MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899

Total Repeats: 1262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020059	AAAG	2	8	183	190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020059	CGAG	2	8	261	268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020059	GGAA	2	8	14613	14620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020059	AGGA	2	8	15594	15601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020059	GCAA	2	8	17035	17042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020059	AGTC	2	8	20138	20145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020059	GTCT	2	8	38701	38708	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020059	TCGG	2	8	44598	44605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020059	CTGC	2	8	44720	44727	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020059	ATTT	2	8	44754	44761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020059	TGGG	2	8	47073	47080	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020059	TTAG	2	8	54765	54772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020059	AGTA	2	8	57599	57606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020059	CGCC	2	8	57639	57646	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_020059	GGCT	2	8	68228	68235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020059	GGCA	2	8	68436	68443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020059	GAAC	2	8	69043	69050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020059	GTGA	2	8	69386	69393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020059	GATC	2	8	69545	69552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020059	TCTT	2	8	70677	70684	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020059	AGGA	2	8	71224	71231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020059	GCGA	2	8	71933	71940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020059	CAAG	2	8	72267	72274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020059	CGTC	2	8	72632	72639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020059	AAAG	2	8	72755	72762	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020059	AACC	2	8	74309	74316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020059	GGCC	2	8	76084	76091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020059	GACC	2	8	77129	77136	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020059	GGCG	2	8	83566	83573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020059	ATCG	2	8	84941	84948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020059	CCGT	2	8	86751	86758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020059	AAAG	2	8	86850	86857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020059	GAGG	2	8	94886	94893	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020059	TTTA	2	8	102435	102442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020059	GAAA	2	8	107830	107837	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020059	ACCC	2	8	108547	108554	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_020059	GTCC	2	8	110195	110202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020059	TCGA	2	8	112210	112217	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020059	ATGA	2	8	112222	112229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020059	CATC	2	8	112280	112287	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020059	AGGC	2	8	115664	115671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020059	TGTC	2	8	118061	118068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020059	CGCC	2	8	120763	120770	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_020059	TTGA	2	8	122137	122144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020059	CGTC	2	8	127018	127025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020059	GGAA	2	8	132333	132340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020059	CAGG	2	8	133604	133611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020059	AAGC	2	8	137303	137310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020059	AGGA	2	8	139493	139500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020059	TGGG	2	8	144633	144640	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020059	CCTG	2	8	144674	144681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020059	GCAA	2	8	145970	145977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020059	AAGC	2	8	147140	147147	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020059	CGTT	2	8	148395	148402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020059	TTTG	2	8	148477	148484	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020059	CGAA	2	8	153674	153681	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020059	AAGC	2	8	158082	158089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020059	ACTG	2	8	158195	158202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020059	GCCG	2	8	160862	160869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020059	GCCG	2	8	162216	162223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020059	ACAA	2	8	165329	165336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020059	GTCG	2	8	168480	168487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020059	CCCT	2	8	171124	171131	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_020059	GAAC	2	8	171680	171687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020059	GTGA	2	8	172023	172030	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020059	GATC	2	8	172182	172189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020059	TCTT	2	8	173314	173321	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020059	AGGA	2	8	173861	173868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020059	GCGA	2	8	174570	174577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020059	CAAG	2	8	174904	174911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020059	CGTC	2	8	175269	175276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020059	AAAG	2	8	175392	175399	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020059	AACC	2	8	176946	176953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020059	GTGA	2	8	181748	181755	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020059	GGCA	2	8	181986	181993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020059	ATCC	2	8	183996	184003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020059	GTCC	2	8	186804	186811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020059	TCAA	2	8	191525	191532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020059	TGCC	2	8	193126	193133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020059	GGGC	2	8	193308	193315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020059	GAGG	2	8	197923	197930	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020059	GCCG	2	8	199390	199397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020059	TCGA	2	8	200668	200675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020059	GGGT	2	8	213665	213672	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020059	GGCG	2	8	213690	213697	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020059	CGCC	2	8	213905	213912	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_020059	GCCG	2	8	218967	218974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020059	TGGG	2	8	221713	221720	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020059	TCCG	2	8	228636	228643	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020059	GACG	2	8	237567	237574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020059	TTTC	2	8	242559	242566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020059	TCCG	2	8	244120	244127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020059	CCTG	2	8	250868	250875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020059	GTTT	2	8	253655	253662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020059	CTGA	2	8	258520	258527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020059	CGCT	2	8	259428	259435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020059	ATCG	2	8	276231	276238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020059	TGAA	2	8	276775	276782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020059	AACC	2	8	277331	277338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020059	TCGT	2	8	286214	286221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020059	CGGC	2	8	286929	286936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020059	CTTC	2	8	299648	299655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020059	GCAC	2	8	299970	299977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020059	CGGG	2	8	300043	300050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020059	GAAA	2	8	304139	304146	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020059	AGCG	2	8	313265	313272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020059	AAAT	2	8	313315	313322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020059	AAAT	2	8	313388	313395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020059	GGCC	2	8	339672	339679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020059	TCAA	2	8	347086	347093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020059	AGGC	2	8	347235	347242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020059	TCTG	2	8	355543	355550	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020059	AATG	2	8	356645	356652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020059	GCTG	2	8	362453	362460	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020059	CAAA	2	8	369623	369630	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020059	CATA	2	8	370875	370882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020059	GGGC	2	8	372181	372188	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020059	GCAG	2	8	372227	372234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020059	GAAG	2	8	373529	373536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020059	GATG	2	8	375755	375762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020059	CGGT	2	8	375774	375781	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020059	CCCA	2	8	378246	378253	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_020059	CCGG	2	8	379800	379807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020059	CTGC	2	8	379835	379842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020059	CGGC	2	8	381654	381661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020059	AAGC	2	8	382208	382215	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020059	CGAA	2	8	382279	382286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020059	ACCT	2	8	383485	383492	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020059	CAAC	2	8	384246	384253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020059	CGGA	2	8	386035	386042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020059	TCGA	2	8	388366	388373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020059	GCTT	2	8	388381	388388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020059	AAGC	2	8	388400	388407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020059	GATA	2	8	388473	388480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020059	ATGT	2	8	388530	388537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020059	CCCT	2	8	393150	393157	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_020059	AAAC	2	8	394510	394517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020059	GAAT	2	8	396761	396768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020059	TGAT	2	8	399711	399718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020059	CCGT	2	8	405943	405950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020059	CGAG	2	8	409072	409079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020059	CCGC	2	8	411794	411801	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_020059	TAAA	2	8	416349	416356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020059	CGGT	2	8	424778	424785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020059	CCTT	2	8	428264	428271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020059	TGCG	2	8	428366	428373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020059	ATTC	2	8	431329	431336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020059	AAGC	2	8	434207	434214	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020059	TTAA	2	8	435940	435947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020059	CAGA	2	8	446135	446142	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020059	TGTC	2	8	451548	451555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_020059	CGGC	2	8	453438	453445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020059	GCCG	2	8	453452	453459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020059	GGCG	2	8	453477	453484	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
155	NC_020059	GCCG	2	8	455532	455539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_020059	AGGG	2	8	460501	460508	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_020059	CGGA	2	8	494507	494514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_020059	CTTC	2	8	496239	496246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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187	NC_020059	CGTC	2	8	569415	569422	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_020059	AGGG	2	8	606363	606370	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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205	NC_020059	AGCT	2	8	648078	648085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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233	NC_020059	TGTC	2	8	718202	718209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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262	NC_020059	ATTT	2	8	813799	813806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_020059	CTGA	2	8	871539	871546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
282	NC_020059	GTAA	2	8	879766	879773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020059	AGGA	2	8	891944	891951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_020059	CGGA	2	8	932072	932079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
297	NC_020059	GCCA	2	8	932623	932630	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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452	NC_020059	GCAA	2	8	1398430	1398437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_020059	GATC	2	8	1453506	1453513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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474	NC_020059	GGAC	2	8	1496403	1496410	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_020059	CTTA	2	8	1504149	1504156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_020059	AACC	2	8	1506301	1506308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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485	NC_020059	ATTG	2	8	1506909	1506916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_020059	AGGG	2	8	1529352	1529359	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
495	NC_020059	TTTG	2	8	1529374	1529381	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_020059	TCCG	2	8	1530847	1530854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_020059	CCGG	2	8	1534046	1534053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
499	NC_020059	AACG	2	8	1534111	1534118	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_020059	GCGA	2	8	1535157	1535164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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