MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020060	ATCG	2	8	147	154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020060	TCGC	2	8	2226	2233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020060	GCCG	2	8	3445	3452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020060	CTTC	2	8	4937	4944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020060	CGAG	2	8	6848	6855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020060	ATCA	2	8	7902	7909	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020060	CGAC	2	8	9689	9696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020060	CGAT	2	8	10412	10419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020060	GTCG	2	8	13546	13553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020060	CGCT	2	8	16972	16979	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020060	CGTC	2	8	17272	17279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020060	CGAC	2	8	17432	17439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020060	CGGC	2	8	19069	19076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020060	GCCG	2	8	21059	21066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020060	AGGA	2	8	21083	21090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020060	TCGA	2	8	28187	28194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020060	CGGG	2	8	33694	33701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020060	AGCA	2	8	34802	34809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020060	AGCC	2	8	47555	47562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020060	CCAT	2	8	47609	47616	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020060	GTCG	2	8	47801	47808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020060	CTCG	2	8	48612	48619	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020060	CTGT	2	8	49348	49355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020060	GAAA	2	8	53145	53152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020060	GATA	2	8	53341	53348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020060	TCGT	2	8	53687	53694	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020060	CTAC	2	8	59505	59512	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020060	TCGA	2	8	64479	64486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020060	GGAC	2	8	66427	66434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020060	TCGC	2	8	70598	70605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020060	ACGG	2	8	70636	70643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020060	GAAG	2	8	74592	74599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020060	AGTG	2	8	77162	77169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020060	TAGC	2	8	83931	83938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020060	TGTC	2	8	84041	84048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020060	ATGC	2	8	84096	84103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020060	CGAT	2	8	88849	88856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020060	CGGA	2	8	89388	89395	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020060	GATT	2	8	90934	90941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020060	CAGG	2	8	91360	91367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020060	CAAA	2	8	91488	91495	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020060	ATCG	2	8	91588	91595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020060	CGGA	2	8	91652	91659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020060	CGAT	2	8	92281	92288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020060	GAGC	2	8	93143	93150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020060	ACTC	2	8	93459	93466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020060	CAAC	2	8	93494	93501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020060	CAGG	2	8	93510	93517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020060	CGGT	2	8	97737	97744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020060	CGGC	2	8	98096	98103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020060	CCCG	2	8	98175	98182	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_020060	TGCT	2	8	98639	98646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020060	CGCA	2	8	98741	98748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020060	CAGC	2	8	98900	98907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020060	GGCC	2	8	99043	99050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020060	GACT	2	8	99131	99138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020060	GTCA	2	8	99793	99800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020060	CGTT	2	8	99998	100005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020060	CCTT	2	8	100791	100798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020060	GGCC	2	8	103220	103227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020060	TTCG	2	8	105467	105474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020060	TTGT	2	8	114078	114085	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020060	AGCG	2	8	116446	116453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020060	GGCG	2	8	116738	116745	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020060	TTGA	2	8	117434	117441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020060	GAAG	2	8	117474	117481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020060	ACAG	2	8	118433	118440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020060	TGCC	2	8	127067	127074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020060	GGTG	2	8	128535	128542	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020060	TGCT	2	8	128595	128602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020060	TCGA	2	8	137209	137216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020060	GATT	2	8	137531	137538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020060	ATGG	2	8	137830	137837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020060	GTCG	2	8	143349	143356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020060	GCCG	2	8	149942	149949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020060	GCCC	2	8	149989	149996	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_020060	CGAG	2	8	151302	151309	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020060	TGTC	2	8	157775	157782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020060	ATGG	2	8	158017	158024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020060	AGGA	2	8	160689	160696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020060	TTCG	2	8	161543	161550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020060	AAGG	2	8	173055	173062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020060	CGGG	2	8	185534	185541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020060	GGCA	2	8	187752	187759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020060	CGTC	2	8	189133	189140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020060	TCGG	2	8	189827	189834	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020060	CCCG	2	8	190758	190765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_020060	GCTT	2	8	200672	200679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020060	GGAA	2	8	201103	201110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.