MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis 7199-99 complete genome

Total Repeats: 11363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020089	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	479053933
2	NC_020089	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	479053933
3	NC_020089	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	479053933
4	NC_020089	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	479053933
5	NC_020089	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	479053933
6	NC_020089	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020089	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	479053934
8	NC_020089	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	479053934
9	NC_020089	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	479053934
10	NC_020089	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	479053934
11	NC_020089	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	479053934
12	NC_020089	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	479053934
13	NC_020089	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	479053935
14	NC_020089	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	479053935
15	NC_020089	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	479053935
16	NC_020089	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	479053935
17	NC_020089	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	479053937
18	NC_020089	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	479053937
19	NC_020089	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	479053937
20	NC_020089	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	479053937
21	NC_020089	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	479053937
22	NC_020089	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	479053938
23	NC_020089	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	479053938
24	NC_020089	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	479053938
25	NC_020089	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	479053938
26	NC_020089	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	479053938
27	NC_020089	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	479053938
28	NC_020089	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	479053939
29	NC_020089	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020089	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	479053940
31	NC_020089	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	479053940
32	NC_020089	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_020089	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	479053942
34	NC_020089	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	479053942
35	NC_020089	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020089	ACCC	2	8	14098	14105	25 %	0 %	0 %	75 %	479053944
37	NC_020089	TGAT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	479053944
38	NC_020089	TGCT	2	8	14182	14189	0 %	50 %	25 %	25 %	479053944
39	NC_020089	GCCC	2	8	14669	14676	0 %	0 %	25 %	75 %	479053944
40	NC_020089	GGGC	2	8	15450	15457	0 %	0 %	75 %	25 %	479053945
41	NC_020089	CTGA	2	8	15905	15912	25 %	25 %	25 %	25 %	479053946
42	NC_020089	TGGC	2	8	16048	16055	0 %	25 %	50 %	25 %	479053946
43	NC_020089	GCTT	2	8	16107	16114	0 %	50 %	25 %	25 %	479053946
44	NC_020089	CAGT	2	8	16135	16142	25 %	25 %	25 %	25 %	479053946
45	NC_020089	CGGT	2	8	16506	16513	0 %	25 %	50 %	25 %	479053946
46	NC_020089	GCCG	2	8	16565	16572	0 %	0 %	50 %	50 %	479053946
47	NC_020089	CGGG	2	8	17800	17807	0 %	0 %	75 %	25 %	479053947
48	NC_020089	CTGG	2	8	17908	17915	0 %	25 %	50 %	25 %	479053947
49	NC_020089	GTGC	2	8	18408	18415	0 %	25 %	50 %	25 %	479053947
50	NC_020089	GCCG	2	8	18426	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	479053947
51	NC_020089	CCGC	2	8	18791	18798	0 %	0 %	25 %	75 %	479053948
52	NC_020089	GCCG	2	8	20255	20262	0 %	0 %	50 %	50 %	479053949
53	NC_020089	CCAG	2	8	20743	20750	25 %	0 %	25 %	50 %	479053949
54	NC_020089	CACC	2	8	20926	20933	25 %	0 %	0 %	75 %	479053949
55	NC_020089	CGGG	2	8	21882	21889	0 %	0 %	75 %	25 %	479053950
56	NC_020089	GCCG	2	8	21973	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	479053950
57	NC_020089	GCTG	2	8	22353	22360	0 %	25 %	50 %	25 %	479053950
58	NC_020089	CGGC	2	8	22373	22380	0 %	0 %	50 %	50 %	479053950
59	NC_020089	GCCG	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	479053950
60	NC_020089	CCCA	2	8	23056	23063	25 %	0 %	0 %	75 %	479053950
61	NC_020089	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	479053952
62	NC_020089	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	479053952
63	NC_020089	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	479053952
64	NC_020089	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	479053952
65	NC_020089	TCAA	2	8	25496	25503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020089	GAGC	2	8	25524	25531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020089	GGCC	2	8	25538	25545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020089	GCTC	2	8	26487	26494	0 %	25 %	25 %	50 %	479053953
69	NC_020089	CCAA	2	8	26704	26711	50 %	0 %	0 %	50 %	479053953
70	NC_020089	CAGC	2	8	26770	26777	25 %	0 %	25 %	50 %	479053953
71	NC_020089	CGGC	2	8	27590	27597	0 %	0 %	50 %	50 %	479053955
72	NC_020089	CCGG	2	8	28076	28083	0 %	0 %	50 %	50 %	479053955
73	NC_020089	GCTC	2	8	28632	28639	0 %	25 %	25 %	50 %	479053956
74	NC_020089	TGCG	2	8	28771	28778	0 %	25 %	50 %	25 %	479053956
75	NC_020089	CCGG	2	8	29036	29043	0 %	0 %	50 %	50 %	479053956
76	NC_020089	CGTC	2	8	29367	29374	0 %	25 %	25 %	50 %	479053957
77	NC_020089	CACG	2	8	29726	29733	25 %	0 %	25 %	50 %	479053958
78	NC_020089	ACCG	2	8	29807	29814	25 %	0 %	25 %	50 %	479053958
79	NC_020089	CCGG	2	8	30126	30133	0 %	0 %	50 %	50 %	479053958
80	NC_020089	GTCG	2	8	30302	30309	0 %	25 %	50 %	25 %	479053958
81	NC_020089	ACCA	2	8	31105	31112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020089	CGAG	2	8	31436	31443	25 %	0 %	50 %	25 %	479053959
83	NC_020089	CGAC	2	8	31733	31740	25 %	0 %	25 %	50 %	479053960
84	NC_020089	GCCG	2	8	32460	32467	0 %	0 %	50 %	50 %	479053961
85	NC_020089	CCGA	2	8	33449	33456	25 %	0 %	25 %	50 %	479053962
86	NC_020089	GCTA	2	8	33836	33843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020089	GGCC	2	8	34584	34591	0 %	0 %	50 %	50 %	479053964
88	NC_020089	ATCG	2	8	35077	35084	25 %	25 %	25 %	25 %	479053964
89	NC_020089	GATC	2	8	35415	35422	25 %	25 %	25 %	25 %	479053964
90	NC_020089	CCAC	2	8	36236	36243	25 %	0 %	0 %	75 %	479053964
91	NC_020089	ACCG	2	8	36629	36636	25 %	0 %	25 %	50 %	479053965
92	NC_020089	CTGG	2	8	36973	36980	0 %	25 %	50 %	25 %	479053966
93	NC_020089	GCAT	2	8	37368	37375	25 %	25 %	25 %	25 %	479053967
94	NC_020089	GCTG	2	8	37882	37889	0 %	25 %	50 %	25 %	479053967
95	NC_020089	AACG	2	8	38637	38644	50 %	0 %	25 %	25 %	479053967
96	NC_020089	CCGA	2	8	38698	38705	25 %	0 %	25 %	50 %	479053967
97	NC_020089	CCAC	2	8	38854	38861	25 %	0 %	0 %	75 %	479053967
98	NC_020089	CAGC	2	8	39081	39088	25 %	0 %	25 %	50 %	479053968
99	NC_020089	CCGG	2	8	39577	39584	0 %	0 %	50 %	50 %	479053968
100	NC_020089	GGCC	2	8	40108	40115	0 %	0 %	50 %	50 %	479053969
101	NC_020089	CGAT	2	8	40558	40565	25 %	25 %	25 %	25 %	479053969
102	NC_020089	GCCG	2	8	40858	40865	0 %	0 %	50 %	50 %	479053969
103	NC_020089	CACC	2	8	40883	40890	25 %	0 %	0 %	75 %	479053969
104	NC_020089	ACCG	2	8	41106	41113	25 %	0 %	25 %	50 %	479053969
105	NC_020089	GCGT	2	8	41132	41139	0 %	25 %	50 %	25 %	479053969
106	NC_020089	CCAC	2	8	41861	41868	25 %	0 %	0 %	75 %	479053970
107	NC_020089	CGAT	2	8	41870	41877	25 %	25 %	25 %	25 %	479053970
108	NC_020089	GGCC	2	8	42566	42573	0 %	0 %	50 %	50 %	479053972
109	NC_020089	CCCG	2	8	43157	43164	0 %	0 %	25 %	75 %	479053972
110	NC_020089	CGGG	2	8	43186	43193	0 %	0 %	75 %	25 %	479053972
111	NC_020089	CGAC	2	8	43825	43832	25 %	0 %	25 %	50 %	479053973
112	NC_020089	GAGC	2	8	44205	44212	25 %	0 %	50 %	25 %	479053973
113	NC_020089	GGGC	2	8	45364	45371	0 %	0 %	75 %	25 %	479053973
114	NC_020089	CGGC	2	8	45459	45466	0 %	0 %	50 %	50 %	479053973
115	NC_020089	GCCG	2	8	46422	46429	0 %	0 %	50 %	50 %	479053973
116	NC_020089	TTGC	2	8	46586	46593	0 %	50 %	25 %	25 %	479053974
117	NC_020089	CCGC	2	8	46734	46741	0 %	0 %	25 %	75 %	479053974
118	NC_020089	CCGC	2	8	46767	46774	0 %	0 %	25 %	75 %	479053974
119	NC_020089	GGTC	2	8	46875	46882	0 %	25 %	50 %	25 %	479053974
120	NC_020089	CTAC	2	8	47199	47206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020089	CGGG	2	8	47426	47433	0 %	0 %	75 %	25 %	479053975
122	NC_020089	GCAG	2	8	47499	47506	25 %	0 %	50 %	25 %	479053975
123	NC_020089	GTGC	2	8	48399	48406	0 %	25 %	50 %	25 %	479053976
124	NC_020089	GCCG	2	8	48683	48690	0 %	0 %	50 %	50 %	479053976
125	NC_020089	CAGC	2	8	49868	49875	25 %	0 %	25 %	50 %	479053977
126	NC_020089	CGGG	2	8	50057	50064	0 %	0 %	75 %	25 %	479053978
127	NC_020089	GCCG	2	8	50157	50164	0 %	0 %	50 %	50 %	479053978
128	NC_020089	GGTG	2	8	50480	50487	0 %	25 %	75 %	0 %	479053978
129	NC_020089	CTCA	2	8	51096	51103	25 %	25 %	0 %	50 %	479053978
130	NC_020089	CGCT	2	8	51235	51242	0 %	25 %	25 %	50 %	479053979
131	NC_020089	GGTA	2	8	52101	52108	25 %	25 %	50 %	0 %	479053980
132	NC_020089	CTGG	2	8	52696	52703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020089	GCCG	2	8	53550	53557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020089	ACCA	2	8	53721	53728	50 %	0 %	0 %	50 %	479053982
135	NC_020089	GTGC	2	8	54606	54613	0 %	25 %	50 %	25 %	479053982
136	NC_020089	ACCG	2	8	55484	55491	25 %	0 %	25 %	50 %	479053982
137	NC_020089	CCCG	2	8	55646	55653	0 %	0 %	25 %	75 %	479053982
138	NC_020089	GGCC	2	8	56320	56327	0 %	0 %	50 %	50 %	479053983
139	NC_020089	CGCT	2	8	57047	57054	0 %	25 %	25 %	50 %	479053983
140	NC_020089	GCGG	2	8	58804	58811	0 %	0 %	75 %	25 %	479053986
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