MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma pneumoniae M129-B7

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020076	TGGTAA	2	12	14305	14316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020076	TATTTT	2	12	15819	15830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020076	TACTTT	2	12	46420	46431	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020076	AAAAAT	2	12	47075	47086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020076	TTTTAA	2	12	61949	61960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020076	TCTTAA	2	12	69097	69108	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020076	AAATTT	2	12	107205	107216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020076	AATATT	2	12	108249	108260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020076	TAAATA	2	12	110449	110460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020076	TTAAAT	2	12	113347	113358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020076	AAGCAG	2	12	115055	115066	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020076	TTAACT	2	12	115569	115580	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020076	GGCGAA	2	12	119032	119043	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020076	ACGGGC	2	12	127821	127832	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020076	CCCAGC	2	12	128938	128949	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020076	GGAAGG	2	12	132479	132490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020076	TTCCAC	2	12	132888	132899	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020076	AAAATA	2	12	134907	134918	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020076	AAGTTA	2	12	142220	142231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020076	CAAGAA	2	12	143228	143239	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020076	AGGTAA	2	12	143254	143265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020076	AAGCAT	2	12	143444	143455	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020076	ACAAAC	2	12	143863	143874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020076	AAGATG	2	12	144078	144089	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020076	AAAAGC	2	12	144298	144309	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020076	CAACTT	2	12	144462	144473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020076	AGAAAA	2	12	144673	144684	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020076	GTTTTC	2	12	164283	164294	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020076	CACCGC	2	12	165821	165832	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020076	GGCAGT	2	12	166074	166085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020076	ATCTGG	2	12	166565	166576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020076	CACCCC	2	12	166815	166826	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
33	NC_020076	CCCAAC	3	18	171502	171519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020076	CTAATA	2	12	171712	171723	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020076	GCTAAC	2	12	171809	171820	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020076	TTAAAC	2	12	179836	179847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020076	CAACTA	2	12	194994	195005	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020076	TTTTTA	2	12	196355	196366	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020076	CAAGGC	2	12	197703	197714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020076	CAGCTT	2	12	246606	246617	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020076	CCCAAC	3	18	247117	247134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_020076	GGCAGT	2	12	248583	248594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020076	TTTTTC	2	12	253440	253451	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020076	ATTTTG	2	12	253517	253528	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020076	CTTTTT	2	12	265826	265837	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020076	TAGTTT	2	12	284473	284484	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020076	AACAGT	2	12	324059	324070	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020076	ATTTAC	2	12	334764	334775	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020076	ATGCTA	2	12	335203	335214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020076	AAAATG	2	12	335403	335414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020076	CCAAAA	2	12	342958	342969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020076	CCCAAC	2	12	343107	343118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_020076	GCTCAG	2	12	343206	343217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020076	CAAAAA	2	12	348245	348256	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020076	GTATTA	2	12	359660	359671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020076	TACCCG	2	12	360576	360587	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020076	TCATTT	2	12	364106	364117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020076	AAATTA	2	12	364151	364162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020076	ATTTAA	2	12	372693	372704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020076	TAAAAT	2	12	407766	407777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020076	AAGATG	2	12	414990	415001	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020076	AGAAAA	2	12	415401	415412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020076	GGAAGG	2	12	437467	437478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020076	AAGCAG	2	12	438234	438245	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020076	GCAAAT	2	12	440902	440913	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020076	GTGGGG	2	12	442996	443007	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020076	GGCAGT	2	12	443359	443370	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020076	ATCTGG	2	12	443846	443857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020076	CACCCC	2	12	444085	444096	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
70	NC_020076	TAAAAG	2	12	483382	483393	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020076	GCAACT	2	12	490172	490183	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020076	AAAATA	2	12	495129	495140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020076	CAAATA	2	12	495229	495240	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020076	TGAAGG	2	12	496622	496633	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020076	GATCCT	2	12	497034	497045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020076	CAAGGC	2	12	498396	498407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020076	TTAACT	2	12	499285	499296	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020076	TTTTTA	2	12	521664	521675	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020076	TTTCGT	2	12	529632	529643	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020076	AGTTTT	2	12	534281	534292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020076	ACCATT	2	12	559208	559219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020076	TTAACC	2	12	560005	560016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020076	GTTCTT	2	12	560034	560045	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020076	GAAGGG	2	12	560923	560934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020076	CGGATG	2	12	561693	561704	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020076	AATATA	2	12	564343	564354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020076	TGAAGG	2	12	565225	565236	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020076	AGTTCC	2	12	565293	565304	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020076	TCCACC	2	12	565314	565325	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_020076	CACCCC	2	12	565544	565555	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
91	NC_020076	CAAGGC	2	12	566977	566988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020076	AAGCAG	2	12	567352	567363	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020076	TTAACT	2	12	567866	567877	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020076	ATTGTT	2	12	583364	583375	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020076	ATCTTA	2	12	586699	586710	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020076	AGGTGA	2	12	596368	596379	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020076	AGTGGG	2	12	606498	606509	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020076	CAGCTT	2	12	607094	607105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020076	CCCAGC	2	12	607618	607629	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_020076	CACCCC	2	12	609964	609975	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
101	NC_020076	CAAGGC	2	12	611398	611409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020076	AAGCAG	2	12	611773	611784	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020076	ATTTAA	2	12	624735	624746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020076	TTTTGT	2	12	625669	625680	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020076	ACTTTG	2	12	650587	650598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_020076	GTAAAA	2	12	650782	650793	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020076	AATTTT	2	12	690483	690494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020076	TAATAT	2	12	690495	690506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020076	AAATAA	2	12	697709	697720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020076	ATCAGT	2	12	711579	711590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020076	GCAAAG	2	12	716185	716196	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020076	ATTTAA	2	12	716529	716540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020076	GTAAAA	2	12	736224	736235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020076	ATCAAA	2	12	736620	736631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020076	CTGTTT	2	12	774264	774275	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020076	AAAAGT	2	12	776008	776019	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020076	AACAAA	2	12	779652	779663	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020076	CCTTTT	2	12	797660	797671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.