MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 3628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020125	TA	3	6	608	613	50 %	50 %	0 %	0 %	442313697
2	NC_020125	AC	4	8	1281	1288	50 %	0 %	0 %	50 %	442313698
3	NC_020125	TG	10	20	1535	1554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020125	AC	3	6	1831	1836	50 %	0 %	0 %	50 %	442313699
5	NC_020125	GA	4	8	2378	2385	50 %	0 %	50 %	0 %	442313699
6	NC_020125	CA	3	6	2482	2487	50 %	0 %	0 %	50 %	442313699
7	NC_020125	AC	3	6	3669	3674	50 %	0 %	0 %	50 %	442313700
8	NC_020125	AG	3	6	4213	4218	50 %	0 %	50 %	0 %	442313700
9	NC_020125	AC	3	6	4766	4771	50 %	0 %	0 %	50 %	442313701
10	NC_020125	AG	3	6	5659	5664	50 %	0 %	50 %	0 %	442313701
11	NC_020125	AG	3	6	5990	5995	50 %	0 %	50 %	0 %	442313702
12	NC_020125	AG	3	6	6332	6337	50 %	0 %	50 %	0 %	442313702
13	NC_020125	TA	3	6	7543	7548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020125	AG	3	6	8052	8057	50 %	0 %	50 %	0 %	442313703
15	NC_020125	AT	3	6	8379	8384	50 %	50 %	0 %	0 %	442313703
16	NC_020125	AG	3	6	9030	9035	50 %	0 %	50 %	0 %	442313703
17	NC_020125	TC	3	6	9388	9393	0 %	50 %	0 %	50 %	442313703
18	NC_020125	TA	3	6	9465	9470	50 %	50 %	0 %	0 %	442313703
19	NC_020125	TC	3	6	9986	9991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020125	TA	3	6	10301	10306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020125	GT	3	6	10314	10319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020125	TC	3	6	11614	11619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020125	AT	3	6	12157	12162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020125	AT	3	6	12885	12890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020125	GT	3	6	13057	13062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020125	TA	3	6	13596	13601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020125	GT	3	6	13811	13816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020125	GT	3	6	13980	13985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020125	TC	3	6	15290	15295	0 %	50 %	0 %	50 %	442313704
30	NC_020125	TC	3	6	15477	15482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020125	AT	3	6	15554	15559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020125	AT	4	8	15606	15613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020125	TA	3	6	16531	16536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020125	AT	3	6	16642	16647	50 %	50 %	0 %	0 %	442313706
35	NC_020125	CT	3	6	16809	16814	0 %	50 %	0 %	50 %	442313706
36	NC_020125	TC	3	6	17336	17341	0 %	50 %	0 %	50 %	442313706
37	NC_020125	AT	3	6	17442	17447	50 %	50 %	0 %	0 %	442313706
38	NC_020125	TA	3	6	17520	17525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020125	TA	3	6	18022	18027	50 %	50 %	0 %	0 %	442313707
40	NC_020125	TG	3	6	18199	18204	0 %	50 %	50 %	0 %	442313708
41	NC_020125	TA	3	6	18282	18287	50 %	50 %	0 %	0 %	442313708
42	NC_020125	AT	3	6	18863	18868	50 %	50 %	0 %	0 %	442313708
43	NC_020125	CT	3	6	19890	19895	0 %	50 %	0 %	50 %	442313710
44	NC_020125	TA	4	8	19947	19954	50 %	50 %	0 %	0 %	442313710
45	NC_020125	TA	3	6	20291	20296	50 %	50 %	0 %	0 %	442313710
46	NC_020125	TA	3	6	20683	20688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020125	AT	3	6	20839	20844	50 %	50 %	0 %	0 %	442313711
48	NC_020125	AT	3	6	21138	21143	50 %	50 %	0 %	0 %	442313711
49	NC_020125	TC	3	6	21430	21435	0 %	50 %	0 %	50 %	442313711
50	NC_020125	AT	3	6	21702	21707	50 %	50 %	0 %	0 %	442313711
51	NC_020125	AT	3	6	21728	21733	50 %	50 %	0 %	0 %	442313711
52	NC_020125	AT	3	6	21889	21894	50 %	50 %	0 %	0 %	442313711
53	NC_020125	TA	3	6	22004	22009	50 %	50 %	0 %	0 %	442313711
54	NC_020125	CT	3	6	22096	22101	0 %	50 %	0 %	50 %	442313711
55	NC_020125	GT	3	6	22232	22237	0 %	50 %	50 %	0 %	442313711
56	NC_020125	TA	3	6	22718	22723	50 %	50 %	0 %	0 %	442313711
57	NC_020125	AT	3	6	22815	22820	50 %	50 %	0 %	0 %	442313711
58	NC_020125	TA	3	6	23909	23914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020125	TA	3	6	24101	24106	50 %	50 %	0 %	0 %	442313715
60	NC_020125	TC	3	6	25611	25616	0 %	50 %	0 %	50 %	442313718
61	NC_020125	CT	3	6	26954	26959	0 %	50 %	0 %	50 %	442313720
62	NC_020125	TA	3	6	27051	27056	50 %	50 %	0 %	0 %	442313720
63	NC_020125	AT	3	6	27955	27960	50 %	50 %	0 %	0 %	442313721
64	NC_020125	TC	3	6	29583	29588	0 %	50 %	0 %	50 %	442313724
65	NC_020125	TC	3	6	29725	29730	0 %	50 %	0 %	50 %	442313724
66	NC_020125	TC	3	6	30302	30307	0 %	50 %	0 %	50 %	442313724
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68	NC_020125	TC	3	6	34467	34472	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
69	NC_020125	CT	3	6	34903	34908	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
70	NC_020125	TC	3	6	35529	35534	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
71	NC_020125	CT	3	6	35716	35721	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
72	NC_020125	AT	4	8	35846	35853	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
73	NC_020125	AT	3	6	36240	36245	50 %	50 %	0 %	0 %	442313727
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75	NC_020125	CT	3	6	38138	38143	0 %	50 %	0 %	50 %	442313727
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80	NC_020125	AT	3	6	39845	39850	50 %	50 %	0 %	0 %	442313728
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82	NC_020125	TC	3	6	40527	40532	0 %	50 %	0 %	50 %	442313728
83	NC_020125	AT	3	6	40611	40616	50 %	50 %	0 %	0 %	442313728
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85	NC_020125	TA	3	6	41730	41735	50 %	50 %	0 %	0 %	442313728
86	NC_020125	CT	4	8	42041	42048	0 %	50 %	0 %	50 %	442313728
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89	NC_020125	GT	3	6	42188	42193	0 %	50 %	50 %	0 %	442313728
90	NC_020125	AT	3	6	42598	42603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020125	CT	3	6	42929	42934	0 %	50 %	0 %	50 %	442313729
92	NC_020125	CT	3	6	45806	45811	0 %	50 %	0 %	50 %	442313730
93	NC_020125	AT	4	8	46086	46093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020125	AT	3	6	46187	46192	50 %	50 %	0 %	0 %	442313731
95	NC_020125	TC	3	6	47340	47345	0 %	50 %	0 %	50 %	442313733
96	NC_020125	TA	3	6	48174	48179	50 %	50 %	0 %	0 %	442313733
97	NC_020125	AT	3	6	48814	48819	50 %	50 %	0 %	0 %	442313733
98	NC_020125	GA	3	6	49981	49986	50 %	0 %	50 %	0 %	442313736
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100	NC_020125	CT	3	6	51163	51168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020125	TA	3	6	51209	51214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_020125	CT	3	6	51457	51462	0 %	50 %	0 %	50 %	442313738
104	NC_020125	TA	3	6	51783	51788	50 %	50 %	0 %	0 %	442313738
105	NC_020125	TA	3	6	52039	52044	50 %	50 %	0 %	0 %	442313739
106	NC_020125	CT	3	6	52564	52569	0 %	50 %	0 %	50 %	442313740
107	NC_020125	CT	3	6	53081	53086	0 %	50 %	0 %	50 %	442313740
108	NC_020125	AT	3	6	53593	53598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020125	AT	3	6	53658	53663	50 %	50 %	0 %	0 %	442313741
110	NC_020125	TC	3	6	54697	54702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020125	GA	3	6	54709	54714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020125	TC	4	8	55957	55964	0 %	50 %	0 %	50 %	442313743
113	NC_020125	TA	3	6	57773	57778	50 %	50 %	0 %	0 %	442313746
114	NC_020125	TC	3	6	58184	58189	0 %	50 %	0 %	50 %	442313746
115	NC_020125	CT	4	8	60451	60458	0 %	50 %	0 %	50 %	442313749
116	NC_020125	CT	3	6	60839	60844	0 %	50 %	0 %	50 %	442313750
117	NC_020125	AT	3	6	61170	61175	50 %	50 %	0 %	0 %	442313750
118	NC_020125	TG	3	6	62344	62349	0 %	50 %	50 %	0 %	442313751
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122	NC_020125	AT	3	6	66555	66560	50 %	50 %	0 %	0 %	442313754
123	NC_020125	AG	3	6	67874	67879	50 %	0 %	50 %	0 %	442313756
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129	NC_020125	AT	3	6	71042	71047	50 %	50 %	0 %	0 %	442313759
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131	NC_020125	TA	3	6	71814	71819	50 %	50 %	0 %	0 %	442313760
132	NC_020125	AT	3	6	72061	72066	50 %	50 %	0 %	0 %	442313760
133	NC_020125	AT	3	6	72436	72441	50 %	50 %	0 %	0 %	442313760
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136	NC_020125	AT	3	6	73734	73739	50 %	50 %	0 %	0 %	442313761
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138	NC_020125	CA	3	6	74643	74648	50 %	0 %	0 %	50 %	442313763
139	NC_020125	TA	3	6	74986	74991	50 %	50 %	0 %	0 %	442313764
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141	NC_020125	TA	3	6	76564	76569	50 %	50 %	0 %	0 %	442313766
142	NC_020125	AT	3	6	76733	76738	50 %	50 %	0 %	0 %	442313766
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144	NC_020125	AG	3	6	77257	77262	50 %	0 %	50 %	0 %	442313766
145	NC_020125	TC	3	6	77267	77272	0 %	50 %	0 %	50 %	442313766
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