MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 2701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020060	GGT	2	6	434	439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228566
2	NC_020060	ACC	2	6	446	451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228566
3	NC_020060	AAT	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440228567
4	NC_020060	GCT	2	6	784	789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228567
5	NC_020060	GCG	2	6	825	830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228567
6	NC_020060	CTC	2	6	934	939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228567
7	NC_020060	CAT	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228567
8	NC_020060	AGT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228567
9	NC_020060	GGT	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228567
10	NC_020060	GAG	2	6	1378	1383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228567
11	NC_020060	CTT	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228567
12	NC_020060	CGA	2	6	1470	1475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228567
13	NC_020060	TGC	2	6	1517	1522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228567
14	NC_020060	GCC	2	6	2322	2327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228568
15	NC_020060	GCC	2	6	2407	2412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228568
16	NC_020060	GGT	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228568
17	NC_020060	CGA	2	6	2443	2448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228568
18	NC_020060	CAG	2	6	2460	2465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228568
19	NC_020060	CGA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228568
20	NC_020060	CGA	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228568
21	NC_020060	CAC	2	6	2598	2603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228568
22	NC_020060	CGC	2	6	2736	2741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228568
23	NC_020060	GAC	3	9	2943	2951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228568
24	NC_020060	CGG	2	6	3050	3055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228568
25	NC_020060	AGG	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228568
26	NC_020060	TGG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228568
27	NC_020060	ATC	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228569
28	NC_020060	GTT	2	6	3464	3469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228570
29	NC_020060	AGG	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228570
30	NC_020060	CGC	3	9	3771	3779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228571
31	NC_020060	TCG	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228571
32	NC_020060	GAA	2	6	3852	3857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228571
33	NC_020060	CGC	2	6	3919	3924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228571
34	NC_020060	CCT	2	6	3967	3972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228571
35	NC_020060	TAA	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440228571
36	NC_020060	CGA	2	6	4225	4230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228571
37	NC_020060	GAG	2	6	4467	4472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228571
38	NC_020060	GGC	2	6	4474	4479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228571
39	NC_020060	CAC	2	6	4510	4515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228571
40	NC_020060	CCG	2	6	4595	4600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228571
41	NC_020060	CAC	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228571
42	NC_020060	GCG	2	6	4629	4634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228571
43	NC_020060	CGC	2	6	4661	4666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228571
44	NC_020060	CAT	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228571
45	NC_020060	CCG	2	6	4786	4791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228571
46	NC_020060	TCT	2	6	4813	4818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228571
47	NC_020060	CTG	2	6	4830	4835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228571
48	NC_020060	ATC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228572
49	NC_020060	GCC	2	6	5107	5112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228572
50	NC_020060	CGG	2	6	5120	5125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228572
51	NC_020060	GCA	2	6	5199	5204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228572
52	NC_020060	GAC	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228572
53	NC_020060	CGG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228572
54	NC_020060	GCT	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228572
55	NC_020060	CGC	2	6	5373	5378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228572
56	NC_020060	CCT	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228572
57	NC_020060	TGG	3	9	5390	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228572
58	NC_020060	GCG	3	9	5449	5457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228572
59	NC_020060	CCG	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228572
60	NC_020060	GCG	2	6	5660	5665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228572
61	NC_020060	CGG	2	6	5669	5674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228572
62	NC_020060	GCC	2	6	5699	5704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228572
63	NC_020060	GCT	2	6	5715	5720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228572
64	NC_020060	AGG	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228572
65	NC_020060	ACG	2	6	5758	5763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228572
66	NC_020060	GGC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228572
67	NC_020060	CCA	2	6	5813	5818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228572
68	NC_020060	CGG	2	6	5833	5838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228572
69	NC_020060	CGG	2	6	5862	5867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228572
70	NC_020060	CGG	2	6	5926	5931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228573
71	NC_020060	CCG	2	6	5974	5979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228573
72	NC_020060	CGG	2	6	6032	6037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228573
73	NC_020060	CGA	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228573
74	NC_020060	GAA	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228573
75	NC_020060	CGG	2	6	6156	6161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228573
76	NC_020060	GCA	2	6	6165	6170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228573
77	NC_020060	AGC	2	6	6221	6226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228573
78	NC_020060	GTT	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228573
79	NC_020060	AGG	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228573
80	NC_020060	CGT	2	6	6366	6371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228573
81	NC_020060	GAC	2	6	6420	6425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228573
82	NC_020060	AGC	2	6	6594	6599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228573
83	NC_020060	CGA	2	6	6992	6997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228574
84	NC_020060	CCG	2	6	7147	7152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228574
85	NC_020060	CGA	3	9	7187	7195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228574
86	NC_020060	TGA	2	6	7532	7537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228574
87	NC_020060	CAA	2	6	7572	7577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228574
88	NC_020060	CTG	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228574
89	NC_020060	CAA	2	6	7635	7640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228574
90	NC_020060	CGT	2	6	7695	7700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228574
91	NC_020060	CTC	2	6	7728	7733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228574
92	NC_020060	CGC	2	6	7812	7817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228574
93	NC_020060	GAT	2	6	7830	7835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228574
94	NC_020060	ATG	2	6	8019	8024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228575
95	NC_020060	CTG	2	6	8089	8094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228575
96	NC_020060	CGC	2	6	8102	8107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228575
97	NC_020060	CCG	2	6	8134	8139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228575
98	NC_020060	GGA	2	6	8360	8365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228575
99	NC_020060	CCG	2	6	8584	8589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228575
100	NC_020060	CGT	2	6	8890	8895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228576
101	NC_020060	GCC	2	6	8978	8983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228576
102	NC_020060	GTT	2	6	9179	9184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228576
103	NC_020060	GGC	2	6	9272	9277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228576
104	NC_020060	CAT	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228576
105	NC_020060	CCA	2	6	9387	9392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228576
106	NC_020060	AAT	2	6	9506	9511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440228576
107	NC_020060	CGC	2	6	9543	9548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228576
108	NC_020060	CAT	2	6	9583	9588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228576
109	NC_020060	TGC	2	6	9589	9594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228576
110	NC_020060	TCG	2	6	9602	9607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228576
111	NC_020060	GGC	2	6	9647	9652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228576
112	NC_020060	GTG	2	6	9838	9843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228577
113	NC_020060	CCG	2	6	10049	10054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228577
114	NC_020060	GCG	2	6	10090	10095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228577
115	NC_020060	TCC	2	6	10151	10156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228577
116	NC_020060	CGG	2	6	10161	10166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228577
117	NC_020060	GGT	2	6	10302	10307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228577
118	NC_020060	CTG	2	6	10385	10390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228577
119	NC_020060	TCC	2	6	10519	10524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228578
120	NC_020060	TAT	2	6	10591	10596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440228578
121	NC_020060	CGA	2	6	10732	10737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228578
122	NC_020060	CGT	2	6	10818	10823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228578
123	NC_020060	AAC	2	6	10839	10844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228578
124	NC_020060	TGG	2	6	10859	10864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228578
125	NC_020060	TCG	2	6	10888	10893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228578
126	NC_020060	TGC	2	6	11048	11053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228578
127	NC_020060	CTG	2	6	11218	11223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228578
128	NC_020060	GGC	2	6	11280	11285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228578
129	NC_020060	GCC	2	6	11312	11317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228578
130	NC_020060	TAC	2	6	11340	11345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228578
131	NC_020060	TTG	2	6	11416	11421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440228578
132	NC_020060	GGT	2	6	11658	11663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228578
133	NC_020060	GCG	3	9	12321	12329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228579
134	NC_020060	GTG	2	6	12480	12485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228579
135	NC_020060	CGC	2	6	12686	12691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228579
136	NC_020060	GTG	2	6	12769	12774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228579
137	NC_020060	TGC	2	6	12779	12784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228579
138	NC_020060	GAT	2	6	12858	12863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228579
139	NC_020060	CCA	2	6	12885	12890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440228579
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142	NC_020060	GCC	2	6	13025	13030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228579
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147	NC_020060	CCG	2	6	13732	13737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228580
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152	NC_020060	GGT	2	6	14159	14164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228580
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159	NC_020060	GTC	2	6	14885	14890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228581
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163	NC_020060	CAA	2	6	15142	15147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228581
164	NC_020060	CGC	2	6	15166	15171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228581
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240	NC_020060	ATC	2	6	22491	22496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228590
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247	NC_020060	ATC	2	6	22995	23000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228590
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251	NC_020060	GGC	2	6	23517	23522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228591
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253	NC_020060	ATG	2	6	23612	23617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228591
254	NC_020060	GCG	2	6	23738	23743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228591
255	NC_020060	GCC	2	6	23779	23784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228591
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378	NC_020060	GCG	2	6	33475	33480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228599
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499	NC_020060	GCA	2	6	43421	43426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228609
500	NC_020060	TGA	2	6	43555	43560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228609

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