MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis 7199-99 complete genome

Total Repeats: 83898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020089	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053933
2	NC_020089	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053933
3	NC_020089	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053933
4	NC_020089	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053933
5	NC_020089	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053933
6	NC_020089	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053933
7	NC_020089	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053933
8	NC_020089	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053933
9	NC_020089	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053933
10	NC_020089	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053933
11	NC_020089	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053933
12	NC_020089	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479053933
13	NC_020089	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053933
14	NC_020089	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053933
15	NC_020089	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053933
16	NC_020089	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479053933
17	NC_020089	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479053933
18	NC_020089	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053933
19	NC_020089	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053933
20	NC_020089	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053933
21	NC_020089	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053933
22	NC_020089	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053933
23	NC_020089	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053933
24	NC_020089	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053933
25	NC_020089	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020089	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020089	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020089	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020089	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020089	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020089	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020089	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020089	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020089	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020089	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053934
36	NC_020089	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053934
37	NC_020089	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053934
38	NC_020089	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053934
39	NC_020089	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053934
40	NC_020089	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479053934
41	NC_020089	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053934
42	NC_020089	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053934
43	NC_020089	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053934
44	NC_020089	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053934
45	NC_020089	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053934
46	NC_020089	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053934
47	NC_020089	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053934
48	NC_020089	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479053934
49	NC_020089	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053934
50	NC_020089	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479053934
51	NC_020089	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053934
52	NC_020089	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053934
53	NC_020089	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053935
54	NC_020089	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053935
55	NC_020089	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053935
56	NC_020089	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053935
57	NC_020089	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479053935
58	NC_020089	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479053935
59	NC_020089	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053935
60	NC_020089	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053935
61	NC_020089	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479053935
62	NC_020089	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053935
63	NC_020089	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479053935
64	NC_020089	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053935
65	NC_020089	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053935
66	NC_020089	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053935
67	NC_020089	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053935
68	NC_020089	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053935
69	NC_020089	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053935
70	NC_020089	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053935
71	NC_020089	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053935
72	NC_020089	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053935
73	NC_020089	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053935
74	NC_020089	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053935
75	NC_020089	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053935
76	NC_020089	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053936
77	NC_020089	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053936
78	NC_020089	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053936
79	NC_020089	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053936
80	NC_020089	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053936
81	NC_020089	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053936
82	NC_020089	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053936
83	NC_020089	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020089	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020089	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020089	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020089	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020089	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479053937
89	NC_020089	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053937
90	NC_020089	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053937
91	NC_020089	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053937
92	NC_020089	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053937
93	NC_020089	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053937
94	NC_020089	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053937
95	NC_020089	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053937
96	NC_020089	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053937
97	NC_020089	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479053937
98	NC_020089	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479053937
99	NC_020089	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053937
100	NC_020089	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053937
101	NC_020089	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053937
102	NC_020089	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053937
103	NC_020089	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053937
104	NC_020089	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053937
105	NC_020089	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053937
106	NC_020089	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479053937
107	NC_020089	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479053937
108	NC_020089	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053937
109	NC_020089	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053937
110	NC_020089	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053937
111	NC_020089	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053937
112	NC_020089	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053937
113	NC_020089	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479053937
114	NC_020089	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479053937
115	NC_020089	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053937
116	NC_020089	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053937
117	NC_020089	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053937
118	NC_020089	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053937
119	NC_020089	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053938
120	NC_020089	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
121	NC_020089	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
122	NC_020089	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
123	NC_020089	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053938
124	NC_020089	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053938
125	NC_020089	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053938
126	NC_020089	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
127	NC_020089	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
128	NC_020089	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
129	NC_020089	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053938
130	NC_020089	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053938
131	NC_020089	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
132	NC_020089	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
133	NC_020089	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053938
134	NC_020089	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
135	NC_020089	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479053938
136	NC_020089	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479053938
137	NC_020089	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479053938
138	NC_020089	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479053938
139	NC_020089	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
140	NC_020089	ACC	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053938
141	NC_020089	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053938
142	NC_020089	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053938
143	NC_020089	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
144	NC_020089	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
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146	NC_020089	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479053938
147	NC_020089	CGA	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
148	NC_020089	CGA	2	6	8741	8746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
149	NC_020089	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
150	NC_020089	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479053938
151	NC_020089	CGA	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
152	NC_020089	CGT	2	6	8846	8851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
153	NC_020089	CGG	2	6	8918	8923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053938
154	NC_020089	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
155	NC_020089	TCG	2	6	8962	8967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
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157	NC_020089	TTC	2	6	9006	9011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479053938
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160	NC_020089	ACG	2	6	9268	9273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
161	NC_020089	CGA	3	9	9302	9310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
162	NC_020089	CTG	3	9	9312	9320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
163	NC_020089	CGA	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
164	NC_020089	GCT	2	6	9431	9436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
165	NC_020089	CGT	2	6	9446	9451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
166	NC_020089	CTG	2	6	9468	9473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053938
167	NC_020089	CGG	2	6	9536	9541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479053938
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169	NC_020089	CGA	3	9	9605	9613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
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171	NC_020089	TGA	2	6	9709	9714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479053938
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173	NC_020089	CGA	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053938
174	NC_020089	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_020089	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_020089	CGC	3	9	14700	14708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053944
252	NC_020089	GCT	2	6	14716	14721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479053944
253	NC_020089	GAA	2	6	14788	14793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479053944
254	NC_020089	ACT	2	6	14870	14875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479053944
255	NC_020089	ACG	2	6	15008	15013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479053945
256	NC_020089	ACC	2	6	15014	15019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479053945
257	NC_020089	GCC	2	6	15034	15039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479053945
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