MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis 7199-99 complete genome

Total Repeats: 1067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020089	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020089	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020089	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_020089	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020089	TCAA	2	8	25496	25503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020089	GAGC	2	8	25524	25531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020089	GGCC	2	8	25538	25545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020089	ACCA	2	8	31105	31112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020089	GCTA	2	8	33836	33843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020089	CTAC	2	8	47199	47206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020089	CTGG	2	8	52696	52703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020089	GCCG	2	8	53550	53557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020089	CGGT	2	8	79189	79196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020089	CGGT	2	8	79374	79381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020089	CTGG	2	8	87237	87244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020089	CGCA	2	8	89538	89545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020089	CGCT	2	8	97668	97675	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020089	CCTG	2	8	97715	97722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020089	GCGA	2	8	97759	97766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020089	ACCG	2	8	99482	99489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020089	ATCC	2	8	125617	125624	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020089	GCGA	2	8	130705	130712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020089	CGGG	2	8	130748	130755	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020089	GCTC	2	8	131260	131267	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020089	CGGG	2	8	133972	133979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020089	TTCT	2	8	139888	139895	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020089	ACGC	2	8	139960	139967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020089	GGGC	2	8	140052	140059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020089	AGCA	2	8	141132	141139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020089	GCCG	2	8	143938	143945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020089	GCGT	2	8	148482	148489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020089	GCGG	2	8	149548	149555	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020089	GCCG	2	8	152455	152462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020089	CCGG	2	8	155821	155828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020089	GCGT	3	12	155849	155860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020089	GGCT	2	8	157995	158002	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020089	CGCA	2	8	158021	158028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020089	TCGT	2	8	161712	161719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020089	CCGG	2	8	161720	161727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020089	CCCG	2	8	161932	161939	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_020089	ACTT	2	8	171409	171416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020089	GCCG	2	8	181117	181124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020089	TTGA	2	8	186941	186948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020089	CTGG	2	8	196926	196933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020089	CTGT	2	8	212478	212485	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020089	GGCC	2	8	218566	218573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020089	CGGT	2	8	218902	218909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020089	GATG	2	8	219649	219656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020089	AACT	2	8	230844	230851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020089	GGAA	2	8	231019	231026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020089	ACGT	2	8	231771	231778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020089	ACAT	2	8	231838	231845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020089	GTGC	2	8	241551	241558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020089	GAAC	2	8	249237	249244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020089	CGCA	2	8	253846	253853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020089	GACG	2	8	256255	256262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020089	GCGG	2	8	273136	273143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020089	CGGC	2	8	274502	274509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020089	TAGA	2	8	288611	288618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020089	ACTT	2	8	292315	292322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020089	TCGT	2	8	293943	293950	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020089	AACT	2	8	295993	296000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020089	AACC	2	8	296001	296008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020089	ATGC	2	8	296991	296998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020089	GACG	2	8	302309	302316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020089	TCGG	2	8	310346	310353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020089	GGTA	2	8	336592	336599	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020089	GCCG	2	8	336679	336686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020089	TGGC	2	8	336691	336698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020089	GCCG	2	8	339629	339636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020089	TGGC	2	8	339641	339648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020089	CTGT	2	8	367458	367465	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020089	AATC	2	8	378668	378675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020089	GGCC	2	8	389028	389035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020089	AAGG	2	8	390044	390051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020089	TGAC	2	8	399013	399020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020089	GTCA	2	8	399024	399031	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020089	ATCG	2	8	419994	420001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020089	GCCA	2	8	420085	420092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020089	GTCC	2	8	420111	420118	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020089	ACGG	2	8	420197	420204	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020089	GAGC	2	8	426979	426986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020089	GAGC	2	8	427030	427037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020089	CACG	2	8	457286	457293	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020089	TGCG	2	8	458398	458405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020089	GCTC	2	8	458778	458785	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020089	GGAT	2	8	471071	471078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020089	CGAG	2	8	471214	471221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020089	GCAC	2	8	479294	479301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020089	CAAC	2	8	483163	483170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020089	AGAA	2	8	495028	495035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020089	GCGG	2	8	507404	507411	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020089	ACCG	2	8	509284	509291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020089	CGGG	2	8	509321	509328	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020089	GAGG	2	8	511277	511284	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020089	GCGT	2	8	511363	511370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020089	ACGG	2	8	514613	514620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020089	GATG	2	8	519587	519594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020089	CTGA	2	8	520211	520218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020089	GCAA	2	8	522847	522854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020089	GCTG	2	8	525720	525727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020089	CCGT	2	8	532765	532772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020089	CGGC	2	8	538078	538085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020089	CGGC	2	8	542821	542828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020089	GACG	2	8	542831	542838	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020089	CCGA	2	8	549083	549090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020089	AATC	2	8	549514	549521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020089	GTCT	2	8	550136	550143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020089	CGGC	2	8	564140	564147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020089	CCGG	2	8	565075	565082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020089	AGCA	2	8	569219	569226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020089	CGAC	2	8	569889	569896	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020089	CGCC	2	8	581665	581672	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_020089	GCAT	2	8	581748	581755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020089	GTTT	2	8	590458	590465	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020089	GCCG	2	8	595472	595479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020089	GCTA	2	8	600774	600781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020089	GCGT	2	8	608659	608666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020089	CCGA	2	8	608684	608691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020089	CCGA	2	8	612687	612694	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020089	GTCC	2	8	615242	615249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020089	GCGG	2	8	628052	628059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020089	GGGT	2	8	628384	628391	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020089	CGGC	2	8	628580	628587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020089	GCCC	2	8	629743	629750	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_020089	AGCC	2	8	634224	634231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020089	CCGG	2	8	639748	639755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020089	TGCC	2	8	644185	644192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020089	CGCC	2	8	645130	645137	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_020089	GCCG	2	8	655727	655734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020089	TGGC	2	8	659017	659024	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020089	CCAG	2	8	661727	661734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020089	CGGT	2	8	662471	662478	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020089	GTGC	2	8	665171	665178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020089	AAGG	2	8	665194	665201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020089	CTGG	2	8	665229	665236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020089	GACC	2	8	665337	665344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020089	CGGC	2	8	667678	667685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020089	TTGC	2	8	669772	669779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020089	GTCG	2	8	669843	669850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020089	CGGC	2	8	672672	672679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020089	GTGG	2	8	672689	672696	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020089	GCCG	2	8	676178	676185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020089	CGAA	2	8	680281	680288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020089	CGGC	2	8	681306	681313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020089	CCGG	2	8	683317	683324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020089	TTCA	2	8	688603	688610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020089	TCCC	2	8	696192	696199	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_020089	CGGA	2	8	699834	699841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020089	TCCG	2	8	701206	701213	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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187	NC_020089	GGCG	2	8	799377	799384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_020089	CCGC	2	8	2063427	2063434	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_020089	GCCG	2	8	2076427	2076434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
497	NC_020089	TTCG	2	8	2077719	2077726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_020089	TGGG	2	8	2082522	2082529	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
499	NC_020089	GCGG	2	8	2088503	2088510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
500	NC_020089	GCTG	2	8	2090875	2090882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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