MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 28537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020125	ACT	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020125	TAG	2	6	75	80	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020125	ACC	2	6	156	161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_020125	AGT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020125	GAG	2	6	201	206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020125	GTA	2	6	234	239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020125	TCC	2	6	311	316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020125	TAG	2	6	432	437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313697
9	NC_020125	CCG	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313697
10	NC_020125	ATT	2	6	597	602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313697
11	NC_020125	TCC	2	6	746	751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313697
12	NC_020125	CTA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313697
13	NC_020125	CCT	2	6	792	797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313697
14	NC_020125	AAG	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313697
15	NC_020125	GTG	2	6	834	839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313697
16	NC_020125	ATA	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313697
17	NC_020125	TTG	2	6	1134	1139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020125	TGA	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313698
19	NC_020125	GAG	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313698
20	NC_020125	CAA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313698
21	NC_020125	CAA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020125	ATT	2	6	1563	1568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020125	AAT	2	6	1580	1585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020125	AAG	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313699
25	NC_020125	CTT	2	6	1908	1913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313699
26	NC_020125	TAT	2	6	1914	1919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313699
27	NC_020125	TAA	2	6	2077	2082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313699
28	NC_020125	TGT	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313699
29	NC_020125	TTA	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313699
30	NC_020125	AGA	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313699
31	NC_020125	CTT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313699
32	NC_020125	CAT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313699
33	NC_020125	ACC	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313699
34	NC_020125	TTA	2	6	2436	2441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313699
35	NC_020125	CCA	2	6	2572	2577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313699
36	NC_020125	GCC	2	6	2578	2583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313699
37	NC_020125	ACC	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313699
38	NC_020125	TGG	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313699
39	NC_020125	AGA	2	6	2908	2913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313699
40	NC_020125	AGA	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313699
41	NC_020125	CAT	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313700
42	NC_020125	GGT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313700
43	NC_020125	CAA	2	6	3139	3144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313700
44	NC_020125	GAG	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313700
45	NC_020125	GTT	3	9	3279	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313700
46	NC_020125	CCT	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313700
47	NC_020125	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313700
48	NC_020125	GAC	2	6	3583	3588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313700
49	NC_020125	ATG	2	6	3713	3718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313700
50	NC_020125	TCA	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313700
51	NC_020125	TCA	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313700
52	NC_020125	ACC	2	6	3848	3853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313700
53	NC_020125	GAA	2	6	3867	3872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313700
54	NC_020125	TGG	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313700
55	NC_020125	GAG	2	6	3989	3994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442313700
56	NC_020125	GGT	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313700
57	NC_020125	ATC	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313700
58	NC_020125	TCT	2	6	4033	4038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313700
59	NC_020125	CTA	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313700
60	NC_020125	TGA	2	6	4206	4211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313700
61	NC_020125	AGC	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313700
62	NC_020125	TAA	2	6	4261	4266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313700
63	NC_020125	TAT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020125	CCT	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_020125	TTC	2	6	4474	4479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313701
66	NC_020125	AAC	2	6	4560	4565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313701
67	NC_020125	GTA	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313701
68	NC_020125	TGA	3	9	4595	4603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313701
69	NC_020125	ATT	2	6	4605	4610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313701
70	NC_020125	ATT	2	6	4689	4694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313701
71	NC_020125	GAA	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313701
72	NC_020125	TAA	2	6	4973	4978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313701
73	NC_020125	GCA	2	6	5076	5081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313701
74	NC_020125	TAC	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313701
75	NC_020125	AAT	2	6	5190	5195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313701
76	NC_020125	AGA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313701
77	NC_020125	GAT	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313701
78	NC_020125	CTA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313701
79	NC_020125	AAG	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313701
80	NC_020125	GTA	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313701
81	NC_020125	TAC	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313701
82	NC_020125	GGC	2	6	5606	5611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442313701
83	NC_020125	TGG	2	6	5727	5732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313701
84	NC_020125	CAA	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313702
85	NC_020125	TGA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
86	NC_020125	GAA	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
87	NC_020125	AGA	3	9	6025	6033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
88	NC_020125	GAA	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
89	NC_020125	ACT	2	6	6165	6170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313702
90	NC_020125	TGA	3	9	6175	6183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
91	NC_020125	CAA	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313702
92	NC_020125	ATG	2	6	6315	6320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
93	NC_020125	GAT	2	6	6353	6358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
94	NC_020125	GAA	2	6	6389	6394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
95	NC_020125	GAA	2	6	6401	6406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
96	NC_020125	GAA	2	6	6614	6619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
97	NC_020125	AAG	2	6	6624	6629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
98	NC_020125	GGT	2	6	6665	6670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313702
99	NC_020125	ATT	2	6	6707	6712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313702
100	NC_020125	ATA	2	6	6738	6743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313702
101	NC_020125	CTC	2	6	6750	6755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313702
102	NC_020125	CAC	2	6	6774	6779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313702
103	NC_020125	TCA	2	6	6867	6872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313702
104	NC_020125	ACA	2	6	6964	6969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313702
105	NC_020125	TGA	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
106	NC_020125	AGT	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
107	NC_020125	TAC	2	6	7107	7112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313702
108	NC_020125	AAG	2	6	7191	7196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
109	NC_020125	TAG	2	6	7197	7202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
110	NC_020125	TGA	2	6	7231	7236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313702
111	NC_020125	ACA	2	6	7269	7274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313702
112	NC_020125	AGA	2	6	7280	7285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313702
113	NC_020125	ATC	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020125	TAT	2	6	7392	7397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020125	CAT	2	6	7727	7732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313703
116	NC_020125	TTA	2	6	7785	7790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313703
117	NC_020125	TGA	3	9	7888	7896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313703
118	NC_020125	CTT	2	6	8002	8007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313703
119	NC_020125	GCG	2	6	8016	8021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442313703
120	NC_020125	AGA	2	6	8060	8065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313703
121	NC_020125	ACA	2	6	8086	8091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313703
122	NC_020125	AAC	2	6	8151	8156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313703
123	NC_020125	GAA	2	6	8256	8261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313703
124	NC_020125	TGG	2	6	8291	8296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442313703
125	NC_020125	AAT	2	6	8402	8407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313703
126	NC_020125	CAA	2	6	8439	8444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313703
127	NC_020125	TCA	2	6	8620	8625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313703
128	NC_020125	TAC	2	6	8724	8729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313703
129	NC_020125	AGA	2	6	8921	8926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313703
130	NC_020125	TAA	2	6	8939	8944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313703
131	NC_020125	TTC	2	6	8955	8960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313703
132	NC_020125	AAT	2	6	9057	9062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313703
133	NC_020125	CAC	2	6	9134	9139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313703
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153	NC_020125	TAC	2	6	10426	10431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020125	GGC	2	6	10583	10588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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261	NC_020125	CAC	2	6	20501	20506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313710
262	NC_020125	TGA	2	6	20646	20651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_020125	TAG	2	6	20754	20759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313711
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266	NC_020125	ATC	2	6	20793	20798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313711
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268	NC_020125	TTC	2	6	20832	20837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313711
269	NC_020125	TCT	3	9	20851	20859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313711
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272	NC_020125	TTC	2	6	20954	20959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313711
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376	NC_020125	TAT	2	6	28024	28029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
377	NC_020125	CTT	2	6	28261	28266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313722
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386	NC_020125	CTA	2	6	28911	28916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313723
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388	NC_020125	ACC	3	9	29007	29015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313723
389	NC_020125	TAA	2	6	29063	29068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313723
390	NC_020125	GAA	2	6	29163	29168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313723
391	NC_020125	GTA	2	6	29248	29253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313723
392	NC_020125	CTC	2	6	29261	29266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313723
393	NC_020125	ACC	2	6	29388	29393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313723
394	NC_020125	CTT	2	6	29408	29413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313723
395	NC_020125	CTG	2	6	29444	29449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442313723
396	NC_020125	TAT	2	6	29504	29509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_020125	AAT	2	6	29519	29524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_020125	CTT	2	6	29552	29557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313724
399	NC_020125	TCT	2	6	29716	29721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313724
400	NC_020125	TTA	2	6	29809	29814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313724
401	NC_020125	ACC	2	6	29914	29919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313724
402	NC_020125	TCA	2	6	30028	30033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313724
403	NC_020125	CTC	2	6	30092	30097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442313724
404	NC_020125	TCA	2	6	30133	30138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313724
405	NC_020125	AAT	2	6	30145	30150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313724
406	NC_020125	TTC	2	6	30176	30181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313724
407	NC_020125	TGA	2	6	30215	30220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313724
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411	NC_020125	ATT	2	6	30639	30644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313724
412	NC_020125	TTC	2	6	30672	30677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313724
413	NC_020125	CCA	2	6	30845	30850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313724
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419	NC_020125	CAA	2	6	31313	31318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313724
420	NC_020125	CAG	2	6	31400	31405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442313724
421	NC_020125	ATA	2	6	31503	31508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_020125	CTA	2	6	31518	31523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313725
423	NC_020125	GAA	2	6	31551	31556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313725
424	NC_020125	ATT	2	6	31680	31685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
425	NC_020125	TGA	2	6	31753	31758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313725
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429	NC_020125	ATT	2	6	31992	31997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
430	NC_020125	TAA	2	6	32397	32402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313725
431	NC_020125	CAA	2	6	32415	32420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442313725
432	NC_020125	TTA	2	6	32443	32448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
433	NC_020125	AGA	2	6	32464	32469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313725
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437	NC_020125	TAT	2	6	32792	32797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
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441	NC_020125	ATT	2	6	32955	32960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313725
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449	NC_020125	TAA	2	6	33642	33647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442313725
450	NC_020125	ATT	2	6	33732	33737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_020125	TTA	2	6	33752	33757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313726
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453	NC_020125	TTG	2	6	33911	33916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442313726
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456	NC_020125	ATT	3	9	34067	34075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_020125	TTA	2	6	34079	34084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_020125	TTA	2	6	34170	34175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442313727
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465	NC_020125	TCA	2	6	34633	34638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
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467	NC_020125	TCA	2	6	34668	34673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
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474	NC_020125	TTC	2	6	35337	35342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
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481	NC_020125	TTC	2	6	35792	35797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
482	NC_020125	CTA	2	6	35896	35901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
483	NC_020125	TCA	2	6	35904	35909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442313727
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489	NC_020125	TCT	2	6	36427	36432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
490	NC_020125	CAC	2	6	36440	36445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442313727
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492	NC_020125	TTC	2	6	36582	36587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442313727
493	NC_020125	TGA	2	6	36601	36606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313727
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497	NC_020125	AAG	2	6	37106	37111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442313727
498	NC_020125	TGA	3	9	37228	37236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313727
499	NC_020125	GCC	2	6	37254	37259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442313727
500	NC_020125	AGT	2	6	37327	37332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442313727

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