MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 461

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020125	TG	10	20	1535	1554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020125	TA	3	6	7543	7548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020125	TC	3	6	9986	9991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020125	TA	3	6	10301	10306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020125	GT	3	6	10314	10319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020125	TC	3	6	11614	11619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020125	AT	3	6	12157	12162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020125	AT	3	6	12885	12890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020125	GT	3	6	13057	13062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020125	TA	3	6	13596	13601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020125	GT	3	6	13811	13816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020125	GT	3	6	13980	13985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020125	TC	3	6	15477	15482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020125	AT	3	6	15554	15559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020125	AT	4	8	15606	15613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020125	TA	3	6	16531	16536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020125	TA	3	6	17520	17525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020125	TA	3	6	20683	20688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020125	TA	3	6	23909	23914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020125	AT	3	6	42598	42603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020125	AT	4	8	46086	46093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020125	CT	3	6	51163	51168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020125	TA	3	6	51209	51214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020125	CA	3	6	51227	51232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020125	AT	3	6	53593	53598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020125	TC	3	6	54697	54702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020125	GA	3	6	54709	54714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020125	AT	4	8	80415	80422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020125	TA	3	6	80427	80432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020125	AT	3	6	82431	82436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020125	TA	3	6	93115	93120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020125	AT	3	6	94018	94023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020125	TA	3	6	108322	108327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020125	TA	3	6	115599	115604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020125	GT	3	6	116604	116609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020125	AT	3	6	117716	117721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020125	TA	3	6	124920	124925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020125	AT	3	6	126249	126254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020125	CT	3	6	141150	141155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020125	TC	3	6	157751	157756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020125	TA	3	6	158668	158673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020125	TA	3	6	160561	160566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020125	AG	3	6	160637	160642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020125	TA	3	6	170731	170736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020125	CT	3	6	172388	172393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020125	CT	3	6	173137	173142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020125	TA	3	6	175419	175424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020125	GT	3	6	182291	182296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020125	TA	3	6	182571	182576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020125	AG	3	6	184015	184020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020125	AG	3	6	188206	188211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020125	CA	3	6	190195	190200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020125	AT	4	8	191206	191213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020125	AT	3	6	193320	193325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020125	TC	3	6	193483	193488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020125	AG	3	6	195990	195995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020125	AT	3	6	219962	219967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020125	TC	3	6	221256	221261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020125	GA	3	6	221278	221283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020125	TA	3	6	229896	229901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020125	TG	3	6	241553	241558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020125	CA	3	6	247359	247364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020125	AT	3	6	250019	250024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020125	TA	3	6	250064	250069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020125	GT	3	6	250457	250462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020125	TA	3	6	258286	258291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020125	TA	4	8	259217	259224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020125	AT	3	6	263598	263603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020125	AT	3	6	275483	275488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020125	AG	3	6	287745	287750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020125	TA	3	6	303112	303117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020125	TA	3	6	318475	318480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020125	CT	3	6	319367	319372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020125	AC	4	8	322182	322189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020125	CA	3	6	322221	322226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020125	TA	3	6	329427	329432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020125	AT	3	6	330412	330417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020125	TA	3	6	330724	330729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020125	TA	3	6	330847	330852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020125	TA	3	6	330868	330873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020125	GA	3	6	330942	330947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020125	AT	3	6	335899	335904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020125	AT	3	6	335995	336000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020125	AT	3	6	343821	343826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020125	TA	3	6	344582	344587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020125	AT	4	8	345442	345449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020125	TA	3	6	348748	348753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020125	AT	3	6	358965	358970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020125	AG	3	6	359461	359466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020125	TA	4	8	365134	365141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020125	TA	3	6	365143	365148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020125	TA	3	6	371561	371566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020125	TC	3	6	371696	371701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020125	TG	4	8	372398	372405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020125	AT	3	6	372791	372796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020125	AT	3	6	374881	374886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020125	TA	3	6	377704	377709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020125	AT	3	6	377727	377732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020125	TA	3	6	393443	393448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020125	TA	3	6	396408	396413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020125	CT	3	6	400390	400395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020125	TA	3	6	400422	400427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020125	AT	3	6	401730	401735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020125	AC	3	6	402623	402628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020125	AT	3	6	407433	407438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020125	CA	3	6	407440	407445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020125	TA	3	6	420260	420265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020125	AT	3	6	426103	426108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020125	AT	3	6	442760	442765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020125	AT	3	6	446981	446986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020125	TA	3	6	462822	462827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020125	TA	4	8	477217	477224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020125	AC	3	6	486091	486096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020125	TC	3	6	490011	490016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020125	AT	3	6	496754	496759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020125	TC	3	6	500477	500482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020125	AT	3	6	503389	503394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020125	TA	4	8	515571	515578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020125	AT	3	6	516666	516671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020125	TA	3	6	524078	524083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020125	AT	3	6	526981	526986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020125	AT	4	8	536442	536449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020125	TC	3	6	536668	536673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020125	GA	3	6	540245	540250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020125	AG	3	6	544087	544092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020125	AT	3	6	545115	545120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020125	AT	3	6	559468	559473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020125	TA	3	6	564722	564727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020125	TA	3	6	570520	570525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020125	GA	3	6	570598	570603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020125	CA	3	6	572092	572097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020125	AC	3	6	572262	572267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020125	CA	3	6	573015	573020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020125	TA	3	6	573187	573192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020125	AT	3	6	573916	573921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020125	AC	3	6	575761	575766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020125	TA	3	6	575774	575779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020125	GA	3	6	576089	576094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020125	AT	3	6	576241	576246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020125	AG	3	6	600850	600855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020125	TA	3	6	611028	611033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020125	CT	3	6	611641	611646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020125	AT	3	6	618339	618344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020125	AG	3	6	633908	633913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020125	AT	3	6	636335	636340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020125	TA	3	6	644021	644026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020125	GA	3	6	645550	645555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020125	AG	3	6	645582	645587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020125	TA	3	6	646980	646985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020125	AT	3	6	663064	663069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020125	TA	3	6	663079	663084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020125	AT	3	6	663782	663787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020125	GA	3	6	677592	677597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020125	TA	3	6	677652	677657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_020125	AT	3	6	686802	686807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_020125	AT	3	6	2097019	2097024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_020125	AT	3	6	2109812	2109817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_020125	GA	3	6	2113575	2113580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
455	NC_020125	AT	3	6	2129698	2129703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_020125	AC	3	6	2131681	2131686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
457	NC_020125	TA	4	8	2156045	2156052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_020125	CT	3	6	2156139	2156144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
459	NC_020125	AT	3	6	2157327	2157332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_020125	GA	3	6	2164546	2164551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
461	NC_020125	TA	3	6	2165377	2165382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.