MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020125	GATT	2	8	330	337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020125	GTAT	2	8	1399	1406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020125	TTGT	2	8	1604	1611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020125	TTAA	2	8	7586	7593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020125	GAGT	2	8	9760	9767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020125	GGTC	2	8	9811	9818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020125	CAAA	2	8	10136	10143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020125	ATAG	2	8	10668	10675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020125	CCTT	2	8	11415	11422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020125	AGTA	2	8	11735	11742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020125	TCCA	2	8	11796	11803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020125	TCGC	2	8	12913	12920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020125	TTTC	2	8	13145	13152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020125	CGCT	2	8	13237	13244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020125	AGGC	2	8	13353	13360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020125	TCTT	2	8	13555	13562	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020125	TAAG	2	8	13630	13637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020125	AGTT	2	8	23394	23401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020125	TATT	2	8	23402	23409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020125	TAAG	2	8	24373	24380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020125	CAAA	2	8	24877	24884	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020125	AATA	2	8	28849	28856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020125	TTTA	2	8	48959	48966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020125	TATT	2	8	52222	52229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020125	TTTA	2	8	54955	54962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020125	GTCC	2	8	55050	55057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020125	ATAA	2	8	56482	56489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020125	ATTT	2	8	56844	56851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020125	ACTT	2	8	71721	71728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020125	ATTA	2	8	80437	80444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020125	TAAA	2	8	86736	86743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020125	AAAG	2	8	86759	86766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020125	GAAG	2	8	105323	105330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020125	ATTT	2	8	110539	110546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020125	CAAC	2	8	132405	132412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020125	TTTA	2	8	134660	134667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020125	CAAA	2	8	137292	137299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020125	TTTC	2	8	153622	153629	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020125	AAAC	2	8	159642	159649	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020125	TTTA	2	8	164909	164916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020125	TATT	2	8	168266	168273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020125	TTTA	2	8	173292	173299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020125	AAGG	10	40	173300	173339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020125	AATT	2	8	173623	173630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020125	AAAC	2	8	174120	174127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020125	ATTA	2	8	175433	175440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020125	AACT	2	8	182283	182290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020125	AACC	2	8	182695	182702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020125	TTAC	2	8	183993	184000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020125	ATAG	2	8	196064	196071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020125	GAGG	2	8	214803	214810	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020125	AATT	2	8	219856	219863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020125	TATT	2	8	223512	223519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020125	ACAA	2	8	223759	223766	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020125	TAGA	2	8	223783	223790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020125	AAGC	2	8	229965	229972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020125	ATTC	2	8	230017	230024	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020125	ATGG	2	8	248814	248821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020125	CCAT	2	8	248834	248841	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020125	AGGA	2	8	258249	258256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020125	TAAA	2	8	258295	258302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020125	TAAA	2	8	275495	275502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020125	GAAA	2	8	279942	279949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020125	TAAA	2	8	287083	287090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020125	AAGT	2	8	294209	294216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020125	AAAT	2	8	298702	298709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020125	TTGT	2	8	303624	303631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020125	CTTT	2	8	303664	303671	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020125	TATC	2	8	303806	303813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020125	GTCA	2	8	305010	305017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020125	TATC	2	8	305033	305040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020125	AAAT	2	8	308335	308342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020125	ATTT	2	8	308847	308854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020125	AAAT	2	8	310118	310125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020125	TTTA	2	8	310126	310133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020125	TTTA	2	8	316776	316783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020125	AAAC	2	8	319341	319348	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020125	ACTT	2	8	322320	322327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020125	AAAG	2	8	325693	325700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020125	TTCG	2	8	330682	330689	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020125	TTTA	2	8	330706	330713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020125	TTAC	2	8	330764	330771	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020125	TATC	2	8	330839	330846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020125	GGAT	2	8	330932	330939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020125	TAAA	2	8	332468	332475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020125	TTAT	2	8	333633	333640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020125	TTAC	2	8	336039	336046	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020125	TTTA	2	8	336079	336086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020125	TAAA	2	8	339799	339806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020125	CTTC	2	8	342902	342909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020125	AAAG	2	8	344616	344623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020125	TTTA	2	8	349460	349467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020125	TTAA	2	8	353231	353238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020125	ATTT	2	8	353755	353762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020125	AAAT	2	8	360885	360892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020125	TTCT	2	8	365195	365202	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020125	TTAT	2	8	365463	365470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020125	AAAT	2	8	371800	371807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020125	CTTA	2	8	371812	371819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020125	TAAG	2	8	372288	372295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020125	CTAA	2	8	372778	372785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020125	TGTT	2	8	375364	375371	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020125	TTAA	2	8	377775	377782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020125	ATTT	2	8	381739	381746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020125	TAAC	2	8	393347	393354	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020125	TATT	2	8	400308	400315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020125	TATT	2	8	400727	400734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020125	AAAT	2	8	401749	401756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020125	AATT	2	8	402484	402491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020125	ACTT	2	8	426278	426285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020125	TTAA	2	8	428755	428762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020125	ATTT	2	8	430541	430548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020125	AATA	2	8	435901	435908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020125	ATAA	2	8	436850	436857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020125	AAAC	2	8	442746	442753	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020125	TTTA	2	8	442777	442784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020125	GACC	2	8	450930	450937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020125	ATGA	2	8	456629	456636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020125	ATAA	2	8	456657	456664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020125	TAAC	2	8	463724	463731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020125	TATC	2	8	468931	468938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020125	TAAG	2	8	476378	476385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020125	ATTT	2	8	476402	476409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020125	TATT	2	8	477229	477236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020125	TTTA	2	8	478223	478230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020125	ATCT	2	8	479367	479374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020125	TTTA	2	8	482680	482687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020125	TGAT	2	8	482764	482771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020125	TTTA	2	8	491498	491505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020125	AAAT	2	8	502633	502640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020125	TTTA	2	8	506176	506183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020125	TTTG	2	8	513352	513359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020125	GGGT	2	8	513369	513376	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020125	AATA	2	8	513387	513394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020125	ATTA	2	8	515565	515572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020125	TTAA	2	8	518887	518894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020125	TTTA	2	8	526969	526976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020125	TCTG	2	8	536360	536367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020125	TTAA	2	8	536538	536545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020125	TACT	2	8	536590	536597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020125	ATTT	2	8	536811	536818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020125	TGAT	2	8	536856	536863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020125	ATAG	2	8	553464	553471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020125	AAAT	2	8	553986	553993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020125	AATA	2	8	559474	559481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020125	TTTA	2	8	567869	567876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020125	TGAT	2	8	570526	570533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020125	CTTA	2	8	572441	572448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020125	TGGT	2	8	572470	572477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020125	AAGA	2	8	572516	572523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_020125	AGCG	2	8	572834	572841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_020125	GAAA	2	8	1628529	1628536	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
486	NC_020125	CTTT	2	8	1638120	1638127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_020125	TAAA	2	8	1686688	1686695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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