MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei W56 plasmid pW56

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020057	ACGTG	2	10	1482	1491	20 %	20 %	40 %	20 %	436843292
2	NC_020057	CTTTG	2	10	3387	3396	0 %	60 %	20 %	20 %	436843293
3	NC_020057	TAGTT	2	10	3430	3439	20 %	60 %	20 %	0 %	436843293
4	NC_020057	TTTTG	2	10	4974	4983	0 %	80 %	20 %	0 %	436843295
5	NC_020057	TGGAT	2	10	5569	5578	20 %	40 %	40 %	0 %	436843297
6	NC_020057	TCAGC	2	10	6681	6690	20 %	20 %	20 %	40 %	436843298
7	NC_020057	TTGGC	2	10	6731	6740	0 %	40 %	40 %	20 %	436843298
8	NC_020057	TGGTT	2	10	9484	9493	0 %	60 %	40 %	0 %	436843301
9	NC_020057	TGACA	2	10	9585	9594	40 %	20 %	20 %	20 %	436843301
10	NC_020057	TCATC	2	10	12867	12876	20 %	40 %	0 %	40 %	436843302
11	NC_020057	TGTTT	2	10	16919	16928	0 %	80 %	20 %	0 %	436843306
12	NC_020057	GAAAG	2	10	18324	18333	60 %	0 %	40 %	0 %	436843307
13	NC_020057	TGGGA	2	10	23158	23167	20 %	20 %	60 %	0 %	436843316
14	NC_020057	CAGTA	2	10	25356	25365	40 %	20 %	20 %	20 %	436843319
15	NC_020057	ATTCA	2	10	39476	39485	40 %	40 %	0 %	20 %	436843333
16	NC_020057	TGGCC	2	10	39810	39819	0 %	20 %	40 %	40 %	436843334
17	NC_020057	TGTTT	2	10	39909	39918	0 %	80 %	20 %	0 %	436843334
18	NC_020057	ACCTT	2	10	41540	41549	20 %	40 %	0 %	40 %	436843335
19	NC_020057	TTCCA	2	10	45262	45271	20 %	40 %	0 %	40 %	436843336
20	NC_020057	ATCCA	2	10	49115	49124	40 %	20 %	0 %	40 %	436843342
21	NC_020057	CAAAG	2	10	49240	49249	60 %	0 %	20 %	20 %	436843342
22	NC_020057	CTACC	2	10	50095	50104	20 %	20 %	0 %	60 %	436843344
23	NC_020057	CGTCA	2	10	52413	52422	20 %	20 %	20 %	40 %	436843346
24	NC_020057	AAAAG	2	10	54988	54997	80 %	0 %	20 %	0 %	436843351

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.