MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020128	T	6	6	491	496	0 %	100 %	0 %	0 %	442556481
2	NC_020128	A	6	6	566	571	100 %	0 %	0 %	0 %	442556481
3	NC_020128	T	7	7	664	670	0 %	100 %	0 %	0 %	442556481
4	NC_020128	A	8	8	1022	1029	100 %	0 %	0 %	0 %	442556481
5	NC_020128	T	8	8	1078	1085	0 %	100 %	0 %	0 %	442556481
6	NC_020128	A	6	6	1186	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	442556481
7	NC_020128	T	6	6	1855	1860	0 %	100 %	0 %	0 %	442556482
8	NC_020128	T	6	6	2864	2869	0 %	100 %	0 %	0 %	442556483
9	NC_020128	A	6	6	2875	2880	100 %	0 %	0 %	0 %	442556483
10	NC_020128	T	6	6	3472	3477	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
11	NC_020128	A	7	7	3825	3831	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
12	NC_020128	A	6	6	4030	4035	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
13	NC_020128	T	6	6	4065	4070	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
14	NC_020128	T	6	6	4078	4083	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
15	NC_020128	T	6	6	4189	4194	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
16	NC_020128	A	6	6	4215	4220	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
17	NC_020128	A	6	6	4552	4557	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
18	NC_020128	A	6	6	4879	4884	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
19	NC_020128	T	7	7	4951	4957	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
20	NC_020128	T	6	6	4965	4970	0 %	100 %	0 %	0 %	442556484
21	NC_020128	A	7	7	4990	4996	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
22	NC_020128	A	6	6	5189	5194	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
23	NC_020128	A	7	7	5248	5254	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
24	NC_020128	A	7	7	5271	5277	100 %	0 %	0 %	0 %	442556484
25	NC_020128	A	7	7	5929	5935	100 %	0 %	0 %	0 %	442556485
26	NC_020128	A	6	6	5991	5996	100 %	0 %	0 %	0 %	442556485
27	NC_020128	A	6	6	6025	6030	100 %	0 %	0 %	0 %	442556485
28	NC_020128	T	6	6	6059	6064	0 %	100 %	0 %	0 %	442556485
29	NC_020128	T	6	6	6146	6151	0 %	100 %	0 %	0 %	442556485
30	NC_020128	T	6	6	6326	6331	0 %	100 %	0 %	0 %	442556485
31	NC_020128	T	8	8	6955	6962	0 %	100 %	0 %	0 %	442556486
32	NC_020128	A	7	7	7239	7245	100 %	0 %	0 %	0 %	442556486
33	NC_020128	T	7	7	7268	7274	0 %	100 %	0 %	0 %	442556486
34	NC_020128	T	6	6	7516	7521	0 %	100 %	0 %	0 %	442556487
35	NC_020128	T	6	6	7536	7541	0 %	100 %	0 %	0 %	442556487
36	NC_020128	A	6	6	7755	7760	100 %	0 %	0 %	0 %	442556487
37	NC_020128	T	7	7	7769	7775	0 %	100 %	0 %	0 %	442556487
38	NC_020128	A	6	6	8545	8550	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
39	NC_020128	A	7	7	8722	8728	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
40	NC_020128	A	7	7	8882	8888	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
41	NC_020128	A	6	6	9149	9154	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
42	NC_020128	T	6	6	9155	9160	0 %	100 %	0 %	0 %	442556488
43	NC_020128	A	6	6	9333	9338	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
44	NC_020128	A	6	6	9356	9361	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
45	NC_020128	A	6	6	9493	9498	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
46	NC_020128	T	7	7	9499	9505	0 %	100 %	0 %	0 %	442556488
47	NC_020128	A	8	8	9523	9530	100 %	0 %	0 %	0 %	442556488
48	NC_020128	T	8	8	9771	9778	0 %	100 %	0 %	0 %	442556489
49	NC_020128	T	7	7	9970	9976	0 %	100 %	0 %	0 %	442556489
50	NC_020128	T	8	8	10008	10015	0 %	100 %	0 %	0 %	442556489
51	NC_020128	C	13	13	10971	10983	0 %	0 %	0 %	100 %	442556490
52	NC_020128	T	8	8	11203	11210	0 %	100 %	0 %	0 %	442556490
53	NC_020128	A	6	6	11252	11257	100 %	0 %	0 %	0 %	442556490
54	NC_020128	T	8	8	11330	11337	0 %	100 %	0 %	0 %	442556490
55	NC_020128	T	6	6	11368	11373	0 %	100 %	0 %	0 %	442556490
56	NC_020128	T	7	7	11433	11439	0 %	100 %	0 %	0 %	442556491
57	NC_020128	T	6	6	11581	11586	0 %	100 %	0 %	0 %	442556491
58	NC_020128	C	7	7	11714	11720	0 %	0 %	0 %	100 %	442556491
59	NC_020128	A	7	7	11831	11837	100 %	0 %	0 %	0 %	442556491
60	NC_020128	T	8	8	11934	11941	0 %	100 %	0 %	0 %	442556491
61	NC_020128	A	6	6	11983	11988	100 %	0 %	0 %	0 %	442556491
62	NC_020128	T	6	6	12079	12084	0 %	100 %	0 %	0 %	442556491
63	NC_020128	T	7	7	12215	12221	0 %	100 %	0 %	0 %	442556492
64	NC_020128	A	7	7	12239	12245	100 %	0 %	0 %	0 %	442556492
65	NC_020128	T	7	7	12288	12294	0 %	100 %	0 %	0 %	442556492
66	NC_020128	A	6	6	12405	12410	100 %	0 %	0 %	0 %	442556492
67	NC_020128	T	6	6	12422	12427	0 %	100 %	0 %	0 %	442556492
68	NC_020128	T	8	8	12636	12643	0 %	100 %	0 %	0 %	442556492
69	NC_020128	A	7	7	12713	12719	100 %	0 %	0 %	0 %	442556492
70	NC_020128	T	7	7	13170	13176	0 %	100 %	0 %	0 %	442556493
71	NC_020128	A	7	7	13304	13310	100 %	0 %	0 %	0 %	442556493
72	NC_020128	T	6	6	13409	13414	0 %	100 %	0 %	0 %	442556493
73	NC_020128	T	7	7	13808	13814	0 %	100 %	0 %	0 %	442556493
74	NC_020128	T	7	7	14006	14012	0 %	100 %	0 %	0 %	442556494
75	NC_020128	T	6	6	14166	14171	0 %	100 %	0 %	0 %	442556494
76	NC_020128	T	6	6	14269	14274	0 %	100 %	0 %	0 %	442556494
77	NC_020128	T	6	6	14795	14800	0 %	100 %	0 %	0 %	442556494
78	NC_020128	T	6	6	16137	16142	0 %	100 %	0 %	0 %	442556495
79	NC_020128	A	7	7	16973	16979	100 %	0 %	0 %	0 %	442556495
80	NC_020128	T	6	6	17000	17005	0 %	100 %	0 %	0 %	442556495
81	NC_020128	A	8	8	17547	17554	100 %	0 %	0 %	0 %	442556495
82	NC_020128	A	8	8	17674	17681	100 %	0 %	0 %	0 %	442556496
83	NC_020128	A	6	6	17769	17774	100 %	0 %	0 %	0 %	442556496
84	NC_020128	T	6	6	17863	17868	0 %	100 %	0 %	0 %	442556496
85	NC_020128	A	6	6	18109	18114	100 %	0 %	0 %	0 %	442556497
86	NC_020128	A	6	6	18235	18240	100 %	0 %	0 %	0 %	442556497
87	NC_020128	A	6	6	18377	18382	100 %	0 %	0 %	0 %	442556497
88	NC_020128	T	6	6	18415	18420	0 %	100 %	0 %	0 %	442556497
89	NC_020128	A	6	6	18617	18622	100 %	0 %	0 %	0 %	442556498
90	NC_020128	A	7	7	18704	18710	100 %	0 %	0 %	0 %	442556498
91	NC_020128	A	6	6	18798	18803	100 %	0 %	0 %	0 %	442556498
92	NC_020128	A	6	6	19100	19105	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
93	NC_020128	A	6	6	19117	19122	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
94	NC_020128	A	6	6	19198	19203	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
95	NC_020128	T	6	6	19256	19261	0 %	100 %	0 %	0 %	442556499
96	NC_020128	A	6	6	19288	19293	100 %	0 %	0 %	0 %	442556499
97	NC_020128	T	6	6	19372	19377	0 %	100 %	0 %	0 %	442556500
98	NC_020128	T	7	7	19524	19530	0 %	100 %	0 %	0 %	442556500
99	NC_020128	T	7	7	19616	19622	0 %	100 %	0 %	0 %	442556500
100	NC_020128	T	7	7	20114	20120	0 %	100 %	0 %	0 %	442556501
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102	NC_020128	A	6	6	20898	20903	100 %	0 %	0 %	0 %	442556501
103	NC_020128	T	6	6	20952	20957	0 %	100 %	0 %	0 %	442556501
104	NC_020128	T	7	7	21099	21105	0 %	100 %	0 %	0 %	442556501
105	NC_020128	T	6	6	21456	21461	0 %	100 %	0 %	0 %	442556502
106	NC_020128	A	8	8	21489	21496	100 %	0 %	0 %	0 %	442556502
107	NC_020128	T	7	7	21757	21763	0 %	100 %	0 %	0 %	442556502
108	NC_020128	A	6	6	22127	22132	100 %	0 %	0 %	0 %	442556503
109	NC_020128	T	9	9	22235	22243	0 %	100 %	0 %	0 %	442556503
110	NC_020128	T	6	6	22478	22483	0 %	100 %	0 %	0 %	442556504
111	NC_020128	T	7	7	23231	23237	0 %	100 %	0 %	0 %	442556505
112	NC_020128	A	6	6	23344	23349	100 %	0 %	0 %	0 %	442556505
113	NC_020128	T	6	6	23370	23375	0 %	100 %	0 %	0 %	442556505
114	NC_020128	A	7	7	23480	23486	100 %	0 %	0 %	0 %	442556505
115	NC_020128	T	6	6	23511	23516	0 %	100 %	0 %	0 %	442556505
116	NC_020128	A	6	6	23528	23533	100 %	0 %	0 %	0 %	442556505
117	NC_020128	T	6	6	23670	23675	0 %	100 %	0 %	0 %	442556505
118	NC_020128	A	6	6	23932	23937	100 %	0 %	0 %	0 %	442556505
119	NC_020128	T	6	6	24422	24427	0 %	100 %	0 %	0 %	442556506
120	NC_020128	T	6	6	24442	24447	0 %	100 %	0 %	0 %	442556506
121	NC_020128	T	7	7	25377	25383	0 %	100 %	0 %	0 %	442556506
122	NC_020128	G	6	6	25433	25438	0 %	0 %	100 %	0 %	442556506
123	NC_020128	T	6	6	25460	25465	0 %	100 %	0 %	0 %	442556506
124	NC_020128	T	6	6	25516	25521	0 %	100 %	0 %	0 %	442556506
125	NC_020128	T	6	6	25617	25622	0 %	100 %	0 %	0 %	442556506
126	NC_020128	A	6	6	25691	25696	100 %	0 %	0 %	0 %	442556506
127	NC_020128	A	6	6	26088	26093	100 %	0 %	0 %	0 %	442556507
128	NC_020128	T	7	7	26233	26239	0 %	100 %	0 %	0 %	442556507
129	NC_020128	A	6	6	26494	26499	100 %	0 %	0 %	0 %	442556507

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.