	7	19524	19530	0 %	100 %	0 %	0 %	442556500
125	NC_020128	T	7	7	19616	19622	0 %	100 %	0 %	0 %	442556500
126	NC_020128	T	7	7	20114	20120	0 %	100 %	0 %	0 %	442556501
127	NC_020128	T	6	6	20363	20368	0 %	100 %	0 %	0 %	442556501
128	NC_020128	A	6	6	20898	20903	100 %	0 %	0 %	0 %	442556501
129	NC_020128	T	6	6	20952	20957	0 %	100 %	0 %	0 %	442556501
130	NC_020128	T	7	7	21099	21105	0 %	100 %	0 %	0 %	442556501
131	NC_020128	T	6	6	21456	21461	0 %	100 %	0 %	0 %	442556502
132	NC_020128	A	8	8	21489	21496	100 %	0 %	0 %	0 %	442556502
133	NC_020128	T	7	7	21757	21763	0 %	100 %	0 %	0 %	442556502
134	NC_020128	A	6	6	22127	22132	100 %	0 %	0 %	0 %	442556503
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136	NC_020128	T	6	6	22478	22483	0 %	100 %	0 %	0 %	442556504
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139	NC_020128	T	6	6	22997	23002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020128	T	7	7	23099	23105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020128	T	7	7	23231	23237	0 %	100 %	0 %	0 %	442556505
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143	NC_020128	T	6	6	23370	23375	0 %	100 %	0 %	0 %	442556505
144	NC_020128	A	7	7	23480	23486	100 %	0 %	0 %	0 %	442556505
145	NC_020128	T	6	6	23511	23516	0 %	100 %	0 %	0 %	442556505
146	NC_020128	A	6	6	23528	23533	100 %	0 %	0 %	0 %	442556505
147	NC_020128	T	6	6	23670	23675	0 %	100 %	0 %	0 %	442556505
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.