MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei W56 plasmid pW56

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020057	TG	3	6	1094	1099	0 %	50 %	50 %	0 %	436843292
2	NC_020057	AT	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	436843293
3	NC_020057	CA	3	6	3575	3580	50 %	0 %	0 %	50 %	436843293
4	NC_020057	CG	3	6	3843	3848	0 %	0 %	50 %	50 %	436843293
5	NC_020057	GC	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	436843294
6	NC_020057	TG	3	6	5964	5969	0 %	50 %	50 %	0 %	436843297
7	NC_020057	CT	3	6	6039	6044	0 %	50 %	0 %	50 %	436843297
8	NC_020057	CT	3	6	6079	6084	0 %	50 %	0 %	50 %	436843297
9	NC_020057	TG	3	6	6167	6172	0 %	50 %	50 %	0 %	436843297
10	NC_020057	GA	3	6	8450	8455	50 %	0 %	50 %	0 %	436843301
11	NC_020057	GA	3	6	9347	9352	50 %	0 %	50 %	0 %	436843301
12	NC_020057	AT	3	6	10877	10882	50 %	50 %	0 %	0 %	436843302
13	NC_020057	AT	3	6	11441	11446	50 %	50 %	0 %	0 %	436843302
14	NC_020057	GA	3	6	11736	11741	50 %	0 %	50 %	0 %	436843302
15	NC_020057	GT	3	6	12592	12597	0 %	50 %	50 %	0 %	436843302
16	NC_020057	AC	3	6	12639	12644	50 %	0 %	0 %	50 %	436843302
17	NC_020057	AT	3	6	14294	14299	50 %	50 %	0 %	0 %	436843303
18	NC_020057	CG	3	6	15032	15037	0 %	0 %	50 %	50 %	436843305
19	NC_020057	CA	3	6	15253	15258	50 %	0 %	0 %	50 %	436843305
20	NC_020057	GT	3	6	15956	15961	0 %	50 %	50 %	0 %	436843305
21	NC_020057	AT	3	6	16520	16525	50 %	50 %	0 %	0 %	436843305
22	NC_020057	GC	4	8	16853	16860	0 %	0 %	50 %	50 %	436843306
23	NC_020057	AC	3	6	19325	19330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020057	GC	3	6	19405	19410	0 %	0 %	50 %	50 %	436843310
25	NC_020057	CA	3	6	19498	19503	50 %	0 %	0 %	50 %	436843310
26	NC_020057	TC	3	6	19564	19569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020057	AC	3	6	19646	19651	50 %	0 %	0 %	50 %	436843311
28	NC_020057	GC	3	6	19842	19847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020057	GC	3	6	25235	25240	0 %	0 %	50 %	50 %	436843318
30	NC_020057	CA	3	6	26091	26096	50 %	0 %	0 %	50 %	436843319
31	NC_020057	TA	3	6	27738	27743	50 %	50 %	0 %	0 %	436843322
32	NC_020057	GT	3	6	29884	29889	0 %	50 %	50 %	0 %	436843324
33	NC_020057	TA	3	6	30635	30640	50 %	50 %	0 %	0 %	436843324
34	NC_020057	AT	3	6	31213	31218	50 %	50 %	0 %	0 %	436843324
35	NC_020057	TA	3	6	37025	37030	50 %	50 %	0 %	0 %	436843331
36	NC_020057	TC	3	6	37421	37426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020057	AT	6	12	37506	37517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020057	TA	3	6	39894	39899	50 %	50 %	0 %	0 %	436843334
39	NC_020057	GA	3	6	39965	39970	50 %	0 %	50 %	0 %	436843334
40	NC_020057	CT	3	6	39989	39994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020057	AG	3	6	42418	42423	50 %	0 %	50 %	0 %	436843335
42	NC_020057	AT	3	6	42539	42544	50 %	50 %	0 %	0 %	436843335
43	NC_020057	TG	3	6	44348	44353	0 %	50 %	50 %	0 %	436843335
44	NC_020057	AT	3	6	45001	45006	50 %	50 %	0 %	0 %	436843335
45	NC_020057	AT	4	8	45122	45129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020057	TA	3	6	45650	45655	50 %	50 %	0 %	0 %	436843337
47	NC_020057	GT	3	6	47374	47379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020057	CA	3	6	48182	48187	50 %	0 %	0 %	50 %	436843341
49	NC_020057	CA	3	6	48470	48475	50 %	0 %	0 %	50 %	436843341
50	NC_020057	AC	3	6	49356	49361	50 %	0 %	0 %	50 %	436843342
51	NC_020057	GT	3	6	50040	50045	0 %	50 %	50 %	0 %	436843344
52	NC_020057	AG	4	8	50208	50215	50 %	0 %	50 %	0 %	436843344
53	NC_020057	TA	3	6	50820	50825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020057	AC	3	6	52972	52977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020057	GC	3	6	53295	53300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020057	GC	3	6	56249	56254	0 %	0 %	50 %	50 %	436843353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.