MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020059	TTTTAA	2	12	5361	5372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020059	ATCCGG	2	12	73756	73767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020059	CAGCCG	2	12	110736	110747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020059	TCTCTG	2	12	123080	123091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020059	GTTCCT	2	12	126988	126999	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020059	CCTGTC	2	12	147070	147081	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020059	CATGTC	2	12	149657	149668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020059	TTTTTG	2	12	163620	163631	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020059	CATTTT	2	12	163665	163676	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020059	ATCCGG	2	12	176393	176404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020059	GCAAGT	2	12	191488	191499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020059	TTTAGA	2	12	338142	338153	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020059	AGCAAT	2	12	400968	400979	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020059	GAATTC	2	12	432236	432247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020059	CATGCG	2	12	501781	501792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020059	ATAGGA	2	12	598372	598383	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020059	TATGAT	2	12	607433	607444	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020059	CGGCTT	2	12	627103	627114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020059	TTGAAC	2	12	648471	648482	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020059	AATGGA	2	12	685573	685584	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020059	AATCTC	2	12	715149	715160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020059	ATATTA	2	12	715210	715221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020059	TTTGCA	2	12	856904	856915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020059	AAGCGG	2	12	881850	881861	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020059	GAGAAT	2	12	998002	998013	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020059	TCCTCT	2	12	1000309	1000320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020059	TCACAA	2	12	1052154	1052165	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020059	ATGCTT	2	12	1054860	1054871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020059	ACGTTA	2	12	1054930	1054941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020059	GCTAAG	2	12	1069888	1069899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020059	GTTCCG	2	12	1085358	1085369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020059	CTTCAA	2	12	1131348	1131359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020059	CGGTGA	2	12	1135852	1135863	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020059	AAATCC	2	12	1158348	1158359	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020059	TTCAGC	2	12	1280028	1280039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020059	TGGTTA	2	12	1287016	1287027	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020059	CAATGA	2	12	1313254	1313265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020059	CGATTT	2	12	1337530	1337541	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020059	ATTTTA	2	12	1396853	1396864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020059	ATTGCG	2	12	1412424	1412435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020059	CGTCGC	2	12	1422944	1422955	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020059	GGAAGA	2	12	1433029	1433040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020059	ATACTT	2	12	1451275	1451286	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020059	CGAGGG	2	12	1502851	1502862	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020059	AAAAGC	2	12	1596959	1596970	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020059	CGGGCA	2	12	1607502	1607513	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020059	TTTTGC	2	12	1688641	1688652	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020059	GGAGAG	2	12	1767408	1767419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020059	TGCGGT	2	12	1767857	1767868	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020059	GCCGGC	2	12	1837584	1837595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020059	ACAGGG	2	12	1900442	1900453	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020059	AAACGG	2	12	1910435	1910446	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020059	CAAAAT	2	12	1919251	1919262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020059	TGCCGT	2	12	1951692	1951703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020059	GAAAAA	2	12	2015707	2015718	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020059	TTGAAT	2	12	2197478	2197489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020059	GTGACA	2	12	2199975	2199986	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020059	TGCCGC	2	12	2255929	2255940	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020059	AAGAGC	2	12	2276317	2276328	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020059	TCTTTT	2	12	2342493	2342504	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020059	GAAGCA	2	12	2424835	2424846	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020059	AAACAA	2	12	2425446	2425457	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020059	GGCGAG	2	12	2426324	2426335	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020059	CCGCGA	2	12	2455213	2455224	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020059	CAGTGG	2	12	2530350	2530361	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020059	GCGAGC	2	12	2599996	2600007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020059	GCCGAT	2	12	2602317	2602328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020059	TCCGTC	2	12	2606915	2606926	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020059	GAAAAT	2	12	2610882	2610893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020059	CCTCGA	2	12	2614743	2614754	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020059	GATTCC	2	12	2703068	2703079	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020059	GACAAA	2	12	2735820	2735831	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020059	TCGCAA	2	12	2797703	2797714	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020059	CGTTAC	2	12	2802553	2802564	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020059	TCCATA	2	12	2809300	2809311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020059	TCGACA	2	12	2832416	2832427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020059	GCCCGC	2	12	2841675	2841686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_020059	ATCGGA	2	12	2917826	2917837	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020059	ACGAGA	2	12	2931062	2931073	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020059	AACCAA	2	12	3139993	3140004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020059	CTCTTC	2	12	3160383	3160394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020059	CACCGG	2	12	3171192	3171203	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020059	CCGGAT	2	12	3251147	3251158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020059	TCGCTT	2	12	3252606	3252617	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020059	CTGTCG	2	12	3295643	3295654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020059	TTGACG	2	12	3301040	3301051	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020059	GGAGAA	2	12	3303953	3303964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020059	CCCCGC	2	12	3313986	3313997	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
89	NC_020059	GCCCGG	2	12	3378314	3378325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020059	ACGTAA	2	12	3416034	3416045	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020059	CAAAAG	2	12	3448462	3448473	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020059	CAGGTA	2	12	3451346	3451357	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020059	GATCGA	2	12	3501360	3501371	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020059	TACTCA	2	12	3563448	3563459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020059	TTCTGT	2	12	3659004	3659015	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020059	GCGCAT	2	12	3675920	3675931	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020059	TTTGCA	2	12	3706229	3706240	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020059	ATTCAC	2	12	3715751	3715762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020059	ATCGAG	2	12	3720724	3720735	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020059	CCAATC	2	12	3721048	3721059	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020059	CTCCAT	2	12	3732875	3732886	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020059	CGGCAA	2	12	3740561	3740572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020059	AATCCG	2	12	3792571	3792582	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020059	TTTCGT	2	12	3800487	3800498	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020059	CACGCA	2	12	3828133	3828144	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.