MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 1299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020062	CTTTT	2	10	5260	5269	0 %	80 %	0 %	20 %	440222969
2	NC_020062	ATCGA	2	10	5507	5516	40 %	20 %	20 %	20 %	440222969
3	NC_020062	ACCTG	2	10	5862	5871	20 %	20 %	20 %	40 %	440222970
4	NC_020062	GCCAC	2	10	6172	6181	20 %	0 %	20 %	60 %	440222970
5	NC_020062	CGTCG	2	10	9756	9765	0 %	20 %	40 %	40 %	440222975
6	NC_020062	GGACC	2	10	13151	13160	20 %	0 %	40 %	40 %	440222979
7	NC_020062	GTCCC	2	10	18344	18353	0 %	20 %	20 %	60 %	440222983
8	NC_020062	TGCAA	2	10	19861	19870	40 %	20 %	20 %	20 %	440222985
9	NC_020062	CGGCG	2	10	23647	23656	0 %	0 %	60 %	40 %	440222987
10	NC_020062	GGTCG	2	10	24149	24158	0 %	20 %	60 %	20 %	440222987
11	NC_020062	CGTTA	2	10	24638	24647	20 %	40 %	20 %	20 %	440222987
12	NC_020062	CGAGC	2	10	25650	25659	20 %	0 %	40 %	40 %	440222988
13	NC_020062	GCCGG	2	10	26727	26736	0 %	0 %	60 %	40 %	440222988
14	NC_020062	CTTTT	2	10	26772	26781	0 %	80 %	0 %	20 %	440222988
15	NC_020062	CGATA	2	10	26816	26825	40 %	20 %	20 %	20 %	440222988
16	NC_020062	AGCGC	2	10	27262	27271	20 %	0 %	40 %	40 %	440222988
17	NC_020062	GCCCG	2	10	28380	28389	0 %	0 %	40 %	60 %	440222988
18	NC_020062	GCTCG	2	10	29477	29486	0 %	20 %	40 %	40 %	440222989
19	NC_020062	ATCCG	2	10	29993	30002	20 %	20 %	20 %	40 %	440222989
20	NC_020062	GCATC	2	10	30482	30491	20 %	20 %	20 %	40 %	440222989
21	NC_020062	TGTCG	2	10	30723	30732	0 %	40 %	40 %	20 %	440222989
22	NC_020062	GCGCC	2	10	34005	34014	0 %	0 %	40 %	60 %	440222989
23	NC_020062	GGTTG	2	10	36460	36469	0 %	40 %	60 %	0 %	440222990
24	NC_020062	GCTCG	2	10	37207	37216	0 %	20 %	40 %	40 %	440222990
25	NC_020062	CTGTT	2	10	42835	42844	0 %	60 %	20 %	20 %	440222996
26	NC_020062	GTTCG	2	10	43655	43664	0 %	40 %	40 %	20 %	440222997
27	NC_020062	TCTGG	2	10	43847	43856	0 %	40 %	40 %	20 %	440222997
28	NC_020062	GGCTG	2	10	44064	44073	0 %	20 %	60 %	20 %	440222998
29	NC_020062	AGGCG	2	10	48804	48813	20 %	0 %	60 %	20 %	440223004
30	NC_020062	GGCCG	2	10	57830	57839	0 %	0 %	60 %	40 %	440223012
31	NC_020062	ACCGG	2	10	58013	58022	20 %	0 %	40 %	40 %	440223012
32	NC_020062	GTATT	2	10	60586	60595	20 %	60 %	20 %	0 %	440223015
33	NC_020062	GTCGG	2	10	60631	60640	0 %	20 %	60 %	20 %	440223015
34	NC_020062	AAGGC	2	10	65056	65065	40 %	0 %	40 %	20 %	440223019
35	NC_020062	TCGAA	2	10	66251	66260	40 %	20 %	20 %	20 %	440223020
36	NC_020062	GAAAT	2	10	67577	67586	60 %	20 %	20 %	0 %	440223021
37	NC_020062	CGGAG	2	10	68690	68699	20 %	0 %	60 %	20 %	440223022
38	NC_020062	GAGCG	2	10	68925	68934	20 %	0 %	60 %	20 %	440223022
39	NC_020062	ACAGA	2	10	70129	70138	60 %	0 %	20 %	20 %	440223024
40	NC_020062	CGAAG	2	10	73802	73811	40 %	0 %	40 %	20 %	440223028
41	NC_020062	CCGAA	2	10	74878	74887	40 %	0 %	20 %	40 %	440223030
42	NC_020062	GCGCA	2	10	76035	76044	20 %	0 %	40 %	40 %	440223031
43	NC_020062	CATCT	2	10	76120	76129	20 %	40 %	0 %	40 %	440223031
44	NC_020062	GTGCG	2	10	78635	78644	0 %	20 %	60 %	20 %	440223032
45	NC_020062	ATAGC	2	10	79774	79783	40 %	20 %	20 %	20 %	440223033
46	NC_020062	GACGG	2	10	82954	82963	20 %	0 %	60 %	20 %	440223037
47	NC_020062	GTCGG	2	10	89076	89085	0 %	20 %	60 %	20 %	440223041
48	NC_020062	TCTCA	2	10	92634	92643	20 %	40 %	0 %	40 %	440223044
49	NC_020062	GGTCG	2	10	92750	92759	0 %	20 %	60 %	20 %	440223044
50	NC_020062	GACGC	2	10	93402	93411	20 %	0 %	40 %	40 %	440223044
51	NC_020062	GGCAA	2	10	98420	98429	40 %	0 %	40 %	20 %	440223050
52	NC_020062	GCGCC	2	10	98888	98897	0 %	0 %	40 %	60 %	440223050
53	NC_020062	CCCGA	2	10	99146	99155	20 %	0 %	20 %	60 %	440223050
54	NC_020062	GGCGA	2	10	100644	100653	20 %	0 %	60 %	20 %	440223052
55	NC_020062	TGGCC	2	10	102985	102994	0 %	20 %	40 %	40 %	440223055
56	NC_020062	GAGTG	2	10	103390	103399	20 %	20 %	60 %	0 %	440223056
57	NC_020062	GGTCG	2	10	104245	104254	0 %	20 %	60 %	20 %	440223057
58	NC_020062	CGATG	2	10	104389	104398	20 %	20 %	40 %	20 %	440223057
59	NC_020062	CCGCA	2	10	104427	104436	20 %	0 %	20 %	60 %	440223057
60	NC_020062	TCAGC	2	10	105793	105802	20 %	20 %	20 %	40 %	440223057
61	NC_020062	CGATC	2	10	108121	108130	20 %	20 %	20 %	40 %	440223060
62	NC_020062	AACCC	2	10	108806	108815	40 %	0 %	0 %	60 %	440223061
63	NC_020062	GCTGG	2	10	109306	109315	0 %	20 %	60 %	20 %	440223061
64	NC_020062	GGTGA	2	10	109672	109681	20 %	20 %	60 %	0 %	440223062
65	NC_020062	CGAGA	2	10	109716	109725	40 %	0 %	40 %	20 %	440223062
66	NC_020062	GGCGA	2	10	110343	110352	20 %	0 %	60 %	20 %	440223062
67	NC_020062	AAATC	2	10	117519	117528	60 %	20 %	0 %	20 %	440223067
68	NC_020062	TAATT	2	10	118154	118163	40 %	60 %	0 %	0 %	440223067
69	NC_020062	GGCAG	2	10	120013	120022	20 %	0 %	60 %	20 %	440223068
70	NC_020062	TGCGG	2	10	120597	120606	0 %	20 %	60 %	20 %	440223069
71	NC_020062	TTCTC	2	10	122206	122215	0 %	60 %	0 %	40 %	440223070
72	NC_020062	ATGTC	2	10	124206	124215	20 %	40 %	20 %	20 %	440223073
73	NC_020062	GCGCC	2	10	124816	124825	0 %	0 %	40 %	60 %	440223074
74	NC_020062	GCCGA	2	10	126537	126546	20 %	0 %	40 %	40 %	440223075
75	NC_020062	TCCAT	2	10	126849	126858	20 %	40 %	0 %	40 %	440223076
76	NC_020062	GCCAA	2	10	129419	129428	40 %	0 %	20 %	40 %	440223078
77	NC_020062	GCTTT	2	10	130836	130845	0 %	60 %	20 %	20 %	440223080
78	NC_020062	CAGTC	2	10	137422	137431	20 %	20 %	20 %	40 %	440223084
79	NC_020062	CGTTC	2	10	139929	139938	0 %	40 %	20 %	40 %	440223087
80	NC_020062	CGTGA	2	10	140148	140157	20 %	20 %	40 %	20 %	440223087
81	NC_020062	GCATC	2	10	140542	140551	20 %	20 %	20 %	40 %	440223087
82	NC_020062	CGGGC	2	10	141079	141088	0 %	0 %	60 %	40 %	440223088
83	NC_020062	CAGCG	2	10	143872	143881	20 %	0 %	40 %	40 %	440223092
84	NC_020062	GGCTG	2	10	145915	145924	0 %	20 %	60 %	20 %	440223093
85	NC_020062	TGCCT	2	10	146346	146355	0 %	40 %	20 %	40 %	440223094
86	NC_020062	GGCAG	2	10	156699	156708	20 %	0 %	60 %	20 %	440223095
87	NC_020062	GCCGA	2	10	159154	159163	20 %	0 %	40 %	40 %	440223098
88	NC_020062	GATCA	2	10	161693	161702	40 %	20 %	20 %	20 %	440223100
89	NC_020062	GGATC	2	10	162520	162529	20 %	20 %	40 %	20 %	440223100
90	NC_020062	AAGGG	2	10	163627	163636	40 %	0 %	60 %	0 %	440223100
91	NC_020062	ACCGA	2	10	165286	165295	40 %	0 %	20 %	40 %	440223101
92	NC_020062	ATAGA	2	10	168655	168664	60 %	20 %	20 %	0 %	440223106
93	NC_020062	GAGCC	2	10	169291	169300	20 %	0 %	40 %	40 %	440223106
94	NC_020062	CTGGC	2	10	170389	170398	0 %	20 %	40 %	40 %	440223107
95	NC_020062	GAGCG	2	10	170711	170720	20 %	0 %	60 %	20 %	440223107
96	NC_020062	CGCCC	2	10	175440	175449	0 %	0 %	20 %	80 %	440223113
97	NC_020062	GCTGG	2	10	175708	175717	0 %	20 %	60 %	20 %	440223113
98	NC_020062	ATCTG	3	15	176512	176526	20 %	40 %	20 %	20 %	440223114
99	NC_020062	AACAA	2	10	177427	177436	80 %	0 %	0 %	20 %	440223115
100	NC_020062	TTCTC	2	10	178814	178823	0 %	60 %	0 %	40 %	440223116
101	NC_020062	CGATG	2	10	180952	180961	20 %	20 %	40 %	20 %	440223118
102	NC_020062	CAGCG	2	10	182008	182017	20 %	0 %	40 %	40 %	440223119
103	NC_020062	TAGCC	2	10	182449	182458	20 %	20 %	20 %	40 %	440223119
104	NC_020062	AGTTG	2	10	186300	186309	20 %	40 %	40 %	0 %	440223124
105	NC_020062	TGCGG	2	10	191123	191132	0 %	20 %	60 %	20 %	440223130
106	NC_020062	TGATT	2	10	192497	192506	20 %	60 %	20 %	0 %	440223131
107	NC_020062	GCAAG	2	10	193916	193925	40 %	0 %	40 %	20 %	440223132
108	NC_020062	TGCTG	2	10	194354	194363	0 %	40 %	40 %	20 %	440223133
109	NC_020062	CGATA	2	10	195369	195378	40 %	20 %	20 %	20 %	440223134
110	NC_020062	GCAGA	2	10	199454	199463	40 %	0 %	40 %	20 %	440223136
111	NC_020062	CGCGT	2	10	200566	200575	0 %	20 %	40 %	40 %	440223137
112	NC_020062	GCGAG	2	10	202278	202287	20 %	0 %	60 %	20 %	440223138
113	NC_020062	AGCCC	2	10	204977	204986	20 %	0 %	20 %	60 %	440223141
114	NC_020062	GAAAG	2	10	205134	205143	60 %	0 %	40 %	0 %	440223141
115	NC_020062	CCAGT	2	10	206175	206184	20 %	20 %	20 %	40 %	440223142
116	NC_020062	GCCAA	2	10	208659	208668	40 %	0 %	20 %	40 %	440223144
117	NC_020062	CCGTT	2	10	209315	209324	0 %	40 %	20 %	40 %	440223145
118	NC_020062	CCACG	2	10	210385	210394	20 %	0 %	20 %	60 %	440223147
119	NC_020062	GCCTT	2	10	210819	210828	0 %	40 %	20 %	40 %	440223147
120	NC_020062	GCCAA	2	10	214156	214165	40 %	0 %	20 %	40 %	440223151
121	NC_020062	GCGAC	2	10	214373	214382	20 %	0 %	40 %	40 %	440223151
122	NC_020062	GCCGC	2	10	215768	215777	0 %	0 %	40 %	60 %	440223153
123	NC_020062	GCCGG	2	10	216347	216356	0 %	0 %	60 %	40 %	440223153
124	NC_020062	TTATA	2	10	217942	217951	40 %	60 %	0 %	0 %	440223155
125	NC_020062	CGTTG	2	10	219943	219952	0 %	40 %	40 %	20 %	440223158
126	NC_020062	GCGAC	2	10	221023	221032	20 %	0 %	40 %	40 %	440223159
127	NC_020062	AGCGC	2	10	221881	221890	20 %	0 %	40 %	40 %	440223160
128	NC_020062	TGATC	2	10	222110	222119	20 %	40 %	20 %	20 %	440223160
129	NC_020062	CGGGC	2	10	222227	222236	0 %	0 %	60 %	40 %	440223160
130	NC_020062	TCTCG	2	10	224977	224986	0 %	40 %	20 %	40 %	440223163
131	NC_020062	TCCTG	2	10	225339	225348	0 %	40 %	20 %	40 %	440223163
132	NC_020062	ACCAG	2	10	226157	226166	40 %	0 %	20 %	40 %	440223164
133	NC_020062	CCTTG	2	10	227184	227193	0 %	40 %	20 %	40 %	440223166
134	NC_020062	GGCCG	2	10	228128	228137	0 %	0 %	60 %	40 %	440223167
135	NC_020062	CACCC	2	10	230567	230576	20 %	0 %	0 %	80 %	440223169
136	NC_020062	TCGGG	2	10	232654	232663	0 %	20 %	60 %	20 %	440223171
137	NC_020062	TCGGC	2	10	234718	234727	0 %	20 %	40 %	40 %	440223174
138	NC_020062	AGCCG	2	10	236353	236362	20 %	0 %	40 %	40 %	440223177
139	NC_020062	CATTC	2	10	239349	239358	20 %	40 %	0 %	40 %	440223181
140	NC_020062	CTCGG	2	10	243619	243628	0 %	20 %	40 %	40 %	440223184
141	NC_020062	GAGCG	2	10	250467	250476	20 %	0 %	60 %	20 %	440223190
142	NC_020062	AGACA	2	10	258905	258914	60 %	0 %	20 %	20 %	440223196
143	NC_020062	GCTCA	2	10	260331	260340	20 %	20 %	20 %	40 %	440223196
144	NC_020062	CCGTG	2	10	263146	263155	0 %	20 %	40 %	40 %	440223199
145	NC_020062	TCGTT	2	10	264637	264646	0 %	60 %	20 %	20 %	440223200
146	NC_020062	TCCGA	2	10	266417	266426	20 %	20 %	20 %	40 %	440223202
147	NC_020062	TGCTT	2	10	267131	267140	0 %	60 %	20 %	20 %	440223203
148	NC_020062	AGGAT	2	10	269834	269843	40 %	20 %	40 %	0 %	440223205
149	NC_020062	GTTCC	2	10	270136	270145	0 %	40 %	20 %	40 %	440223205
150	NC_020062	CTTCC	2	10	271848	271857	0 %	40 %	0 %	60 %	440223206
151	NC_020062	ATCCG	2	10	272515	272524	20 %	20 %	20 %	40 %	440223207
152	NC_020062	ATCCC	2	10	272892	272901	20 %	20 %	0 %	60 %	440223207
153	NC_020062	CGAAC	2	10	272944	272953	40 %	0 %	20 %	40 %	440223207
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155	NC_020062	CCGCG	2	10	277824	277833	0 %	0 %	40 %	60 %	440223211
156	NC_020062	CCGGC	2	10	280344	280353	0 %	0 %	40 %	60 %	440223213
157	NC_020062	ACGGC	2	10	280598	280607	20 %	0 %	40 %	40 %	440223213
158	NC_020062	CGATC	2	10	281410	281419	20 %	20 %	20 %	40 %	440223213
159	NC_020062	TCAAG	2	10	281854	281863	40 %	20 %	20 %	20 %	440223213
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165	NC_020062	CCGGG	2	10	290190	290199	0 %	0 %	60 %	40 %	440223221
166	NC_020062	TGCGC	2	10	291024	291033	0 %	20 %	40 %	40 %	440223221
167	NC_020062	CGCCT	2	10	291134	291143	0 %	20 %	20 %	60 %	440223221
168	NC_020062	ACCGA	2	10	291990	291999	40 %	0 %	20 %	40 %	440223222
169	NC_020062	ATGCA	2	10	292861	292870	40 %	20 %	20 %	20 %	440223223
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171	NC_020062	TCGCC	2	10	295286	295295	0 %	20 %	20 %	60 %	440223225
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173	NC_020062	GATCG	2	10	297950	297959	20 %	20 %	40 %	20 %	440223228
174	NC_020062	CGCGT	2	10	298142	298151	0 %	20 %	40 %	40 %	440223229
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176	NC_020062	GGGCA	2	10	300798	300807	20 %	0 %	60 %	20 %	440223231
177	NC_020062	GATGA	2	10	301044	301053	40 %	20 %	40 %	0 %	440223231
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184	NC_020062	TTGCG	2	10	309623	309632	0 %	40 %	40 %	20 %	440223237
185	NC_020062	CTCCG	2	10	313159	313168	0 %	20 %	20 %	60 %	440223240
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192	NC_020062	GGCCG	2	10	324517	324526	0 %	0 %	60 %	40 %	440223249
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241	NC_020062	GTCGG	2	10	395787	395796	0 %	20 %	60 %	20 %	440223314
242	NC_020062	CCGCG	2	10	398254	398263	0 %	0 %	40 %	60 %	440223316
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246	NC_020062	TCATT	2	10	402681	402690	20 %	60 %	0 %	20 %	440223321
247	NC_020062	TTCCG	2	10	403456	403465	0 %	40 %	20 %	40 %	440223322
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249	NC_020062	CAATA	2	10	406597	406606	60 %	20 %	0 %	20 %	440223323
250	NC_020062	TCGGC	2	10	407132	407141	0 %	20 %	40 %	40 %	440223323
251	NC_020062	CAGGG	2	10	407516	407525	20 %	0 %	60 %	20 %	440223323
252	NC_020062	AGGCA	2	10	408104	408113	40 %	0 %	40 %	20 %	440223323
253	NC_020062	GGCGA	2	10	408200	408209	20 %	0 %	60 %	20 %	440223323
254	NC_020062	CGGCG	2	10	411134	411143	0 %	0 %	60 %	40 %	440223328
255	NC_020062	GCCGA	2	10	418335	418344	20 %	0 %	40 %	40 %	440223336
256	NC_020062	TGCCG	2	10	421678	421687	0 %	20 %	40 %	40 %	440223339
257	NC_020062	AGGCG	2	10	424375	424384	20 %	0 %	60 %	20 %	440223342
258	NC_020062	GGTGA	2	10	433233	433242	20 %	20 %	60 %	0 %	440223348
259	NC_020062	TTCGA	2	10	433497	433506	20 %	40 %	20 %	20 %	440223348
260	NC_020062	CTTGC	2	10	434305	434314	0 %	40 %	20 %	40 %	440223349
261	NC_020062	TGCGA	2	10	435859	435868	20 %	20 %	40 %	20 %	440223351
262	NC_020062	ATTCA	2	10	436723	436732	40 %	40 %	0 %	20 %	440223352
263	NC_020062	CATCG	2	10	437380	437389	20 %	20 %	20 %	40 %	440223352
264	NC_020062	AAATC	2	10	438770	438779	60 %	20 %	0 %	20 %	440223353
265	NC_020062	GAGCT	2	10	438957	438966	20 %	20 %	40 %	20 %	440223354
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267	NC_020062	CACGT	2	10	441512	441521	20 %	20 %	20 %	40 %	440223357
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281	NC_020062	GCTTG	2	10	465916	465925	0 %	40 %	40 %	20 %	440223378
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285	NC_020062	ATCGC	2	10	473526	473535	20 %	20 %	20 %	40 %	440223382
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338	NC_020062	CATCG	2	10	556733	556742	20 %	20 %	20 %	40 %	440223468
339	NC_020062	ACCGT	2	10	557244	557253	20 %	20 %	20 %	40 %	440223468
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341	NC_020062	CCGAT	2	10	558226	558235	20 %	20 %	20 %	40 %	440223468
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366	NC_020062	ATCGC	2	10	599067	599076	20 %	20 %	20 %	40 %	440223509
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374	NC_020062	TGGCG	2	10	611049	611058	0 %	20 %	60 %	20 %	440223521
375	NC_020062	AGGGC	2	10	611262	611271	20 %	0 %	60 %	20 %	440223521
376	NC_020062	GGTCA	2	10	611359	611368	20 %	20 %	40 %	20 %	440223521
377	NC_020062	GGCTC	2	10	611390	611399	0 %	20 %	40 %	40 %	440223521
378	NC_020062	ATATG	2	10	612065	612074	40 %	40 %	20 %	0 %	440223522
379	NC_020062	AGGTC	2	10	612978	612987	20 %	20 %	40 %	20 %	440223523
380	NC_020062	CAGCG	2	10	613045	613054	20 %	0 %	40 %	40 %	440223523
381	NC_020062	AGCGA	2	10	613985	613994	40 %	0 %	40 %	20 %	440223523
382	NC_020062	CGATC	2	10	614487	614496	20 %	20 %	20 %	40 %	440223524
383	NC_020062	ACGGC	2	10	615752	615761	20 %	0 %	40 %	40 %	440223525
384	NC_020062	GAAGC	2	10	615902	615911	40 %	0 %	40 %	20 %	440223525
385	NC_020062	GGCGT	2	10	616931	616940	0 %	20 %	60 %	20 %	440223526
386	NC_020062	CCGCC	2	10	622284	622293	0 %	0 %	20 %	80 %	440223531
387	NC_020062	CCGTC	2	10	625141	625150	0 %	20 %	20 %	60 %	440223533
388	NC_020062	TCCGT	2	10	626432	626441	0 %	40 %	20 %	40 %	440223534
389	NC_020062	GGGCA	2	10	627439	627448	20 %	0 %	60 %	20 %	440223535
390	NC_020062	CCGAT	2	10	627951	627960	20 %	20 %	20 %	40 %	440223536
391	NC_020062	GCTCA	2	10	628598	628607	20 %	20 %	20 %	40 %	440223536
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