MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 23828

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020127	TAA	2	6	25	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020127	TTA	2	6	122	127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020127	TAA	2	6	163	168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020127	CTT	2	6	169	174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020127	ACA	2	6	373	378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555262
6	NC_020127	TAG	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555262
7	NC_020127	ATT	2	6	474	479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555262
8	NC_020127	AGG	2	6	564	569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555262
9	NC_020127	TAA	3	9	639	647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555262
10	NC_020127	ACA	2	6	648	653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555262
11	NC_020127	AAG	2	6	696	701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555262
12	NC_020127	TGT	2	6	798	803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555262
13	NC_020127	TAA	2	6	813	818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555262
14	NC_020127	TGC	3	9	828	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555262
15	NC_020127	GGA	2	6	987	992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555262
16	NC_020127	AGA	2	6	1109	1114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555262
17	NC_020127	GTT	2	6	1168	1173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555262
18	NC_020127	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555262
19	NC_020127	TAT	2	6	1509	1514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555262
20	NC_020127	TGT	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555262
21	NC_020127	AGA	2	6	1666	1671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555262
22	NC_020127	TTA	2	6	1824	1829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555263
23	NC_020127	GAT	2	6	1955	1960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
24	NC_020127	TTG	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555263
25	NC_020127	AAC	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555263
26	NC_020127	GTA	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
27	NC_020127	TGA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
28	NC_020127	TCT	2	6	2281	2286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555263
29	NC_020127	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555263
30	NC_020127	TGT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555263
31	NC_020127	GAC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555263
32	NC_020127	AAT	2	6	2424	2429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555263
33	NC_020127	CCA	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555263
34	NC_020127	TGC	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555263
35	NC_020127	TTC	2	6	2544	2549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555263
36	NC_020127	CCT	2	6	2551	2556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555263
37	NC_020127	AGA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555263
38	NC_020127	TTC	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555263
39	NC_020127	TAA	2	6	2711	2716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555263
40	NC_020127	TGT	2	6	2737	2742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555263
41	NC_020127	AGT	2	6	2766	2771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
42	NC_020127	AGA	2	6	2922	2927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020127	TTA	2	6	2980	2985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020127	ATT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020127	TTA	2	6	3049	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020127	GTA	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020127	TAC	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020127	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555264
49	NC_020127	TAT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020127	ATA	2	6	3433	3438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020127	GAA	2	6	3445	3450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020127	TGA	2	6	3477	3482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555265
53	NC_020127	TTA	2	6	3533	3538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555265
54	NC_020127	TAA	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
55	NC_020127	TGG	2	6	3747	3752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555265
56	NC_020127	ACA	2	6	3771	3776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555265
57	NC_020127	GAA	2	6	3904	3909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555265
58	NC_020127	ATT	3	9	3994	4002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555265
59	NC_020127	TAA	2	6	4007	4012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
60	NC_020127	GTA	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555265
61	NC_020127	GTT	2	6	4141	4146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555265
62	NC_020127	TAA	2	6	4154	4159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
63	NC_020127	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
64	NC_020127	TTA	2	6	4216	4221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020127	TAT	2	6	4236	4241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020127	ATT	2	6	4269	4274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020127	CTC	2	6	4304	4309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020127	ACA	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020127	CAC	3	9	4369	4377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555266
70	NC_020127	CAC	2	6	4411	4416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555266
71	NC_020127	CAT	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555266
72	NC_020127	CAG	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555266
73	NC_020127	TCC	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555266
74	NC_020127	TCA	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555266
75	NC_020127	TAC	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555266
76	NC_020127	ATA	2	6	4878	4883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555266
77	NC_020127	TAA	2	6	4897	4902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020127	TAT	2	6	4910	4915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020127	ATT	2	6	4919	4924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020127	ATT	2	6	5010	5015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020127	ACT	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020127	TTA	2	6	5192	5197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020127	TAT	2	6	5207	5212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020127	CTT	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020127	ATT	2	6	5360	5365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020127	ATT	2	6	5374	5379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020127	ATT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020127	TAA	2	6	5528	5533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020127	GAA	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555267
90	NC_020127	ATG	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555267
91	NC_020127	GGT	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555267
92	NC_020127	TAA	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555267
93	NC_020127	TTG	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555267
94	NC_020127	ATT	3	9	6179	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
95	NC_020127	TCT	2	6	6283	6288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555267
96	NC_020127	TTG	2	6	6480	6485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555267
97	NC_020127	ACT	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555267
98	NC_020127	AAC	2	6	6565	6570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555267
99	NC_020127	ATT	2	6	6584	6589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
100	NC_020127	CAG	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555267
101	NC_020127	CAA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555267
102	NC_020127	ATT	2	6	6695	6700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
103	NC_020127	TGT	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555267
104	NC_020127	TAT	2	6	6937	6942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
105	NC_020127	TAG	3	9	7008	7016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555267
106	NC_020127	ATT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
107	NC_020127	CAA	2	6	7079	7084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555267
108	NC_020127	AAG	2	6	7113	7118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555267
109	NC_020127	TAA	2	6	7190	7195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020127	GAA	2	6	7399	7404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020127	TCT	2	6	7459	7464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020127	TAA	2	6	7500	7505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020127	TAT	2	6	7540	7545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020127	AAT	2	6	7582	7587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020127	TAT	2	6	7594	7599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020127	GAG	2	6	7611	7616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020127	TCT	2	6	7774	7779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555268
118	NC_020127	CAT	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555268
119	NC_020127	AAT	2	6	7860	7865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555268
120	NC_020127	AAC	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020127	TTC	2	6	8006	8011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020127	TAA	2	6	8018	8023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020127	TAG	2	6	8144	8149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020127	GTT	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020127	ATT	2	6	8202	8207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020127	TTG	2	6	8214	8219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020127	TAT	2	6	8220	8225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020127	TCT	2	6	8354	8359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020127	TAA	2	6	8363	8368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020127	AAG	2	6	8379	8384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020127	TAA	2	6	8396	8401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020127	ATC	2	6	8457	8462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020127	ATT	2	6	8502	8507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020127	AGT	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020127	TAT	2	6	8555	8560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020127	AAT	2	6	8561	8566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020127	TGT	2	6	8568	8573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020127	AAT	3	9	8583	8591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020127	GTC	2	6	8682	8687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020127	GAT	2	6	8738	8743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020127	TGT	2	6	8818	8823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020127	TAA	3	9	8973	8981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020127	ATT	2	6	8988	8993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_020127	ATG	2	6	16433	16438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555273
269	NC_020127	TGT	3	9	16446	16454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555273
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271	NC_020127	TTG	2	6	16575	16580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555273
272	NC_020127	GAA	2	6	16607	16612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555273
273	NC_020127	AGG	2	6	16684	16689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555273
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275	NC_020127	ATA	2	6	16804	16809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555273
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287	NC_020127	ATA	2	6	17559	17564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020127	AGT	2	6	17598	17603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020127	CAT	2	6	17732	17737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555275
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300	NC_020127	ATT	2	6	18094	18099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555275
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