MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 32476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020062	ACC	2	6	210	215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222966
2	NC_020062	TGA	2	6	264	269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222966
3	NC_020062	ACG	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222966
4	NC_020062	TGC	2	6	383	388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020062	TGA	2	6	406	411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020062	CGG	2	6	577	582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020062	TCT	2	6	668	673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020062	TGG	2	6	696	701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020062	ATG	2	6	860	865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020062	GGC	2	6	1000	1005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020062	CTC	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_020062	GAG	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020062	CTT	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222967
14	NC_020062	GCT	2	6	1237	1242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222967
15	NC_020062	ATC	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222967
16	NC_020062	CAA	2	6	1367	1372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222967
17	NC_020062	GCC	2	6	1502	1507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_020062	ATG	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020062	GCG	2	6	1999	2004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020062	CGC	2	6	2010	2015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_020062	AGC	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222968
22	NC_020062	GCG	2	6	2104	2109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222968
23	NC_020062	ATG	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222968
24	NC_020062	GCC	2	6	2137	2142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222968
25	NC_020062	CGA	2	6	2189	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222968
26	NC_020062	CAC	2	6	2202	2207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222968
27	NC_020062	CGC	2	6	2232	2237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222968
28	NC_020062	CCG	2	6	2308	2313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222968
29	NC_020062	CTT	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222968
30	NC_020062	ATC	2	6	2410	2415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222968
31	NC_020062	GCC	2	6	2475	2480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222968
32	NC_020062	GGC	2	6	2490	2495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222968
33	NC_020062	CGG	2	6	2504	2509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222968
34	NC_020062	GTG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222968
35	NC_020062	CTT	2	6	2565	2570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222968
36	NC_020062	CAG	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222968
37	NC_020062	CAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222968
38	NC_020062	GCC	2	6	2778	2783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222968
39	NC_020062	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222968
40	NC_020062	CGT	2	6	3053	3058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222968
41	NC_020062	GCG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222968
42	NC_020062	CTT	2	6	3366	3371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222968
43	NC_020062	CGA	2	6	3509	3514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222968
44	NC_020062	GGA	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222968
45	NC_020062	AGC	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222968
46	NC_020062	CAT	2	6	3639	3644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222968
47	NC_020062	CGG	2	6	3687	3692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222968
48	NC_020062	TGA	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222968
49	NC_020062	GAT	2	6	3759	3764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222968
50	NC_020062	ATT	2	6	4218	4223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020062	TCC	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020062	TGG	2	6	4325	4330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020062	GGC	2	6	4334	4339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020062	TGG	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020062	CAA	2	6	4453	4458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020062	CTT	2	6	4475	4480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020062	ACG	3	9	4486	4494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020062	CGG	2	6	4499	4504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020062	ATG	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020062	TCT	2	6	4576	4581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020062	GGC	2	6	4644	4649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020062	TTC	2	6	4752	4757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020062	CTC	2	6	4799	4804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_020062	CGG	3	9	4844	4852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020062	CCA	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_020062	GCT	2	6	5066	5071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222969
67	NC_020062	ACG	2	6	5088	5093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222969
68	NC_020062	GTG	2	6	5096	5101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222969
69	NC_020062	GCG	2	6	5232	5237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222969
70	NC_020062	GAC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222969
71	NC_020062	GCC	2	6	5304	5309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222969
72	NC_020062	TGA	2	6	5436	5441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222969
73	NC_020062	ACG	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222969
74	NC_020062	CAG	2	6	5661	5666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222970
75	NC_020062	TGA	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222970
76	NC_020062	TGC	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222970
77	NC_020062	TCC	2	6	5922	5927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222970
78	NC_020062	GAC	2	6	6159	6164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222970
79	NC_020062	TGG	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222970
80	NC_020062	GCG	2	6	6189	6194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222970
81	NC_020062	CGG	2	6	6211	6216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222970
82	NC_020062	ACA	2	6	6222	6227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222970
83	NC_020062	ATG	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222970
84	NC_020062	ATG	2	6	6317	6322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222970
85	NC_020062	CGT	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222970
86	NC_020062	GGC	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222970
87	NC_020062	CTG	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222970
88	NC_020062	GAC	2	6	6480	6485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222970
89	NC_020062	CTT	2	6	6537	6542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222970
90	NC_020062	CGA	2	6	6639	6644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222970
91	NC_020062	GAA	2	6	6731	6736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222970
92	NC_020062	TCG	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222970
93	NC_020062	CGA	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222970
94	NC_020062	GTC	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222970
95	NC_020062	GGA	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020062	CCG	2	6	7024	7029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_020062	TCC	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_020062	CTT	2	6	7128	7133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222971
99	NC_020062	CGT	2	6	7176	7181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222971
100	NC_020062	CTT	2	6	7252	7257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222971
101	NC_020062	GAT	2	6	7362	7367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222972
102	NC_020062	GAG	2	6	7389	7394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222972
103	NC_020062	AAG	2	6	7441	7446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222972
104	NC_020062	CGT	2	6	7498	7503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222972
105	NC_020062	GTG	2	6	7514	7519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222972
106	NC_020062	CAT	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222972
107	NC_020062	ACG	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222972
108	NC_020062	CGC	2	6	7724	7729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222973
109	NC_020062	CCA	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222973
110	NC_020062	CGA	2	6	7987	7992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222973
111	NC_020062	ACG	2	6	8018	8023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222973
112	NC_020062	TCC	2	6	8033	8038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222973
113	NC_020062	CTC	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020062	CAC	2	6	8165	8170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_020062	GCC	2	6	8293	8298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_020062	GGC	2	6	8319	8324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020062	ACG	2	6	8555	8560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222974
118	NC_020062	TCT	2	6	8832	8837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222974
119	NC_020062	CTG	2	6	8887	8892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222974
120	NC_020062	CTG	2	6	8920	8925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222974
121	NC_020062	AGC	2	6	8939	8944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222974
122	NC_020062	CGC	2	6	9003	9008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222974
123	NC_020062	GCA	2	6	9021	9026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222974
124	NC_020062	CAA	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222974
125	NC_020062	GCC	2	6	9127	9132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222974
126	NC_020062	TCG	2	6	9242	9247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222974
127	NC_020062	GGC	2	6	9315	9320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222974
128	NC_020062	CAT	2	6	9330	9335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222974
129	NC_020062	GGA	2	6	9372	9377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222974
130	NC_020062	GAA	2	6	9525	9530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020062	GAA	2	6	9619	9624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222975
132	NC_020062	CCG	2	6	9787	9792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222975
133	NC_020062	TGT	2	6	9966	9971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222975
134	NC_020062	GCC	2	6	9997	10002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222975
135	NC_020062	GAT	2	6	10019	10024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222975
136	NC_020062	GCA	2	6	10066	10071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222975
137	NC_020062	ACG	2	6	10072	10077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222975
138	NC_020062	TAA	2	6	10099	10104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222975
139	NC_020062	GCC	2	6	10121	10126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222975
140	NC_020062	GTT	2	6	10136	10141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222975
141	NC_020062	TCT	2	6	10144	10149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222975
142	NC_020062	CAA	3	9	10204	10212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222976
143	NC_020062	TGC	2	6	10339	10344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222976
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147	NC_020062	GTT	2	6	10801	10806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222976
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150	NC_020062	CCG	2	6	11030	11035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222976
151	NC_020062	ACG	2	6	11039	11044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222976
152	NC_020062	GAG	2	6	11089	11094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222976
153	NC_020062	CCA	2	6	11138	11143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222976
154	NC_020062	GCG	2	6	11160	11165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222976
155	NC_020062	GAT	2	6	11287	11292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222976
156	NC_020062	GCG	2	6	11306	11311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222976
157	NC_020062	CAA	2	6	11400	11405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222976
158	NC_020062	CCA	2	6	11444	11449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222976
159	NC_020062	ATG	2	6	11465	11470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222976
160	NC_020062	GAT	3	9	11533	11541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222976
161	NC_020062	TGT	2	6	11597	11602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020062	TGC	2	6	11796	11801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_020062	GTT	2	6	11847	11852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222977
164	NC_020062	CCA	2	6	11886	11891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222977
165	NC_020062	TCT	2	6	11977	11982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222977
166	NC_020062	TGT	2	6	12159	12164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020062	GCT	2	6	12209	12214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_020062	AGG	2	6	12240	12245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
169	NC_020062	GGT	2	6	12304	12309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_020062	GGC	2	6	12356	12361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222978
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172	NC_020062	CGA	2	6	12538	12543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222978
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174	NC_020062	CGG	2	6	12647	12652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222978
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176	NC_020062	GAG	2	6	12717	12722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222978
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178	NC_020062	GCC	2	6	12966	12971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222979
179	NC_020062	GCG	2	6	12992	12997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222979
180	NC_020062	TCG	2	6	13126	13131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222979
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192	NC_020062	TGA	2	6	13796	13801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222979
193	NC_020062	CGG	2	6	13814	13819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222979
194	NC_020062	TGA	2	6	13844	13849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222979
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215	NC_020062	GCG	2	6	14992	14997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222980
216	NC_020062	TGA	2	6	15068	15073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222980
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219	NC_020062	CTA	2	6	15215	15220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222980
220	NC_020062	TCG	2	6	15259	15264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222980
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222	NC_020062	CGG	2	6	15363	15368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
223	NC_020062	AGC	2	6	15610	15615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222981
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226	NC_020062	CGA	2	6	15946	15951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222981
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231	NC_020062	GTC	2	6	16396	16401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222982
232	NC_020062	CGT	2	6	16411	16416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222982
233	NC_020062	TCT	2	6	16489	16494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222982
234	NC_020062	CGC	2	6	16517	16522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222982
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236	NC_020062	GAG	2	6	16667	16672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222982
237	NC_020062	TGA	2	6	16684	16689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222982
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239	NC_020062	GAC	2	6	16814	16819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222982
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241	NC_020062	CTG	2	6	16880	16885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222982
242	NC_020062	TGC	2	6	16932	16937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222982
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244	NC_020062	CGC	2	6	17039	17044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222982
245	NC_020062	TGA	2	6	17100	17105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222982
246	NC_020062	GCA	2	6	17116	17121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222982
247	NC_020062	GGC	2	6	17163	17168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222982
248	NC_020062	TCG	2	6	17187	17192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222982
249	NC_020062	CGA	2	6	17202	17207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222982
250	NC_020062	GAA	2	6	17300	17305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222982
251	NC_020062	TTC	2	6	17490	17495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222982
252	NC_020062	AGG	2	6	17500	17505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222982
253	NC_020062	CGC	2	6	17517	17522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222982
254	NC_020062	AGC	2	6	17565	17570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222982
255	NC_020062	GTT	2	6	17587	17592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222982
256	NC_020062	CGA	2	6	17655	17660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222982
257	NC_020062	CGT	2	6	17665	17670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222982
258	NC_020062	CGC	2	6	17728	17733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222982
259	NC_020062	CGT	2	6	17889	17894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222982
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