MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 1419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020061	GCGA	2	8	1432	1439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020061	GCCG	2	8	1813	1820	0 %	0 %	50 %	50 %	440222458
3	NC_020061	GTTC	2	8	2239	2246	0 %	50 %	25 %	25 %	440222458
4	NC_020061	ATCG	2	8	2322	2329	25 %	25 %	25 %	25 %	440222458
5	NC_020061	AGCG	2	8	2338	2345	25 %	0 %	50 %	25 %	440222458
6	NC_020061	CTGA	2	8	2395	2402	25 %	25 %	25 %	25 %	440222458
7	NC_020061	ACGA	2	8	2421	2428	50 %	0 %	25 %	25 %	440222458
8	NC_020061	AATG	2	8	2685	2692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020061	AGGC	2	8	2766	2773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020061	AGGG	2	8	3273	3280	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020061	CCCT	2	8	3506	3513	0 %	25 %	0 %	75 %	440222460
12	NC_020061	CATG	2	8	3594	3601	25 %	25 %	25 %	25 %	440222460
13	NC_020061	AAGA	2	8	3809	3816	75 %	0 %	25 %	0 %	440222461
14	NC_020061	AAGC	2	8	4036	4043	50 %	0 %	25 %	25 %	440222462
15	NC_020061	GGCC	2	8	4430	4437	0 %	0 %	50 %	50 %	440222463
16	NC_020061	CGTT	2	8	4441	4448	0 %	50 %	25 %	25 %	440222463
17	NC_020061	GAGC	2	8	4556	4563	25 %	0 %	50 %	25 %	440222464
18	NC_020061	GAAA	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	440222464
19	NC_020061	GCGG	2	8	5873	5880	0 %	0 %	75 %	25 %	440222465
20	NC_020061	AGCC	2	8	6396	6403	25 %	0 %	25 %	50 %	440222465
21	NC_020061	CGAC	2	8	6415	6422	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020061	TCGA	2	8	6514	6521	25 %	25 %	25 %	25 %	440222466
23	NC_020061	CACC	2	8	6848	6855	25 %	0 %	0 %	75 %	440222467
24	NC_020061	TCAA	2	8	8127	8134	50 %	25 %	0 %	25 %	440222468
25	NC_020061	ATCG	2	8	8351	8358	25 %	25 %	25 %	25 %	440222468
26	NC_020061	TTGA	2	8	8366	8373	25 %	50 %	25 %	0 %	440222468
27	NC_020061	CGGC	2	8	8745	8752	0 %	0 %	50 %	50 %	440222469
28	NC_020061	CGAG	2	8	9354	9361	25 %	0 %	50 %	25 %	440222469
29	NC_020061	GTCC	2	8	9813	9820	0 %	25 %	25 %	50 %	440222470
30	NC_020061	GCTC	2	8	10484	10491	0 %	25 %	25 %	50 %	440222471
31	NC_020061	ATGA	2	8	11320	11327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020061	TCGT	2	8	11849	11856	0 %	50 %	25 %	25 %	440222472
33	NC_020061	TGCC	2	8	12132	12139	0 %	25 %	25 %	50 %	440222473
34	NC_020061	ACCA	2	8	12179	12186	50 %	0 %	0 %	50 %	440222473
35	NC_020061	CCGA	2	8	12904	12911	25 %	0 %	25 %	50 %	440222474
36	NC_020061	CGGC	2	8	12936	12943	0 %	0 %	50 %	50 %	440222474
37	NC_020061	CGGT	2	8	13019	13026	0 %	25 %	50 %	25 %	440222474
38	NC_020061	CACG	2	8	14915	14922	25 %	0 %	25 %	50 %	440222476
39	NC_020061	GATA	2	8	15397	15404	50 %	25 %	25 %	0 %	440222477
40	NC_020061	CTGC	2	8	15578	15585	0 %	25 %	25 %	50 %	440222477
41	NC_020061	CACC	2	8	15811	15818	25 %	0 %	0 %	75 %	440222477
42	NC_020061	GATA	2	8	15910	15917	50 %	25 %	25 %	0 %	440222477
43	NC_020061	TTCG	2	8	16247	16254	0 %	50 %	25 %	25 %	440222477
44	NC_020061	GCCT	2	8	16302	16309	0 %	25 %	25 %	50 %	440222477
45	NC_020061	AGGT	2	8	16314	16321	25 %	25 %	50 %	0 %	440222477
46	NC_020061	CCGA	2	8	16757	16764	25 %	0 %	25 %	50 %	440222478
47	NC_020061	TCGC	2	8	16922	16929	0 %	25 %	25 %	50 %	440222478
48	NC_020061	TCGA	2	8	17627	17634	25 %	25 %	25 %	25 %	440222478
49	NC_020061	TGGC	2	8	19530	19537	0 %	25 %	50 %	25 %	440222479
50	NC_020061	CACC	2	8	19664	19671	25 %	0 %	0 %	75 %	440222479
51	NC_020061	GCCT	2	8	19800	19807	0 %	25 %	25 %	50 %	440222479
52	NC_020061	TCAA	2	8	20014	20021	50 %	25 %	0 %	25 %	440222480
53	NC_020061	GCAG	2	8	20426	20433	25 %	0 %	50 %	25 %	440222480
54	NC_020061	GATG	2	8	20479	20486	25 %	25 %	50 %	0 %	440222480
55	NC_020061	GAAC	2	8	20537	20544	50 %	0 %	25 %	25 %	440222480
56	NC_020061	CCGA	2	8	21158	21165	25 %	0 %	25 %	50 %	440222481
57	NC_020061	AGCG	2	8	21503	21510	25 %	0 %	50 %	25 %	440222481
58	NC_020061	GTTC	2	8	21991	21998	0 %	50 %	25 %	25 %	440222481
59	NC_020061	GGCG	2	8	22496	22503	0 %	0 %	75 %	25 %	440222482
60	NC_020061	AATG	2	8	22987	22994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020061	CGGT	2	8	23024	23031	0 %	25 %	50 %	25 %	440222483
62	NC_020061	CAGG	2	8	23192	23199	25 %	0 %	50 %	25 %	440222484
63	NC_020061	CGGC	2	8	23507	23514	0 %	0 %	50 %	50 %	440222484
64	NC_020061	GGCA	2	8	23842	23849	25 %	0 %	50 %	25 %	440222484
65	NC_020061	AGGT	2	8	23965	23972	25 %	25 %	50 %	0 %	440222484
66	NC_020061	CGCT	2	8	24438	24445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020061	ATGG	2	8	24904	24911	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020061	CCCA	2	8	25022	25029	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_020061	TTGG	2	8	25061	25068	0 %	50 %	50 %	0 %	440222485
70	NC_020061	GTCG	2	8	25682	25689	0 %	25 %	50 %	25 %	440222486
71	NC_020061	GCCT	2	8	26163	26170	0 %	25 %	25 %	50 %	440222487
72	NC_020061	CGCT	2	8	26175	26182	0 %	25 %	25 %	50 %	440222487
73	NC_020061	GCTG	2	8	27010	27017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020061	GATC	2	8	27035	27042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020061	CTCC	2	8	27722	27729	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_020061	GCAG	2	8	27879	27886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020061	TTTA	2	8	28077	28084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020061	AGTC	2	8	28311	28318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020061	CGGG	2	8	29090	29097	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020061	CATG	2	8	29873	29880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020061	CGAT	2	8	30267	30274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020061	CGAC	2	8	30384	30391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020061	TGGC	2	8	30489	30496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020061	GACC	2	8	31178	31185	25 %	0 %	25 %	50 %	440222488
85	NC_020061	TGAC	2	8	31583	31590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020061	CAGC	2	8	32640	32647	25 %	0 %	25 %	50 %	440222489
87	NC_020061	AACG	2	8	33511	33518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020061	CGCA	2	8	33601	33608	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020061	TTTC	2	8	33686	33693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020061	AATC	2	8	34064	34071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020061	AGCG	2	8	34838	34845	25 %	0 %	50 %	25 %	440222491
92	NC_020061	TCAG	2	8	34921	34928	25 %	25 %	25 %	25 %	440222491
93	NC_020061	CCTG	2	8	34973	34980	0 %	25 %	25 %	50 %	440222491
94	NC_020061	GATC	2	8	35240	35247	25 %	25 %	25 %	25 %	440222491
95	NC_020061	GCCG	2	8	35339	35346	0 %	0 %	50 %	50 %	440222491
96	NC_020061	TGCC	2	8	35928	35935	0 %	25 %	25 %	50 %	440222492
97	NC_020061	GCGG	2	8	36439	36446	0 %	0 %	75 %	25 %	440222492
98	NC_020061	GCGA	2	8	36599	36606	25 %	0 %	50 %	25 %	440222492
99	NC_020061	GCCG	2	8	38476	38483	0 %	0 %	50 %	50 %	440222494
100	NC_020061	GGCC	2	8	38769	38776	0 %	0 %	50 %	50 %	440222494
101	NC_020061	CGGC	2	8	39003	39010	0 %	0 %	50 %	50 %	440222495
102	NC_020061	CGGC	2	8	39687	39694	0 %	0 %	50 %	50 %	440222495
103	NC_020061	GCCG	2	8	40542	40549	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
104	NC_020061	GCCC	2	8	41195	41202	0 %	0 %	25 %	75 %	440222497
105	NC_020061	ATCG	2	8	41432	41439	25 %	25 %	25 %	25 %	440222497
106	NC_020061	GGGC	2	8	41703	41710	0 %	0 %	75 %	25 %	440222497
107	NC_020061	ATGA	2	8	42718	42725	50 %	25 %	25 %	0 %	440222498
108	NC_020061	GATC	2	8	42988	42995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020061	GAAA	2	8	44519	44526	75 %	0 %	25 %	0 %	440222500
110	NC_020061	CCGG	2	8	45110	45117	0 %	0 %	50 %	50 %	440222501
111	NC_020061	GCTG	2	8	45213	45220	0 %	25 %	50 %	25 %	440222501
112	NC_020061	ATCG	2	8	45541	45548	25 %	25 %	25 %	25 %	440222501
113	NC_020061	ATGC	2	8	46233	46240	25 %	25 %	25 %	25 %	440222502
114	NC_020061	AGGC	2	8	46540	46547	25 %	0 %	50 %	25 %	440222502
115	NC_020061	TGCG	2	8	47845	47852	0 %	25 %	50 %	25 %	440222503
116	NC_020061	GCGA	2	8	47874	47881	25 %	0 %	50 %	25 %	440222503
117	NC_020061	GCGG	2	8	48182	48189	0 %	0 %	75 %	25 %	440222503
118	NC_020061	GGGA	2	8	49015	49022	25 %	0 %	75 %	0 %	440222504
119	NC_020061	CGAT	2	8	49633	49640	25 %	25 %	25 %	25 %	440222504
120	NC_020061	CGGT	2	8	50258	50265	0 %	25 %	50 %	25 %	440222505
121	NC_020061	CGCA	2	8	51271	51278	25 %	0 %	25 %	50 %	440222505
122	NC_020061	GCCT	2	8	51590	51597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020061	CGAC	2	8	51879	51886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020061	ACGG	2	8	51906	51913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020061	TTCG	2	8	51987	51994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020061	GCCG	2	8	52005	52012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020061	GCCG	2	8	52190	52197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020061	CGCC	2	8	52200	52207	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
129	NC_020061	CAGA	2	8	52663	52670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020061	CTTT	2	8	52853	52860	0 %	75 %	0 %	25 %	440222506
131	NC_020061	TCGG	2	8	53643	53650	0 %	25 %	50 %	25 %	440222506
132	NC_020061	AGGC	2	8	54354	54361	25 %	0 %	50 %	25 %	440222507
133	NC_020061	CAAT	2	8	54629	54636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020061	ATGG	2	8	55382	55389	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020061	CGGC	2	8	55463	55470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020061	GACG	2	8	55513	55520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020061	AGAT	2	8	57154	57161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020061	CCAG	2	8	57179	57186	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020061	GCGG	2	8	57522	57529	0 %	0 %	75 %	25 %	440222510
140	NC_020061	CGCA	2	8	57660	57667	25 %	0 %	25 %	50 %	440222510
141	NC_020061	CGGG	2	8	58344	58351	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020061	AAGC	2	8	58514	58521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020061	CAGC	2	8	58685	58692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020061	GGCG	2	8	58702	58709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020061	GGAT	2	8	59459	59466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020061	GACC	2	8	59522	59529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020061	CACC	2	8	60042	60049	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_020061	TGAA	2	8	60090	60097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020061	GGCC	2	8	60612	60619	0 %	0 %	50 %	50 %	440222512
150	NC_020061	CGGG	2	8	60932	60939	0 %	0 %	75 %	25 %	440222513
151	NC_020061	TTGG	2	8	61183	61190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020061	CGTT	2	8	61556	61563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_020061	CGAG	2	8	61727	61734	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_020061	AGGT	2	8	62777	62784	25 %	25 %	50 %	0 %	440222516
155	NC_020061	GCCC	2	8	63064	63071	0 %	0 %	25 %	75 %	440222516
156	NC_020061	CCAA	2	8	63510	63517	50 %	0 %	0 %	50 %	440222517
157	NC_020061	ATCG	2	8	63833	63840	25 %	25 %	25 %	25 %	440222518
158	NC_020061	GCTG	2	8	63868	63875	0 %	25 %	50 %	25 %	440222518
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161	NC_020061	TCCA	2	8	64725	64732	25 %	25 %	0 %	50 %	440222518
162	NC_020061	TGCC	2	8	65422	65429	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_020061	GCGA	2	8	65559	65566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
164	NC_020061	TCAA	2	8	65705	65712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_020061	TCTG	2	8	66372	66379	0 %	50 %	25 %	25 %	440222520
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167	NC_020061	ATTG	2	8	67500	67507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_020061	CATC	2	8	67672	67679	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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170	NC_020061	AGCG	2	8	68407	68414	25 %	0 %	50 %	25 %	440222522
171	NC_020061	GATG	2	8	68576	68583	25 %	25 %	50 %	0 %	440222522
172	NC_020061	CGTT	2	8	68829	68836	0 %	50 %	25 %	25 %	440222523
173	NC_020061	CGGA	2	8	69533	69540	25 %	0 %	50 %	25 %	440222524
174	NC_020061	ATCC	2	8	69771	69778	25 %	25 %	0 %	50 %	440222525
175	NC_020061	AGAT	2	8	70194	70201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_020061	ATGG	2	8	70699	70706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_020061	TTGC	2	8	72111	72118	0 %	50 %	25 %	25 %	440222528
184	NC_020061	GGCC	2	8	72435	72442	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
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192	NC_020061	CCAG	2	8	75765	75772	25 %	0 %	25 %	50 %	440222530
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202	NC_020061	ACCT	2	8	80507	80514	25 %	25 %	0 %	50 %	440222535
203	NC_020061	GTAG	2	8	80611	80618	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
204	NC_020061	CGAA	2	8	80733	80740	50 %	0 %	25 %	25 %	440222536
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206	NC_020061	GCCG	2	8	82182	82189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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210	NC_020061	TGCG	2	8	82348	82355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
211	NC_020061	CCTG	2	8	82892	82899	0 %	25 %	25 %	50 %	440222538
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221	NC_020061	TCGC	2	8	85602	85609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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245	NC_020061	GTTC	2	8	93379	93386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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251	NC_020061	GTCT	2	8	95444	95451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
252	NC_020061	CGAT	2	8	96173	96180	25 %	25 %	25 %	25 %	440222550
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261	NC_020061	GATT	2	8	99523	99530	25 %	50 %	25 %	0 %	440222555
262	NC_020061	GACC	2	8	99912	99919	25 %	0 %	25 %	50 %	440222556
263	NC_020061	GGTG	2	8	100130	100137	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
264	NC_020061	TCCA	2	8	100640	100647	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
265	NC_020061	TCGG	2	8	100684	100691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
266	NC_020061	CCGG	2	8	100696	100703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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269	NC_020061	GAGC	2	8	102478	102485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
270	NC_020061	GCCA	2	8	102495	102502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
271	NC_020061	GGTC	2	8	102574	102581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
272	NC_020061	ATCC	2	8	102637	102644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
273	NC_020061	GAGC	2	8	103761	103768	25 %	0 %	50 %	25 %	440222558
274	NC_020061	GCAA	2	8	103915	103922	50 %	0 %	25 %	25 %	440222558
275	NC_020061	TCGG	2	8	104880	104887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
276	NC_020061	GGAA	2	8	105395	105402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_020061	GGGC	2	8	106259	106266	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
280	NC_020061	TCCT	2	8	106747	106754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
281	NC_020061	CGTT	2	8	107197	107204	0 %	50 %	25 %	25 %	440222560
282	NC_020061	GGGC	2	8	107639	107646	0 %	0 %	75 %	25 %	440222560
283	NC_020061	TGGC	3	12	107810	107821	0 %	25 %	50 %	25 %	440222560
284	NC_020061	TGCG	2	8	108148	108155	0 %	25 %	50 %	25 %	440222561
285	NC_020061	ATCG	2	8	108956	108963	25 %	25 %	25 %	25 %	440222562
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470	NC_020061	TTTA	2	8	189289	189296	25 %	75 %	0 %	0 %	440222630
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473	NC_020061	GCGG	2	8	190632	190639	0 %	0 %	75 %	25 %	440222631
474	NC_020061	TTGC	2	8	191101	191108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_020061	AGAA	2	8	201503	201510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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