MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 4269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020127	AGAT	2	8	40	47	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020127	TAAT	2	8	233	240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020127	TAAA	2	8	248	255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020127	AAGG	2	8	1046	1053	50 %	0 %	50 %	0 %	442555262
5	NC_020127	AAAG	2	8	1718	1725	75 %	0 %	25 %	0 %	442555262
6	NC_020127	CATT	2	8	1779	1786	25 %	50 %	0 %	25 %	442555262
7	NC_020127	TTGC	2	8	1844	1851	0 %	50 %	25 %	25 %	442555263
8	NC_020127	TAAT	2	8	2949	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020127	TATT	2	8	4130	4137	25 %	75 %	0 %	0 %	442555265
10	NC_020127	TTAT	2	8	4981	4988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020127	CTTA	2	8	5021	5028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020127	ATTT	2	8	5060	5067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020127	TATT	2	8	5429	5436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020127	TTAT	2	8	5681	5688	25 %	75 %	0 %	0 %	442555267
15	NC_020127	GATG	2	8	6306	6313	25 %	25 %	50 %	0 %	442555267
16	NC_020127	TTAT	2	8	7293	7300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020127	ATAC	2	8	7522	7529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020127	TAAA	2	8	7570	7577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020127	TTAT	2	8	7657	7664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020127	TCAA	2	8	8077	8084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020127	TTCT	2	8	8108	8115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020127	ATTA	2	8	8175	8182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020127	AAGA	2	8	8262	8269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020127	TTTG	2	8	8777	8784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020127	TTTG	2	8	8865	8872	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020127	CATT	2	8	8926	8933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020127	CTTC	2	8	10218	10225	0 %	50 %	0 %	50 %	442555269
28	NC_020127	TGAC	2	8	10669	10676	25 %	25 %	25 %	25 %	442555270
29	NC_020127	TGTT	2	8	10761	10768	0 %	75 %	25 %	0 %	442555270
30	NC_020127	TAAA	2	8	11168	11175	75 %	25 %	0 %	0 %	442555270
31	NC_020127	TTTG	2	8	11623	11630	0 %	75 %	25 %	0 %	442555270
32	NC_020127	TAAT	2	8	11812	11819	50 %	50 %	0 %	0 %	442555270
33	NC_020127	AGGA	2	8	11877	11884	50 %	0 %	50 %	0 %	442555270
34	NC_020127	TGTC	2	8	12639	12646	0 %	50 %	25 %	25 %	442555270
35	NC_020127	TAGT	2	8	13103	13110	25 %	50 %	25 %	0 %	442555270
36	NC_020127	TAAC	2	8	13595	13602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020127	TCTA	2	8	13837	13844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020127	ATTT	2	8	13867	13874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020127	TAGT	2	8	14001	14008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020127	TTTG	2	8	14031	14038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020127	TTTA	2	8	14774	14781	25 %	75 %	0 %	0 %	442555272
42	NC_020127	ATTT	2	8	14809	14816	25 %	75 %	0 %	0 %	442555272
43	NC_020127	GATT	2	8	14913	14920	25 %	50 %	25 %	0 %	442555272
44	NC_020127	GAAG	2	8	15260	15267	50 %	0 %	50 %	0 %	442555272
45	NC_020127	TTGA	2	8	15399	15406	25 %	50 %	25 %	0 %	442555272
46	NC_020127	AGGT	2	8	16185	16192	25 %	25 %	50 %	0 %	442555273
47	NC_020127	AGCA	2	8	16455	16462	50 %	0 %	25 %	25 %	442555273
48	NC_020127	AGAA	2	8	16827	16834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020127	TCGA	2	8	16965	16972	25 %	25 %	25 %	25 %	442555274
50	NC_020127	AATA	2	8	17262	17269	75 %	25 %	0 %	0 %	442555274
51	NC_020127	TATT	2	8	17470	17477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020127	CTAT	2	8	17492	17499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020127	AAAG	2	8	17531	17538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020127	TAAA	2	8	17575	17582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020127	TAAA	2	8	17715	17722	75 %	25 %	0 %	0 %	442555275
56	NC_020127	TTAT	2	8	18120	18127	25 %	75 %	0 %	0 %	442555275
57	NC_020127	TAAT	2	8	18392	18399	50 %	50 %	0 %	0 %	442555275
58	NC_020127	AATA	2	8	19008	19015	75 %	25 %	0 %	0 %	442555276
59	NC_020127	TAGA	2	8	19293	19300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020127	ACTT	2	8	19425	19432	25 %	50 %	0 %	25 %	442555277
61	NC_020127	CCAT	2	8	19762	19769	25 %	25 %	0 %	50 %	442555277
62	NC_020127	TAAG	2	8	19989	19996	50 %	25 %	25 %	0 %	442555277
63	NC_020127	GAAA	2	8	20354	20361	75 %	0 %	25 %	0 %	442555277
64	NC_020127	TTTA	2	8	20883	20890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020127	TATG	2	8	20953	20960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020127	AATT	2	8	21151	21158	50 %	50 %	0 %	0 %	442555278
67	NC_020127	CAAG	2	8	22740	22747	50 %	0 %	25 %	25 %	442555280
68	NC_020127	CCAA	2	8	22970	22977	50 %	0 %	0 %	50 %	442555280
69	NC_020127	CCAT	2	8	23105	23112	25 %	25 %	0 %	50 %	442555280
70	NC_020127	GTAA	2	8	24819	24826	50 %	25 %	25 %	0 %	442555282
71	NC_020127	CAAT	2	8	24975	24982	50 %	25 %	0 %	25 %	442555282
72	NC_020127	ATAG	2	8	25013	25020	50 %	25 %	25 %	0 %	442555282
73	NC_020127	TAAC	2	8	25091	25098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020127	TTTA	2	8	25175	25182	25 %	75 %	0 %	0 %	442555283
75	NC_020127	GTAT	2	8	26727	26734	25 %	50 %	25 %	0 %	442555284
76	NC_020127	GATT	2	8	26914	26921	25 %	50 %	25 %	0 %	442555284
77	NC_020127	AGCA	2	8	26934	26941	50 %	0 %	25 %	25 %	442555284
78	NC_020127	TGAA	2	8	26989	26996	50 %	25 %	25 %	0 %	442555284
79	NC_020127	CGAG	2	8	27001	27008	25 %	0 %	50 %	25 %	442555284
80	NC_020127	GAAG	2	8	27019	27026	50 %	0 %	50 %	0 %	442555284
81	NC_020127	GATA	2	8	27317	27324	50 %	25 %	25 %	0 %	442555284
82	NC_020127	ACTT	2	8	27489	27496	25 %	50 %	0 %	25 %	442555284
83	NC_020127	ATTT	2	8	28155	28162	25 %	75 %	0 %	0 %	442555284
84	NC_020127	ACAT	2	8	28864	28871	50 %	25 %	0 %	25 %	442555284
85	NC_020127	ACGA	2	8	29282	29289	50 %	0 %	25 %	25 %	442555284
86	NC_020127	ATTT	2	8	29501	29508	25 %	75 %	0 %	0 %	442555284
87	NC_020127	AGGA	2	8	30406	30413	50 %	0 %	50 %	0 %	442555285
88	NC_020127	TCTT	2	8	30544	30551	0 %	75 %	0 %	25 %	442555285
89	NC_020127	GCTT	2	8	30940	30947	0 %	50 %	25 %	25 %	442555285
90	NC_020127	ATTT	2	8	31633	31640	25 %	75 %	0 %	0 %	442555286
91	NC_020127	ACTT	2	8	32488	32495	25 %	50 %	0 %	25 %	442555287
92	NC_020127	AACA	2	8	32513	32520	75 %	0 %	0 %	25 %	442555287
93	NC_020127	CAGT	2	8	32737	32744	25 %	25 %	25 %	25 %	442555287
94	NC_020127	TCCT	2	8	33241	33248	0 %	50 %	0 %	50 %	442555288
95	NC_020127	TCTT	2	8	33986	33993	0 %	75 %	0 %	25 %	442555288
96	NC_020127	AAAT	2	8	34502	34509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020127	TAGA	2	8	34586	34593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020127	TTAC	2	8	34896	34903	25 %	50 %	0 %	25 %	442555289
99	NC_020127	CTGT	2	8	35242	35249	0 %	50 %	25 %	25 %	442555289
100	NC_020127	CTTT	2	8	35340	35347	0 %	75 %	0 %	25 %	442555289
101	NC_020127	CTAG	2	8	35697	35704	25 %	25 %	25 %	25 %	442555289
102	NC_020127	TAGT	2	8	35882	35889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020127	TAAG	2	8	36046	36053	50 %	25 %	25 %	0 %	442555290
104	NC_020127	TAGT	2	8	37188	37195	25 %	50 %	25 %	0 %	442555291
105	NC_020127	TTGT	2	8	37312	37319	0 %	75 %	25 %	0 %	442555291
106	NC_020127	AGTA	2	8	38017	38024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020127	GTTT	2	8	38257	38264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020127	GTTT	2	8	38554	38561	0 %	75 %	25 %	0 %	442555292
109	NC_020127	TCTG	2	8	38761	38768	0 %	50 %	25 %	25 %	442555292
110	NC_020127	AAAT	2	8	38820	38827	75 %	25 %	0 %	0 %	442555292
111	NC_020127	TAAG	2	8	39086	39093	50 %	25 %	25 %	0 %	442555292
112	NC_020127	AATG	2	8	39537	39544	50 %	25 %	25 %	0 %	442555292
113	NC_020127	CTGA	2	8	40171	40178	25 %	25 %	25 %	25 %	442555292
114	NC_020127	TTGT	2	8	40212	40219	0 %	75 %	25 %	0 %	442555292
115	NC_020127	AGCC	2	8	40472	40479	25 %	0 %	25 %	50 %	442555292
116	NC_020127	GTTA	2	8	40819	40826	25 %	50 %	25 %	0 %	442555292
117	NC_020127	AATA	3	12	40876	40887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020127	AATT	2	8	40963	40970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020127	CTAT	2	8	40983	40990	25 %	50 %	0 %	25 %	442555293
120	NC_020127	ATAA	2	8	42178	42185	75 %	25 %	0 %	0 %	442555294
121	NC_020127	TTGC	2	8	42403	42410	0 %	50 %	25 %	25 %	442555294
122	NC_020127	TAGA	2	8	42680	42687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020127	CATT	2	8	42941	42948	25 %	50 %	0 %	25 %	442555295
124	NC_020127	AGTT	2	8	42960	42967	25 %	50 %	25 %	0 %	442555295
125	NC_020127	TTTA	2	8	43341	43348	25 %	75 %	0 %	0 %	442555295
126	NC_020127	GGAT	2	8	43363	43370	25 %	25 %	50 %	0 %	442555295
127	NC_020127	ATAA	2	8	44279	44286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020127	TTTC	2	8	44429	44436	0 %	75 %	0 %	25 %	442555296
129	NC_020127	ACTA	2	8	44572	44579	50 %	25 %	0 %	25 %	442555296
130	NC_020127	CTTT	3	12	44598	44609	0 %	75 %	0 %	25 %	442555296
131	NC_020127	CTTG	2	8	44891	44898	0 %	50 %	25 %	25 %	442555297
132	NC_020127	AGAA	2	8	44963	44970	75 %	0 %	25 %	0 %	442555297
133	NC_020127	TTGT	2	8	45267	45274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020127	GTTC	2	8	45422	45429	0 %	50 %	25 %	25 %	442555298
135	NC_020127	AATG	2	8	45670	45677	50 %	25 %	25 %	0 %	442555298
136	NC_020127	ATAA	2	8	45775	45782	75 %	25 %	0 %	0 %	442555298
137	NC_020127	AATA	2	8	45833	45840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020127	ACAG	2	8	46065	46072	50 %	0 %	25 %	25 %	442555299
139	NC_020127	TCAG	2	8	46347	46354	25 %	25 %	25 %	25 %	442555299
140	NC_020127	TTCA	2	8	46441	46448	25 %	50 %	0 %	25 %	442555299
141	NC_020127	CAAA	2	8	46544	46551	75 %	0 %	0 %	25 %	442555299
142	NC_020127	TGAC	2	8	47104	47111	25 %	25 %	25 %	25 %	442555299
143	NC_020127	AGTT	2	8	47567	47574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020127	TAAA	2	8	47628	47635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020127	TAAT	3	12	47636	47647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020127	AGTA	2	8	48111	48118	50 %	25 %	25 %	0 %	442555300
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