MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 1013

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020061	CG	3	6	337	342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020061	CT	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	440222457
3	NC_020061	CG	3	6	1257	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020061	GC	3	6	1919	1924	0 %	0 %	50 %	50 %	440222458
5	NC_020061	CG	3	6	1986	1991	0 %	0 %	50 %	50 %	440222458
6	NC_020061	GC	3	6	2257	2262	0 %	0 %	50 %	50 %	440222458
7	NC_020061	AG	3	6	2746	2751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020061	GC	3	6	3446	3451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020061	GC	3	6	4186	4191	0 %	0 %	50 %	50 %	440222463
10	NC_020061	AG	3	6	4799	4804	50 %	0 %	50 %	0 %	440222464
11	NC_020061	GC	3	6	4808	4813	0 %	0 %	50 %	50 %	440222464
12	NC_020061	CG	3	6	4902	4907	0 %	0 %	50 %	50 %	440222464
13	NC_020061	GA	3	6	5471	5476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020061	GC	3	6	5999	6004	0 %	0 %	50 %	50 %	440222465
15	NC_020061	AT	3	6	6106	6111	50 %	50 %	0 %	0 %	440222465
16	NC_020061	GC	3	6	7160	7165	0 %	0 %	50 %	50 %	440222467
17	NC_020061	CG	3	6	7209	7214	0 %	0 %	50 %	50 %	440222467
18	NC_020061	GC	3	6	10057	10062	0 %	0 %	50 %	50 %	440222470
19	NC_020061	CT	3	6	11171	11176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020061	GC	3	6	11731	11736	0 %	0 %	50 %	50 %	440222472
21	NC_020061	GA	3	6	12086	12091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020061	AT	3	6	12244	12249	50 %	50 %	0 %	0 %	440222473
23	NC_020061	GC	3	6	12258	12263	0 %	0 %	50 %	50 %	440222473
24	NC_020061	GC	3	6	13146	13151	0 %	0 %	50 %	50 %	440222474
25	NC_020061	TA	4	8	13216	13223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020061	TA	3	6	13281	13286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020061	GC	5	10	13494	13503	0 %	0 %	50 %	50 %	440222475
28	NC_020061	CG	3	6	13616	13621	0 %	0 %	50 %	50 %	440222475
29	NC_020061	TG	3	6	15036	15041	0 %	50 %	50 %	0 %	440222476
30	NC_020061	TA	3	6	15203	15208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020061	AT	3	6	16391	16396	50 %	50 %	0 %	0 %	440222478
32	NC_020061	GC	3	6	16437	16442	0 %	0 %	50 %	50 %	440222478
33	NC_020061	CT	3	6	17413	17418	0 %	50 %	0 %	50 %	440222478
34	NC_020061	GA	3	6	18328	18333	50 %	0 %	50 %	0 %	440222479
35	NC_020061	GC	3	6	18456	18461	0 %	0 %	50 %	50 %	440222479
36	NC_020061	CG	3	6	19029	19034	0 %	0 %	50 %	50 %	440222479
37	NC_020061	GC	4	8	19135	19142	0 %	0 %	50 %	50 %	440222479
38	NC_020061	CG	3	6	19714	19719	0 %	0 %	50 %	50 %	440222479
39	NC_020061	AG	3	6	21130	21135	50 %	0 %	50 %	0 %	440222481
40	NC_020061	CT	3	6	21513	21518	0 %	50 %	0 %	50 %	440222481
41	NC_020061	TC	3	6	22241	22246	0 %	50 %	0 %	50 %	440222482
42	NC_020061	CA	3	6	22748	22753	50 %	0 %	0 %	50 %	440222482
43	NC_020061	GA	4	8	23753	23760	50 %	0 %	50 %	0 %	440222484
44	NC_020061	CG	3	6	27130	27135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020061	GC	3	6	27301	27306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020061	AG	4	8	29406	29413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020061	AT	3	6	29978	29983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020061	GC	3	6	30310	30315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020061	CG	3	6	31466	31471	0 %	0 %	50 %	50 %	440222488
50	NC_020061	GC	3	6	31500	31505	0 %	0 %	50 %	50 %	440222488
51	NC_020061	CG	3	6	31638	31643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020061	GA	3	6	31708	31713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020061	GC	3	6	31879	31884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020061	CG	3	6	32619	32624	0 %	0 %	50 %	50 %	440222489
55	NC_020061	AT	3	6	34044	34049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020061	GT	3	6	35305	35310	0 %	50 %	50 %	0 %	440222491
57	NC_020061	CG	3	6	35999	36004	0 %	0 %	50 %	50 %	440222492
58	NC_020061	CT	4	8	36057	36064	0 %	50 %	0 %	50 %	440222492
59	NC_020061	GC	3	6	36290	36295	0 %	0 %	50 %	50 %	440222492
60	NC_020061	CG	4	8	36407	36414	0 %	0 %	50 %	50 %	440222492
61	NC_020061	GC	3	6	37472	37477	0 %	0 %	50 %	50 %	440222493
62	NC_020061	GC	3	6	38360	38365	0 %	0 %	50 %	50 %	440222494
63	NC_020061	GC	3	6	40557	40562	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
64	NC_020061	GA	3	6	40681	40686	50 %	0 %	50 %	0 %	440222496
65	NC_020061	CG	3	6	40723	40728	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
66	NC_020061	CG	3	6	40948	40953	0 %	0 %	50 %	50 %	440222496
67	NC_020061	GC	3	6	42273	42278	0 %	0 %	50 %	50 %	440222497
68	NC_020061	GA	3	6	42409	42414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020061	GC	3	6	42527	42532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020061	GA	3	6	43886	43891	50 %	0 %	50 %	0 %	440222500
71	NC_020061	GA	3	6	44825	44830	50 %	0 %	50 %	0 %	440222501
72	NC_020061	AG	3	6	45296	45301	50 %	0 %	50 %	0 %	440222501
73	NC_020061	GA	3	6	45453	45458	50 %	0 %	50 %	0 %	440222501
74	NC_020061	GT	3	6	46871	46876	0 %	50 %	50 %	0 %	440222502
75	NC_020061	GA	3	6	46925	46930	50 %	0 %	50 %	0 %	440222502
76	NC_020061	GC	4	8	48267	48274	0 %	0 %	50 %	50 %	440222503
77	NC_020061	CG	3	6	48874	48879	0 %	0 %	50 %	50 %	440222504
78	NC_020061	GA	3	6	49363	49368	50 %	0 %	50 %	0 %	440222504
79	NC_020061	GC	3	6	49384	49389	0 %	0 %	50 %	50 %	440222504
80	NC_020061	GC	4	8	49830	49837	0 %	0 %	50 %	50 %	440222504
81	NC_020061	CG	4	8	50178	50185	0 %	0 %	50 %	50 %	440222505
82	NC_020061	CG	4	8	50919	50926	0 %	0 %	50 %	50 %	440222505
83	NC_020061	GC	3	6	51220	51225	0 %	0 %	50 %	50 %	440222505
84	NC_020061	TC	3	6	51972	51977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020061	CG	3	6	51993	51998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020061	TG	3	6	52126	52131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020061	GA	3	6	52326	52331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020061	TC	3	6	52540	52545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020061	GC	3	6	53106	53111	0 %	0 %	50 %	50 %	440222506
90	NC_020061	GC	3	6	53655	53660	0 %	0 %	50 %	50 %	440222506
91	NC_020061	TC	3	6	53701	53706	0 %	50 %	0 %	50 %	440222506
92	NC_020061	GC	3	6	54814	54819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020061	GA	3	6	55088	55093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020061	GC	3	6	55859	55864	0 %	0 %	50 %	50 %	440222508
95	NC_020061	AG	3	6	55878	55883	50 %	0 %	50 %	0 %	440222508
96	NC_020061	GC	3	6	56604	56609	0 %	0 %	50 %	50 %	440222508
97	NC_020061	GA	3	6	57266	57271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020061	GT	3	6	57320	57325	0 %	50 %	50 %	0 %	440222510
99	NC_020061	GC	3	6	58618	58623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020061	CG	3	6	59680	59685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020061	GA	3	6	60069	60074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020061	CG	4	8	60715	60722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020061	GC	3	6	63400	63405	0 %	0 %	50 %	50 %	440222517
104	NC_020061	GC	3	6	64298	64303	0 %	0 %	50 %	50 %	440222518
105	NC_020061	AG	3	6	64372	64377	50 %	0 %	50 %	0 %	440222518
106	NC_020061	GC	3	6	65285	65290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020061	GC	3	6	65761	65766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020061	CG	3	6	66667	66672	0 %	0 %	50 %	50 %	440222520
109	NC_020061	TC	3	6	66702	66707	0 %	50 %	0 %	50 %	440222520
110	NC_020061	CT	3	6	66885	66890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020061	AT	3	6	67547	67552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020061	CG	3	6	68026	68031	0 %	0 %	50 %	50 %	440222522
113	NC_020061	TC	3	6	70238	70243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_020061	GC	4	8	70826	70833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020061	CG	3	6	70848	70853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020061	CG	4	8	71192	71199	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
117	NC_020061	GC	3	6	71322	71327	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
118	NC_020061	GC	3	6	71333	71338	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
119	NC_020061	GC	3	6	71451	71456	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
120	NC_020061	GC	3	6	71736	71741	0 %	0 %	50 %	50 %	440222527
121	NC_020061	GC	3	6	71782	71787	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
122	NC_020061	GC	5	10	71952	71961	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
123	NC_020061	GC	4	8	72089	72096	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
124	NC_020061	CG	3	6	72648	72653	0 %	0 %	50 %	50 %	440222528
125	NC_020061	GC	3	6	73359	73364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020061	GC	3	6	73612	73617	0 %	0 %	50 %	50 %	440222529
127	NC_020061	CG	3	6	73837	73842	0 %	0 %	50 %	50 %	440222529
128	NC_020061	GC	3	6	74415	74420	0 %	0 %	50 %	50 %	440222529
129	NC_020061	CG	3	6	74947	74952	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
130	NC_020061	GC	3	6	75204	75209	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
131	NC_020061	GC	3	6	75256	75261	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
132	NC_020061	GC	6	12	75267	75278	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
133	NC_020061	CG	3	6	75603	75608	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
134	NC_020061	GC	3	6	75618	75623	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
135	NC_020061	CG	3	6	75796	75801	0 %	0 %	50 %	50 %	440222530
136	NC_020061	CT	3	6	75934	75939	0 %	50 %	0 %	50 %	440222531
137	NC_020061	CG	3	6	75976	75981	0 %	0 %	50 %	50 %	440222531
138	NC_020061	CG	3	6	76470	76475	0 %	0 %	50 %	50 %	440222531
139	NC_020061	CG	3	6	76691	76696	0 %	0 %	50 %	50 %	440222531
140	NC_020061	CA	3	6	77020	77025	50 %	0 %	0 %	50 %	440222532
141	NC_020061	GC	3	6	77177	77182	0 %	0 %	50 %	50 %	440222533
142	NC_020061	GC	3	6	77969	77974	0 %	0 %	50 %	50 %	440222533
143	NC_020061	GC	3	6	78137	78142	0 %	0 %	50 %	50 %	440222533
144	NC_020061	GC	3	6	78396	78401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020061	GC	3	6	78405	78410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020061	GC	3	6	79085	79090	0 %	0 %	50 %	50 %	440222534
147	NC_020061	GC	3	6	79206	79211	0 %	0 %	50 %	50 %	440222534
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149	NC_020061	GC	3	6	79822	79827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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