MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 4896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020125	CTAT	2	8	2313	2320	25 %	50 %	0 %	25 %	442313699
2	NC_020125	AAAG	2	8	2446	2453	75 %	0 %	25 %	0 %	442313699
3	NC_020125	TCCG	2	8	2871	2878	0 %	25 %	25 %	50 %	442313699
4	NC_020125	TATC	2	8	3014	3021	25 %	50 %	0 %	25 %	442313700
5	NC_020125	ATAG	2	8	3394	3401	50 %	25 %	25 %	0 %	442313700
6	NC_020125	AAAC	2	8	4434	4441	75 %	0 %	0 %	25 %	442313701
7	NC_020125	TCTT	2	8	5223	5230	0 %	75 %	0 %	25 %	442313701
8	NC_020125	GGCA	2	8	7868	7875	25 %	0 %	50 %	25 %	442313703
9	NC_020125	CATG	2	8	8313	8320	25 %	25 %	25 %	25 %	442313703
10	NC_020125	TTTC	2	8	9006	9013	0 %	75 %	0 %	25 %	442313703
11	NC_020125	TGTT	2	8	16181	16188	0 %	75 %	25 %	0 %	442313705
12	NC_020125	ATTT	2	8	17222	17229	25 %	75 %	0 %	0 %	442313706
13	NC_020125	CCTT	2	8	18014	18021	0 %	50 %	0 %	50 %	442313707
14	NC_020125	CTTT	2	8	18268	18275	0 %	75 %	0 %	25 %	442313708
15	NC_020125	TATT	2	8	18492	18499	25 %	75 %	0 %	0 %	442313708
16	NC_020125	TAAA	2	8	19914	19921	75 %	25 %	0 %	0 %	442313710
17	NC_020125	AATC	2	8	19976	19983	50 %	25 %	0 %	25 %	442313710
18	NC_020125	TTTC	2	8	20431	20438	0 %	75 %	0 %	25 %	442313710
19	NC_020125	TGGG	2	8	20527	20534	0 %	25 %	75 %	0 %	442313710
20	NC_020125	TCTT	2	8	21580	21587	0 %	75 %	0 %	25 %	442313711
21	NC_020125	TATT	2	8	22517	22524	25 %	75 %	0 %	0 %	442313711
22	NC_020125	CCAT	2	8	22593	22600	25 %	25 %	0 %	50 %	442313711
23	NC_020125	TAAA	2	8	22908	22915	75 %	25 %	0 %	0 %	442313712
24	NC_020125	TTTC	2	8	23019	23026	0 %	75 %	0 %	25 %	442313712
25	NC_020125	TATC	2	8	24311	24318	25 %	50 %	0 %	25 %	442313715
26	NC_020125	GTAA	2	8	24597	24604	50 %	25 %	25 %	0 %	442313716
27	NC_020125	GCTT	2	8	24977	24984	0 %	50 %	25 %	25 %	442313717
28	NC_020125	TTTA	2	8	26935	26942	25 %	75 %	0 %	0 %	442313720
29	NC_020125	CTTA	2	8	27212	27219	25 %	50 %	0 %	25 %	442313721
30	NC_020125	AGTA	2	8	27554	27561	50 %	25 %	25 %	0 %	442313721
31	NC_020125	TGAT	2	8	27949	27956	25 %	50 %	25 %	0 %	442313721
32	NC_020125	TGTC	2	8	28186	28193	0 %	50 %	25 %	25 %	442313722
33	NC_020125	AGTA	2	8	28313	28320	50 %	25 %	25 %	0 %	442313722
34	NC_020125	TAAG	2	8	29180	29187	50 %	25 %	25 %	0 %	442313723
35	NC_020125	TCTT	2	8	29679	29686	0 %	75 %	0 %	25 %	442313724
36	NC_020125	TCTG	2	8	29776	29783	0 %	50 %	25 %	25 %	442313724
37	NC_020125	ATGT	2	8	30720	30727	25 %	50 %	25 %	0 %	442313724
38	NC_020125	TATC	2	8	30781	30788	25 %	50 %	0 %	25 %	442313724
39	NC_020125	TGGT	2	8	30865	30872	0 %	50 %	50 %	0 %	442313724
40	NC_020125	TTTA	2	8	31227	31234	25 %	75 %	0 %	0 %	442313724
41	NC_020125	ATTC	2	8	31413	31420	25 %	50 %	0 %	25 %	442313724
42	NC_020125	TTTA	2	8	31980	31987	25 %	75 %	0 %	0 %	442313725
43	NC_020125	TTGT	2	8	32382	32389	0 %	75 %	25 %	0 %	442313725
44	NC_020125	GATT	2	8	32810	32817	25 %	50 %	25 %	0 %	442313725
45	NC_020125	AAAC	2	8	33135	33142	75 %	0 %	0 %	25 %	442313725
46	NC_020125	CTTT	2	8	33549	33556	0 %	75 %	0 %	25 %	442313725
47	NC_020125	TCAA	2	8	33689	33696	50 %	25 %	0 %	25 %	442313725
48	NC_020125	TGAA	2	8	33933	33940	50 %	25 %	25 %	0 %	442313726
49	NC_020125	AAAC	2	8	33946	33953	75 %	0 %	0 %	25 %	442313726
50	NC_020125	AATT	2	8	34146	34153	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
51	NC_020125	TTAA	2	8	35046	35053	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
52	NC_020125	GGTA	2	8	35159	35166	25 %	25 %	50 %	0 %	442313727
53	NC_020125	CTGT	2	8	35212	35219	0 %	50 %	25 %	25 %	442313727
54	NC_020125	GAAC	2	8	35742	35749	50 %	0 %	25 %	25 %	442313727
55	NC_020125	GGTC	2	8	36265	36272	0 %	25 %	50 %	25 %	442313727
56	NC_020125	ATCA	2	8	36326	36333	50 %	25 %	0 %	25 %	442313727
57	NC_020125	TCTA	2	8	37166	37173	25 %	50 %	0 %	25 %	442313727
58	NC_020125	AAGT	2	8	37346	37353	50 %	25 %	25 %	0 %	442313727
59	NC_020125	AAGA	2	8	37792	37799	75 %	0 %	25 %	0 %	442313727
60	NC_020125	AACG	2	8	38079	38086	50 %	0 %	25 %	25 %	442313727
61	NC_020125	GCAT	2	8	38791	38798	25 %	25 %	25 %	25 %	442313728
62	NC_020125	CCAA	2	8	39006	39013	50 %	0 %	0 %	50 %	442313728
63	NC_020125	ACGA	2	8	39120	39127	50 %	0 %	25 %	25 %	442313728
64	NC_020125	GAAG	2	8	39232	39239	50 %	0 %	50 %	0 %	442313728
65	NC_020125	AATT	2	8	39318	39325	50 %	50 %	0 %	0 %	442313728
66	NC_020125	TTAA	2	8	39328	39335	50 %	50 %	0 %	0 %	442313728
67	NC_020125	ACTG	2	8	39394	39401	25 %	25 %	25 %	25 %	442313728
68	NC_020125	TTGG	2	8	40134	40141	0 %	50 %	50 %	0 %	442313728
69	NC_020125	CATT	2	8	40991	40998	25 %	50 %	0 %	25 %	442313728
70	NC_020125	AGTA	2	8	41169	41176	50 %	25 %	25 %	0 %	442313728
71	NC_020125	ACCT	2	8	41229	41236	25 %	25 %	0 %	50 %	442313728
72	NC_020125	TCTA	2	8	41490	41497	25 %	50 %	0 %	25 %	442313728
73	NC_020125	TTTC	2	8	41509	41516	0 %	75 %	0 %	25 %	442313728
74	NC_020125	TCCA	2	8	41770	41777	25 %	25 %	0 %	50 %	442313728
75	NC_020125	TAAG	2	8	42031	42038	50 %	25 %	25 %	0 %	442313728
76	NC_020125	AATT	2	8	42275	42282	50 %	50 %	0 %	0 %	442313728
77	NC_020125	CTGA	2	8	42974	42981	25 %	25 %	25 %	25 %	442313729
78	NC_020125	CCAC	2	8	42996	43003	25 %	0 %	0 %	75 %	442313729
79	NC_020125	ATTT	2	8	46202	46209	25 %	75 %	0 %	0 %	442313731
80	NC_020125	AGAA	2	8	49462	49469	75 %	0 %	25 %	0 %	442313735
81	NC_020125	TAAG	2	8	49582	49589	50 %	25 %	25 %	0 %	442313735
82	NC_020125	CATT	2	8	49824	49831	25 %	50 %	0 %	25 %	442313735
83	NC_020125	CTAC	2	8	50786	50793	25 %	25 %	0 %	50 %	442313737
84	NC_020125	CTTT	2	8	51069	51076	0 %	75 %	0 %	25 %	442313737
85	NC_020125	TGTT	2	8	51081	51088	0 %	75 %	25 %	0 %	442313737
86	NC_020125	ATCA	2	8	51441	51448	50 %	25 %	0 %	25 %	442313738
87	NC_020125	CATC	2	8	51509	51516	25 %	25 %	0 %	50 %	442313738
88	NC_020125	CTCA	2	8	51843	51850	25 %	25 %	0 %	50 %	442313738
89	NC_020125	ATTA	2	8	51870	51877	50 %	50 %	0 %	0 %	442313739
90	NC_020125	CCAC	2	8	52876	52883	25 %	0 %	0 %	75 %	442313740
91	NC_020125	CCAT	2	8	53133	53140	25 %	25 %	0 %	50 %	442313740
92	NC_020125	CTTT	2	8	53259	53266	0 %	75 %	0 %	25 %	442313740
93	NC_020125	ATCA	2	8	53928	53935	50 %	25 %	0 %	25 %	442313741
94	NC_020125	TTCT	2	8	54048	54055	0 %	75 %	0 %	25 %	442313741
95	NC_020125	CTTC	2	8	54296	54303	0 %	50 %	0 %	50 %	442313741
96	NC_020125	TCTT	2	8	55290	55297	0 %	75 %	0 %	25 %	442313742
97	NC_020125	ATTT	2	8	55492	55499	25 %	75 %	0 %	0 %	442313742
98	NC_020125	TTTC	2	8	55601	55608	0 %	75 %	0 %	25 %	442313743
99	NC_020125	CTTT	3	12	55898	55909	0 %	75 %	0 %	25 %	442313743
100	NC_020125	TTTA	2	8	56084	56091	25 %	75 %	0 %	0 %	442313743
101	NC_020125	TATC	2	8	57151	57158	25 %	50 %	0 %	25 %	442313745
102	NC_020125	TTTA	2	8	57786	57793	25 %	75 %	0 %	0 %	442313746
103	NC_020125	CTAT	2	8	58474	58481	25 %	50 %	0 %	25 %	442313746
104	NC_020125	CTTT	2	8	58633	58640	0 %	75 %	0 %	25 %	442313746
105	NC_020125	GCTT	2	8	59157	59164	0 %	50 %	25 %	25 %	442313747
106	NC_020125	ATAA	2	8	59556	59563	75 %	25 %	0 %	0 %	442313747
107	NC_020125	ATTG	4	16	60241	60256	25 %	50 %	25 %	0 %	442313749
108	NC_020125	CTCC	2	8	61176	61183	0 %	25 %	0 %	75 %	442313750
109	NC_020125	AGAT	2	8	61558	61565	50 %	25 %	25 %	0 %	442313751
110	NC_020125	AAAG	2	8	61566	61573	75 %	0 %	25 %	0 %	442313751
111	NC_020125	TCAA	2	8	61639	61646	50 %	25 %	0 %	25 %	442313751
112	NC_020125	TAAA	2	8	61666	61673	75 %	25 %	0 %	0 %	442313751
113	NC_020125	CCCT	2	8	62080	62087	0 %	25 %	0 %	75 %	442313751
114	NC_020125	TCTT	2	8	62093	62100	0 %	75 %	0 %	25 %	442313751
115	NC_020125	CTTT	2	8	62143	62150	0 %	75 %	0 %	25 %	442313751
116	NC_020125	CATT	2	8	62797	62804	25 %	50 %	0 %	25 %	442313751
117	NC_020125	TACA	2	8	63525	63532	50 %	25 %	0 %	25 %	442313751
118	NC_020125	TGCG	2	8	64261	64268	0 %	25 %	50 %	25 %	442313753
119	NC_020125	GGTA	2	8	64793	64800	25 %	25 %	50 %	0 %	442313753
120	NC_020125	CTTT	2	8	64839	64846	0 %	75 %	0 %	25 %	442313753
121	NC_020125	TAAA	2	8	65290	65297	75 %	25 %	0 %	0 %	442313753
122	NC_020125	ACTG	2	8	65310	65317	25 %	25 %	25 %	25 %	442313753
123	NC_020125	AGAA	2	8	65689	65696	75 %	0 %	25 %	0 %	442313753
124	NC_020125	TTTA	2	8	65785	65792	25 %	75 %	0 %	0 %	442313753
125	NC_020125	TCAC	2	8	65954	65961	25 %	25 %	0 %	50 %	442313753
126	NC_020125	AGAT	2	8	66277	66284	50 %	25 %	25 %	0 %	442313753
127	NC_020125	TGGA	2	8	66297	66304	25 %	25 %	50 %	0 %	442313753
128	NC_020125	AAAT	2	8	66498	66505	75 %	25 %	0 %	0 %	442313753
129	NC_020125	ACAA	2	8	66526	66533	75 %	0 %	0 %	25 %	442313754
130	NC_020125	GTTC	2	8	66805	66812	0 %	50 %	25 %	25 %	442313755
131	NC_020125	CTTA	2	8	66951	66958	25 %	50 %	0 %	25 %	442313755
132	NC_020125	TTGG	2	8	67111	67118	0 %	50 %	50 %	0 %	442313755
133	NC_020125	AACT	2	8	67312	67319	50 %	25 %	0 %	25 %	442313755
134	NC_020125	ATCA	2	8	67532	67539	50 %	25 %	0 %	25 %	442313755
135	NC_020125	AATA	2	8	67858	67865	75 %	25 %	0 %	0 %	442313756
136	NC_020125	TTTA	2	8	68286	68293	25 %	75 %	0 %	0 %	442313756
137	NC_020125	TTGT	2	8	68328	68335	0 %	75 %	25 %	0 %	442313756
138	NC_020125	ATTG	2	8	68468	68475	25 %	50 %	25 %	0 %	442313756
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