MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 3919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020062	GA	3	6	336	341	50 %	0 %	50 %	0 %	440222966
2	NC_020062	TG	3	6	559	564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020062	CG	3	6	1208	1213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020062	CG	3	6	1356	1361	0 %	0 %	50 %	50 %	440222967
5	NC_020062	GC	3	6	1877	1882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020062	CG	3	6	3523	3528	0 %	0 %	50 %	50 %	440222968
7	NC_020062	GC	3	6	3648	3653	0 %	0 %	50 %	50 %	440222968
8	NC_020062	CG	3	6	3678	3683	0 %	0 %	50 %	50 %	440222968
9	NC_020062	CG	3	6	3896	3901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020062	AT	3	6	4146	4151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020062	TC	3	6	4409	4414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020062	CA	3	6	4440	4445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020062	GC	3	6	5152	5157	0 %	0 %	50 %	50 %	440222969
14	NC_020062	GC	4	8	5290	5297	0 %	0 %	50 %	50 %	440222969
15	NC_020062	CT	3	6	5844	5849	0 %	50 %	0 %	50 %	440222970
16	NC_020062	TG	3	6	6946	6951	0 %	50 %	50 %	0 %	440222970
17	NC_020062	CG	3	6	7108	7113	0 %	0 %	50 %	50 %	440222971
18	NC_020062	GC	3	6	8709	8714	0 %	0 %	50 %	50 %	440222974
19	NC_020062	CG	3	6	8853	8858	0 %	0 %	50 %	50 %	440222974
20	NC_020062	GC	3	6	9219	9224	0 %	0 %	50 %	50 %	440222974
21	NC_020062	AC	3	6	9779	9784	50 %	0 %	0 %	50 %	440222975
22	NC_020062	CT	3	6	10397	10402	0 %	50 %	0 %	50 %	440222976
23	NC_020062	AG	3	6	10521	10526	50 %	0 %	50 %	0 %	440222976
24	NC_020062	CG	3	6	10940	10945	0 %	0 %	50 %	50 %	440222976
25	NC_020062	GC	3	6	11371	11376	0 %	0 %	50 %	50 %	440222976
26	NC_020062	CG	3	6	12483	12488	0 %	0 %	50 %	50 %	440222978
27	NC_020062	CG	3	6	12572	12577	0 %	0 %	50 %	50 %	440222978
28	NC_020062	CG	3	6	13910	13915	0 %	0 %	50 %	50 %	440222979
29	NC_020062	CT	3	6	14408	14413	0 %	50 %	0 %	50 %	440222980
30	NC_020062	GA	3	6	15028	15033	50 %	0 %	50 %	0 %	440222980
31	NC_020062	CA	3	6	15880	15885	50 %	0 %	0 %	50 %	440222981
32	NC_020062	CG	4	8	15980	15987	0 %	0 %	50 %	50 %	440222981
33	NC_020062	CT	3	6	16033	16038	0 %	50 %	0 %	50 %	440222981
34	NC_020062	GC	3	6	16694	16699	0 %	0 %	50 %	50 %	440222982
35	NC_020062	GC	5	10	17435	17444	0 %	0 %	50 %	50 %	440222982
36	NC_020062	CG	3	6	17471	17476	0 %	0 %	50 %	50 %	440222982
37	NC_020062	CA	3	6	17815	17820	50 %	0 %	0 %	50 %	440222982
38	NC_020062	CA	3	6	17941	17946	50 %	0 %	0 %	50 %	440222982
39	NC_020062	GC	3	6	19051	19056	0 %	0 %	50 %	50 %	440222984
40	NC_020062	CT	3	6	19495	19500	0 %	50 %	0 %	50 %	440222985
41	NC_020062	TG	3	6	19711	19716	0 %	50 %	50 %	0 %	440222985
42	NC_020062	GC	3	6	21290	21295	0 %	0 %	50 %	50 %	440222986
43	NC_020062	CG	3	6	21544	21549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020062	GC	3	6	22045	22050	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
45	NC_020062	CG	3	6	22492	22497	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
46	NC_020062	GC	3	6	22549	22554	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
47	NC_020062	CG	4	8	22717	22724	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
48	NC_020062	CG	3	6	23263	23268	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
49	NC_020062	GA	3	6	23283	23288	50 %	0 %	50 %	0 %	440222987
50	NC_020062	CG	3	6	23353	23358	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
51	NC_020062	GC	3	6	23362	23367	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
52	NC_020062	CG	3	6	23488	23493	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
53	NC_020062	CG	4	8	24112	24119	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
54	NC_020062	GC	3	6	24292	24297	0 %	0 %	50 %	50 %	440222987
55	NC_020062	GC	3	6	25718	25723	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
56	NC_020062	CG	3	6	26330	26335	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
57	NC_020062	GC	5	10	27136	27145	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
58	NC_020062	GC	3	6	28659	28664	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
59	NC_020062	CG	3	6	28790	28795	0 %	0 %	50 %	50 %	440222988
60	NC_020062	GC	3	6	30094	30099	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
61	NC_020062	GC	3	6	32259	32264	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
62	NC_020062	CG	3	6	32581	32586	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
63	NC_020062	CG	3	6	33045	33050	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
64	NC_020062	GA	3	6	35256	35261	50 %	0 %	50 %	0 %	440222989
65	NC_020062	GC	3	6	35977	35982	0 %	0 %	50 %	50 %	440222989
66	NC_020062	GA	3	6	36079	36084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020062	TG	3	6	36343	36348	0 %	50 %	50 %	0 %	440222990
68	NC_020062	GC	3	6	36682	36687	0 %	0 %	50 %	50 %	440222990
69	NC_020062	GA	3	6	36704	36709	50 %	0 %	50 %	0 %	440222990
70	NC_020062	CG	3	6	37105	37110	0 %	0 %	50 %	50 %	440222990
71	NC_020062	CT	3	6	37276	37281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020062	GC	4	8	37770	37777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020062	TA	3	6	38426	38431	50 %	50 %	0 %	0 %	440222992
74	NC_020062	TC	3	6	38777	38782	0 %	50 %	0 %	50 %	440222992
75	NC_020062	GC	3	6	41018	41023	0 %	0 %	50 %	50 %	440222995
76	NC_020062	CG	3	6	41580	41585	0 %	0 %	50 %	50 %	440222995
77	NC_020062	CG	3	6	43355	43360	0 %	0 %	50 %	50 %	440222997
78	NC_020062	GC	3	6	44784	44789	0 %	0 %	50 %	50 %	440222999
79	NC_020062	GA	3	6	45118	45123	50 %	0 %	50 %	0 %	440222999
80	NC_020062	TC	3	6	45465	45470	0 %	50 %	0 %	50 %	440223000
81	NC_020062	GC	3	6	45906	45911	0 %	0 %	50 %	50 %	440223000
82	NC_020062	AT	3	6	46394	46399	50 %	50 %	0 %	0 %	440223001
83	NC_020062	GC	3	6	46799	46804	0 %	0 %	50 %	50 %	440223001
84	NC_020062	GC	3	6	47011	47016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020062	CG	3	6	47025	47030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020062	CG	3	6	47428	47433	0 %	0 %	50 %	50 %	440223002
87	NC_020062	TC	3	6	47914	47919	0 %	50 %	0 %	50 %	440223003
88	NC_020062	CG	3	6	48015	48020	0 %	0 %	50 %	50 %	440223003
89	NC_020062	CG	3	6	48812	48817	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
90	NC_020062	GC	3	6	49619	49624	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
91	NC_020062	CG	3	6	49908	49913	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
92	NC_020062	CG	3	6	49968	49973	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
93	NC_020062	GA	3	6	50266	50271	50 %	0 %	50 %	0 %	440223004
94	NC_020062	GA	3	6	50282	50287	50 %	0 %	50 %	0 %	440223004
95	NC_020062	GC	3	6	50607	50612	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
96	NC_020062	GC	3	6	50793	50798	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
97	NC_020062	CG	4	8	50940	50947	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
98	NC_020062	GC	3	6	50956	50961	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
99	NC_020062	CG	3	6	51026	51031	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
100	NC_020062	GC	3	6	51398	51403	0 %	0 %	50 %	50 %	440223004
101	NC_020062	GC	5	10	52014	52023	0 %	0 %	50 %	50 %	440223005
102	NC_020062	AG	4	8	52372	52379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020062	CT	3	6	52751	52756	0 %	50 %	0 %	50 %	440223006
104	NC_020062	CA	3	6	53603	53608	50 %	0 %	0 %	50 %	440223008
105	NC_020062	GC	3	6	54933	54938	0 %	0 %	50 %	50 %	440223009
106	NC_020062	GC	3	6	55116	55121	0 %	0 %	50 %	50 %	440223009
107	NC_020062	GC	3	6	55633	55638	0 %	0 %	50 %	50 %	440223010
108	NC_020062	GC	4	8	55773	55780	0 %	0 %	50 %	50 %	440223010
109	NC_020062	CG	3	6	56148	56153	0 %	0 %	50 %	50 %	440223011
110	NC_020062	GC	3	6	56304	56309	0 %	0 %	50 %	50 %	440223011
111	NC_020062	CG	3	6	56608	56613	0 %	0 %	50 %	50 %	440223011
112	NC_020062	CG	3	6	56672	56677	0 %	0 %	50 %	50 %	440223011
113	NC_020062	TC	3	6	57964	57969	0 %	50 %	0 %	50 %	440223012
114	NC_020062	TC	3	6	58097	58102	0 %	50 %	0 %	50 %	440223013
115	NC_020062	GC	3	6	59638	59643	0 %	0 %	50 %	50 %	440223014
116	NC_020062	CG	3	6	60158	60163	0 %	0 %	50 %	50 %	440223015
117	NC_020062	GC	3	6	60234	60239	0 %	0 %	50 %	50 %	440223015
118	NC_020062	TA	3	6	61772	61777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020062	GC	3	6	61982	61987	0 %	0 %	50 %	50 %	440223016
120	NC_020062	GA	3	6	62055	62060	50 %	0 %	50 %	0 %	440223016
121	NC_020062	GC	3	6	63503	63508	0 %	0 %	50 %	50 %	440223017
122	NC_020062	GC	3	6	66232	66237	0 %	0 %	50 %	50 %	440223020
123	NC_020062	CG	3	6	66571	66576	0 %	0 %	50 %	50 %	440223020
124	NC_020062	GC	3	6	66958	66963	0 %	0 %	50 %	50 %	440223021
125	NC_020062	CG	3	6	67236	67241	0 %	0 %	50 %	50 %	440223021
126	NC_020062	TC	3	6	68016	68021	0 %	50 %	0 %	50 %	440223022
127	NC_020062	GC	3	6	68252	68257	0 %	0 %	50 %	50 %	440223022
128	NC_020062	GC	3	6	69928	69933	0 %	0 %	50 %	50 %	440223024
129	NC_020062	GC	3	6	70270	70275	0 %	0 %	50 %	50 %	440223024
130	NC_020062	GC	3	6	70469	70474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020062	GC	3	6	70478	70483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020062	CG	3	6	70532	70537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020062	GC	3	6	70929	70934	0 %	0 %	50 %	50 %	440223025
134	NC_020062	GC	3	6	71133	71138	0 %	0 %	50 %	50 %	440223025
135	NC_020062	GC	3	6	71271	71276	0 %	0 %	50 %	50 %	440223025
136	NC_020062	CG	3	6	71475	71480	0 %	0 %	50 %	50 %	440223026
137	NC_020062	GC	3	6	71535	71540	0 %	0 %	50 %	50 %	440223026
138	NC_020062	AG	3	6	71913	71918	50 %	0 %	50 %	0 %	440223026
139	NC_020062	GC	3	6	71946	71951	0 %	0 %	50 %	50 %	440223026
140	NC_020062	TC	3	6	72738	72743	0 %	50 %	0 %	50 %	440223027
141	NC_020062	GC	3	6	74895	74900	0 %	0 %	50 %	50 %	440223030
142	NC_020062	CG	3	6	75029	75034	0 %	0 %	50 %	50 %	440223031
143	NC_020062	GC	3	6	75224	75229	0 %	0 %	50 %	50 %	440223031
144	NC_020062	CG	3	6	75675	75680	0 %	0 %	50 %	50 %	440223031
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146	NC_020062	CT	3	6	76284	76289	0 %	50 %	0 %	50 %	440223031
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