MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020061	A	7	7	10554	10560	100 %	0 %	0 %	0 %	440222471
2	NC_020061	T	6	6	17282	17287	0 %	100 %	0 %	0 %	440222478
3	NC_020061	A	6	6	21752	21757	100 %	0 %	0 %	0 %	440222481
4	NC_020061	T	7	7	32252	32258	0 %	100 %	0 %	0 %	440222489
5	NC_020061	G	7	7	45532	45538	0 %	0 %	100 %	0 %	440222501
6	NC_020061	T	6	6	50974	50979	0 %	100 %	0 %	0 %	440222505
7	NC_020061	T	7	7	63901	63907	0 %	100 %	0 %	0 %	440222518
8	NC_020061	T	6	6	66565	66570	0 %	100 %	0 %	0 %	440222520
9	NC_020061	C	6	6	72327	72332	0 %	0 %	0 %	100 %	440222528
10	NC_020061	G	6	6	78812	78817	0 %	0 %	100 %	0 %	440222534
11	NC_020061	A	6	6	84750	84755	100 %	0 %	0 %	0 %	440222539
12	NC_020061	T	6	6	87291	87296	0 %	100 %	0 %	0 %	440222540
13	NC_020061	G	6	6	87547	87552	0 %	0 %	100 %	0 %	440222540
14	NC_020061	A	6	6	90473	90478	100 %	0 %	0 %	0 %	440222543
15	NC_020061	A	7	7	90606	90612	100 %	0 %	0 %	0 %	440222544
16	NC_020061	C	6	6	94644	94649	0 %	0 %	0 %	100 %	440222549
17	NC_020061	T	6	6	94691	94696	0 %	100 %	0 %	0 %	440222549
18	NC_020061	A	7	7	103864	103870	100 %	0 %	0 %	0 %	440222558
19	NC_020061	T	6	6	109006	109011	0 %	100 %	0 %	0 %	440222562
20	NC_020061	A	6	6	112150	112155	100 %	0 %	0 %	0 %	440222565
21	NC_020061	C	6	6	114731	114736	0 %	0 %	0 %	100 %	440222567
22	NC_020061	G	6	6	131194	131199	0 %	0 %	100 %	0 %	440222580
23	NC_020061	G	6	6	139873	139878	0 %	0 %	100 %	0 %	440222585
24	NC_020061	T	6	6	141468	141473	0 %	100 %	0 %	0 %	440222586
25	NC_020061	C	6	6	153687	153692	0 %	0 %	0 %	100 %	440222597
26	NC_020061	A	6	6	155673	155678	100 %	0 %	0 %	0 %	440222598
27	NC_020061	C	6	6	158345	158350	0 %	0 %	0 %	100 %	440222601
28	NC_020061	C	7	7	158503	158509	0 %	0 %	0 %	100 %	440222601
29	NC_020061	T	6	6	164118	164123	0 %	100 %	0 %	0 %	440222607
30	NC_020061	A	6	6	164372	164377	100 %	0 %	0 %	0 %	440222607
31	NC_020061	C	6	6	167980	167985	0 %	0 %	0 %	100 %	440222611
32	NC_020061	G	6	6	171405	171410	0 %	0 %	100 %	0 %	440222613
33	NC_020061	A	7	7	174019	174025	100 %	0 %	0 %	0 %	440222614
34	NC_020061	A	6	6	174037	174042	100 %	0 %	0 %	0 %	440222614
35	NC_020061	A	6	6	178886	178891	100 %	0 %	0 %	0 %	440222620
36	NC_020061	T	8	8	180906	180913	0 %	100 %	0 %	0 %	440222621
37	NC_020061	T	6	6	185360	185365	0 %	100 %	0 %	0 %	440222624
38	NC_020061	T	6	6	186076	186081	0 %	100 %	0 %	0 %	440222624
39	NC_020061	A	6	6	188395	188400	100 %	0 %	0 %	0 %	440222629
40	NC_020061	G	6	6	191163	191168	0 %	0 %	100 %	0 %	440222632
41	NC_020061	T	6	6	198625	198630	0 %	100 %	0 %	0 %	440222639
42	NC_020061	C	6	6	199634	199639	0 %	0 %	0 %	100 %	440222639
43	NC_020061	T	6	6	202387	202392	0 %	100 %	0 %	0 %	440222641
44	NC_020061	A	6	6	203504	203509	100 %	0 %	0 %	0 %	440222642
45	NC_020061	A	6	6	204227	204232	100 %	0 %	0 %	0 %	440222642
46	NC_020061	G	6	6	204620	204625	0 %	0 %	100 %	0 %	440222642
47	NC_020061	T	6	6	205549	205554	0 %	100 %	0 %	0 %	440222644
48	NC_020061	G	6	6	205752	205757	0 %	0 %	100 %	0 %	440222644
49	NC_020061	A	6	6	207978	207983	100 %	0 %	0 %	0 %	440222646
50	NC_020061	A	6	6	210077	210082	100 %	0 %	0 %	0 %	440222648
51	NC_020061	T	6	6	211848	211853	0 %	100 %	0 %	0 %	440222650
52	NC_020061	C	6	6	223353	223358	0 %	0 %	0 %	100 %	440222660
53	NC_020061	G	6	6	225378	225383	0 %	0 %	100 %	0 %	440222662
54	NC_020061	A	8	8	227493	227500	100 %	0 %	0 %	0 %	440222664
55	NC_020061	T	6	6	232546	232551	0 %	100 %	0 %	0 %	440222669
56	NC_020061	T	7	7	241544	241550	0 %	100 %	0 %	0 %	440222678
57	NC_020061	C	6	6	263148	263153	0 %	0 %	0 %	100 %	440222702
58	NC_020061	A	6	6	263310	263315	100 %	0 %	0 %	0 %	440222702
59	NC_020061	T	6	6	265632	265637	0 %	100 %	0 %	0 %	440222705
60	NC_020061	A	6	6	266296	266301	100 %	0 %	0 %	0 %	440222706
61	NC_020061	G	6	6	273454	273459	0 %	0 %	100 %	0 %	440222713
62	NC_020061	G	6	6	273826	273831	0 %	0 %	100 %	0 %	440222713
63	NC_020061	C	7	7	274673	274679	0 %	0 %	0 %	100 %	440222714
64	NC_020061	A	6	6	287521	287526	100 %	0 %	0 %	0 %	440222724
65	NC_020061	A	6	6	287959	287964	100 %	0 %	0 %	0 %	440222725
66	NC_020061	A	6	6	292394	292399	100 %	0 %	0 %	0 %	440222727
67	NC_020061	T	7	7	294124	294130	0 %	100 %	0 %	0 %	440222732
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69	NC_020061	T	6	6	308455	308460	0 %	100 %	0 %	0 %	440222745
70	NC_020061	A	6	6	312793	312798	100 %	0 %	0 %	0 %	440222747
71	NC_020061	G	6	6	313144	313149	0 %	0 %	100 %	0 %	440222747
72	NC_020061	G	6	6	327908	327913	0 %	0 %	100 %	0 %	440222757
73	NC_020061	A	6	6	330495	330500	100 %	0 %	0 %	0 %	440222759
74	NC_020061	T	6	6	338744	338749	0 %	100 %	0 %	0 %	440222766
75	NC_020061	G	6	6	341975	341980	0 %	0 %	100 %	0 %	440222768
76	NC_020061	G	6	6	344289	344294	0 %	0 %	100 %	0 %	440222770
77	NC_020061	C	7	7	344568	344574	0 %	0 %	0 %	100 %	440222770
78	NC_020061	G	6	6	347625	347630	0 %	0 %	100 %	0 %	440222773
79	NC_020061	A	7	7	348188	348194	100 %	0 %	0 %	0 %	440222774
80	NC_020061	C	6	6	351993	351998	0 %	0 %	0 %	100 %	440222777
81	NC_020061	A	6	6	362188	362193	100 %	0 %	0 %	0 %	440222785
82	NC_020061	G	7	7	364487	364493	0 %	0 %	100 %	0 %	440222787
83	NC_020061	G	6	6	369934	369939	0 %	0 %	100 %	0 %	440222791
84	NC_020061	T	7	7	388649	388655	0 %	100 %	0 %	0 %	440222807
85	NC_020061	T	6	6	393385	393390	0 %	100 %	0 %	0 %	440222813
86	NC_020061	A	6	6	394001	394006	100 %	0 %	0 %	0 %	440222814
87	NC_020061	A	6	6	394408	394413	100 %	0 %	0 %	0 %	440222814
88	NC_020061	T	6	6	401696	401701	0 %	100 %	0 %	0 %	440222821
89	NC_020061	T	6	6	402620	402625	0 %	100 %	0 %	0 %	440222821
90	NC_020061	T	7	7	404233	404239	0 %	100 %	0 %	0 %	440222822
91	NC_020061	T	6	6	408930	408935	0 %	100 %	0 %	0 %	440222826
92	NC_020061	A	6	6	410515	410520	100 %	0 %	0 %	0 %	440222828
93	NC_020061	T	6	6	411812	411817	0 %	100 %	0 %	0 %	440222830
94	NC_020061	A	6	6	414423	414428	100 %	0 %	0 %	0 %	440222832
95	NC_020061	T	6	6	427259	427264	0 %	100 %	0 %	0 %	440222848
96	NC_020061	C	6	6	429578	429583	0 %	0 %	0 %	100 %	440222848
97	NC_020061	T	7	7	431934	431940	0 %	100 %	0 %	0 %	440222849
98	NC_020061	T	6	6	467500	467505	0 %	100 %	0 %	0 %	440222874
99	NC_020061	G	6	6	468105	468110	0 %	0 %	100 %	0 %	440222874
100	NC_020061	G	6	6	468385	468390	0 %	0 %	100 %	0 %	440222874
101	NC_020061	T	7	7	470792	470798	0 %	100 %	0 %	0 %	440222877
102	NC_020061	G	6	6	491464	491469	0 %	0 %	100 %	0 %	440222899
103	NC_020061	T	6	6	492143	492148	0 %	100 %	0 %	0 %	440222899
104	NC_020061	T	7	7	494278	494284	0 %	100 %	0 %	0 %	440222902
105	NC_020061	G	6	6	517128	517133	0 %	0 %	100 %	0 %	440222920
106	NC_020061	T	6	6	521518	521523	0 %	100 %	0 %	0 %	440222926
107	NC_020061	T	6	6	523251	523256	0 %	100 %	0 %	0 %	440222931
108	NC_020061	T	6	6	531549	531554	0 %	100 %	0 %	0 %	440222937
109	NC_020061	A	6	6	539638	539643	100 %	0 %	0 %	0 %	440222947
110	NC_020061	T	7	7	542765	542771	0 %	100 %	0 %	0 %	440222949
111	NC_020061	A	6	6	547708	547713	100 %	0 %	0 %	0 %	440222955
112	NC_020061	A	6	6	548979	548984	100 %	0 %	0 %	0 %	440222956

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.