MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 361

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020060	TG	3	6	214	219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020060	GA	3	6	836	841	50 %	0 %	50 %	0 %	440228567
3	NC_020060	AC	3	6	1100	1105	50 %	0 %	0 %	50 %	440228567
4	NC_020060	GC	3	6	1263	1268	0 %	0 %	50 %	50 %	440228567
5	NC_020060	GC	4	8	1787	1794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020060	GC	3	6	2328	2333	0 %	0 %	50 %	50 %	440228568
7	NC_020060	GC	3	6	2360	2365	0 %	0 %	50 %	50 %	440228568
8	NC_020060	CG	3	6	2654	2659	0 %	0 %	50 %	50 %	440228568
9	NC_020060	CG	3	6	2726	2731	0 %	0 %	50 %	50 %	440228568
10	NC_020060	GC	3	6	3004	3009	0 %	0 %	50 %	50 %	440228568
11	NC_020060	CG	3	6	3322	3327	0 %	0 %	50 %	50 %	440228569
12	NC_020060	CG	3	6	3866	3871	0 %	0 %	50 %	50 %	440228571
13	NC_020060	AG	3	6	4296	4301	50 %	0 %	50 %	0 %	440228571
14	NC_020060	GA	3	6	4796	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	440228571
15	NC_020060	CG	4	8	4990	4997	0 %	0 %	50 %	50 %	440228572
16	NC_020060	CG	3	6	5126	5131	0 %	0 %	50 %	50 %	440228572
17	NC_020060	CG	3	6	5302	5307	0 %	0 %	50 %	50 %	440228572
18	NC_020060	GC	3	6	5422	5427	0 %	0 %	50 %	50 %	440228572
19	NC_020060	GA	3	6	7766	7771	50 %	0 %	50 %	0 %	440228574
20	NC_020060	CG	3	6	9873	9878	0 %	0 %	50 %	50 %	440228577
21	NC_020060	GT	3	6	10764	10769	0 %	50 %	50 %	0 %	440228578
22	NC_020060	CG	3	6	12982	12987	0 %	0 %	50 %	50 %	440228579
23	NC_020060	TA	3	6	13035	13040	50 %	50 %	0 %	0 %	440228579
24	NC_020060	CT	3	6	13122	13127	0 %	50 %	0 %	50 %	440228579
25	NC_020060	CG	3	6	13890	13895	0 %	0 %	50 %	50 %	440228580
26	NC_020060	GA	3	6	14143	14148	50 %	0 %	50 %	0 %	440228580
27	NC_020060	GC	3	6	14539	14544	0 %	0 %	50 %	50 %	440228580
28	NC_020060	AT	3	6	14597	14602	50 %	50 %	0 %	0 %	440228580
29	NC_020060	CA	3	6	15001	15006	50 %	0 %	0 %	50 %	440228581
30	NC_020060	GC	3	6	15342	15347	0 %	0 %	50 %	50 %	440228581
31	NC_020060	CG	3	6	16395	16400	0 %	0 %	50 %	50 %	440228582
32	NC_020060	CT	3	6	16867	16872	0 %	50 %	0 %	50 %	440228582
33	NC_020060	AC	3	6	18834	18839	50 %	0 %	0 %	50 %	440228585
34	NC_020060	TG	3	6	19338	19343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020060	CA	3	6	19444	19449	50 %	0 %	0 %	50 %	440228586
36	NC_020060	GA	3	6	19953	19958	50 %	0 %	50 %	0 %	440228586
37	NC_020060	GA	3	6	20085	20090	50 %	0 %	50 %	0 %	440228586
38	NC_020060	CG	3	6	22009	22014	0 %	0 %	50 %	50 %	440228589
39	NC_020060	AG	3	6	23053	23058	50 %	0 %	50 %	0 %	440228590
40	NC_020060	CG	3	6	23209	23214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020060	GC	3	6	25638	25643	0 %	0 %	50 %	50 %	440228593
42	NC_020060	GC	3	6	27405	27410	0 %	0 %	50 %	50 %	440228594
43	NC_020060	CA	3	6	28006	28011	50 %	0 %	0 %	50 %	440228594
44	NC_020060	CG	3	6	30250	30255	0 %	0 %	50 %	50 %	440228597
45	NC_020060	GA	3	6	30291	30296	50 %	0 %	50 %	0 %	440228597
46	NC_020060	CG	4	8	31440	31447	0 %	0 %	50 %	50 %	440228598
47	NC_020060	GC	3	6	31648	31653	0 %	0 %	50 %	50 %	440228598
48	NC_020060	CG	3	6	32119	32124	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
49	NC_020060	CG	3	6	32131	32136	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
50	NC_020060	TC	3	6	32362	32367	0 %	50 %	0 %	50 %	440228599
51	NC_020060	GC	3	6	34508	34513	0 %	0 %	50 %	50 %	440228600
52	NC_020060	CT	3	6	34861	34866	0 %	50 %	0 %	50 %	440228601
53	NC_020060	CG	3	6	35134	35139	0 %	0 %	50 %	50 %	440228601
54	NC_020060	GC	3	6	36301	36306	0 %	0 %	50 %	50 %	440228602
55	NC_020060	GA	3	6	37156	37161	50 %	0 %	50 %	0 %	440228602
56	NC_020060	GA	3	6	37504	37509	50 %	0 %	50 %	0 %	440228602
57	NC_020060	CA	3	6	40243	40248	50 %	0 %	0 %	50 %	440228606
58	NC_020060	GA	3	6	40564	40569	50 %	0 %	50 %	0 %	440228606
59	NC_020060	GC	3	6	40728	40733	0 %	0 %	50 %	50 %	440228607
60	NC_020060	CG	3	6	41366	41371	0 %	0 %	50 %	50 %	440228607
61	NC_020060	GC	3	6	41432	41437	0 %	0 %	50 %	50 %	440228607
62	NC_020060	CG	3	6	42029	42034	0 %	0 %	50 %	50 %	440228608
63	NC_020060	GC	3	6	42294	42299	0 %	0 %	50 %	50 %	440228608
64	NC_020060	CG	3	6	42778	42783	0 %	0 %	50 %	50 %	440228609
65	NC_020060	GC	3	6	42822	42827	0 %	0 %	50 %	50 %	440228609
66	NC_020060	CG	3	6	43503	43508	0 %	0 %	50 %	50 %	440228609
67	NC_020060	CG	3	6	43518	43523	0 %	0 %	50 %	50 %	440228609
68	NC_020060	CG	3	6	44885	44890	0 %	0 %	50 %	50 %	440228610
69	NC_020060	AG	3	6	45271	45276	50 %	0 %	50 %	0 %	440228610
70	NC_020060	GC	3	6	45433	45438	0 %	0 %	50 %	50 %	440228610
71	NC_020060	GC	3	6	45903	45908	0 %	0 %	50 %	50 %	440228610
72	NC_020060	CG	3	6	46495	46500	0 %	0 %	50 %	50 %	440228611
73	NC_020060	CT	3	6	46699	46704	0 %	50 %	0 %	50 %	440228611
74	NC_020060	CT	3	6	46716	46721	0 %	50 %	0 %	50 %	440228611
75	NC_020060	GA	3	6	47164	47169	50 %	0 %	50 %	0 %	440228611
76	NC_020060	CA	4	8	47499	47506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020060	AG	3	6	47888	47893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020060	GA	3	6	47909	47914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020060	AG	3	6	48402	48407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020060	GA	3	6	48482	48487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020060	AG	3	6	48528	48533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020060	AT	3	6	49165	49170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020060	TC	3	6	49330	49335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020060	GC	3	6	49547	49552	0 %	0 %	50 %	50 %	440228613
85	NC_020060	GC	3	6	50103	50108	0 %	0 %	50 %	50 %	440228613
86	NC_020060	GC	3	6	50110	50115	0 %	0 %	50 %	50 %	440228613
87	NC_020060	GT	3	6	50431	50436	0 %	50 %	50 %	0 %	440228613
88	NC_020060	GC	3	6	50677	50682	0 %	0 %	50 %	50 %	440228614
89	NC_020060	CG	3	6	50723	50728	0 %	0 %	50 %	50 %	440228614
90	NC_020060	CG	3	6	52529	52534	0 %	0 %	50 %	50 %	440228616
91	NC_020060	GC	3	6	52578	52583	0 %	0 %	50 %	50 %	440228616
92	NC_020060	GC	3	6	52619	52624	0 %	0 %	50 %	50 %	440228616
93	NC_020060	CG	3	6	52651	52656	0 %	0 %	50 %	50 %	440228616
94	NC_020060	GA	3	6	53605	53610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020060	GC	3	6	54001	54006	0 %	0 %	50 %	50 %	440228618
96	NC_020060	GC	3	6	55142	55147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020060	TC	3	6	55325	55330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020060	AC	3	6	56132	56137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020060	GA	3	6	56926	56931	50 %	0 %	50 %	0 %	440228620
100	NC_020060	GC	4	8	57681	57688	0 %	0 %	50 %	50 %	440228621
101	NC_020060	CA	3	6	57963	57968	50 %	0 %	0 %	50 %	440228621
102	NC_020060	CG	3	6	58167	58172	0 %	0 %	50 %	50 %	440228621
103	NC_020060	CT	3	6	59361	59366	0 %	50 %	0 %	50 %	440228623
104	NC_020060	TC	3	6	60399	60404	0 %	50 %	0 %	50 %	440228625
105	NC_020060	AT	3	6	61380	61385	50 %	50 %	0 %	0 %	440228627
106	NC_020060	CG	3	6	61691	61696	0 %	0 %	50 %	50 %	440228628
107	NC_020060	GC	3	6	62281	62286	0 %	0 %	50 %	50 %	440228628
108	NC_020060	GC	3	6	62394	62399	0 %	0 %	50 %	50 %	440228628
109	NC_020060	CG	3	6	62466	62471	0 %	0 %	50 %	50 %	440228628
110	NC_020060	TC	3	6	64873	64878	0 %	50 %	0 %	50 %	440228631
111	NC_020060	GA	3	6	65632	65637	50 %	0 %	50 %	0 %	440228632
112	NC_020060	GA	3	6	66326	66331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020060	CG	3	6	68252	68257	0 %	0 %	50 %	50 %	440228634
114	NC_020060	GT	4	8	69612	69619	0 %	50 %	50 %	0 %	440228635
115	NC_020060	GC	3	6	69750	69755	0 %	0 %	50 %	50 %	440228635
116	NC_020060	GC	3	6	69862	69867	0 %	0 %	50 %	50 %	440228636
117	NC_020060	CG	3	6	69880	69885	0 %	0 %	50 %	50 %	440228636
118	NC_020060	TC	3	6	70852	70857	0 %	50 %	0 %	50 %	440228637
119	NC_020060	TC	3	6	71233	71238	0 %	50 %	0 %	50 %	440228637
120	NC_020060	GC	3	6	71698	71703	0 %	0 %	50 %	50 %	440228637
121	NC_020060	CG	3	6	71736	71741	0 %	0 %	50 %	50 %	440228637
122	NC_020060	AT	3	6	71870	71875	50 %	50 %	0 %	0 %	440228637
123	NC_020060	GC	3	6	71961	71966	0 %	0 %	50 %	50 %	440228637
124	NC_020060	CA	3	6	72174	72179	50 %	0 %	0 %	50 %	440228638
125	NC_020060	TC	3	6	72279	72284	0 %	50 %	0 %	50 %	440228638
126	NC_020060	CG	3	6	72977	72982	0 %	0 %	50 %	50 %	440228639
127	NC_020060	GC	3	6	74048	74053	0 %	0 %	50 %	50 %	440228639
128	NC_020060	TC	3	6	75579	75584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020060	CG	3	6	75818	75823	0 %	0 %	50 %	50 %	440228643
130	NC_020060	GC	4	8	76015	76022	0 %	0 %	50 %	50 %	440228643
131	NC_020060	GA	3	6	76510	76515	50 %	0 %	50 %	0 %	440228644
132	NC_020060	GC	3	6	77868	77873	0 %	0 %	50 %	50 %	440228645
133	NC_020060	AT	4	8	78818	78825	50 %	50 %	0 %	0 %	440228646
134	NC_020060	AC	3	6	79853	79858	50 %	0 %	0 %	50 %	440228647
135	NC_020060	CG	3	6	80741	80746	0 %	0 %	50 %	50 %	440228647
136	NC_020060	AG	3	6	80800	80805	50 %	0 %	50 %	0 %	440228647
137	NC_020060	GA	3	6	81073	81078	50 %	0 %	50 %	0 %	440228647
138	NC_020060	GC	3	6	81163	81168	0 %	0 %	50 %	50 %	440228647
139	NC_020060	AT	3	6	81763	81768	50 %	50 %	0 %	0 %	440228647
140	NC_020060	CT	3	6	82441	82446	0 %	50 %	0 %	50 %	440228648
141	NC_020060	TG	3	6	82797	82802	0 %	50 %	50 %	0 %	440228648
142	NC_020060	GC	4	8	83049	83056	0 %	0 %	50 %	50 %	440228648
143	NC_020060	CG	3	6	83206	83211	0 %	0 %	50 %	50 %	440228648
144	NC_020060	TG	4	8	83279	83286	0 %	50 %	50 %	0 %	440228648
145	NC_020060	CG	3	6	83443	83448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020060	CT	3	6	83490	83495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.