MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 5517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020062	GGGA	2	8	289	296	25 %	0 %	75 %	0 %	440222966
2	NC_020062	CTCG	2	8	479	486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020062	GGGA	2	8	880	887	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020062	CGGT	2	8	980	987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020062	CCGT	2	8	1054	1061	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020062	ATAG	2	8	1143	1150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020062	TGAA	2	8	1515	1522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020062	ATAG	2	8	1591	1598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020062	CGGG	2	8	1959	1966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020062	GAAT	2	8	2241	2248	50 %	25 %	25 %	0 %	440222968
11	NC_020062	TGCG	2	8	2440	2447	0 %	25 %	50 %	25 %	440222968
12	NC_020062	TGGC	2	8	2580	2587	0 %	25 %	50 %	25 %	440222968
13	NC_020062	CAGC	2	8	2910	2917	25 %	0 %	25 %	50 %	440222968
14	NC_020062	GCCG	2	8	3009	3016	0 %	0 %	50 %	50 %	440222968
15	NC_020062	TCGA	2	8	3082	3089	25 %	25 %	25 %	25 %	440222968
16	NC_020062	CGCC	2	8	3232	3239	0 %	0 %	25 %	75 %	440222968
17	NC_020062	GATC	2	8	3434	3441	25 %	25 %	25 %	25 %	440222968
18	NC_020062	GCAA	2	8	3487	3494	50 %	0 %	25 %	25 %	440222968
19	NC_020062	CCGC	2	8	3628	3635	0 %	0 %	25 %	75 %	440222968
20	NC_020062	GCCG	2	8	3890	3897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020062	ACCG	2	8	4020	4027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020062	CATA	2	8	4833	4840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020062	CGGA	2	8	4947	4954	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020062	GCAT	2	8	5683	5690	25 %	25 %	25 %	25 %	440222970
25	NC_020062	CTGC	2	8	5935	5942	0 %	25 %	25 %	50 %	440222970
26	NC_020062	ACGC	2	8	5969	5976	25 %	0 %	25 %	50 %	440222970
27	NC_020062	AGCA	2	8	5980	5987	50 %	0 %	25 %	25 %	440222970
28	NC_020062	ACGC	2	8	6413	6420	25 %	0 %	25 %	50 %	440222970
29	NC_020062	CTGC	2	8	6430	6437	0 %	25 %	25 %	50 %	440222970
30	NC_020062	ACGC	2	8	6803	6810	25 %	0 %	25 %	50 %	440222970
31	NC_020062	TCGG	2	8	7581	7588	0 %	25 %	50 %	25 %	440222972
32	NC_020062	ATCG	2	8	7814	7821	25 %	25 %	25 %	25 %	440222973
33	NC_020062	GACC	2	8	8096	8103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020062	CGGA	2	8	8238	8245	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020062	CTTT	2	8	8384	8391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020062	GCTG	2	8	8585	8592	0 %	25 %	50 %	25 %	440222974
37	NC_020062	ACCT	2	8	8675	8682	25 %	25 %	0 %	50 %	440222974
38	NC_020062	TTCA	2	8	9190	9197	25 %	50 %	0 %	25 %	440222974
39	NC_020062	CGGC	2	8	9500	9507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020062	AGGA	2	8	9632	9639	50 %	0 %	50 %	0 %	440222975
41	NC_020062	CGCC	2	8	9727	9734	0 %	0 %	25 %	75 %	440222975
42	NC_020062	CGAA	2	8	9857	9864	50 %	0 %	25 %	25 %	440222975
43	NC_020062	GGAT	2	8	10238	10245	25 %	25 %	50 %	0 %	440222976
44	NC_020062	GCAT	2	8	10283	10290	25 %	25 %	25 %	25 %	440222976
45	NC_020062	GCCG	2	8	10758	10765	0 %	0 %	50 %	50 %	440222976
46	NC_020062	GGCA	2	8	11633	11640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020062	CTTG	2	8	11722	11729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020062	CGAC	2	8	12220	12227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020062	GTGG	2	8	12530	12537	0 %	25 %	75 %	0 %	440222978
50	NC_020062	GAGC	2	8	12977	12984	25 %	0 %	50 %	25 %	440222979
51	NC_020062	TGCG	2	8	13049	13056	0 %	25 %	50 %	25 %	440222979
52	NC_020062	CTGA	2	8	13332	13339	25 %	25 %	25 %	25 %	440222979
53	NC_020062	ACCG	2	8	13890	13897	25 %	0 %	25 %	50 %	440222979
54	NC_020062	CAGC	2	8	14501	14508	25 %	0 %	25 %	50 %	440222980
55	NC_020062	TCGG	2	8	14697	14704	0 %	25 %	50 %	25 %	440222980
56	NC_020062	CTGC	2	8	16673	16680	0 %	25 %	25 %	50 %	440222982
57	NC_020062	TCGT	2	8	17031	17038	0 %	50 %	25 %	25 %	440222982
58	NC_020062	CGGC	2	8	17445	17452	0 %	0 %	50 %	50 %	440222982
59	NC_020062	GTCC	2	8	17573	17580	0 %	25 %	25 %	50 %	440222982
60	NC_020062	GCTC	2	8	17600	17607	0 %	25 %	25 %	50 %	440222982
61	NC_020062	GGAA	2	8	18073	18080	50 %	0 %	50 %	0 %	440222982
62	NC_020062	TGCC	2	8	19030	19037	0 %	25 %	25 %	50 %	440222984
63	NC_020062	TGGA	2	8	19215	19222	25 %	25 %	50 %	0 %	440222985
64	NC_020062	GGCA	2	8	19228	19235	25 %	0 %	50 %	25 %	440222985
65	NC_020062	ATGT	2	8	19530	19537	25 %	50 %	25 %	0 %	440222985
66	NC_020062	GCCG	2	8	19757	19764	0 %	0 %	50 %	50 %	440222985
67	NC_020062	ATGT	2	8	20854	20861	25 %	50 %	25 %	0 %	440222986
68	NC_020062	CCGG	2	8	21138	21145	0 %	0 %	50 %	50 %	440222986
69	NC_020062	CCGG	2	8	21581	21588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020062	GCAG	2	8	21593	21600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020062	AGCA	2	8	21642	21649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020062	CTGG	2	8	23057	23064	0 %	25 %	50 %	25 %	440222987
73	NC_020062	TGCA	2	8	23081	23088	25 %	25 %	25 %	25 %	440222987
74	NC_020062	CAGG	2	8	23200	23207	25 %	0 %	50 %	25 %	440222987
75	NC_020062	GCCA	2	8	24250	24257	25 %	0 %	25 %	50 %	440222987
76	NC_020062	CCGG	2	8	24648	24655	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
77	NC_020062	TGGC	2	8	24769	24776	0 %	25 %	50 %	25 %	440222987
78	NC_020062	CAGG	2	8	25005	25012	25 %	0 %	50 %	25 %	440222987
79	NC_020062	TCGC	2	8	25294	25301	0 %	25 %	25 %	50 %	440222988
80	NC_020062	CGGA	2	8	25362	25369	25 %	0 %	50 %	25 %	440222988
81	NC_020062	GTGG	2	8	25536	25543	0 %	25 %	75 %	0 %	440222988
82	NC_020062	GATC	2	8	25556	25563	25 %	25 %	25 %	25 %	440222988
83	NC_020062	CGAT	2	8	25600	25607	25 %	25 %	25 %	25 %	440222988
84	NC_020062	GGGA	2	8	25895	25902	25 %	0 %	75 %	0 %	440222988
85	NC_020062	CACC	2	8	26168	26175	25 %	0 %	0 %	75 %	440222988
86	NC_020062	GGGA	2	8	27017	27024	25 %	0 %	75 %	0 %	440222988
87	NC_020062	GCGT	2	8	27059	27066	0 %	25 %	50 %	25 %	440222988
88	NC_020062	TCGC	2	8	27067	27074	0 %	25 %	25 %	50 %	440222988
89	NC_020062	CGGT	2	8	27122	27129	0 %	25 %	50 %	25 %	440222988
90	NC_020062	AGCC	2	8	27189	27196	25 %	0 %	25 %	50 %	440222988
91	NC_020062	CGGC	2	8	27335	27342	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
92	NC_020062	CCTG	2	8	27647	27654	0 %	25 %	25 %	50 %	440222988
93	NC_020062	CGAT	2	8	27886	27893	25 %	25 %	25 %	25 %	440222988
94	NC_020062	GGCA	2	8	28780	28787	25 %	0 %	50 %	25 %	440222988
95	NC_020062	GCTG	2	8	28966	28973	0 %	25 %	50 %	25 %	440222989
96	NC_020062	GCCT	2	8	29225	29232	0 %	25 %	25 %	50 %	440222989
97	NC_020062	TGGT	2	8	29933	29940	0 %	50 %	50 %	0 %	440222989
98	NC_020062	GCGG	2	8	30069	30076	0 %	0 %	75 %	25 %	440222989
99	NC_020062	TCCG	2	8	30266	30273	0 %	25 %	25 %	50 %	440222989
100	NC_020062	GGCT	2	8	30598	30605	0 %	25 %	50 %	25 %	440222989
101	NC_020062	GGTG	2	8	30853	30860	0 %	25 %	75 %	0 %	440222989
102	NC_020062	GTAT	2	8	31346	31353	25 %	50 %	25 %	0 %	440222989
103	NC_020062	ATCG	2	8	31580	31587	25 %	25 %	25 %	25 %	440222989
104	NC_020062	TGGG	2	8	31794	31801	0 %	25 %	75 %	0 %	440222989
105	NC_020062	CCGA	2	8	31977	31984	25 %	0 %	25 %	50 %	440222989
106	NC_020062	AGCA	2	8	32279	32286	50 %	0 %	25 %	25 %	440222989
107	NC_020062	CGAT	2	8	32532	32539	25 %	25 %	25 %	25 %	440222989
108	NC_020062	GCGG	2	8	32757	32764	0 %	0 %	75 %	25 %	440222989
109	NC_020062	GAGC	2	8	33033	33040	25 %	0 %	50 %	25 %	440222989
110	NC_020062	CTGC	2	8	33242	33249	0 %	25 %	25 %	50 %	440222989
111	NC_020062	GCCG	2	8	33434	33441	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
112	NC_020062	GCCG	2	8	33960	33967	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
113	NC_020062	TGGT	2	8	34071	34078	0 %	50 %	50 %	0 %	440222989
114	NC_020062	GCCC	2	8	34888	34895	0 %	0 %	25 %	75 %	440222989
115	NC_020062	CAGG	2	8	34978	34985	25 %	0 %	50 %	25 %	440222989
116	NC_020062	TCGA	2	8	35454	35461	25 %	25 %	25 %	25 %	440222989
117	NC_020062	TGCG	2	8	35811	35818	0 %	25 %	50 %	25 %	440222989
118	NC_020062	CGAA	2	8	36391	36398	50 %	0 %	25 %	25 %	440222990
119	NC_020062	ACCG	2	8	36649	36656	25 %	0 %	25 %	50 %	440222990
120	NC_020062	GGCG	2	8	36748	36755	0 %	0 %	75 %	25 %	440222990
121	NC_020062	CGTG	2	8	37041	37048	0 %	25 %	50 %	25 %	440222990
122	NC_020062	TGCG	2	8	37466	37473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020062	GCAG	2	8	37718	37725	25 %	0 %	50 %	25 %	440222991
124	NC_020062	CCGA	2	8	37894	37901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020062	TTGC	2	8	37909	37916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020062	AGGA	2	8	38032	38039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020062	ATTG	2	8	39056	39063	25 %	50 %	25 %	0 %	440222992
128	NC_020062	GGCA	2	8	39420	39427	25 %	0 %	50 %	25 %	440222993
129	NC_020062	CGGA	2	8	40212	40219	25 %	0 %	50 %	25 %	440222994
130	NC_020062	TCGA	2	8	40367	40374	25 %	25 %	25 %	25 %	440222994
131	NC_020062	AAGT	2	8	40613	40620	50 %	25 %	25 %	0 %	440222994
132	NC_020062	AGGA	2	8	40665	40672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020062	CATG	2	8	40932	40939	25 %	25 %	25 %	25 %	440222995
134	NC_020062	TGGG	2	8	41243	41250	0 %	25 %	75 %	0 %	440222995
135	NC_020062	TGCC	2	8	41429	41436	0 %	25 %	25 %	50 %	440222995
136	NC_020062	ATGT	2	8	41668	41675	25 %	50 %	25 %	0 %	440222995
137	NC_020062	GGCG	2	8	42255	42262	0 %	0 %	75 %	25 %	440222995
138	NC_020062	AACC	2	8	42409	42416	50 %	0 %	0 %	50 %	440222995
139	NC_020062	CTGG	2	8	42533	42540	0 %	25 %	50 %	25 %	440222996
140	NC_020062	ATCC	2	8	42907	42914	25 %	25 %	0 %	50 %	440222996
141	NC_020062	TGGG	2	8	42961	42968	0 %	25 %	75 %	0 %	440222996
142	NC_020062	AGCG	2	8	43255	43262	25 %	0 %	50 %	25 %	440222997
143	NC_020062	AGGG	2	8	43611	43618	25 %	0 %	75 %	0 %	440222997
144	NC_020062	GGCT	2	8	44204	44211	0 %	25 %	50 %	25 %	440222998
145	NC_020062	CCAT	2	8	44250	44257	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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179	NC_020062	CGGC	2	8	57355	57362	0 %	0 %	50 %	50 %	440223012
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185	NC_020062	AGGA	2	8	59136	59143	50 %	0 %	50 %	0 %	440223014
186	NC_020062	GCGA	2	8	59291	59298	25 %	0 %	50 %	25 %	440223014
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249	NC_020062	GCAA	2	8	81204	81211	50 %	0 %	25 %	25 %	440223035
250	NC_020062	CCTT	2	8	81323	81330	0 %	50 %	0 %	50 %	440223035
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260	NC_020062	GCTT	2	8	85853	85860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
261	NC_020062	GGCC	2	8	86345	86352	0 %	0 %	50 %	50 %	440223039
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265	NC_020062	CGAT	2	8	87660	87667	25 %	25 %	25 %	25 %	440223040
266	NC_020062	TCCA	2	8	88049	88056	25 %	25 %	0 %	50 %	440223040
267	NC_020062	CGGA	2	8	88144	88151	25 %	0 %	50 %	25 %	440223040
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270	NC_020062	CAGG	2	8	90450	90457	25 %	0 %	50 %	25 %	440223042
271	NC_020062	GGGA	2	8	90812	90819	25 %	0 %	75 %	0 %	440223042
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