MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020060	G	6	6	4572	4577	0 %	0 %	100 %	0 %	440228571
2	NC_020060	A	6	6	17262	17267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020060	G	6	6	19050	19055	0 %	0 %	100 %	0 %	440228585
4	NC_020060	A	6	6	30052	30057	100 %	0 %	0 %	0 %	440228597
5	NC_020060	A	6	6	34829	34834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020060	T	6	6	36458	36463	0 %	100 %	0 %	0 %	440228602
7	NC_020060	A	7	7	36581	36587	100 %	0 %	0 %	0 %	440228602
8	NC_020060	A	6	6	37703	37708	100 %	0 %	0 %	0 %	440228603
9	NC_020060	T	6	6	39421	39426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020060	G	6	6	42083	42088	0 %	0 %	100 %	0 %	440228608
11	NC_020060	A	6	6	43397	43402	100 %	0 %	0 %	0 %	440228609
12	NC_020060	A	6	6	44177	44182	100 %	0 %	0 %	0 %	440228609
13	NC_020060	C	9	9	48283	48291	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_020060	T	6	6	49234	49239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020060	A	8	8	52437	52444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020060	A	6	6	53150	53155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020060	G	6	6	53368	53373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020060	T	6	6	61206	61211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020060	G	6	6	64864	64869	0 %	0 %	100 %	0 %	440228631
20	NC_020060	A	6	6	68610	68615	100 %	0 %	0 %	0 %	440228634
21	NC_020060	C	6	6	68794	68799	0 %	0 %	0 %	100 %	440228635
22	NC_020060	A	6	6	70032	70037	100 %	0 %	0 %	0 %	440228636
23	NC_020060	A	6	6	70671	70676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020060	T	6	6	72158	72163	0 %	100 %	0 %	0 %	440228638
25	NC_020060	T	6	6	74949	74954	0 %	100 %	0 %	0 %	440228641
26	NC_020060	T	6	6	77519	77524	0 %	100 %	0 %	0 %	440228645
27	NC_020060	G	6	6	83233	83238	0 %	0 %	100 %	0 %	440228648
28	NC_020060	A	6	6	85559	85564	100 %	0 %	0 %	0 %	440228651
29	NC_020060	A	6	6	86591	86596	100 %	0 %	0 %	0 %	440228652
30	NC_020060	C	7	7	88173	88179	0 %	0 %	0 %	100 %	440228654
31	NC_020060	T	6	6	89355	89360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020060	T	6	6	89990	89995	0 %	100 %	0 %	0 %	440228655
33	NC_020060	G	6	6	93383	93388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020060	G	6	6	98555	98560	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020060	A	6	6	105818	105823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020060	G	6	6	115560	115565	0 %	0 %	100 %	0 %	440228678
37	NC_020060	A	6	6	117513	117518	100 %	0 %	0 %	0 %	440228680
38	NC_020060	A	6	6	119029	119034	100 %	0 %	0 %	0 %	440228682
39	NC_020060	A	6	6	120583	120588	100 %	0 %	0 %	0 %	440228684
40	NC_020060	G	6	6	123904	123909	0 %	0 %	100 %	0 %	440228686
41	NC_020060	G	6	6	132426	132431	0 %	0 %	100 %	0 %	440228694
42	NC_020060	G	6	6	132564	132569	0 %	0 %	100 %	0 %	440228694
43	NC_020060	C	6	6	135247	135252	0 %	0 %	0 %	100 %	440228697
44	NC_020060	T	6	6	135333	135338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020060	A	6	6	136921	136926	100 %	0 %	0 %	0 %	440228699
46	NC_020060	G	6	6	137798	137803	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020060	C	6	6	139922	139927	0 %	0 %	0 %	100 %	440228703
48	NC_020060	G	6	6	140421	140426	0 %	0 %	100 %	0 %	440228703
49	NC_020060	C	7	7	140745	140751	0 %	0 %	0 %	100 %	440228704
50	NC_020060	G	6	6	151112	151117	0 %	0 %	100 %	0 %	440228713
51	NC_020060	T	6	6	156322	156327	0 %	100 %	0 %	0 %	440228718
52	NC_020060	C	6	6	159380	159385	0 %	0 %	0 %	100 %	440228719
53	NC_020060	G	6	6	160480	160485	0 %	0 %	100 %	0 %	440228719
54	NC_020060	T	7	7	160772	160778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020060	A	7	7	161957	161963	100 %	0 %	0 %	0 %	440228721
56	NC_020060	T	6	6	162034	162039	0 %	100 %	0 %	0 %	440228721
57	NC_020060	G	6	6	165058	165063	0 %	0 %	100 %	0 %	440228723
58	NC_020060	T	6	6	166412	166417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020060	G	6	6	167812	167817	0 %	0 %	100 %	0 %	440228726
60	NC_020060	A	6	6	171431	171436	100 %	0 %	0 %	0 %	440228730
61	NC_020060	G	6	6	172943	172948	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020060	T	7	7	180246	180252	0 %	100 %	0 %	0 %	440228736
63	NC_020060	T	6	6	185598	185603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020060	C	6	6	187867	187872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_020060	C	6	6	193065	193070	0 %	0 %	0 %	100 %	440228753
66	NC_020060	T	6	6	198332	198337	0 %	100 %	0 %	0 %	440228756
67	NC_020060	T	6	6	198550	198555	0 %	100 %	0 %	0 %	440228756
68	NC_020060	T	6	6	199281	199286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020060	T	6	6	207114	207119	0 %	100 %	0 %	0 %	440228769
70	NC_020060	T	6	6	213706	213711	0 %	100 %	0 %	0 %	440228775
71	NC_020060	A	6	6	214194	214199	100 %	0 %	0 %	0 %	440228775
72	NC_020060	G	6	6	216327	216332	0 %	0 %	100 %	0 %	440228777
73	NC_020060	G	6	6	216533	216538	0 %	0 %	100 %	0 %	440228777

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.