MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Blochmannia chromaiodes str. 640 chromosome

Total Repeats: 303

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020075	CAAATG	2	12	967	978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440509587
2	NC_020075	TTTTAT	2	12	3364	3375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	440509588
3	NC_020075	TATTAC	2	12	4510	4521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440509591
4	NC_020075	TAGAAA	2	12	4573	4584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440509591
5	NC_020075	ATATTG	2	12	6300	6311	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509592
6	NC_020075	GGAATA	2	12	6386	6397	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440509593
7	NC_020075	AAAGAA	2	12	7606	7617	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	440509594
8	NC_020075	TGTTGG	2	12	7830	7841	0 %	50 %	50 %	0 %	440509594
9	NC_020075	ATGTGA	2	12	14059	14070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509598
10	NC_020075	TTAAAG	2	12	14097	14108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509598
11	NC_020075	ATTTAA	2	12	14583	14594	50 %	50 %	0 %	0 %	440509599
12	NC_020075	TGTTAT	2	12	18420	18431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440509602
13	NC_020075	TAACAA	2	12	24078	24089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440509606
14	NC_020075	TAAAAA	2	12	27162	27173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509608
15	NC_020075	ATTTTT	2	12	28470	28481	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	440509609
16	NC_020075	GTTATT	2	12	28713	28724	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440509609
17	NC_020075	AATATT	2	12	33565	33576	50 %	50 %	0 %	0 %	440509612
18	NC_020075	CAAAAT	2	12	34297	34308	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440509613
19	NC_020075	GATTCT	2	12	35071	35082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509614
20	NC_020075	GTGGTT	2	12	36052	36063	0 %	50 %	50 %	0 %	440509614
21	NC_020075	TGGACT	2	12	37894	37905	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440509615
22	NC_020075	GTATCT	2	12	43636	43647	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509619
23	NC_020075	TTCATT	2	12	45154	45165	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509620
24	NC_020075	AGATAA	2	12	46439	46450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440509621
25	NC_020075	TGTTAT	2	12	51494	51505	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440509626
26	NC_020075	ATTTTA	2	12	59757	59768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440509632
27	NC_020075	CATATC	2	12	60730	60741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440509633
28	NC_020075	TATAGA	2	12	61688	61699	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509634
29	NC_020075	CATAAA	2	12	65233	65244	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440509637
30	NC_020075	ATTAGC	2	12	66805	66816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509638
31	NC_020075	ATATTT	2	12	71042	71053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440509640
32	NC_020075	GTATGA	2	12	74668	74679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509645
33	NC_020075	GATAGT	2	12	76263	76274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509646
34	NC_020075	CAACCG	2	12	85893	85904	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440509653
35	NC_020075	ATCTAA	2	12	88970	88981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440509655
36	NC_020075	AATTAA	2	12	96888	96899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440509660
37	NC_020075	TAAAAA	2	12	99336	99347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509663
38	NC_020075	GTTAAT	2	12	99360	99371	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509663
39	NC_020075	GTAATA	2	12	100465	100476	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509664
40	NC_020075	TTTCAT	2	12	100957	100968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509664
41	NC_020075	AAGCTA	2	12	105100	105111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440509669
42	NC_020075	TAAAAA	2	12	108930	108941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509672
43	NC_020075	ACAAGG	2	12	110545	110556	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440509672
44	NC_020075	TTAAAT	2	12	111257	111268	50 %	50 %	0 %	0 %	440509672
45	NC_020075	AAGGAG	2	12	113323	113334	50 %	0 %	50 %	0 %	440509674
46	NC_020075	TAAGCA	2	12	114742	114753	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440509675
47	NC_020075	AGAAAT	2	12	115043	115054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440509676
48	NC_020075	GGGTTT	2	12	118651	118662	0 %	50 %	50 %	0 %	440509680
49	NC_020075	TGTCGG	2	12	118982	118993	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440509680
50	NC_020075	TGGTTT	2	12	120926	120937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440509681
51	NC_020075	TTAATA	2	12	121863	121874	50 %	50 %	0 %	0 %	440509682
52	NC_020075	AGTATA	2	12	124360	124371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509684
53	NC_020075	TGATAT	2	12	126594	126605	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509685
54	NC_020075	TGGTAT	2	12	128055	128066	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440509685
55	NC_020075	CAACAG	2	12	130677	130688	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440509689
56	NC_020075	CTAATG	2	12	131436	131447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509689
57	NC_020075	ATTCAA	2	12	132998	133009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440509690
58	NC_020075	TAATAT	2	12	137440	137451	50 %	50 %	0 %	0 %	440509692
59	NC_020075	ATTATC	2	12	138121	138132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440509692
60	NC_020075	ACCATT	2	12	138526	138537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440509692
61	NC_020075	TTCAAA	2	12	144008	144019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440509696
62	NC_020075	ATGGTT	2	12	148825	148836	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440509700
63	NC_020075	ATTGGC	2	12	149184	149195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440509700
64	NC_020075	TTTAGA	2	12	153145	153156	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509704
65	NC_020075	GTGAAT	2	12	154494	154505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509704
66	NC_020075	GTAGAT	2	12	155132	155143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509704
67	NC_020075	ATTTAA	2	12	155299	155310	50 %	50 %	0 %	0 %	440509704
68	NC_020075	TATTTC	2	12	156951	156962	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509706
69	NC_020075	TATTAA	2	12	158653	158664	50 %	50 %	0 %	0 %	440509707
70	NC_020075	CTGTTC	2	12	158914	158925	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440509708
71	NC_020075	TAATAT	2	12	162403	162414	50 %	50 %	0 %	0 %	440509710
72	NC_020075	AGTATC	2	12	164671	164682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509711
73	NC_020075	ATATTT	2	12	166887	166898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440509713
74	NC_020075	GGGATA	2	12	167999	168010	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	440509714
75	NC_020075	AAAGCA	2	12	168740	168751	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	440509714
76	NC_020075	ATTAGC	2	12	171726	171737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509717
77	NC_020075	GGAAAA	2	12	175091	175102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440509719
78	NC_020075	AAATAA	2	12	175111	175122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509719
79	NC_020075	AATTGG	2	12	177768	177779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509722
80	NC_020075	TTTGCA	2	12	180520	180531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509724
81	NC_020075	CACTGA	2	12	181746	181757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440509725
82	NC_020075	TGCTCA	2	12	188571	188582	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440509729
83	NC_020075	TCTTTA	2	12	190064	190075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509730
84	NC_020075	TTTAGA	2	12	191904	191915	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509732
85	NC_020075	TTTTTA	2	12	195247	195258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	440509733
86	NC_020075	CATATG	2	12	197419	197430	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509735
87	NC_020075	CTGATT	2	12	209402	209413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509740
88	NC_020075	GCAGAA	2	12	211758	211769	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440509741
89	NC_020075	TGAATT	2	12	216903	216914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509745
90	NC_020075	TTAAAT	2	12	225828	225839	50 %	50 %	0 %	0 %	440509753
91	NC_020075	TACTGT	2	12	227778	227789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509755
92	NC_020075	AAACAA	2	12	228462	228473	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	440509756
93	NC_020075	ATTAAA	2	12	228862	228873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440509757
94	NC_020075	AATGAA	2	12	230802	230813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440509759
95	NC_020075	ATTTGA	2	12	232478	232489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509760
96	NC_020075	AGAATT	2	12	232603	232614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509760
97	NC_020075	TAAATA	2	12	239219	239230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440509765
98	NC_020075	AGGAAG	2	12	239451	239462	50 %	0 %	50 %	0 %	440509765
99	NC_020075	ATTAAA	2	12	239614	239625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440509765
100	NC_020075	GGTATT	2	12	239719	239730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440509765
101	NC_020075	TAAAGG	2	12	243521	243532	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440509769
102	NC_020075	ATTACT	2	12	249239	249250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440509781
103	NC_020075	GATCTA	2	12	252219	252230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509788
104	NC_020075	ATTCCA	2	12	252323	252334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440509788
105	NC_020075	TTAATT	2	12	252857	252868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440509788
106	NC_020075	TTGTAG	2	12	253422	253433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440509788
107	NC_020075	CCAGGA	2	12	254397	254408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440509791
108	NC_020075	ACTTTA	2	12	255512	255523	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440509793
109	NC_020075	CAATAA	2	12	258004	258015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440509796
110	NC_020075	TAAAAA	2	12	258730	258741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509797
111	NC_020075	CCTAAT	2	12	271282	271293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440509808
112	NC_020075	TTGGAT	2	12	272774	272785	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440509809
113	NC_020075	TGGTTT	2	12	273528	273539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440509811
114	NC_020075	ATAAAA	2	12	279270	279281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509815
115	NC_020075	CCAAAT	2	12	282213	282224	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	440509819
116	NC_020075	CCAAAA	2	12	282650	282661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440509819
117	NC_020075	ACACCA	2	12	283470	283481	50 %	0 %	0 %	50 %	440509819
118	NC_020075	TAAATT	2	12	287837	287848	50 %	50 %	0 %	0 %	440509821
119	NC_020075	GCAGTA	2	12	288245	288256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440509822
120	NC_020075	TCATTT	2	12	290047	290058	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509824
121	NC_020075	ACAATA	2	12	290071	290082	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440509824
122	NC_020075	ACTGGA	2	12	291888	291899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440509825
123	NC_020075	TAATAG	2	12	295536	295547	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509828
124	NC_020075	CTTATG	2	12	298749	298760	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509830
125	NC_020075	ACTGTA	2	12	302792	302803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509834
126	NC_020075	ATAAAA	2	12	307230	307241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509837
127	NC_020075	TGCATA	2	12	309770	309781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509839
128	NC_020075	TAGATG	2	12	309857	309868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509839
129	NC_020075	AAATAG	2	12	313232	313243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440509842
130	NC_020075	TCATCT	2	12	313918	313929	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440509842
131	NC_020075	ATATTA	2	12	315413	315424	50 %	50 %	0 %	0 %	440509842
132	NC_020075	ATTGAT	2	12	317581	317592	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509843
133	NC_020075	TCTTTA	2	12	321273	321284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509844
134	NC_020075	TTTTAG	2	12	322635	322646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440509845
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137	NC_020075	TATATG	2	12	333699	333710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509855
138	NC_020075	TCAAGA	2	12	333838	333849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440509855
139	NC_020075	TTTAAT	2	12	339592	339603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440509861
140	NC_020075	GAAAAA	2	12	342795	342806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	440509862
141	NC_020075	TAACAT	2	12	348771	348782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440509866
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143	NC_020075	ATTGCT	2	12	358201	358212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509874
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146	NC_020075	TAAAAT	2	12	369769	369780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440509880
147	NC_020075	TTAATT	2	12	373330	373341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440509882
148	NC_020075	GGAATA	2	12	376699	376710	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440509884
149	NC_020075	TATCTG	2	12	376761	376772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509884
150	NC_020075	AAATTT	2	12	378379	378390	50 %	50 %	0 %	0 %	440509886
151	NC_020075	TTTTGA	2	12	380319	380330	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440509888
152	NC_020075	AGTATC	2	12	380724	380735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509888
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156	NC_020075	TATATT	2	12	386224	386235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440509892
157	NC_020075	ACTGAT	2	12	386361	386372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509892
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159	NC_020075	ATATTG	2	12	390108	390119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509894
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161	NC_020075	TTATCT	2	12	399293	399304	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509900
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163	NC_020075	ATGCAC	3	18	402860	402877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440509904
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170	NC_020075	AGATCA	2	12	420022	420033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440509918
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188	NC_020075	ATGCTA	2	12	458054	458065	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509952
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231	NC_020075	ATCAGC	2	12	575861	575872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440510039
232	NC_020075	ATATTT	2	12	584422	584433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440510044
233	NC_020075	TTTTCC	2	12	587415	587426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440510046
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235	NC_020075	ACTAAT	2	12	592563	592574	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440510048
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237	NC_020075	GCAAAA	2	12	596683	596694	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	440510052
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.