MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 468

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020062	TG	3	6	559	564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020062	CG	3	6	1208	1213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020062	GC	3	6	1877	1882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020062	CG	3	6	3896	3901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020062	AT	3	6	4146	4151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020062	TC	3	6	4409	4414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020062	CA	3	6	4440	4445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020062	CG	3	6	21544	21549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020062	GA	3	6	36079	36084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020062	CT	3	6	37276	37281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020062	GC	4	8	37770	37777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020062	GC	3	6	47011	47016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020062	CG	3	6	47025	47030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020062	AG	4	8	52372	52379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020062	TA	3	6	61772	61777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020062	GC	3	6	70469	70474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020062	GC	3	6	70478	70483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020062	CG	3	6	70532	70537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020062	GA	3	6	78467	78472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020062	CT	3	6	85578	85583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020062	AT	3	6	86016	86021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020062	AT	3	6	96591	96596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020062	GA	3	6	96828	96833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020062	AG	3	6	98094	98099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020062	TG	3	6	98141	98146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020062	AC	3	6	120150	120155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020062	AC	3	6	120466	120471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020062	TC	3	6	125531	125536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020062	AG	3	6	127410	127415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020062	GC	3	6	130575	130580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020062	GA	3	6	133056	133061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020062	GA	3	6	133624	133629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020062	GA	3	6	134136	134141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020062	AC	3	6	137984	137989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020062	AT	3	6	141723	141728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020062	TC	3	6	143324	143329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020062	CA	4	8	157484	157491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020062	CG	3	6	157531	157536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020062	AG	3	6	167714	167719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020062	GC	3	6	167914	167919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020062	AG	3	6	168004	168009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020062	CT	3	6	169494	169499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020062	GC	3	6	174022	174027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020062	AT	3	6	176794	176799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020062	CG	3	6	179688	179693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020062	GC	3	6	180846	180851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020062	GA	3	6	181855	181860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020062	TC	3	6	183304	183309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020062	TA	3	6	186873	186878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020062	GC	3	6	193430	193435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020062	GT	3	6	199069	199074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020062	AT	3	6	211292	211297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020062	GC	3	6	217173	217178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020062	GC	3	6	219179	219184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020062	GT	5	10	219892	219901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020062	CG	3	6	219922	219927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020062	GA	3	6	223121	223126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020062	AT	3	6	232084	232089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020062	TC	3	6	234408	234413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020062	TG	3	6	234471	234476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020062	GA	3	6	234498	234503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020062	AT	3	6	234541	234546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020062	CA	3	6	239574	239579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020062	GA	3	6	240249	240254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020062	AG	3	6	249180	249185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020062	GA	3	6	254082	254087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020062	CT	3	6	255839	255844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020062	TG	3	6	255874	255879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020062	GC	3	6	256537	256542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020062	CT	3	6	258251	258256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020062	AG	3	6	258470	258475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020062	GC	3	6	263830	263835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020062	GC	3	6	263866	263871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020062	CA	3	6	266771	266776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020062	CA	3	6	267866	267871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020062	CG	3	6	270457	270462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020062	CT	3	6	296032	296037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020062	CG	3	6	312304	312309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020062	TG	3	6	317427	317432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020062	TC	3	6	320778	320783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020062	GC	4	8	334200	334207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020062	GC	3	6	336732	336737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020062	CG	3	6	336862	336867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020062	GT	3	6	345938	345943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020062	CA	3	6	357418	357423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020062	GC	3	6	360104	360109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020062	GT	4	8	363536	363543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020062	GA	3	6	372694	372699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020062	CT	3	6	379850	379855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020062	TG	3	6	379921	379926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020062	TG	3	6	383364	383369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020062	TC	3	6	386250	386255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020062	GC	3	6	389363	389368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020062	CG	3	6	393352	393357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020062	TA	3	6	398653	398658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020062	AT	3	6	401480	401485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020062	AT	3	6	401782	401787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020062	CG	3	6	410103	410108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020062	GC	3	6	410122	410127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020062	GA	3	6	410215	410220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020062	AT	3	6	411865	411870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020062	CG	3	6	421862	421867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020062	AG	3	6	425199	425204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020062	CG	3	6	425267	425272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020062	GC	4	8	434045	434052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020062	CA	3	6	434057	434062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020062	GT	3	6	440807	440812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020062	GC	3	6	441759	441764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020062	TA	3	6	463820	463825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020062	AT	3	6	463847	463852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020062	AT	3	6	465492	465497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020062	TC	3	6	467641	467646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020062	CG	3	6	469258	469263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020062	AT	3	6	477340	477345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020062	AT	4	8	477401	477408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020062	TA	4	8	477424	477431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020062	TG	3	6	477438	477443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020062	AT	3	6	483696	483701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020062	CT	3	6	483801	483806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020062	TC	3	6	484709	484714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020062	AT	3	6	485476	485481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020062	CG	3	6	486672	486677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020062	GC	3	6	492817	492822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020062	AT	3	6	494872	494877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020062	GA	3	6	516951	516956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020062	CG	3	6	527861	527866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020062	GC	3	6	537735	537740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020062	GC	3	6	539784	539789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020062	CG	3	6	540121	540126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020062	GC	3	6	544604	544609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020062	CG	3	6	545490	545495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020062	GA	3	6	558617	558622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020062	CG	3	6	558794	558799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020062	GC	3	6	563337	563342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020062	GC	3	6	563372	563377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020062	TC	3	6	564721	564726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020062	GC	3	6	565017	565022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020062	TC	3	6	567456	567461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020062	GT	3	6	568496	568501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020062	TA	3	6	568546	568551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020062	AT	3	6	570790	570795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020062	CA	3	6	575768	575773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020062	GC	3	6	576721	576726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020062	GA	3	6	579848	579853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020062	AG	3	6	582853	582858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020062	CG	3	6	582878	582883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020062	AT	3	6	583037	583042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020062	TG	3	6	588593	588598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020062	CG	3	6	594389	594394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020062	TC	3	6	597892	597897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_020062	GC	3	6	598026	598031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020062	TA	3	6	609613	609618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020062	GC	3	6	629513	629518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020062	CG	3	6	651410	651415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_020062	GA	3	6	653340	653345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_020062	CA	3	6	2012957	2012962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
453	NC_020062	TG	3	6	2014376	2014381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
454	NC_020062	TG	3	6	2017708	2017713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
455	NC_020062	CG	3	6	2021836	2021841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
456	NC_020062	GT	3	6	2024815	2024820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
457	NC_020062	TC	3	6	2029372	2029377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
458	NC_020062	CA	3	6	2034083	2034088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
459	NC_020062	CG	3	6	2034725	2034730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
460	NC_020062	CG	3	6	2046174	2046179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
461	NC_020062	GC	3	6	2048831	2048836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
462	NC_020062	TA	3	6	2059542	2059547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_020062	TC	3	6	2059645	2059650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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465	NC_020062	CT	3	6	2065915	2065920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
466	NC_020062	CA	3	6	2073655	2073660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
467	NC_020062	CA	3	6	2079228	2079233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
468	NC_020062	CG	3	6	2079594	2079599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.