MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Myxococcus stipitatus DSM 14675

Total Repeats: 8620

< Previous12...6789101112131415161718Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_020126	GATGC	2	10	10223286	10223295	20 %	20 %	40 %	20 %	442324962
8502	NC_020126	TTCGG	2	10	10223775	10223784	0 %	40 %	40 %	20 %	442324962
8503	NC_020126	GCGCT	2	10	10223859	10223868	0 %	20 %	40 %	40 %	442324962
8504	NC_020126	GCCTT	2	10	10224540	10224549	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8505	NC_020126	GAGGG	2	10	10227869	10227878	20 %	0 %	80 %	0 %	442324966
8506	NC_020126	CGGAG	2	10	10227926	10227935	20 %	0 %	60 %	20 %	442324966
8507	NC_020126	ACCGC	2	10	10229261	10229270	20 %	0 %	20 %	60 %	442324967
8508	NC_020126	CGAGG	2	10	10230140	10230149	20 %	0 %	60 %	20 %	442324968
8509	NC_020126	TCACC	2	10	10230950	10230959	20 %	20 %	0 %	60 %	442324969
8510	NC_020126	GCTTC	2	10	10235909	10235918	0 %	40 %	20 %	40 %	442324973
8511	NC_020126	GGTCA	2	10	10238407	10238416	20 %	20 %	40 %	20 %	442324975
8512	NC_020126	TGACG	2	10	10239727	10239736	20 %	20 %	40 %	20 %	442324977
8513	NC_020126	CGCGG	2	10	10239824	10239833	0 %	0 %	60 %	40 %	442324977
8514	NC_020126	CGCGC	2	10	10245679	10245688	0 %	0 %	40 %	60 %	442324982
8515	NC_020126	CCCCT	2	10	10248520	10248529	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8516	NC_020126	GGGAG	2	10	10248585	10248594	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_020126	CCACC	2	10	10248652	10248661	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8518	NC_020126	CCGGG	2	10	10249731	10249740	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8519	NC_020126	CGCGG	2	10	10249798	10249807	0 %	0 %	60 %	40 %	442324985
8520	NC_020126	GCGCA	2	10	10250173	10250182	20 %	0 %	40 %	40 %	442324985
8521	NC_020126	GGTCG	2	10	10250461	10250470	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8522	NC_020126	GCTCG	2	10	10252826	10252835	0 %	20 %	40 %	40 %	442324988
8523	NC_020126	CCTCG	2	10	10253238	10253247	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8524	NC_020126	GCACG	2	10	10253410	10253419	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8525	NC_020126	TCCAC	2	10	10253746	10253755	20 %	20 %	0 %	60 %	442324989
8526	NC_020126	CGTCC	2	10	10254281	10254290	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8527	NC_020126	CAGCG	2	10	10254436	10254445	20 %	0 %	40 %	40 %	442324990
8528	NC_020126	CCGAC	2	10	10255052	10255061	20 %	0 %	20 %	60 %	442324991
8529	NC_020126	ACGTC	2	10	10256958	10256967	20 %	20 %	20 %	40 %	442324993
8530	NC_020126	CACGC	2	10	10257057	10257066	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8531	NC_020126	GCGAC	2	10	10257454	10257463	20 %	0 %	40 %	40 %	442324994
8532	NC_020126	CGGCC	2	10	10257573	10257582	0 %	0 %	40 %	60 %	442324994
8533	NC_020126	CGCGC	2	10	10257897	10257906	0 %	0 %	40 %	60 %	442324994
8534	NC_020126	TCGCG	2	10	10258980	10258989	0 %	20 %	40 %	40 %	442324995
8535	NC_020126	CGCAC	2	10	10260058	10260067	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8536	NC_020126	CGGCC	2	10	10261494	10261503	0 %	0 %	40 %	60 %	442324996
8537	NC_020126	CGCGC	2	10	10264181	10264190	0 %	0 %	40 %	60 %	442324999
8538	NC_020126	TCCTC	2	10	10264444	10264453	0 %	40 %	0 %	60 %	442324999
8539	NC_020126	CCCCA	2	10	10265316	10265325	20 %	0 %	0 %	80 %	442325000
8540	NC_020126	CGGCT	2	10	10265406	10265415	0 %	20 %	40 %	40 %	442325000
8541	NC_020126	ACGCA	2	10	10266106	10266115	40 %	0 %	20 %	40 %	442325002
8542	NC_020126	CCTGG	2	10	10268486	10268495	0 %	20 %	40 %	40 %	442325003
8543	NC_020126	TGAAG	2	10	10268627	10268636	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_020126	CAGGA	2	10	10268713	10268722	40 %	0 %	40 %	20 %	442325004
8545	NC_020126	CGCTT	2	10	10269819	10269828	0 %	40 %	20 %	40 %	442325005
8546	NC_020126	TCGCG	2	10	10271036	10271045	0 %	20 %	40 %	40 %	442325007
8547	NC_020126	GGTGG	2	10	10272671	10272680	0 %	20 %	80 %	0 %	442325008
8548	NC_020126	ACACC	2	10	10274304	10274313	40 %	0 %	0 %	60 %	442325009
8549	NC_020126	CGCTG	2	10	10274960	10274969	0 %	20 %	40 %	40 %	442325010
8550	NC_020126	CGGGC	2	10	10276266	10276275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8551	NC_020126	CGAGG	2	10	10278609	10278618	20 %	0 %	60 %	20 %	442325013
8552	NC_020126	CGACG	2	10	10280185	10280194	20 %	0 %	40 %	40 %	442325015
8553	NC_020126	GCTGG	2	10	10281175	10281184	0 %	20 %	60 %	20 %	442325015
8554	NC_020126	CGAGA	2	10	10282169	10282178	40 %	0 %	40 %	20 %	442325015
8555	NC_020126	GGATG	2	10	10282650	10282659	20 %	20 %	60 %	0 %	442325016
8556	NC_020126	CGGCG	2	10	10286819	10286828	0 %	0 %	60 %	40 %	442325018
8557	NC_020126	CCACC	2	10	10286941	10286950	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8558	NC_020126	CGCTG	2	10	10287064	10287073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8559	NC_020126	AGCAC	2	10	10287983	10287992	40 %	0 %	20 %	40 %	442325019
8560	NC_020126	GCCGC	2	10	10288885	10288894	0 %	0 %	40 %	60 %	442325020
8561	NC_020126	TCCGC	2	10	10288933	10288942	0 %	20 %	20 %	60 %	442325020
8562	NC_020126	CGCCC	2	10	10288977	10288986	0 %	0 %	20 %	80 %	442325020
8563	NC_020126	TCGCC	2	10	10289470	10289479	0 %	20 %	20 %	60 %	442325020
8564	NC_020126	CCCGC	2	10	10289797	10289806	0 %	0 %	20 %	80 %	442325020
8565	NC_020126	ATTAA	2	10	10290622	10290631	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_020126	CGCGC	2	10	10290971	10290980	0 %	0 %	40 %	60 %	442325022
8567	NC_020126	CACTG	2	10	10294256	10294265	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8568	NC_020126	CCCCG	2	10	10294288	10294297	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
8569	NC_020126	ATGCC	2	10	10294731	10294740	20 %	20 %	20 %	40 %	442325026
8570	NC_020126	CGGGA	2	10	10294956	10294965	20 %	0 %	60 %	20 %	442325027
8571	NC_020126	CCGCG	2	10	10295542	10295551	0 %	0 %	40 %	60 %	442325027
8572	NC_020126	GCCGG	2	10	10297587	10297596	0 %	0 %	60 %	40 %	442325029
8573	NC_020126	CCTCG	2	10	10297871	10297880	0 %	20 %	20 %	60 %	442325029
8574	NC_020126	GCGCC	2	10	10299250	10299259	0 %	0 %	40 %	60 %	442325029
8575	NC_020126	GCGTC	2	10	10300469	10300478	0 %	20 %	40 %	40 %	442325029
8576	NC_020126	CGGAG	2	10	10300781	10300790	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8577	NC_020126	AGCCA	2	10	10300794	10300803	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8578	NC_020126	GACCT	2	10	10300820	10300829	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8579	NC_020126	CCGCG	2	10	10303754	10303763	0 %	0 %	40 %	60 %	442325032
8580	NC_020126	ACGCC	2	10	10304953	10304962	20 %	0 %	20 %	60 %	442325032
8581	NC_020126	CGGGC	2	10	10306797	10306806	0 %	0 %	60 %	40 %	442325033
8582	NC_020126	GGGCG	2	10	10307773	10307782	0 %	0 %	80 %	20 %	442325034
8583	NC_020126	CGCCC	2	10	10309418	10309427	0 %	0 %	20 %	80 %	442325035
8584	NC_020126	CCGGG	2	10	10309580	10309589	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8585	NC_020126	ACCCC	2	10	10309737	10309746	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8586	NC_020126	CGCGG	2	10	10311001	10311010	0 %	0 %	60 %	40 %	442325036
8587	NC_020126	TCCGC	2	10	10311432	10311441	0 %	20 %	20 %	60 %	442325037
8588	NC_020126	GCCGT	2	10	10312210	10312219	0 %	20 %	40 %	40 %	442325038
8589	NC_020126	GCCGC	2	10	10312241	10312250	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8590	NC_020126	AGCGA	2	10	10312483	10312492	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8591	NC_020126	GTGAG	2	10	10314782	10314791	20 %	20 %	60 %	0 %	442325041
8592	NC_020126	GGATG	2	10	10316060	10316069	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_020126	CCCGG	2	10	10316918	10316927	0 %	0 %	40 %	60 %	442325045
8594	NC_020126	GGTGG	2	10	10318781	10318790	0 %	20 %	80 %	0 %	442325047
8595	NC_020126	GGGTC	2	10	10319324	10319333	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8596	NC_020126	GGCAC	2	10	10320435	10320444	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8597	NC_020126	CCCCA	2	10	10320888	10320897	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8598	NC_020126	TCGCC	2	10	10322421	10322430	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8599	NC_020126	ACGCG	2	10	10327658	10327667	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8600	NC_020126	CACCC	2	10	10327773	10327782	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8601	NC_020126	CGTGA	2	10	10329871	10329880	20 %	20 %	40 %	20 %	442325049
8602	NC_020126	TCCCC	2	10	10330298	10330307	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8603	NC_020126	TCCCC	2	10	10330359	10330368	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8604	NC_020126	TCCCC	2	10	10330504	10330513	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8605	NC_020126	TCCCC	2	10	10330576	10330585	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8606	NC_020126	CTTCC	2	10	10330724	10330733	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8607	NC_020126	CCCCT	2	10	10330793	10330802	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8608	NC_020126	TCCCC	2	10	10330864	10330873	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8609	NC_020126	TCCCC	2	10	10330938	10330947	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8610	NC_020126	TCCCC	2	10	10331010	10331019	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8611	NC_020126	TCCCC	2	10	10331084	10331093	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8612	NC_020126	CCCCT	2	10	10331231	10331240	0 %	20 %	0 %	80 %	442325050
8613	NC_020126	CCGCT	2	10	10331266	10331275	0 %	20 %	20 %	60 %	442325050
8614	NC_020126	GACCG	2	10	10334218	10334227	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8615	NC_020126	CCCTC	2	10	10334349	10334358	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8616	NC_020126	CGCTG	2	10	10336806	10336815	0 %	20 %	40 %	40 %	442325053
8617	NC_020126	CGCGG	2	10	10337254	10337263	0 %	0 %	60 %	40 %	442325053
8618	NC_020126	GGCAG	2	10	10338815	10338824	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8619	NC_020126	CGCAA	2	10	10342267	10342276	40 %	0 %	20 %	40 %	442325056
8620	NC_020126	AGGTC	2	10	10347896	10347905	20 %	20 %	40 %	20 %	442325062

< Previous12...6789101112131415161718Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.