MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Myxococcus stipitatus DSM 14675

Total Repeats: 7605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_020126	CGGCGA	2	12	10197570	10197581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	442324942
7502	NC_020126	GACCGC	2	12	10199701	10199712	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442324944
7503	NC_020126	TCCACC	2	12	10205241	10205252	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	442324947
7504	NC_020126	GCGCCG	2	12	10206013	10206024	0 %	0 %	50 %	50 %	442324948
7505	NC_020126	ACGGGC	2	12	10207565	10207576	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	442324949
7506	NC_020126	CGGGCA	2	12	10207581	10207592	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	442324949
7507	NC_020126	AGCTGG	2	12	10210634	10210645	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	442324951
7508	NC_020126	CCGCGG	2	12	10212661	10212672	0 %	0 %	50 %	50 %	442324953
7509	NC_020126	CCGTCG	2	12	10217254	10217265	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	442324957
7510	NC_020126	CTCCGC	2	12	10218309	10218320	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	442324957
7511	NC_020126	AGCCCC	2	12	10220070	10220081	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	442324958
7512	NC_020126	GCACCA	2	12	10221124	10221135	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	442324958
7513	NC_020126	CTACCT	2	12	10223564	10223575	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	442324962
7514	NC_020126	GTGGAG	4	24	10225884	10225907	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	442324963
7515	NC_020126	GGACCA	2	12	10227786	10227797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442324966
7516	NC_020126	CCGAGC	2	12	10229427	10229438	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442324967
7517	NC_020126	GCCCAC	2	12	10230038	10230049	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	442324968
7518	NC_020126	GCCTCT	2	12	10230081	10230092	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	442324968
7519	NC_020126	AGGCGG	2	12	10230299	10230310	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	442324968
7520	NC_020126	TCGCCA	2	12	10234532	10234543	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	442324972
7521	NC_020126	GTGGAG	2	12	10234921	10234932	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	442324972
7522	NC_020126	GGCATC	2	12	10234981	10234992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442324972
7523	NC_020126	GGGTTG	2	12	10235065	10235076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442324972
7524	NC_020126	GCCCTC	2	12	10241461	10241472	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	442324979
7525	NC_020126	CACCAG	2	12	10241719	10241730	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	442324979
7526	NC_020126	ACCTCC	2	12	10242092	10242103	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	442324979
7527	NC_020126	ATGGCC	2	12	10242140	10242151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442324979
7528	NC_020126	CTCCGC	2	12	10243062	10243073	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	442324981
7529	NC_020126	CAGCGC	2	12	10244142	10244153	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442324981
7530	NC_020126	AGCCCC	2	12	10244533	10244544	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	442324982
7531	NC_020126	CAGCCG	2	12	10244742	10244753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442324982
7532	NC_020126	TCCGCG	2	12	10244773	10244784	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	442324982
7533	NC_020126	CTGCAG	2	12	10245033	10245044	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442324982
7534	NC_020126	CCAGCT	2	12	10245488	10245499	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	442324982
7535	NC_020126	GCCTCC	2	12	10246192	10246203	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	442324982
7536	NC_020126	CCGAGC	2	12	10246923	10246934	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442324982
7537	NC_020126	ATGCGC	2	12	10247545	10247556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442324983
7538	NC_020126	GACCTC	2	12	10252496	10252507	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	442324988
7539	NC_020126	CCCAGG	2	12	10252512	10252523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442324988
7540	NC_020126	CCTGGA	2	12	10253629	10253640	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442324989
7541	NC_020126	AGGTCC	2	12	10253997	10254008	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442324989
7542	NC_020126	CGCCAC	2	12	10254411	10254422	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	442324990
7543	NC_020126	AGCGTC	2	12	10256035	10256046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442324992
7544	NC_020126	CCAGGG	2	12	10256234	10256245	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	442324992
7545	NC_020126	CGCCAC	2	12	10256695	10256706	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	442324993
7546	NC_020126	CGTGGC	2	12	10258034	10258045	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	442324994
7547	NC_020126	CCATCA	2	12	10263024	10263035	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	442324997
7548	NC_020126	TCCGCT	2	12	10263886	10263897	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	442324998
7549	NC_020126	CTCCGC	2	12	10264016	10264027	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	442324999
7550	NC_020126	GGCGCG	2	12	10264746	10264757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442324999
7551	NC_020126	CAAGCG	2	12	10266615	10266626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442325002
7552	NC_020126	CGCAGG	2	12	10266665	10266676	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	442325002
7553	NC_020126	GGCGCA	2	12	10267868	10267879	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	442325003
7554	NC_020126	CCTCAC	2	12	10269703	10269714	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	442325005
7555	NC_020126	CGCCTT	2	12	10270421	10270432	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	442325007
7556	NC_020126	GCCGTC	2	12	10273693	10273704	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	442325009
7557	NC_020126	GGCCAG	2	12	10273860	10273871	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	442325009
7558	NC_020126	TCCTCA	2	12	10273939	10273950	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	442325009
7559	NC_020126	GCCCTC	2	12	10274016	10274027	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	442325009
7560	NC_020126	CCCATG	2	12	10274236	10274247	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	442325009
7561	NC_020126	CAGGCC	2	12	10274553	10274564	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442325010
7562	NC_020126	CCGCAG	2	12	10275255	10275266	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442325010
7563	NC_020126	CGCCCG	2	12	10276636	10276647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442325011
7564	NC_020126	ATGCAC	2	12	10277261	10277272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	442325011
7565	NC_020126	CGTGGG	2	12	10278875	10278886	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	442325013
7566	NC_020126	CGTGGG	2	12	10281751	10281762	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	442325015
7567	NC_020126	CCCCGA	2	12	10286465	10286476	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	442325018
7568	NC_020126	CGTCCC	2	12	10289812	10289823	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	442325020
7569	NC_020126	CCGCGC	2	12	10290327	10290338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442325021
7570	NC_020126	CACCCC	2	12	10290798	10290809	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	442325022
7571	NC_020126	AGCGCC	2	12	10290835	10290846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442325022
7572	NC_020126	GGGCGC	2	12	10292713	10292724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442325023
7573	NC_020126	GGGCCG	2	12	10293283	10293294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442325024
7574	NC_020126	GCGGCT	2	12	10294930	10294941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	442325027
7575	NC_020126	ACGGGC	2	12	10295366	10295377	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	442325027
7576	NC_020126	GCCAGC	2	12	10297258	10297269	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442325029
7577	NC_020126	CTCCGC	2	12	10297458	10297469	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	442325029
7578	NC_020126	GCGCCA	2	12	10298630	10298641	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442325029
7579	NC_020126	GGGCCT	2	12	10299392	10299403	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	442325029
7580	NC_020126	CCGGGC	2	12	10300514	10300525	0 %	0 %	50 %	50 %	442325029
7581	NC_020126	AGCCCC	2	12	10301380	10301391	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	442325030
7582	NC_020126	GAGCTG	2	12	10301463	10301474	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	442325030
7583	NC_020126	GGCCCC	2	12	10303869	10303880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442325032
7584	NC_020126	TCACCT	2	12	10304251	10304262	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	442325032
7585	NC_020126	CGTCAC	3	18	10304387	10304404	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	442325032
7586	NC_020126	CGGCAA	2	12	10304588	10304599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442325032
7587	NC_020126	GGCCCA	2	12	10306470	10306481	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442325033
7588	NC_020126	GCGCGG	2	12	10308531	10308542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442325034
7589	NC_020126	ACGCCC	2	12	10310820	10310831	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	442325036
7590	NC_020126	GGGGTG	2	12	10311042	10311053	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	442325036
7591	NC_020126	CACGCC	2	12	10312001	10312012	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	442325038
7592	NC_020126	ACGCTG	2	12	10312785	10312796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442325039
7593	NC_020126	CACCTC	3	18	10332260	10332277	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	442325051
7594	NC_020126	CCTCGC	2	12	10333471	10333482	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	442325051
7595	NC_020126	CCAGGC	2	12	10333753	10333764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442325051
7596	NC_020126	GGCCCA	2	12	10333798	10333809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	442325051
7597	NC_020126	GGCCTT	2	12	10335922	10335933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442325053
7598	NC_020126	CCAGCT	2	12	10336227	10336238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	442325053
7599	NC_020126	GCCTTC	2	12	10338596	10338607	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	442325053
7600	NC_020126	TGGAGC	2	12	10340750	10340761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	442325055
7601	NC_020126	TGGACC	2	12	10341110	10341121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442325056
7602	NC_020126	GGCGCT	2	12	10342488	10342499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	442325056
7603	NC_020126	CTGCGG	2	12	10347250	10347261	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	442325061
7604	NC_020126	CAGCGG	2	12	10348950	10348961	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	442325062
7605	NC_020126	GGCCTG	2	12	10349235	10349246	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	442325062

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.