MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma pneumoniae M129-B7

Total Repeats: 423

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020076	CAAAA	2	10	991	1000	80 %	0 %	0 %	20 %	479052800
2	NC_020076	CTACA	2	10	1875	1884	40 %	20 %	0 %	40 %	479052801
3	NC_020076	GGTGG	2	10	2426	2435	0 %	20 %	80 %	0 %	479052801
4	NC_020076	ACGTA	2	10	4794	4803	40 %	20 %	20 %	20 %	479052802
5	NC_020076	TGAAG	2	10	5765	5774	40 %	20 %	40 %	0 %	479052803
6	NC_020076	ACCAA	2	10	8560	8569	60 %	0 %	0 %	40 %	479052804
7	NC_020076	AACCC	2	10	9190	9199	40 %	0 %	0 %	60 %	479052805
8	NC_020076	CACTA	2	10	11578	11587	40 %	20 %	0 %	40 %	479052808
9	NC_020076	GAAAC	2	10	12972	12981	60 %	0 %	20 %	20 %	479052810
10	NC_020076	TTTCA	2	10	13119	13128	20 %	60 %	0 %	20 %	479052810
11	NC_020076	CTTGC	2	10	13663	13672	0 %	40 %	20 %	40 %	479052811
12	NC_020076	GTTCA	2	10	17235	17244	20 %	40 %	20 %	20 %	479052814
13	NC_020076	TTGTT	2	10	18694	18703	0 %	80 %	20 %	0 %	479052816
14	NC_020076	TAAGT	2	10	19528	19537	40 %	40 %	20 %	0 %	479052817
15	NC_020076	CCTTT	2	10	19890	19899	0 %	60 %	0 %	40 %	479052817
16	NC_020076	CTTTC	2	10	21789	21798	0 %	60 %	0 %	40 %	479052818
17	NC_020076	TGGTT	2	10	22008	22017	0 %	60 %	40 %	0 %	479052818
18	NC_020076	GTGAG	2	10	22492	22501	20 %	20 %	60 %	0 %	479052818
19	NC_020076	TTAAG	2	10	24406	24415	40 %	40 %	20 %	0 %	479052819
20	NC_020076	AGTGA	2	10	24776	24785	40 %	20 %	40 %	0 %	479052819
21	NC_020076	CAAGA	2	10	25509	25518	60 %	0 %	20 %	20 %	479052819
22	NC_020076	AAAAC	2	10	26300	26309	80 %	0 %	0 %	20 %	479052820
23	NC_020076	CAGTC	2	10	26764	26773	20 %	20 %	20 %	40 %	479052820
24	NC_020076	ATCTC	2	10	29829	29838	20 %	40 %	0 %	40 %	479052823
25	NC_020076	AACCT	2	10	29943	29952	40 %	20 %	0 %	40 %	479052823
26	NC_020076	TGAGT	2	10	31842	31851	20 %	40 %	40 %	0 %	479052825
27	NC_020076	CATGA	2	10	33400	33409	40 %	20 %	20 %	20 %	479052827
28	NC_020076	AAAAG	2	10	33576	33585	80 %	0 %	20 %	0 %	479052827
29	NC_020076	TTTGG	2	10	37625	37634	0 %	60 %	40 %	0 %	479052832
30	NC_020076	GTTTG	2	10	38688	38697	0 %	60 %	40 %	0 %	479052832
31	NC_020076	TCATT	2	10	38790	38799	20 %	60 %	0 %	20 %	479052832
32	NC_020076	CCATC	2	10	39717	39726	20 %	20 %	0 %	60 %	479052832
33	NC_020076	CTACC	2	10	42813	42822	20 %	20 %	0 %	60 %	479052833
34	NC_020076	ATGGT	2	10	43155	43164	20 %	40 %	40 %	0 %	479052833
35	NC_020076	CTGAA	2	10	44734	44743	40 %	20 %	20 %	20 %	479052834
36	NC_020076	ATCTT	2	10	46760	46769	20 %	60 %	0 %	20 %	479052836
37	NC_020076	TACAT	2	10	50566	50575	40 %	40 %	0 %	20 %	479052837
38	NC_020076	TTTAA	2	10	51636	51645	40 %	60 %	0 %	0 %	479052838
39	NC_020076	GGTTA	2	10	54186	54195	20 %	40 %	40 %	0 %	479052840
40	NC_020076	AACTT	2	10	54412	54421	40 %	40 %	0 %	20 %	479052841
41	NC_020076	TGAAT	2	10	56713	56722	40 %	40 %	20 %	0 %	479052842
42	NC_020076	CTAAA	2	10	57999	58008	60 %	20 %	0 %	20 %	479052843
43	NC_020076	GAAAA	2	10	58103	58112	80 %	0 %	20 %	0 %	479052843
44	NC_020076	CTTTG	2	10	58147	58156	0 %	60 %	20 %	20 %	479052843
45	NC_020076	CTTTG	2	10	60243	60252	0 %	60 %	20 %	20 %	479052844
46	NC_020076	AAAGA	2	10	60656	60665	80 %	0 %	20 %	0 %	479052844
47	NC_020076	AATGA	2	10	61082	61091	60 %	20 %	20 %	0 %	479052844
48	NC_020076	AACCA	2	10	61449	61458	60 %	0 %	0 %	40 %	479052844
49	NC_020076	TACCA	2	10	62773	62782	40 %	20 %	0 %	40 %	479052845
50	NC_020076	TCATG	2	10	62896	62905	20 %	40 %	20 %	20 %	479052845
51	NC_020076	TGCTG	2	10	64150	64159	0 %	40 %	40 %	20 %	479052846
52	NC_020076	GTGAT	2	10	65157	65166	20 %	40 %	40 %	0 %	479052847
53	NC_020076	CTTTA	2	10	72772	72781	20 %	60 %	0 %	20 %	479052851
54	NC_020076	TTACC	2	10	73519	73528	20 %	40 %	0 %	40 %	479052852
55	NC_020076	GAAAG	2	10	75916	75925	60 %	0 %	40 %	0 %	479052854
56	NC_020076	CCAGT	2	10	76477	76486	20 %	20 %	20 %	40 %	479052855
57	NC_020076	ACTCC	2	10	77719	77728	20 %	20 %	0 %	60 %	479052857
58	NC_020076	CATGG	2	10	79214	79223	20 %	20 %	40 %	20 %	479052858
59	NC_020076	TGGGT	2	10	86572	86581	0 %	40 %	60 %	0 %	479052868
60	NC_020076	TGGGC	2	10	87311	87320	0 %	20 %	60 %	20 %	479052869
61	NC_020076	CAAAC	2	10	88419	88428	60 %	0 %	0 %	40 %	479052871
62	NC_020076	CTTTA	2	10	88519	88528	20 %	60 %	0 %	20 %	479052871
63	NC_020076	CCATA	2	10	89872	89881	40 %	20 %	0 %	40 %	479052872
64	NC_020076	TTGTT	2	10	91736	91745	0 %	80 %	20 %	0 %	479052873
65	NC_020076	CGTGT	2	10	93274	93283	0 %	40 %	40 %	20 %	479052874
66	NC_020076	AAACC	2	10	100789	100798	60 %	0 %	0 %	40 %	479052878
67	NC_020076	CTCAC	2	10	101025	101034	20 %	20 %	0 %	60 %	479052878
68	NC_020076	AACCC	2	10	104587	104596	40 %	0 %	0 %	60 %	479052880
69	NC_020076	CATGA	2	10	116325	116334	40 %	20 %	20 %	20 %	479052885
70	NC_020076	GAAAA	2	10	134232	134241	80 %	0 %	20 %	0 %	479052891
71	NC_020076	TGTTT	2	10	134648	134657	0 %	80 %	20 %	0 %	479052892
72	NC_020076	GTGAT	2	10	135996	136005	20 %	40 %	40 %	0 %	479052894
73	NC_020076	CTTAA	2	10	137410	137419	40 %	40 %	0 %	20 %	479052895
74	NC_020076	TTGGT	2	10	139652	139661	0 %	60 %	40 %	0 %	479052896
75	NC_020076	CTTTC	2	10	149816	149825	0 %	60 %	0 %	40 %	479052897
76	NC_020076	AAACC	2	10	150960	150969	60 %	0 %	0 %	40 %	479052898
77	NC_020076	TAATT	2	10	151415	151424	40 %	60 %	0 %	0 %	479052899
78	NC_020076	GCAAA	2	10	151537	151546	60 %	0 %	20 %	20 %	479052900
79	NC_020076	ACCAC	2	10	153724	153733	40 %	0 %	0 %	60 %	479052902
80	NC_020076	AGCGA	2	10	156476	156485	40 %	0 %	40 %	20 %	479052905
81	NC_020076	GCATT	2	10	156922	156931	20 %	40 %	20 %	20 %	479052905
82	NC_020076	ATTCG	2	10	157275	157284	20 %	40 %	20 %	20 %	479052905
83	NC_020076	GTGAT	2	10	157332	157341	20 %	40 %	40 %	0 %	479052905
84	NC_020076	TTTCG	2	10	161638	161647	0 %	60 %	20 %	20 %	479052907
85	NC_020076	AAAGC	3	15	162546	162560	60 %	0 %	20 %	20 %	479052908
86	NC_020076	ACCAC	2	10	168457	168466	40 %	0 %	0 %	60 %	479052912
87	NC_020076	GAAAA	2	10	172534	172543	80 %	0 %	20 %	0 %	479052916
88	NC_020076	CAACG	2	10	174925	174934	40 %	0 %	20 %	40 %	479052917
89	NC_020076	CTTTA	2	10	175074	175083	20 %	60 %	0 %	20 %	479052918
90	NC_020076	TTACC	2	10	175622	175631	20 %	40 %	0 %	40 %	479052918
91	NC_020076	ACCAA	2	10	180852	180861	60 %	0 %	0 %	40 %	479052925
92	NC_020076	CCGAA	2	10	181189	181198	40 %	0 %	20 %	40 %	479052925
93	NC_020076	TCCAA	2	10	182851	182860	40 %	20 %	0 %	40 %	479052925
94	NC_020076	ACCAA	2	10	183945	183954	60 %	0 %	0 %	40 %	479052925
95	NC_020076	GGTGA	2	10	183974	183983	20 %	20 %	60 %	0 %	479052925
96	NC_020076	TATGA	2	10	187486	187495	40 %	40 %	20 %	0 %	479052926
97	NC_020076	GAATT	2	10	188492	188501	40 %	40 %	20 %	0 %	479052926
98	NC_020076	AAGCC	2	10	188529	188538	40 %	0 %	20 %	40 %	479052926
99	NC_020076	TTCCC	2	10	189037	189046	0 %	40 %	0 %	60 %	479052926
100	NC_020076	CGATT	2	10	199437	199446	20 %	40 %	20 %	20 %	479052932
101	NC_020076	TTAAC	2	10	202559	202568	40 %	40 %	0 %	20 %	479052934
102	NC_020076	GTTAA	2	10	202786	202795	40 %	40 %	20 %	0 %	479052934
103	NC_020076	ACTTA	2	10	203786	203795	40 %	40 %	0 %	20 %	479052934
104	NC_020076	ACCAA	2	10	204284	204293	60 %	0 %	0 %	40 %	479052934
105	NC_020076	GTGAC	2	10	205011	205020	20 %	20 %	40 %	20 %	479052934
106	NC_020076	TAGAG	2	10	206236	206245	40 %	20 %	40 %	0 %	479052935
107	NC_020076	TGAGT	2	10	206326	206335	20 %	40 %	40 %	0 %	479052935
108	NC_020076	AGCAA	2	10	207055	207064	60 %	0 %	20 %	20 %	479052935
109	NC_020076	AAAGG	2	10	207676	207685	60 %	0 %	40 %	0 %	479052936
110	NC_020076	TGAAT	2	10	210130	210139	40 %	40 %	20 %	0 %	479052939
111	NC_020076	ACCTT	2	10	211017	211026	20 %	40 %	0 %	40 %	479052939
112	NC_020076	ACACC	2	10	212821	212830	40 %	0 %	0 %	60 %	479052941
113	NC_020076	TTAAT	2	10	214106	214115	40 %	60 %	0 %	0 %	479052942
114	NC_020076	AGTTA	2	10	214893	214902	40 %	40 %	20 %	0 %	479052943
115	NC_020076	TGAAA	2	10	215328	215337	60 %	20 %	20 %	0 %	479052943
116	NC_020076	AAGAT	2	10	216414	216423	60 %	20 %	20 %	0 %	479052944
117	NC_020076	GAAGA	2	10	216608	216617	60 %	0 %	40 %	0 %	479052944
118	NC_020076	GAAAT	2	10	216692	216701	60 %	20 %	20 %	0 %	479052944
119	NC_020076	AGAAA	2	10	218798	218807	80 %	0 %	20 %	0 %	479052947
120	NC_020076	CCATT	2	10	218968	218977	20 %	40 %	0 %	40 %	479052948
121	NC_020076	TTACC	2	10	219710	219719	20 %	40 %	0 %	40 %	479052949
122	NC_020076	TCCCA	2	10	225821	225830	20 %	20 %	0 %	60 %	479052962
123	NC_020076	GAACA	2	10	226050	226059	60 %	0 %	20 %	20 %	479052963
124	NC_020076	TTACC	2	10	228340	228349	20 %	40 %	0 %	40 %	479052966
125	NC_020076	GTTTG	2	10	229324	229333	0 %	60 %	40 %	0 %	479052967
126	NC_020076	AAACG	2	10	229798	229807	60 %	0 %	20 %	20 %	479052968
127	NC_020076	AAGCA	2	10	230354	230363	60 %	0 %	20 %	20 %	479052969
128	NC_020076	AAGCG	2	10	233307	233316	40 %	0 %	40 %	20 %	479052975
129	NC_020076	TCAAC	2	10	238586	238595	40 %	20 %	0 %	40 %	479052980
130	NC_020076	GGAAA	2	10	238602	238611	60 %	0 %	40 %	0 %	479052980
131	NC_020076	TAACC	2	10	239696	239705	40 %	20 %	0 %	40 %	479052981
132	NC_020076	GAAGA	2	10	240492	240501	60 %	0 %	40 %	0 %	479052981
133	NC_020076	GAAAA	2	10	241431	241440	80 %	0 %	20 %	0 %	479052981
134	NC_020076	AAAGC	2	10	241623	241632	60 %	0 %	20 %	20 %	479052981
135	NC_020076	CCTAA	2	10	243936	243945	40 %	20 %	0 %	40 %	479052982
136	NC_020076	ATAGA	2	10	244364	244373	60 %	20 %	20 %	0 %	479052982
137	NC_020076	AATTG	2	10	245482	245491	40 %	40 %	20 %	0 %	479052983
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.