MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 29590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020062	ACC	2	6	210	215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222966
2	NC_020062	TGA	2	6	264	269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222966
3	NC_020062	ACG	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222966
4	NC_020062	CTT	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222967
5	NC_020062	GCT	2	6	1237	1242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222967
6	NC_020062	ATC	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222967
7	NC_020062	CAA	2	6	1367	1372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222967
8	NC_020062	AGC	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222968
9	NC_020062	GCG	2	6	2104	2109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222968
10	NC_020062	ATG	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222968
11	NC_020062	GCC	2	6	2137	2142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222968
12	NC_020062	CGA	2	6	2189	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222968
13	NC_020062	CAC	2	6	2202	2207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222968
14	NC_020062	CGC	2	6	2232	2237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222968
15	NC_020062	CCG	2	6	2308	2313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222968
16	NC_020062	CTT	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222968
17	NC_020062	ATC	2	6	2410	2415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222968
18	NC_020062	GCC	2	6	2475	2480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222968
19	NC_020062	GGC	2	6	2490	2495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222968
20	NC_020062	CGG	2	6	2504	2509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222968
21	NC_020062	GTG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222968
22	NC_020062	CTT	2	6	2565	2570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222968
23	NC_020062	CAG	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222968
24	NC_020062	CAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222968
25	NC_020062	GCC	2	6	2778	2783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222968
26	NC_020062	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222968
27	NC_020062	CGT	2	6	3053	3058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222968
28	NC_020062	GCG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222968
29	NC_020062	CTT	2	6	3366	3371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222968
30	NC_020062	CGA	2	6	3509	3514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222968
31	NC_020062	GGA	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222968
32	NC_020062	AGC	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222968
33	NC_020062	CAT	2	6	3639	3644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222968
34	NC_020062	CGG	2	6	3687	3692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222968
35	NC_020062	TGA	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222968
36	NC_020062	GAT	2	6	3759	3764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222968
37	NC_020062	GCT	2	6	5066	5071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222969
38	NC_020062	ACG	2	6	5088	5093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222969
39	NC_020062	GTG	2	6	5096	5101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222969
40	NC_020062	GCG	2	6	5232	5237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222969
41	NC_020062	GAC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222969
42	NC_020062	GCC	2	6	5304	5309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222969
43	NC_020062	TGA	2	6	5436	5441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222969
44	NC_020062	ACG	2	6	5499	5504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222969
45	NC_020062	CAG	2	6	5661	5666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222970
46	NC_020062	TGA	2	6	5708	5713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222970
47	NC_020062	TGC	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222970
48	NC_020062	TCC	2	6	5922	5927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222970
49	NC_020062	GAC	2	6	6159	6164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222970
50	NC_020062	TGG	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222970
51	NC_020062	GCG	2	6	6189	6194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222970
52	NC_020062	CGG	2	6	6211	6216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222970
53	NC_020062	ACA	2	6	6222	6227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222970
54	NC_020062	ATG	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222970
55	NC_020062	ATG	2	6	6317	6322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222970
56	NC_020062	CGT	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222970
57	NC_020062	GGC	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222970
58	NC_020062	CTG	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222970
59	NC_020062	GAC	2	6	6480	6485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222970
60	NC_020062	CTT	2	6	6537	6542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222970
61	NC_020062	CGA	2	6	6639	6644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222970
62	NC_020062	GAA	2	6	6731	6736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222970
63	NC_020062	TCG	2	6	6764	6769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222970
64	NC_020062	CGA	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222970
65	NC_020062	GTC	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222970
66	NC_020062	CTT	2	6	7128	7133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222971
67	NC_020062	CGT	2	6	7176	7181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222971
68	NC_020062	CTT	2	6	7252	7257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222971
69	NC_020062	GAT	2	6	7362	7367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222972
70	NC_020062	GAG	2	6	7389	7394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222972
71	NC_020062	AAG	2	6	7441	7446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222972
72	NC_020062	CGT	2	6	7498	7503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222972
73	NC_020062	GTG	2	6	7514	7519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222972
74	NC_020062	CAT	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222972
75	NC_020062	ACG	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222972
76	NC_020062	CGC	2	6	7724	7729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222973
77	NC_020062	CCA	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222973
78	NC_020062	CGA	2	6	7987	7992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222973
79	NC_020062	ACG	2	6	8018	8023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222973
80	NC_020062	TCC	2	6	8033	8038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222973
81	NC_020062	ACG	2	6	8555	8560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222974
82	NC_020062	TCT	2	6	8832	8837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222974
83	NC_020062	CTG	2	6	8887	8892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222974
84	NC_020062	CTG	2	6	8920	8925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222974
85	NC_020062	AGC	2	6	8939	8944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222974
86	NC_020062	CGC	2	6	9003	9008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222974
87	NC_020062	GCA	2	6	9021	9026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222974
88	NC_020062	CAA	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222974
89	NC_020062	GCC	2	6	9127	9132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222974
90	NC_020062	TCG	2	6	9242	9247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222974
91	NC_020062	GGC	2	6	9315	9320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222974
92	NC_020062	CAT	2	6	9330	9335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222974
93	NC_020062	GGA	2	6	9372	9377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222974
94	NC_020062	GAA	2	6	9619	9624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222975
95	NC_020062	CCG	2	6	9787	9792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222975
96	NC_020062	TGT	2	6	9966	9971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222975
97	NC_020062	GCC	2	6	9997	10002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222975
98	NC_020062	GAT	2	6	10019	10024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222975
99	NC_020062	GCA	2	6	10066	10071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222975
100	NC_020062	ACG	2	6	10072	10077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222975
101	NC_020062	TAA	2	6	10099	10104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440222975
102	NC_020062	GCC	2	6	10121	10126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222975
103	NC_020062	GTT	2	6	10136	10141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222975
104	NC_020062	TCT	2	6	10144	10149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222975
105	NC_020062	CAA	3	9	10204	10212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222976
106	NC_020062	TGC	2	6	10339	10344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222976
107	NC_020062	GAC	2	6	10455	10460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222976
108	NC_020062	GAG	2	6	10570	10575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222976
109	NC_020062	ATC	2	6	10741	10746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222976
110	NC_020062	GTT	2	6	10801	10806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222976
111	NC_020062	TCG	2	6	10916	10921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222976
112	NC_020062	CGG	2	6	10991	10996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222976
113	NC_020062	CCG	2	6	11030	11035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222976
114	NC_020062	ACG	2	6	11039	11044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222976
115	NC_020062	GAG	2	6	11089	11094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222976
116	NC_020062	CCA	2	6	11138	11143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222976
117	NC_020062	GCG	2	6	11160	11165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222976
118	NC_020062	GAT	2	6	11287	11292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222976
119	NC_020062	GCG	2	6	11306	11311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222976
120	NC_020062	CAA	2	6	11400	11405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440222976
121	NC_020062	CCA	2	6	11444	11449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222976
122	NC_020062	ATG	2	6	11465	11470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222976
123	NC_020062	GAT	3	9	11533	11541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222976
124	NC_020062	GTT	2	6	11847	11852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440222977
125	NC_020062	CCA	2	6	11886	11891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222977
126	NC_020062	TCT	2	6	11977	11982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222977
127	NC_020062	GGC	2	6	12356	12361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222978
128	NC_020062	CTT	2	6	12507	12512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222978
129	NC_020062	CGA	2	6	12538	12543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222978
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131	NC_020062	CGG	2	6	12647	12652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222978
132	NC_020062	GCC	2	6	12711	12716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222978
133	NC_020062	GAG	2	6	12717	12722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440222978
134	NC_020062	CGC	2	6	12734	12739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222978
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159	NC_020062	TCT	2	6	14204	14209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222979
160	NC_020062	GCG	2	6	14252	14257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222979
161	NC_020062	ATG	2	6	14397	14402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222980
162	NC_020062	TTC	2	6	14441	14446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222980
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251	NC_020062	GCT	2	6	21129	21134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222986
252	NC_020062	TTC	2	6	21220	21225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440222986
253	NC_020062	GCC	2	6	21237	21242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222986
254	NC_020062	GAC	2	6	21854	21859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222987
255	NC_020062	GCT	2	6	21860	21865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222987
256	NC_020062	CCG	2	6	21867	21872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
257	NC_020062	GCT	2	6	21879	21884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222987
258	NC_020062	TGA	2	6	21892	21897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440222987
259	NC_020062	CCG	2	6	21906	21911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
260	NC_020062	CGG	2	6	21934	21939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222987
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262	NC_020062	CGG	2	6	22015	22020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222987
263	NC_020062	CGC	2	6	22114	22119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
264	NC_020062	CGT	2	6	22291	22296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222987
265	NC_020062	CGA	2	6	22297	22302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222987
266	NC_020062	GCC	2	6	22330	22335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
267	NC_020062	CAC	2	6	22361	22366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440222987
268	NC_020062	CGC	2	6	22424	22429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
269	NC_020062	AGA	2	6	22447	22452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222987
270	NC_020062	CAT	2	6	22597	22602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222987
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272	NC_020062	CAG	2	6	22616	22621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222987
273	NC_020062	CGA	2	6	22689	22694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222987
274	NC_020062	GTG	2	6	22779	22784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222987
275	NC_020062	GCA	2	6	22864	22869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222987
276	NC_020062	GCT	2	6	22872	22877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222987
277	NC_020062	CCG	2	6	22894	22899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440222987
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280	NC_020062	CGG	2	6	23191	23196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222987
281	NC_020062	TGG	2	6	23242	23247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222987
282	NC_020062	GAC	2	6	23294	23299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222987
283	NC_020062	TGC	2	6	23330	23335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222987
284	NC_020062	ATC	2	6	23370	23375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222987
285	NC_020062	GGC	2	6	23424	23429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440222987
286	NC_020062	CAG	2	6	23506	23511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222987
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289	NC_020062	GGT	2	6	23624	23629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222987
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291	NC_020062	GCT	2	6	23665	23670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222987
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320	NC_020062	CTC	2	6	25589	25594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440222988
321	NC_020062	CGA	2	6	25701	25706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222988
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496	NC_020062	ATC	2	6	35204	35209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440222989
497	NC_020062	TGG	2	6	35237	35242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440222989
498	NC_020062	AGC	2	6	35265	35270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440222989
499	NC_020062	TCG	2	6	35298	35303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440222989
500	NC_020062	GAA	2	6	35309	35314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440222989

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