MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Blochmannia chromaiodes str. 640 chromosome

Total Repeats: 329

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020075	ATTGA	2	10	16304	16313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020075	ATTAT	2	10	21103	21112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020075	ATAAA	2	10	21191	21200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020075	ATTAT	2	10	30004	30013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020075	TAATA	2	10	33868	33877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020075	ATTTC	2	10	34871	34880	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020075	GTTTT	2	10	37152	37161	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020075	TCTAT	2	10	39409	39418	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020075	TTATT	2	10	40683	40692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020075	ATTGT	2	10	45767	45776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020075	AATTT	2	10	50729	50738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020075	ATATT	2	10	54572	54581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020075	TCATA	2	10	54868	54877	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020075	ATTTT	2	10	56013	56022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020075	TAAAA	2	10	56328	56337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020075	TTAAT	2	10	56587	56596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020075	ATATT	2	10	56606	56615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020075	TTATA	2	10	60138	60147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020075	TATTT	2	10	60208	60217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020075	GTATA	2	10	60888	60897	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020075	TATAT	2	10	62621	62630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020075	TTTAA	2	10	62783	62792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020075	TATAA	2	10	64353	64362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020075	TAATT	2	10	66346	66355	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020075	AAATA	2	10	66410	66419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020075	AAAAG	2	10	66639	66648	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020075	TAATA	2	10	67660	67669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020075	TTATT	2	10	72044	72053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020075	AATAT	2	10	73911	73920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020075	TAAGA	2	10	74333	74342	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020075	AGAAT	2	10	75363	75372	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020075	AAAAT	2	10	76861	76870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020075	TAATT	2	10	77136	77145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020075	ATATT	2	10	82608	82617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020075	ATATT	2	10	83023	83032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020075	ATTTT	2	10	83968	83977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020075	AGATA	2	10	84328	84337	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020075	TTTAT	2	10	84465	84474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020075	ATTAT	2	10	84493	84502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020075	AGAAA	2	10	84940	84949	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020075	AATGT	2	10	91399	91408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020075	GATTA	2	10	92348	92357	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020075	AATAA	2	10	92935	92944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020075	ATGTT	2	10	106639	106648	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020075	TAACA	2	10	113149	113158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020075	TATAA	2	10	122618	122627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020075	TATAA	2	10	123265	123274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020075	ATTAA	2	10	123748	123757	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020075	ATTTA	2	10	129673	129682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020075	ACAAT	2	10	132465	132474	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020075	ATTTT	2	10	132729	132738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020075	ATGTA	2	10	135326	135335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020075	TTTGA	2	10	135594	135603	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020075	ATTTT	2	10	135683	135692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020075	TGTAT	2	10	135831	135840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020075	AATAT	2	10	149319	149328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020075	TTTTA	2	10	151564	151573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020075	TATAT	2	10	163602	163611	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020075	ATATA	2	10	163970	163979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020075	TAATA	2	10	169018	169027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020075	GAAAC	2	10	181470	181479	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020075	TACAA	2	10	186322	186331	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020075	ATGTG	2	10	190316	190325	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020075	ATTAA	2	10	190377	190386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020075	ATATA	2	10	190757	190766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020075	ATTTT	2	10	192507	192516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020075	ATTTA	2	10	193094	193103	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020075	TATCA	2	10	195360	195369	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020075	TTTAA	2	10	200204	200213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020075	ATATT	2	10	200333	200342	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020075	TTTTA	2	10	203905	203914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020075	ATATA	2	10	203978	203987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020075	GTATA	2	10	204632	204641	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020075	TAAAT	2	10	204948	204957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020075	AAATT	2	10	208440	208449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020075	ATATT	2	10	221162	221171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020075	TATTT	2	10	221310	221319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020075	ATTAT	2	10	221510	221519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020075	TAAAA	2	10	224709	224718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020075	TTTAT	2	10	224786	224795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020075	TATAT	2	10	232932	232941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020075	TTAAT	2	10	232944	232953	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020075	TAATA	2	10	240132	240141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020075	CTTAT	2	10	241192	241201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020075	ATTTA	2	10	241905	241914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020075	ACAAT	2	10	241929	241938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020075	GATAT	2	10	258256	258265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020075	TTGAT	2	10	260077	260086	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020075	TTGAT	2	10	260218	260227	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020075	AATAT	2	10	260528	260537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020075	TAAAA	2	10	260677	260686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020075	AAACA	2	10	263917	263926	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020075	TAAAA	2	10	264996	265005	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020075	TCAAT	2	10	265427	265436	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020075	TATGC	2	10	272364	272373	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020075	CCGAA	2	10	273441	273450	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_020075	ATAAA	2	10	276918	276927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020075	ATATT	2	10	280242	280251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020075	TTAAT	2	10	285263	285272	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020075	TAAAA	2	10	285491	285500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020075	TAATT	2	10	285762	285771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020075	TGAAA	2	10	285884	285893	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020075	ATCAA	2	10	286260	286269	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020075	AATAA	2	10	286374	286383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020075	ATTGC	2	10	286579	286588	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020075	ATACA	2	10	287183	287192	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_020075	GCTTT	2	10	289347	289356	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_020075	ATAAA	2	10	291530	291539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020075	ATTTT	2	10	293054	293063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020075	AATTA	2	10	295183	295192	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020075	TTAAT	2	10	296374	296383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020075	ATCAA	2	10	296477	296486	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020075	TAAAC	2	10	296766	296775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_020075	ATTAG	2	10	299248	299257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020075	ACACA	2	10	301181	301190	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_020075	TACAA	2	10	301601	301610	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020075	AAATT	2	10	302287	302296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020075	ATATA	2	10	305937	305946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020075	ATTTT	2	10	310611	310620	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020075	TTGAG	2	10	310913	310922	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020075	TTTCA	2	10	312873	312882	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020075	TAAAT	2	10	313069	313078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020075	TAATT	2	10	328230	328239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020075	AATAT	2	10	348220	348229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020075	TTTAT	2	10	348993	349002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020075	ATTAC	2	10	351632	351641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020075	ATTTT	2	10	352030	352039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020075	AAAAT	2	10	354927	354936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020075	AATAA	2	10	359326	359335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020075	ATATT	2	10	363351	363360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020075	AATAA	2	10	363596	363605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020075	AAAAT	2	10	363625	363634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020075	TTAAA	2	10	366587	366596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020075	AATCA	2	10	366658	366667	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020075	CAACA	2	10	367950	367959	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_020075	ATATT	2	10	368150	368159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020075	TATTC	2	10	368161	368170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020075	TATGT	2	10	369555	369564	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020075	TAGTA	2	10	372445	372454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020075	ATCAT	2	10	373691	373700	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_020075	TTGTA	2	10	391814	391823	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020075	ACATA	2	10	394437	394446	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_020075	GCAAC	2	10	394505	394514	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_020075	TAATA	2	10	397846	397855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020075	TTATT	2	10	398380	398389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020075	TCATT	2	10	398818	398827	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_020075	CTAAT	2	10	398926	398935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_020075	CAAAA	2	10	398979	398988	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_020075	GAATT	2	10	409204	409213	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_020075	ATATA	4	20	728530	728549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_020075	ATTTT	2	10	736707	736716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_020075	ACTAA	2	10	737110	737119	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
298	NC_020075	GTATA	2	10	737146	737155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
299	NC_020075	AAATA	2	10	738171	738180	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_020075	GTAAT	2	10	739503	739512	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
301	NC_020075	TATAT	2	10	740817	740826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_020075	TACAT	2	10	740951	740960	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
303	NC_020075	ATAAA	2	10	747286	747295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_020075	AATTA	2	10	747410	747419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_020075	GAAAA	2	10	747634	747643	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
306	NC_020075	TAAAA	2	10	755559	755568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_020075	TTACG	2	10	755684	755693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
308	NC_020075	TAAAT	2	10	756009	756018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_020075	TACAA	2	10	756268	756277	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
310	NC_020075	GATAT	2	10	756529	756538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
311	NC_020075	AATTT	2	10	758343	758352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_020075	TTATT	2	10	759856	759865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_020075	TTAAA	2	10	761924	761933	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_020075	TTTTA	2	10	762211	762220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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317	NC_020075	AATTA	2	10	764992	765001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_020075	TAATA	2	10	766626	766635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_020075	TATAA	2	10	766831	766840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_020075	TTAAT	2	10	772951	772960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_020075	TTATA	2	10	773166	773175	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_020075	AAAAT	2	10	775120	775129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_020075	AAATA	2	10	777281	777290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_020075	ATGAT	2	10	779918	779927	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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327	NC_020075	AAATT	2	10	788848	788857	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_020075	ATAAC	2	10	790757	790766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
329	NC_020075	GTAAA	2	10	791049	791058	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.