MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.05

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020056	AAG	2	6	396	401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
2	NC_020056	TCC	2	6	451	456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843264
3	NC_020056	TCG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843264
4	NC_020056	ATT	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843264
5	NC_020056	AAG	2	6	735	740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
6	NC_020056	AGA	2	6	785	790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
7	NC_020056	ACT	2	6	803	808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843264
8	NC_020056	TTA	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843264
9	NC_020056	ATT	2	6	1098	1103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843264
10	NC_020056	GTC	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843264
11	NC_020056	CGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843264
12	NC_020056	ATT	2	6	1247	1252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843264
13	NC_020056	AAC	2	6	1301	1306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843264
14	NC_020056	AAG	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
15	NC_020056	GAA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
16	NC_020056	CGA	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843264
17	NC_020056	ATT	2	6	1809	1814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843264
18	NC_020056	AGA	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
19	NC_020056	TGC	2	6	2104	2109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843264
20	NC_020056	CAG	2	6	2136	2141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843264
21	NC_020056	CAG	2	6	2213	2218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843264
22	NC_020056	ACA	2	6	2366	2371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843265
23	NC_020056	GTT	2	6	2404	2409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
24	NC_020056	CTC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843265
25	NC_020056	ACA	3	9	2475	2483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843265
26	NC_020056	AGT	2	6	2527	2532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843265
27	NC_020056	GTC	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
28	NC_020056	AAC	2	6	2563	2568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843265
29	NC_020056	TCA	3	9	2628	2636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843265
30	NC_020056	TCT	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843265
31	NC_020056	TTG	2	6	2706	2711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
32	NC_020056	AGA	2	6	2749	2754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843265
33	NC_020056	TTG	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
34	NC_020056	TGC	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
35	NC_020056	ACT	2	6	2935	2940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843265
36	NC_020056	TGT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
37	NC_020056	TTG	2	6	2955	2960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
38	NC_020056	CTT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843265
39	NC_020056	TTG	2	6	3112	3117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
40	NC_020056	GTG	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843265
41	NC_020056	CTG	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
42	NC_020056	GCT	2	6	3291	3296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
43	NC_020056	ATA	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843265
44	NC_020056	CTA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843265
45	NC_020056	TGT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
46	NC_020056	AGT	2	6	3479	3484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843265
47	NC_020056	TGT	2	6	3512	3517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
48	NC_020056	TTG	2	6	3628	3633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
49	NC_020056	CTA	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843265
50	NC_020056	TGC	3	9	3692	3700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
51	NC_020056	ACT	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843265
52	NC_020056	TAA	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843265
53	NC_020056	GCA	2	6	3911	3916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843265
54	NC_020056	GTT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
55	NC_020056	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843265
56	NC_020056	CCA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843265
57	NC_020056	TCT	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843265
58	NC_020056	GGT	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843265
59	NC_020056	CTG	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
60	NC_020056	GTT	2	6	4925	4930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843266
61	NC_020056	TTA	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843266
62	NC_020056	GTT	2	6	5470	5475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843267
63	NC_020056	TCT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843267
64	NC_020056	GTT	2	6	5590	5595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843267
65	NC_020056	GAT	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843267
66	NC_020056	TCC	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843268
67	NC_020056	GTA	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843268
68	NC_020056	TCT	2	6	6070	6075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843268
69	NC_020056	TCC	2	6	6121	6126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843268
70	NC_020056	AAC	2	6	6135	6140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843268
71	NC_020056	ATC	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843269
72	NC_020056	CCT	2	6	6440	6445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843269
73	NC_020056	AGG	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436843269
74	NC_020056	TGA	2	6	6591	6596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843269
75	NC_020056	TGC	2	6	6603	6608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843269
76	NC_020056	AAG	2	6	6665	6670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843269
77	NC_020056	TTA	2	6	6800	6805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843269
78	NC_020056	CGG	2	6	6826	6831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843269
79	NC_020056	GAA	2	6	6838	6843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843269
80	NC_020056	CAA	2	6	6988	6993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843269
81	NC_020056	AGG	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436843269
82	NC_020056	TGA	2	6	7007	7012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843269
83	NC_020056	AGA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843270
84	NC_020056	GGC	2	6	7152	7157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843270
85	NC_020056	GCT	2	6	7244	7249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843270
86	NC_020056	GGA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436843270
87	NC_020056	CTG	2	6	7302	7307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843270
88	NC_020056	AAT	2	6	8170	8175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843271
89	NC_020056	TCG	2	6	8257	8262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843271
90	NC_020056	CAA	2	6	8358	8363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843271
91	NC_020056	ACC	2	6	8637	8642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843272
92	NC_020056	CGC	2	6	8661	8666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436843272
93	NC_020056	ATT	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843272
94	NC_020056	CTC	2	6	9045	9050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843273
95	NC_020056	ATA	2	6	9060	9065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843273
96	NC_020056	CAA	2	6	9178	9183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843273
97	NC_020056	TCA	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843273
98	NC_020056	GCT	2	6	9193	9198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843273
99	NC_020056	TCG	2	6	9223	9228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843273
100	NC_020056	GAT	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843274
101	NC_020056	CTT	2	6	9904	9909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843275
102	NC_020056	CGG	2	6	9924	9929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843275
103	NC_020056	GCA	2	6	10029	10034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843275
104	NC_020056	GCG	2	6	10097	10102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843275
105	NC_020056	GAA	2	6	10218	10223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843275
106	NC_020056	TGC	2	6	10226	10231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843275
107	NC_020056	CGG	2	6	10521	10526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843275
108	NC_020056	GAA	2	6	10584	10589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843275
109	NC_020056	TTA	2	6	10621	10626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843275
110	NC_020056	TTG	2	6	10632	10637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843275
111	NC_020056	TAC	2	6	10694	10699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843275
112	NC_020056	GAA	2	6	10730	10735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843275
113	NC_020056	AAG	2	6	10767	10772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843275
114	NC_020056	ATT	2	6	11019	11024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843276
115	NC_020056	TGT	2	6	11025	11030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843276
116	NC_020056	TAA	2	6	11031	11036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843276
117	NC_020056	CAT	2	6	11045	11050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843276
118	NC_020056	TAT	2	6	11055	11060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843276
119	NC_020056	TCT	2	6	11068	11073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843276
120	NC_020056	TAT	2	6	11150	11155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843276
121	NC_020056	AAG	2	6	11268	11273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843276
122	NC_020056	TCT	2	6	11391	11396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843277
123	NC_020056	TGT	2	6	11457	11462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843277
124	NC_020056	TTC	2	6	11600	11605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843277
125	NC_020056	GTG	2	6	11629	11634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843277
126	NC_020056	TCT	2	6	11679	11684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843277
127	NC_020056	AGG	2	6	11693	11698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436843277
128	NC_020056	ATA	2	6	11736	11741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843277
129	NC_020056	AAC	2	6	11766	11771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843277
130	NC_020056	AGC	2	6	11777	11782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843277
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251	NC_020056	CAC	2	6	19324	19329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843280
252	NC_020056	ATT	2	6	19337	19342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843280
253	NC_020056	GCT	2	6	19370	19375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843280
254	NC_020056	GTT	2	6	19408	19413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843280
255	NC_020056	AGG	2	6	19498	19503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436843280
256	NC_020056	TCA	2	6	19529	19534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843280
257	NC_020056	TCA	2	6	19589	19594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843280
258	NC_020056	TTA	2	6	19610	19615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843280
259	NC_020056	CAT	2	6	19620	19625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843280
260	NC_020056	CTG	2	6	19685	19690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843280
261	NC_020056	TAA	2	6	19776	19781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843280
262	NC_020056	TAG	2	6	19839	19844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843280
263	NC_020056	CTG	2	6	19861	19866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843280
264	NC_020056	TTC	2	6	19920	19925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843280
265	NC_020056	TCA	2	6	19961	19966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843280
266	NC_020056	ACA	2	6	19999	20004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843280
267	NC_020056	CCA	2	6	20015	20020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843280
268	NC_020056	ATC	2	6	20038	20043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843280
269	NC_020056	TAA	2	6	20128	20133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843280
270	NC_020056	TGT	2	6	20145	20150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843280
271	NC_020056	ATT	2	6	20165	20170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843280
272	NC_020056	TCA	2	6	20484	20489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843281

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.